АСКАРИДА ЧЕЛОВЕЧЕСКАЯ ОБЩИЕ ЧЕРТЫ СТРОЕНИЯ КРУГЛЫХ ЧЕРВЕЙ mp3 download (13.94 MB)
АСКАРИДА ЧЕЛОВЕЧЕСКАЯ. ОБЩИЕ ЧЕРТЫ СТРОЕНИЯ КРУГЛЫХ ЧЕРВЕЙПонятие о круглых червях. Среда обитания. Внешнее строение круглых червей. Системы органов. Размножение и развитие
Тип Круглые черви. Паразиты. Биология 7 класс. Нематоды, строение Человеческая аскарида, острица ЕГЭ
Видеоурок биологии. Тема: «Тип Круглые черви (нематоды). Строение круглых червей. Представители: человеческая аскарида, трихина, двенадцатиперстная кривологоловка, острица. Характеристика. Биология 7 класс.» Конспект урока и тесты для проверки на сайте ladle.ru/education/biologiya/7class/kruglye-chervi
Биология 6 класс ladle.ru/education/biologiya/6class
Биология 7 класс ladle.ru/education/biologiya/7class
Биология 8 класс ladle.ru/education/biologiya/8class
Тесты ЕГЭ ladle.ru/education/biologiya/ege Тип Круглые черви -.
Урок Тип Круглые черви — ЦТ, ЕГЭ, ЗНО
В этом уроке я расскажу вам об основных представителях группы: аскариде, острице, власоглаве и трихине. Также рассмотрим строение аскариды, ее образ жизни и жизненные циклы этих червей.
Круглые черви| Аскарида.
Портал «Поступи в Мед!»: группа ВК: vk.com/postupivmedclub сайт: postupivmed.ru/ ******************************************************************** #aleksandra_зоология В уроке дается общая характеристика типа круглые черви, а также рассматривается жизненный цикл аскариды человеческой. Будет полезен абитуриентам, сдающим ЕГЭ и ЗНО, при подготовке к экзаменам по биологии, а также студентам младших курсов биофаков и мед. университетов. ******************************************************************** Ознакомиться и приобрести мои…
Человеческая аскарида. Уроки Биологии Онлайн.

BioFamily: Жизненный цикл аскариды человеческой за 7 минут
📍 С 20 по 24 июня повторяем все темы ЕГЭ по Биологии, решаем сложные задания и закрываем твои пробелы. Всё, что нужно знать об интенсиве тут: 👉🏻 vk.cc/as0PID
Круглые черви. Видеоурок по биологии 7 класс
Пройти тест по теме: goo.gl/zcJGsY Учиться можно эффективно и с удовольствием! Домашняя школа InternetUrok.ru — полное среднее образование с 1 по 11 класс дистанционно, возможность официального зачисления в любое время года: home-school.interneturok.ru/?utm_source=youtube&utm_medium=interneturokchannel&utm_campaign=bio Задать вопрос к уроку: goo.gl/oAE6wW Другие видеоуроки по школьной программе — на interneturok.ru Мы рассмотрим основные особенности строения и жизнедеятельности круглых червей, познакомимся с основными чертами этого…
Тип Круглые черви | Биология 7 класс #14 | Инфоурок
Видеоуроки являются идеальными помощниками при изучении новых тем, закреплении материала, для обычных и факультативных занятий, для групповой и индивидуальной работы. Они содержат оптимальное количество графической и анимационной информации для сосредоточения внимания и удержания интереса ребят без отвлечения от сути занятия. Каждый видеоурок озвучен профессиональным мужским голосом, четким и приятным для восприятия. Ученики ценят оригинальность подачи материала, родители радуются повышению отметок детей, а учителя в восторге от эффекта и…
Аскарида человеческая (Ascaris lumbricoides) — Жизненный цикл, Симптомы, Диагностика, Размеры
Аскарида человеческая #аскарида #человеческая #медицинская #паразитология #биология #диагностика #жизненный #цикл #клиника #симптомы
7. Круглые черви (7 класс) — биология, подготовка к ЕГЭ и ОГЭ 2019
Строение и жизненный цикл паразитов
Аскарида человеческая (Ascaris lumbricoides) в стихах
Стихи про биологию Аскариды человеческой с последующим анализом
МНОГООБРАЗИЕ КРУГЛЫХ ЧЕРВЕЙ
Круглые черви. Нематоды. Паразиты человека и животных. Паразиты растений
Круглые черви
Аскарида и другие паразитические нематоды — урок. Биология, Животные (7 класс).
Человеческая аскарида (вызываемое заболевание — аскаридоз)
Человеческая аскарида живёт в тонком кишечнике человека. Взрослые аскариды питаются содержащимися в кишечнике продуктами переваривания пищи.
Длина самцов человеческой аскариды — \(15\)–\(25\) см, а самок — \(20\)–\(40\) см. Самцы отличаются от самок ещё и тем, что задний конец их тела («хвост») изогнут в виде крючка.
При аскаридозе в кишечнике человека обычно живёт несколько червей.
Самка аскариды, как и все паразиты, производит огромное количество яиц. Яйца по выходе из кишечника человека наружу развиваются во влажной среде, и через \(9\)–\(13\) суток в них формируются личинки. В организм человека яйца попадают с заражёнными продуктами или с грязной водой. В кишечнике оболочки яиц растворяются и появляются личинки, которые проникают в кровеносное русло и с током крови переносятся в лёгкие. В лёгких они некоторое время растут, затем через глотку опять перебираются в кишечник. Через \(2\)–\(2,5\) месяца после заражения оплодотворённые самки начинают откладывать яйца.
Острицы (вызываемое заболевание — энтеробиоз)
Кроме аскариды в организме человека могут паразитировать и другие круглые черви, в частности острицы. Это мелкие черви: самцы длиной \(5\) мм, самки — \(12\) мм.
На головном конце остриц заметно вздутие кутикулы. Задний конец самца закручен спирально, у самки он шиловидно вытянут и заострён. Острицы обитают в толстых кишках, где питаются их содержимым. Самки со зрелыми яйцами выползают через анальное отверстие, вызывая зуд, и, отложив вблизи него яйца, погибают. Человек заражается, проглатывая яйца. Очень мелкие яйца остриц могут переносить различные насекомые, например, мухи, тараканы. Продолжительность жизни остриц в теле хозяина — около одного месяца. После этого наступает самоизлечение. Но часто происходит повторное заражение.
Поселившиеся в организме паразиты выделяют ядовитые вещества. Из-за этого нарушается работа пищеварительной системы человека. Чтобы избежать заражения червями, нужно строго соблюдать правила гигиены: регулярно мыть руки с мылом, не есть немытые фрукты и овощи, утюжить бельё.
Источники:
http://biolgra.ucoz.ru/board/biznes_sotrudnichestvo/delovye_predlozhenija/16
http://afanaseva.ru
Зоологический триллер «Тип Круглые черви. Человеческая аскарида»
Введение в замыселСодержание материала |
|
Анализ ситуации | Урок биологии, 7 класс, 3 четверть.![]() Тема урока: Зоологический триллер – тип Круглые черви. Человеческая аскарида. Обычная массовая школа, стандартная программа, практическое применение ЗУН. |
Анализ трудностей | Возможна некоторая скованность учащихся, так как присутствуют гости. |
Анализ литературы | Использовано: учебник «Биология 7 класс» К.Кайым, учебник «Биология 7-8 класс» Козлова, Библиотека 1сентября «Я иду на урок биологии». |
Ключевое понятие | Круглые черви |
Тезис-девиз | Большинство круглых червей внутренние паразиты. |
Задача | Формировать базу знаний по теме с использованием элементов творчества |
Сверхзадача | Развивать интерес к предметам естественного цикла. |
Концепция | Официальная |
Определение собственной позиции | Идеологическая: гуманистическая.![]() |
Стиль общения | Демократический. |
Анализ духовных ценностей | Я хочу, чтобы дети с интересом и желанием шли на урок. |
Анализ адресата | В классе 10 учащихся, 7 девочек и 3 мальчика. Желание учиться есть у 8. |
Уровень направленности личности | Средний |
Уровень понимания | О чем? Что? Почему? Для чего? |
Речевой слух | Средний |
Внимание | Непроизвольное, произвольное развито слабо |
Память | Зрительная, слуховая, моторная |
Воображение | Активное |
Тип аудитории | Соглашательский |
Зоологический триллер на тему: «Тип Круглые черви.

Цель: актуализация санитарно-гигиенического аспекта, через формирование базы знаний по теме «тип круглые черви».
Задачи:
- сформировать знания о строении, процессах жизнедеятельности, образа жизни и приспособленности круглых червей к среде обитания;
- развивать умения выделять главное, сравнивать, самостоятельно работать с учебником и литературой;
- развивать творческие способности;
- осуществлять гигиеническое воспитание.
Методы и методические приемы:
- Словесные: беседа, рассказ.
- Практические: наблюдение, распознание, сравнение, выделение главного, обобщение.
Оборудование: бланки «Сценарий урока»
(Приложение 1),
таблицы по теме, доска магнитная, магниты.
План урока:
1. Организационный момент.
2. Актуализация знаний и цель урока.
3. Написание сценария зоологического триллера.
– «Определение актерского состава» – классификация типа Круглые черви.
– Сцена 1 «Отличительные особенности»
– Сцена 2 «Внешнее строение»
– Сцена 3 «Внутреннее строение»
– Сцена 4 «Процессы жизнедеятельности»
– Сцена 5 «Цикл развития»
– Сцена 6 «Меры профилактики»
– Заключительная сцена.
4. Домашнее задание.
5. Итоги урока.
ХОД УРОКА
Организационный момент – оценка готовности класса и учащихся к уроку, приветствие учеников и гостей.
Актуализация знаний:
В 1995 году журнал Nature Australia опубликовал
любопытную заметку. Некий австралиец,
заглянувший с утра на кухню, обнаружил на столе
большого дохлого паука. Что заставило его прийти
умирать в столь не подходящее место? Но еще
большее удивление и отвращение хозяин дома
испытал, заглянув в стоящую рядом чашку с
остатками вчерашнего кофе – там плавал невесть
откуда взявшийся большой червяк … Мистер Грей –
человек, с которым произошла эта история –
биолог, и он сумел разгадать загадку.
Тема урока – зоологический триллер «тип Круглые черви». Цель: написать сценарий зоологического триллера для изучения материала по данной теме.
Написание сценария.
Подготовительный этап.
1. «Раскадровка» – проверка знаний по теме «Тип Плоские черви».
Первый кадр
Задание: допиши подходящее по смыслу.
Рисунок 1.
Тип – Плоские черви
Класс
Вид – Белая планария
Образ жизни – свободноживущий хищник
Среда обитания – пресноводная
Второй кадр
Задание: Схемы, каких систем органов
планарии здесь представлены? Подпиши.
Пищеварительная
выделительная
нервная
половая
………………………
……………………
………………….. ……………..
Рисунок 2.
Третий кадр
Рисунок 3.
Задание: опиши цикл развития печеночного сосальщика.
С калом КРС яйцо попадает в воду, развивается в свободно живущую плавающую личинку, она проникает в тело улитки (промежуточного хозяина), выходит новое поколение личинок, которые в виде цист закрепляются на траве. КРС съедая траву, проглатывает цисту, которая ЖКТ лопается, личинка проникает в кровь и достигает печени, где развивается в половозрелую особь – гермафродит.
Ученикам предлагается самостоятельно изучить
материал учебников и дополнительной литературы
и выписать главное, интересное по их мнению.
После написания каждой из сцен организуется
небольшое обсуждение.
2. «Определение актерского состава» – классификация круглых червей.
Царство – Животные
Подцарство – Многоклеточные
Тип – Круглые черви
Представители: нитчатый червь, нематоды, ришта,
трихинелла, аскариды, острицы, волосатик,
киноринх, коловратка,и тд.
3. «Написание сценария» – изучение нового материала
Сцена 1
Отличительные особенности круглых червей:
1. Около 15 тысяч видов
2. Тело нечленистое, цилиндрическое,
веретенообразное
3. В поперечном разрезе круглое
4. Первичная полость тела
5. Наличие анального отверстия
6. Только 1 слой продольных мышц, только
изгибается
7. Большинство внутренние паразиты растений,
животных и человека.
Сцена 2
Внешнее строение круглых червей.
Рисунок 4.
Форма тела – веретенообразная
Покровы – кутикула
Длина тела – самки 20-40 см, самцы 15-25 см в длину
Выросты на теле – отсутствуют
Органы на переднем конце – рот с тремя губами
Органы на заднем конце – анальное отверстие.
Сцена 3
Внутреннее строение круглых червей.
Рисунок 5.
Сцена 4
Процессы жизнедеятельности круглых червей.
1. Движение – один слой продольных мышечных
волокон, только изгибаются.
2. Питание – пища проходит через рот и глотку в
трубкообразный кишечник, не переваренные
остатки удаляются через анальное отверстие.
3. Дыхание – дышат всей поверхностью тела.
4. Кровообращение – отсутствует, функции
обмена веществ выполняет первичная полость.
5. Выделение – система представлена парой
боковых каналов, сливающихся под глоткой в один,
открывающийся на брюшной стороне.
6. Чувствительность – нервная система
лестничного типа, органы чувств развиты слабо.
7. Размножение – раздельнополые животные,
размножаются только половым способом,
оплодотворение внутреннее.
Сцена 5
Цикл развития аскариды.
Сцена 6
Меры профилактики заболеваний вызванных гельминтами.
1. Мыть руки перед едой.
2. Хорошо мыть овощи и фрукты.
3. Соблюдать технологию приготовления мяса и
рыбы.
4. Не использовать неочищенную воду.
5. Не купаться на диких пляжах.
Заключительная сцена.
Круглые черви имеют повсеместное
распространение и высокую численность особей,
что указывает на биологический прогресс этого
типа червей, не смотря на простоту их организации
в связи с паразитическим образом жизни.
Зачитывается развязка зоологического триллера.
Червяк в кофейной чашке оказался представителем семейства мермитид, относящихся к одному из классов круглых червей – нематодам. Мермитиды распространены по всему свету. Взрослые черви живут свободно в воде или в почве, но их личинки – паразиты членистоногих. Не оставляют своим «вниманием» ни пауков, ни ракообразных, ни насекомых. Попав в тело хозяина, личинка буквально выедает его изнутри. Когда личинке приходит время, выходить наружу, его хозяин направляется к воде, даже если он обитатель суши. Паук вместе со своим страшным грузом, подчиняясь неведомому приказу, отправился в поисках ближайшего водоема, им и оказалась чашка с кофе. Здесь созревший паразит разорвал его покровы и вышел наружу. Хозяин Мермитиды больше не нужен – ему «дозволяется» вылезти на сушу. Видимо, такая история и произошла на кухне мистера Грея.
4. Домашнее задание – параграф 45,
повторить параграф 44, заполнить таблицу (Приложение 2)
5. Итоги урока.
Рефлексия и самоанализ урока. (Приложение 3)
МЕДИЦИНСКАЯ ПАРАЗИТОЛОГИЯ
38
4. Выделительная система состоит из 1-2 гигантских клеток (кожных
желез). Функцией выделения обладают также особые фагоцитарные клет-
ки, расположенные по ходу выделительных каналов.
5. Нервная система представлена окологлоточным нервным кольцом
и нервными стволами, из которых наиболее развиты дорзальный и вен-
тральный. Органы чувств развиты слабо.
6. Половая система имеет трубчатое строение. Большинство нематод
раздельнополы. У самцов, как правило, имеется только одна (непарная)
трубка, включающая семенник, семяпровод и семяизвергательный канал,
открывающийся в задний отдел кишечника. У самок половая система пар-
ная, состоит из двух яичников, двух яйцеводов, двух маток, соеди-
няющихся в непарное влагалище, которое открывается наружу на перед-
нем конце тела. Половой диморфизм хорошо выражен. Самцы имеют
меньшие размеры, у большинства задний конец тела закручен на брюш-
ную сторону.
Систематическое положение круглых червей –
возбудителей болезней человека
Тип Nemathelminthes — Круглые черви
Класс Nematoda — Собственно круглые черви
Виды:
Ascaris lumbricoides — аскарида человеческая
Enterobius vermicularis — острица
Trichocephalus trichiurus — власоглав
Trichinella spiralis — трихинелла
4.3. Аскарида человеческая (Ascaris lumbricoides)
На микропрепарате поперечного среза самки аскариды под малым
увеличением микроскопа изучите строение покровов. Тело покрыто ку-
тикулой, она образует четко очерченный слой. Найдите четыре гиподер-
мальных валика, расположенных радиально, мышечные ленты (мышечные
клетки образуют отростки, свешивающиеся в полость тела). Мышечный
слой резко истончается по направлению к центру боковой стороны, там
гиподерма образует валики. Найдите отверстие выделительного канала в
центре валика. Обратите внимание на спинной и брюшной валики гипо-
дермы. Они имеют бокаловидную форму, в них проходят нервные стволы.
Рассмотрите части половой системы, расположенные в полости тела. Они
имеют вид округлых дисков, различного диаметра. Срезы яичников имеют
наименьший диаметр и не имеют просвета в центре.
Яичники заполнены
яйцеклетками треугольной формы. Яйцеводы имеют больший диаметр и про-
Онлайн урок: Круглые черви по предмету Биология 7 класс
Круглые черви, или нематоды — двусторонне-симметричные животные, имеющие вытянутое тело, заостренное с двух концов.
В пищеварительной системе круглых червей различают:
- рот на переднем конце тела
- глотку, часто имеющую разнообразные элементы вооружения типа зубов
- среднюю и заднюю кишку
- анальное отверстие в задней части
Именно у круглых червей в процессе эволюции сформировалась сквозная пищеварительная система, то есть и ротовое анальное отверстие, а не только ротовое отверстие как у плоских червей.
Тело нематод на поперечном разрезе круглое, что достигается благодаря:
- внешней упругой кутикуле
- заполнению первичной полости тела особой жидкостью, находящейся под давлением
Под защитной кутикулой находится слой гиподермы и четыре тяжа продольных мышц, образующих вместе кожно- мускульный мешок.
Между кожно- мускульным мешком и внутренними органами расположена псевдоцель. У псевдоцели нет эпителия.
Нервная система представлена:
- окологлоточным кольцом
- продольными нервными стволами
- слабо выраженными органами осязания и хеморецепции
У круглых червей есть также система выделения и половая система.
Выделение продуктов жизнедеятельности и газообмен у круглых червей может происходить через поверхность тела.
Большинство круглых червей- раздельнополые животные, у которых выражен половой диморфизм.
Самки обычно несколько крупнее самцов.
Но есть также примеры видов, у которых вообще нет самок, и все особи делятся на гермафродитов и самцов. Кроме того, среди круглых червей есть и чисто гермафродитные виды.
Для большинства нематод характерно постоянство клеточного состава, т. е. все взрослые черви одного вида состоят из строго определенного количества клеток, которое даже можно подсчитать.
При этом рост животных осуществляется путем последовательных линек.
Регенерация для круглых червей не характерна.
Круглые черви. Аскарида и другие паразиты
Аскариды — довольно крупные, до 40 сантиметров длиной, паразитические черви, относящиеся к типу круглых червей. Они поражают организмы животных и человека вызывают болезнь аскаридоз. Аскарид называют красиво «космополитами» за их повсеместное распространение. Не обнаруживаются эти черви только уж в совсем невыносимых условиях севера и пустынь.
Аскарида человеческая обитает в просвете человеческого кишечника, особенно часто поражая детей, но может мигрировать и внедряться в различные органы. Благодаря телу, заостренному с обоих концов, червь очень подвижен и вездесущ, у него даже отсутствуют органы прикрепления. Подчеркнем, что промежуточного хозяина у этого паразита нет.
Строение и системы органов
1. Аскаридам присущ половой диморфизм, самец мельче самки в полтора-два раза.
2. У самца хвостик подогнут к брюшку, как запятая.
3. Кутикула имеет розоватый цвет, она полупрозрачна, несмотря на многослойность, и способна хорошо защищать червя от переваривания ферментами. Под ней лежит слой клеток гиподермы, почти слившихся друг с другом.
4. Пищеварительную систему начинают рот, который окружен мощными губами, захватывающими содержимое кишечника хозяина, и глотка. Следующий отрезок — пищевод и средняя кишка, где идет всасывание полезных веществ. Задняя кишка открывается вовне анальным отверстием.
5. Дыхательной системы нет, поскольку аскарида анаэроб. Гликолиз для нее — основной путь получения энергии.
6. Выделительная система состоит из лежащей в гиподерме шейной железы, к которой подходит пара слепозамкнутых каналов.
7. Половая система самки представлена парами яичников, яйцеводов, маток и одиночным влагалищем, которое, что интересно, расположено на брюшке ближе к голове червя. Каждый день самка производит как минимум 200 тысяч яиц.
8. Самец выглядит скромнее — у него только по одному семеннику, семяпроводу и семяизвергательный канал, который выходит в заднюю кишку.
Цикл развития аскариды человеческой
1. В жизненном цикле отсутствует необходимость менять хозяев.
2. Оплодотворение внутреннее.
3. Яйца созревают в почве, в кислородной среде, внутри них растет личинка в течение 9–30 дней. Следовательно, свежеотложенные яйца для человека не опасны, даже если они попадут в организм, аскаридоз не разовьется.
4. Достигнув зрелости в почве, яйца становятся инвазионными, — теперь они действительно опасны для хозяина. «Поймать» аскариду несложно: достаточно не помыть фрукты, овощи, руки, напиться зараженной воды, а детям — поиграть в песочнице и потянуть грязные руки в рот.
5. В кишечнике хозяина вышедшие из яиц личинки обживаются, питаются, проникают сквозь стенки кишечника в кровеносные сосуды, а далее в печень, сердце, легкие…
6. При поражении легких аскаридами у человека неизбежно развивается кашель. При кашле личинки забрасываются в рот, вновь заглатываются, попадают в тонкий кишечник и там достигают половой зрелости.
7. Вред аскаридоза не в том, что аскариды питаются пищей человека, а в том, прежде всего, что паразиты выбрасывают в организм токсины. Как результат — изъязвления кишечника и его непроходимость при большом количестве червей.
Как избежать заражения?
1. Не забывать о правилах гигиены, хорошо мыть руки, овощи и фрукты. Не позволять детям на улице брать в рот пальцы, игрушки, облизывать поручни в транспорте и пр. Чаще всего заражение этими гельминтами происходит в теплое время года.
2. Бороться с переносчиками яиц, в частности, мухами и прочими насекомыми, накрывать пищу.
3. Соблюдать санитарные нормы при организации мусорных ям, туалетов, — что, конечно, у нас делается из рук вон плохо.
4. Заботиться о чистоте водоемов.
5. При обнаружении аскарид тщательно пролечиваться — так как ими можно заразить всю семью, полового партнера и т. д.
Какие еще паразитирующие круглые черви опасны?
1. Острица — червь длиной до 10 миллиметров, паразитирующий также исключительно у человека, и очень часто у детей. Живет острица в организме примерно месяц, но за это время можно заразить членов семьи, и заболевание будет ходить по кругу. Яйца паразит откладывает на кожу, в организм человека попадает личинка, защищенная оболочкой. Вернейший признак заражения острицами — зуд по ночам в районе анального отверстия, неспокойный сон и жалобы на дискомфорт у детей.
2. Трихинелла спиральная — заражает человека при употреблении мяса с личинками, преимущественно свинины, а свиньи заражаются при поедании больных крыс. Внутри человеческого организма из личинок формируются взрослые черви, которые, в свою очередь, рождают живых личинок, проникающих в кровоток и мышечные ткани. В мышцах они инкапсулируются и могут находиться десятки лет.
3. Ришта, гвинейский или мединский червь — вызывает заболевание дракункулёз, или ришту. Живет червь в подкожной жировой клетчатке ног, распространен в Азии и Африке. Человек — окончательный хозяин, а заражается он при употреблении воды с веслоногими рачками, которые переносят личинки паразита.
4. Волосатик — получил название по внешнему виду, напоминающему волосок (длина 40 сантиметров и более при ширине не больше 5 миллиметров!). При спаривании черви сбиваются в клубки, называемые «гордиевыми узлами». Волосатики не едят, так как практически утратили рот и переднюю кишку, питаются накопленными в личиночной стадии веществами, — поэтому живут на дольше месяца, но могут надолго превращаться в цисты. Личинки паразитируют на водных насекомых. Волосатик обычно не паразитирует на человеке, но, попав в его организм, ведет себя как ложнопаразит.
5. Некоторые круглые черви паразитируют на растениях, например, луковичная нематода.
Хочешь сдать экзамен на отлично? Жми сюда — ЕГЭ по биологии: онлайн тесты
Человеческая аскарида и другие нематоды-паразиты (острицы, трихинелла) | Биология. Реферат, доклад, сообщение, краткое содержание, лекция, шпаргалка, конспект, ГДЗ, тест
Раздел: Черви (Плоские, Круглые, Кольчатые)
Место проживания взрослых аскарид (рис. 17.3) кишечник человека. Это большие черви грязно-розового цвета, длина тела самцов достигает 25 см, самок — 45 см. Задний конец тела у самцов загнут крючком, с его помощью они охватывают самку во время оплодотворения. Как и все паразиты, аскариды чрезвычайно плодовиты. Самка за день выделяет до 245 тыс. микроскопических яиц, покрытых прочной оболочкой. Вместе с калом яйца удаляются из тела человека (рис. 17.4) и попадают на почву, а с дождевыми потоками и в водоемы. Там они могут находиться, всегда готовые к развитию, на протяжении 5-6 лет.
Рис. 17.3. Аскариды |
С сырой водой, с грязными овощами и фруктами яйца аскариды попадают в организм человека. В кишечнике оболочка яйца растворяется, и из него выходит личинка. Однако вот что удивительно: личинки развиваются только из яиц, пробывших в кислородной среде хотя бы 9-15 дней. Личинка не остается в кишечнике человека, а отправляется в длинные странствия по организму хозяина. Через стенку кровеносных сосудов кишечника она попадает в кровь, а с ней — в легкие и бронхи. Это важный промежуточный пункт в путешествии личинки: здесь она в последний раз «вдохнет» кислород. Когда человек кашляет, личинка вместе с мокротой попадает из бронхов в рот. Человек проглатывает слюну, и личинка, пройдя через желудок, заканчивает странствия в тонком кишечнике. Там она превращается во взрослую аскариду, которая будет жить в бескислородной среде, отравляя хозяина отходами своей жизнедеятельности. Материал с сайта http://worldofschool.ru
Рис. 17.4. Жизненный цикл аскариды: 1 яйцо; 2,3,4,5 — развитие зародыша аскариды в яйце |
К нематодам — паразитам человека — относятся острицы. Они живут в толстом кишечнике, питаясь бактериями. Чтобы яйца «вдохнули кислород», острицы выползают и откладывают их вокруг анального отверстия. Человек из-за зуда начинает расчесывать эти участки кожи. Так яйца остриц попадают на руки, под ногти и дальше — в рот.
Очень опасным паразитом является трихинелла. Эта нематода поселяется в мышцах человека, свиней и крыс. Зараженные мышцы содержат пропитанные известью капсулы с трихинеллами, свернутыми клубочком. Если съесть такое мясо, капсулы попадут в кишечник. Там они растворяются, а личинки быстро растут и через двое суток начинают размножаться. Самка трихинеллы рождает около 2 тыс. личинок, они продырявливают стенки кишечника и с кровью попадают в мышцы хозяина. Человек может стать промежуточным хозяином и для аскарид, живущих в организмах кошек, собак.
На этой странице материал по темам:Реферат острицы
Человеческая аскарида конспект
Человеческая аскарида доклад
Биологии 7 класс схема паразит человеч 1 оскарида 2 острица
Жизненный цикл аскариды. зоология
Каким образом происходит заражение человека аскаридами?
Какой жизненный цикл характерен для остриц?
CDC — Аскаридоз — Биология
Возбудители
Аскариды — очень крупные (взрослые самки: от 20 до 35 см; взрослые самцы: от 15 до 30 см) нематоды (круглые черви), паразитирующие в кишечнике человека. A. lumbricoides является основным видом, вызывающим инфицирование человека во всем мире, но Ascaris , полученное от свиней (часто обозначаемое как A. suum ), также может инфицировать людей. Эти два паразита очень тесно связаны между собой, и были идентифицированы гибриды; таким образом, их статус как отдельных, репродуктивно изолированных видов является спорной темой.
Жизненный цикл:
Взрослые черви живут в просвете тонкой кишки. Самка может производить около 200 000 яиц в день, которые выводятся с фекалиями. Неоплодотворенные яйца можно проглотить, но они не заразны. Инфекция личинок в оплодотворенных яйцах развивается от 18 дней до нескольких недель, в зависимости от условий окружающей среды (оптимально: влажная, теплая, затененная почва). После проглатывания инфекционных яиц личинки вылупляются, проникают в слизистую кишечника и переносятся через портал, а затем через системный кровоток в легкие.Далее личинки созревают в легких (от 10 до 14 дней), проникают через альвеолярные стенки, поднимаются по бронхиальному дереву к глотке и проглатываются. Достигнув тонкой кишки, они превращаются во взрослых червей. От приема инфекционных яиц до их откладки взрослой самкой требуется от 2 до 3 месяцев. Взрослые черви могут жить от 1 до 2 лет.
Хосты
Люди и свиньи являются основными хозяевами аскарид ; см. «Возбудители» для обсуждения видового статуса Ascaris от обоих хозяев.Естественные инфекции, вызванные возбудителем A. lumbricoides , иногда встречаются у обезьян и приматов.
Иногда встречается Ascaris sp. яйца могут быть обнаружены в фекалиях собак. Это указывает не на истинную инфекцию, а на ложное отхождение яиц после копрофагии.
Географическое распространение
Аскаридоз — самая распространенная во всем мире гельминтозная инфекция. Бремя является самым высоким в тропических и субтропических регионах, особенно в районах с неадекватной санитарией. Эта инфекция, как правило, встречается редко или отсутствует в развитых странах, но спорадические случаи могут возникать в сельских бедных регионах этих стран.Некоторые случаи в этих районах, где передача от человека незначительна, имеют прямую эпидемиологическую связь со свинофермами.
Клиническая презентация
Хотя тяжелые инфекции у детей могут вызывать задержку роста из-за недоедания, взрослые черви обычно не вызывают острых симптомов. Большое количество гельминтов может вызвать боль в животе, непроходимость кишечника и потенциально перфорацию при инфекциях очень высокой интенсивности. Мигрирующие взрослые черви могут вызывать симптоматическую окклюзию желчных путей, аппендицит или носоглотку, особенно при инфекциях с участием одного женского гельминта.
Ascaris — обзор | Темы ScienceDirect
Ландшафтная генетика как средство определения передачи
Ascaris в популяции хозяевДля эффективного контроля Ascaris потребуется детальное знание распространения паразитов для полной оценки моделей передачи среди отдельных человеческих хозяев. Однако степень распространения паразитов трудно определить с помощью данных, основанных исключительно на интенсивности заражения (т. Е. Количестве червей на инфицированного хозяина или суррогата, такого как яйца на грамм фекалий).Это связано с тем, что прямое наблюдение за потомством паразита, покидающим одного хозяина и впоследствии заражающим того же или нового хозяина, практически невозможно. 31 Таким образом, хотя данные об интенсивности необходимы для изучения факторов, объясняющих различия в распределении паразитов среди отдельных хозяев, 32 они мало что дают для ответа на вопрос о том, где человек заразился (т. Е. Существуют ли разные очаги заражения). инфекции в отдельной человеческой популяции).
Идентификация подразделения популяции с помощью анализа популяционной генетики на основе мультилокусных генотипических данных предоставляет мощные средства для вывода о распределении макропаразитов среди подразделенных единиц, таких как особи или группы хозяев (например,грамм. домохозяйства). 33–36 При использовании генетических данных для вывода о передаче между отдельными хозяевами единицей выборки должна быть стадия паразита, заражающая этого хозяина. 6 В случае Ascaris взрослые черви будут генотипированы от человека-хозяина. Если, например, было использовано яиц аскарид, изгнанных от человека, то показатели генетической дифференциации могут быть завышены из-за возможного отбора образцов паразитов-братьев и сестер. Я отсылаю читателей к Steinauer и его коллегам 37 для более подробного обсуждения этого типа выборки.Дополнительное понимание того, что контролирует процесс передачи, можно получить, используя подходы ландшафтной генетической статистики, чтобы проверить, коррелируют ли эпидемиологические переменные с наблюдаемой генетической структурой паразита. Пейзажная генетика — это мультидисциплинарная область, которая включает пространственную статистику, ландшафтную экологию и популяционную генетику для оценки роли ландшафтных переменных (например, высоты, почвенного покрова) в формировании генетической дифференциации между популяциями. 38 В этом отношении ландшафтная генетика преследует параллельные цели с областью пространственной эпидемиологии, которая исследует корреляты пространственных вариаций в моделях интенсивности инфекции. 39 Поскольку ландшафтная генетика все еще является развивающейся областью, в которой изучаются несколько методологий, я отсылаю читателей к специальному выпуску Molecular Ecology , в котором эта область освещается более подробно. 40 Здесь я демонстрирую применение ландшафтной генетики к эпидемиологии A. lumbricoides из эндемичной популяции в Джири, Непал. 41
Цели исследования Criscione и его коллег 41 заключались в том, чтобы определить, существует ли более одного источника инфекции (т.е. очаги инфекции) и, если да, изучить эпидемиологические переменные, которые могут коррелировать с этими очагами. Если происходит сильное смешивание и распространение паразитов в человеческой популяции, то паразиты будут иметь панмиктическую популяционную структуру. Таким образом, люди будут эффективно заражаться инфекциями от общей популяции паразитов (то есть от единого источника инфекции). Напротив, повторная передача, которая локализуется в определенных очагах в человеческой популяции, ограничит смешение паразитов, что приведет к генетической дифференциации паразитов в пределах одной человеческой популяции.Таким образом, обнаружение множественных генетических кластеров паразитов является признаком того, что могут быть множественные очаги инфекции (см. Рис. 1 в Criscione et al., 41 ). Взрослые особи A. lumbricoides были собраны у 320 человек из 165 домашних хозяйств, которые занимали территорию примерно 14 км 2 . В дополнение к пространственной выборке для некоторых районов села были взяты две временные выборки (с интервалом ~ 3 года, то есть в общей сложности 211 выборок по годам). По логистическим причинам временная выборка была разнесена для трех регионов Иржи, так что одна группа домов была взята в 1998 и 2001 годах, вторая группа — в 1999 и 2002 годах, а третья — в 2000 и 2003 годах.Как указано ниже, время сбора объясняет менее 1% вариации генетической структуры популяции паразитов. 41 Всего было генотипировано 1094 круглых червя по 23 аутосомным микросателлитным маркерам. 10 Байесовская кластеризация на основе модели (реализованная в структуре программы 23 ) использовалась для анализа генотипов мультилокусных паразитов, чтобы определить, существует ли основная генетическая структура среди выбранных червей. Важно отметить, что в этот анализ не была включена (и не требовалась) никакая предварительная пространственная или временная информация.
Была сильная поддержка генетического структурирования в локальном масштабе с идентифицированными 13 генетическими кластерами паразитов. Результаты анализа кластеризации популяции были впоследствии включены в непараметрический многомерный дисперсионный анализ 42,43 для выяснения пространственных, географических или эпидемиологических особенностей, связанных с распределением генетической изменчивости среди отобранных червей. Этот анализ предоставил новый подход к интеграции результатов генетической привязки индивидуума с последующим статистическим анализом. 41 Независимые переменные включали вложенный дизайн (домохозяйство и хозяева вложены в домохозяйство) и восемь ковариат: возраст хозяина, пол хозяина, плотность хозяев (количество людей, живущих в доме), высота над уровнем моря, географическое расстояние между домохозяйствами (широта – долгота вместе), интенсивность инфекции, пол паразита и время сбора. Когда переменные анализировались независимо, домохозяйство объяснило> 63% вариации генетического структурирования, тогда как каждая ковариата всегда составляла <15%.Когда вложенный дизайн был обусловлен восемью ковариатами (то есть сначала учитывалась дисперсия из-за ковариат), вклад домохозяйства все еще был высоким и объяснялся> 36%. Напротив, ни одна из восьми ковариат не была значимой после учета вложенного дизайна. Интересно, что время не оказало влияния на лежащую в основе генетическую структуру даже при попарном сравнении между периодами времени для 18 домохозяйств с достаточным размером выборки для тестирования. 41 Более того, пространственный автокорреляционный анализ показал, что паразиты между домохозяйствами в пределах 540 м были генетически более похожими, чем ожидалось случайно.Генетическая дифференциация, измеренная как F CT (иерархическая F — статистика домохозяйства к общему количеству), составила 0,023 и была высокозначимой ( p <0,0001) 41 .
Эти результаты 41 выявили три ключевых понимания передачи A. lumbricoides в Иржи: были отдельные очаги передачи в этом локальном масштабе, домашние хозяйства и близлежащие дома были общими генетически связанными паразитами, и люди повторно приобрели своих червей от тех же самых источник инфекции с течением времени.Эти результаты ставят под сомнение догму о том, что единое человеческое сообщество будет соответствовать однородной популяции паразитов (подразумевается во многих классических моделях передачи паразитов 44,45 , которые измеряют одно базовое репродуктивное число, R 0 ). В Иржи при моделировании передачи паразита необходимо учитывать несколько источников инфекции. Таким образом, при использовании моделей для оценки стратегий контроля в Иржи, было бы более целесообразно рассмотреть включение популяций паразитов, которые существуют в взаимосвязанной сети, т.е.е. метапопуляция. 46
Хотя я подчеркивал, как популяционная генетика может быть использована для выяснения моделей передачи, я отмечаю, что я не рассматриваю ландшафтную генетику как панацею для эпидемиологических целей в целом, и я не рассматриваю генетические данные как замену данным об интенсивности инфекции. . Скорее, я рассматриваю два типа данных как предоставляющие разную, но дополняющую информацию о процессе передачи. Например, Уокер и его коллеги 32 обнаружили, что в Бангладеш возраст и пол хозяина частично объясняют различия в количестве червей.Напротив, возраст и пол хозяина не коррелировали с тем, как генетическая изменчивость червя была разделена в Джири, Непал. 41 Я понимаю, что данные двух исследований нельзя напрямую сравнивать, поскольку они были получены из разных мест, но дело в том, что для полного объяснения процесса передачи необходимы как интенсивность паразитов, так и генетические данные. Таким образом, в этом гипотетическом сравнении, хотя пол может объяснить различия в количестве червей в домохозяйстве (женщины имеют более высокую интенсивность, возможно, из-за перидомицилиарного поведения, которое увеличивает экспозицию 32 ), мужчины и женщины по-прежнему получают своих червей из одного и того же источника. инфекционное заболевание.Наконец, следует отметить, что закономерности в Джири не могут быть экстраполированы на другие места, поскольку различия в человеческом поведении, топографии и внешних условиях окружающей среды могут изменить характер передачи. Например, совместное использование человеческих фекалий в качестве удобрений может способствовать распространению паразитов, тем самым создавая единый источник паразитов. Таким образом, предположение о едином инфекционном пуле паразитов необходимо будет проверить для каждой представляющей интерес популяции, и, как свидетельствует исследование в Jiri, 41 , даже в очень локальных масштабах.
Структурная основа иммуномодулирующей функции ингибитора цистеиновой протеазы из аскариды человека Ascaris lumbricoides
Abstract
Иммуносупрессия, связанная с инфекциями нематодных паразитов, была задокументирована. Ингибитор цистеиновой протеазы (CPI), выделяемый паразитами-нематодами, считается одним из основных модуляторов иммунного ответа хозяина. В этом отчете мы продемонстрировали, что рекомбинантный белок CPI Ascaris lumbricoides (Al-CPI) сильно ингибировал активность катепсина L, C, S и показал более слабый эффект на катепсин B.Кристаллическая структура Al-CPI определена с разрешением 2,1 Å. Два сегмента Al-CPI, петля 1 и петля 2, были предложены в качестве ключевых структурных мотивов, ответственных за связывание Al-CPI с протеазами и его ингибирующую активность. Мутации в петле 1 и петле 2 отменяли активность ингибирования протеазы в различной степени. Эти результаты обеспечивают молекулярное понимание взаимодействия между паразитом-нематодой и его хозяином и будут способствовать разработке антигельминтных средств или разработке лекарств от аутоиммунных заболеваний.
Образец цитирования: Mei G, Dong J, Li Z, Liu S, Liu Y, Sun M и др. (2014) Структурные основы иммуномодулирующей функции ингибитора цистеиновой протеазы от круглого червя человека Ascaris lumbricoides . PLoS ONE 9 (4): e96069. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0096069
Редактор: Шеннон Винг-Нгор Ау, Китайский университет Гонконга, Китай
Поступила: 14 декабря 2013 г .; Принята к печати: 3 апреля 2014 г .; Опубликовано: 29 апреля 2014 г.
Авторские права: © 2014 Mei et al.Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License, которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе при условии указания автора и источника.
Финансирование: Эта работа была частично поддержана грантами Национального фонда естественных наук Китая (30872370) для SZ и проекта «Сто талантов» Китайской академии наук для JL. Финансирующие организации не играли никакой роли в дизайне исследования, сборе и анализе данных, принятии решения о публикации или подготовке рукописи.
Конкурирующие интересы: Авторы заявили, что никаких конкурирующих интересов не существует.
Введение
Паразитарные инфекции нематод, которые широко распространены во многих частях мира, вызывают серьезные проблемы со здоровьем [1]. Инфекции этих паразитов часто характеризуются хроническим и бессимптомным течением из-за иммуносупрессии, вызываемой паразитами у хозяев [2]. Иммуносупрессия, вызванная нематодами, также проявляется как защита от аутоиммунных и аллергических заболеваний [3], [4].Человеческая желудочно-кишечная нематода Ascaris lumbricoides поражает до 1,5 миллиарда человек во всем мире и вызывает недоедание, задержку роста, снижение физической формы и снижение трудоспособности у инфицированных людей. Как и другие паразиты нематоды, инфекция A. lumbricoides , как было показано, модулирует иммунные ответы хозяев на инфекции, вызванные неродственными патогенами, снижает частоту астмы и снижает реактивность кожных проб на аллергены и клещей домашней пыли [3] — [6 ].Недавнее исследование показало, что псевдоциеломная жидкость A. lumbricoides модулирует фенотип дендритных клеток и их функцию [7]. Поэтому экстракты паразитарных нематод были предложены в качестве потенциальных терапевтических агентов для лечения аутоиммунных нарушений и аллергических заболеваний [8], [9].
Ингибиторы цистеиновых протеаз (CPI; цистатины) нематод, как было обнаружено, играют важную роль в модуляции иммунитета хозяина [10] — [12]. Цистатины представляют собой группу ингибиторов цистеиновых протеаз, которые обратимо связываются с цистеиновыми протеазами и регулируют их протеолитическую активность.Преобладающими протеазами-мишенями для цистатина являются C1 (папаин-подобная цистеинпептидаза) и семейство C13 (легумаин). CPI паразитов могут модулировать протеазозависимые функции иммунных клеток хозяина. Ряд катепсинов (версия цистеиновых протеаз семейства C1 у млекопитающих) был идентифицирован как важные протеазы, опосредующие иммунные ответы, такие как протеолитическая деградация инвариантной цепи, которая регулирует внутриклеточный транспорт молекулы MHC-II, процессинг антигена и расщепление внутриклеточного домена. Toll-подобного рецептора (TLR) -9 [13] — [15].Ингибирование этих цистеиновых протеаз может подавлять активацию дендритных клеток и препятствовать образованию пептидного комплекса MHC-II-антиген, что приводит к нарушению способности антигенпрезентирующей клетки активировать Т-клетки CD4 + и иммунные ответы.
Члены суперсемейства цистатина подразделяются на три типа в зависимости от их аминокислотных последовательностей и положения дисульфидной связи (ей). Цистатин 1 типа (стефины) содержит одиночный домен 11 кДа без сигнального пептида и дисульфидной связи.Цистатин типа 2 с молекулярной массой около 13 кДа представляет собой однодоменный белок, секретируемый во внеклеточную область, и имеет две консервативные внутримолекулярные дисульфидные связи. Цистатин 3 типа (кининоген) состоит из трех доменов типа 2 [16] — [19]. После первого выяснения структуры цистатина куриного яичного белка (CEW) типа 2 Вольфрамом Боде [20], многие другие структуры цистатинов были определены с помощью рентгеновской кристаллографии или ЯМР, включая человеческий цистатин AD, F [21] — [ 26], а также цистатины простейших паразитов и мягких клещей [27], [28].Структурно типичная цистатиновая складка содержит пятицепочечный антипараллельный β-лист, обернутый вокруг α-спирали.
Хотя CPI многих видов нематод были тщательно изучены на предмет их роли в индукции иммуносупрессии, структурные особенности этой группы иммуномодулирующих белков остаются в значительной степени неизвестными. В этом исследовании мы обнаружили, что рекомбинантный Al-CPI сильно ингибировал протеолитическую активность катепсинов. Затем мы проанализировали структуру A. lumbricoides CPI (Al-CPI).Мы определили критические сегменты молекулы Al-CPI, которые могут участвовать во взаимодействии между Al-CPI и его протеазами-мишенями. Исследование мутагенеза также подтвердило, что эти сегменты ответственны за ингибирование активности цистеиновой протеазы.
Материалы и методы
Заявление о соблюдении этических норм
Взрослые особи A. lumbricoides были собраны у пациентов в деревне в провинции Юньнань, Китай, после письменного информированного согласия. Протоколы исследования были одобрены институциональным комитетом по этике исследований на людях Института биомедицины и здравоохранения Гуанчжоу Китайской академии наук.
Молекулярное клонирование, экспрессия и очистка Al-CPI
Для клонирования кДНК Al-CPI общую РНК выделяли из взрослых червей и получали двухцепочечную кДНК с помощью ОТ-ПЦР с использованием случайных праймеров и системы обратной транскрипции (Promega, Madison, WI). Фрагмент гена, кодирующего Al-CPI, амплифицировали с помощью ПЦР из кДНК с праймерами 5′-CCGGAATTCGAAAACCTGTATTTTCAGGGCCAAGTAGGAGTTCCTGGTGGTTTC-3’и 5′-ACGCGTCGACTTATGCAGATTTGCATGTCT-3 ‘. Смысловой и антисмысловой праймеры были сконструированы на основе последовательностей, консервативных в цистатинах, ранее описанных для Nippostrongylus brasiliensis, Onchocerca volvulus, Brugia malayi, Haemonchus contortus и Caenorhabditis elegans в GenBank и Heligmosomoides polygyrus [28].Праймеры для 3 ‘и 5’ RACE были синтезированы, и полноразмерная кДНК Al-CPI была получена стандартными протоколами RACE. Полноразмерный ген Al-CPI (номер доступа в GenBank HQ404231) был сконструирован в векторе pET32a, а затем трансформирован в Origami (Novagen, Madison, WI). Клетки выращивали в среде Лурия-Бертани (LB), содержащей 100 мг / мл канамицина и ампициллина до A 600 = 0,6–0,8 при 37 ° C в течение ~ 3 часов. Затем клетки делили на две части и культивировали при 20 ° C в течение 20 часов после индукции 1 мМ изопропил-β-D-1-тиогалактопиранозидом (IPTG).Клетки собирали центрифугированием при 6000 об / мин в течение 15 мин и замораживали при -80 ° C. Белок Al-CPI очищали с использованием никелевой аффинной колонки с промывочным буфером A (200 мМ NaCl, 20 мМ Трис, pH 7,5), а затем элюирующим буфером B (200 мМ NaCl, 250 мМ имидазол, 20 мМ Трис, pH 7,5), а затем протеазой TEV. расщепление в буфере для диализа (100 мМ NaCl, 20 мМ Трис, pH 7,5). Al-CPI дополнительно очищали с помощью эксклюзионной хроматографии с использованием колонки HiLoad ™ 16/60 Superdex ™ 75 (GE Healthcare, Уппсала, Швеция) с пиковым объемом элюирования 83 мл, соответствующим мономерной форме Al-CPI.Экспрессия, очистка и кристаллизация рекомбинантного белка Al-CPI были подробно описаны в нашем предыдущем отчете [29]. Стратегию мутагенеза на основе ПЦР использовали для создания мутантов Al-CPI, и были заменены специфические остатки, которые, как предполагается, имеют решающее значение для связывания с протеазами. Мутанты Al-CPI были сконструированы в векторе pET32a и трансформированы в Origami. Мутантные белки экспрессировали и очищали аналогично Al-CPI дикого типа.
Измерение катепсиновой активности Al-CPI
Ингибирующая активность рекомбинантного Al-CPI и мутантных белков определялась с помощью анализов протеазной активности с использованием специфических флуорогенных субстратов [30].Катепсин В и С были приобретены у Sigma-Aldrich (Сент-Луис, Миссури), а катепсины L и S были получены у Calbiochem (Ла-Хойя, Калифорния) и Enzo (Нью-Йорк, Нью-Йорк), соответственно. Флуорогенные субстраты для катепсина B (Z-Arg-Arg-AMC) и катепсина C (Gly-Phe β-нафтиламид) были получены от Sigma-Aldrich и Santa Cruz Biotechnology (Санта-Крус, Калифорния) соответственно. Субстраты для катепсина L (Z-Phe-Arg-AMC) и катепсина S (Z-Val-Val-Arg-AMC) были от Calbiochem и Enzo Life Sciences (Плимут, Пенсильвания), соответственно.Для измерения ингибирующей активности Al-CPI катепсины инкубировали с субстратами в отсутствие или в присутствии серийно разведенного Al-CPI в соответствующем буфере в течение 15 мин. Реакцию останавливали останавливающим буфером. Количество продукта измеряли флуорометрически при возбуждении при 360 нм и испускании при 460 нм. Ингибирующая активность Al-CPI выражалась как процент от общей активности, обнаруженной в реакциях без Al-CPI. Половинную максимальную ингибирующую концентрацию (IC 50 ) Al-CPI и его мутантов, основанную на начальных скоростях реакции, определяли с помощью нелинейного регрессионного анализа.
Кристаллизация и сбор рентгеновских данных
Мономерную форму Al-CPI, элюированную из колонки для исключения размера, использовали для скрининга кристаллизации. Концентрацию белка определяли с помощью набора для анализа белков Bio-Rad (Bio-Rad, Hercules, CA). Кристаллы получали из 0,2 М тригидрата ацетата натрия, 0,1 М тригидрата какодилата натрия, pH 6,5, и 30% мас. / Об. Полиэтиленгликоля 8000 (от Crystal Screen HT). Кристаллы выращивали методом диффузии паров сидя-капельки и микрозасеванием.Для сбора данных кристаллы замачивали в резервуарной жидкости с добавлением 20% глицерина в качестве криозащитного средства. Данные рентгеновской дифракции были собраны с разрешением 2,1 Å с помощью собственной системы Oxford Diffraction Gemini R Ultra (Оксфорд, Англия) и линии пучка 17U Шанхайской установки синхротронного излучения. Дифракционные изображения были проиндексированы и интегрированы с помощью Mosflm [31] и масштабированы с помощью SCALA из CCP4 [32]. Кристаллы принадлежали к пространственной группе P1. Параметры элементарной ячейки приведены в таблице 1.
Определение и уточнение структуры
СтруктуруAl-CPI определяли путем молекулярного замещения с использованием программы MOLREP [33] с цистатином куриного яичного белка (код PDB: 1CEW) в качестве модели поиска [20]. Структура была улучшена с помощью Refmac5 из пакета CCP4 и перестроена с помощью Coot [32], [34], [35]. Значения R / Rfree окончательных моделей составляют 0,202 / 0,256. Подробная статистика уточнения приведена в таблице 1. Все структурные рисунки были подготовлены PyMOL [36]. Координаты атомов и структурные факторы Al-CPI были депонированы в банке данных белков (PDB) с кодом доступа 4IT7.
Молекулярный докинг-анализ
Модели мутантов Al-CPI были созданы с использованием инструмента Design Protein в Discover Studio 3.11 (Accelrys Inc., Сан-Диего, Калифорния). Были построены и оптимизированы пять моделей мутантов Al-CPI. Докинг дикого типа и мутированного Al-CPI к различным катепсинам осуществляли с использованием ZDOCK из Discovery Studio 3.11. Al-CPI (дикого типа и мутантные формы) и катепсины рассматривали как лиганды и рецепторы соответственно. Коды PDB для катепсинов: 2IPP (катепсин B), 3PDF (катепсин C), 3HWN (катепсин L), 2FQ9 (катепсин S).В каждом из расчетов стыковки были сгенерированы две тысячи поз, а позы с оценкой ZDOCK выше 12 были уточнены в RDOCK. Для дальнейшего анализа были выбраны лучшие доработанные модели.
Статистический анализ
Статистический анализ выполняли с помощью программного обеспечения GraphPad Prism 5 (GraphPad Software Inc., Ла-Хойя, Калифорния). Достоверность различий между группами анализировали с помощью критерия Стьюдента t . Индивидуальные данные и среднее значение ± стандартное отклонение. группы представлены.Значение p <0,05 считалось значимым.
Результаты
Молекулярное клонирование и биологическая активность рекомбинантного Al-CPI
Библиотеку кДНК A. lumbricoides подвергали скринингу с помощью ОТ-ПЦР с использованием праймеров для согласованных последовательностей цистатинов, описанных у других паразитов нематод, и получали фрагмент гена CPI. Полноразмерный ген CPI из A. lumbricoides был получен методом RACE. Полная кДНК Al-CPI содержит открытую рамку считывания из 399 п.н., кодирующую 132 аминокислотных остатка.Биологическую активность рекомбинантного белка Al-CPI определяли путем тестирования его способности ингибировать протеолитическую активность катепсинов B, C, L и S. Рекомбинантный белок Al-CPI проявлял различные уровни ингибирующей активности по отношению к четырем катепсинам в дозе: зависимым образом (рис. 1). Al-CPI показал сильное ингибирование катепсина L, тогда как наблюдалось промежуточное ингибирование катепсина C, S и слабое ингибирование катепсина B (фиг. 1).
Рисунок 1. Ингибирующая активность против катепсина B, C, L и S рекомбинантным ингибитором цистеиновой протеазы Ascaris lumbricoides (Al-CPI).
Катепсины инкубировали с флуорогенными субстратами в отсутствие или в присутствии серийно разведенного Al-CPI в соответствующем буфере в течение 15 мин. и реакцию останавливали останавливающим буфером. Количество продукта измеряли флуорометрически при возбуждении при 360 нм и испускании при 460 нм. Ингибирующая активность Al-CPI выражалась как процент от общей активности, обнаруженной в реакциях без Al-CPI. Значения половины максимальной ингибирующей концентрации (IC 50 ) Al-CPI, основанные на начальных скоростях реакции, были определены с помощью нелинейного регрессионного анализа и показаны на каждом графике.Показаны данные одного из трех экспериментов.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0096069.g001
Конструктивная особенность Al-CPI
Для дальнейшего понимания молекулярного механизма взаимодействия между Al-CPI и его протеазами-мишенями была получена кристаллическая структура белка Al-CPI. Мономерная форма Al-CPI кристаллизовалась в пространственной группе P1 (таблица 1). В асимметричной единице четыре копии мономера Al-CPI. Структура мономера Al-CPI показывает обычную цистатиновую складку 2-го типа.Он имеет пятицепочечный антипараллельный β-лист, который оборачивается вокруг центральной α-спирали. От N-конца до C-конца Al-CPI содержит: N-концевой фрагмент (N), короткую β-цепь 1 (β1, остатки 9-11), α-спираль (17–32), β2 (31 –50), петля 1 (L1, 51–54), β3 (55–64), добавочная структура (AS, 65–86), β4 (87–96), петля 2 (L2, 97–101) и β5 (102 –112). Al-CPI также имеет два консервативных внутримолекулярных дисульфидных мостика между C68 и C78 и между C89 и C109 (рис. 2A). В окончательной модели пять N-концевых остатков были невидимы на карте электронной плотности и не моделировались.Подобно кристаллическим структурам комплекса цистатина и катепсина, описанным ранее другими [37], N-концевой фрагмент (G6-G7), петля 1 (V51-T54) и петля 2 (P97-F101) Al-CPI образуют клин сегмент, который, вероятно, вставляется в карман активности папаин-подобных цистеиновых протеаз таким образом, что Al-CPI может ингибировать активность протеазы.
Рисунок 2. Структура Al-CPI и структурное сравнение Al-CPI с цистатином CEW и цистатином человека C.
(A) Структура мономера Al-CPI.(B) Структурное сравнение Al-CPI (зеленый), цистатина CEW (голубой) и цистатина C (пурпурный) вокруг ядра α-спирали. (C) Структурное сравнение Al-CPI (зеленый), цистатина CEW (голубой) и цистатина C (пурпурный) вокруг сегмента активного сайта. (D) Выравнивание последовательностей пяти цистатинов типа 2 из A. lumbricoides , куриного яичного белка (CEW) и слюнной железы мягкого клеща (TS цистатин) и человеческого цистатина C и D. Аминокислотные остатки, частично сохраненные среди пяти цистатинов выделены синим цветом, а полностью сохраненные — красным.Аминокислотные остатки, обозначенные красной стрелкой, были выбраны для измерения расстояния, как показано в таблице 2.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0096069.g002
На сегодняшний день в PDB было обнаружено только пять уникальных структур цистатина типа 2. Они принадлежат к разным видам: цистатин CEW курицы ( Gullus gallus ), цистатин C, D и F человека ( Homo sapiens ) и цистатин слюны мягкого клеща ( Ornithodoros moubata ).Среди этих пяти структур цистатин CEW имеет наивысшую идентичность последовательности (34%) с Al-CPI, а цистатин C показывает наивысшее структурное сходство с Al-CPI с Z-оценкой 16,0 по данным сервера Dali [38]. Большинство этих структур цистатина, включая мутированную форму V57N цистатина C, являются мономерами. Единственным исключением является цистатин F, который был гликозилирован и образовал димер в структуре. Для сравнения структур этих похожих цистатинов было выполнено множественное выравнивание последовательностей с помощью Multalin. Затем измеряли расстояния между α-спиралью и другими частями цистатинов, используя Cα консервативных аминокислотных остатков (отмечены красной стрелкой на рис.2D). Расстояние между α-спиралью и β-листом было намного короче у Al-CPI и цистатина слюны клещей по сравнению с другими цистатинами. Расстояние между α-спиралью и сегментом активного центра (N, L1 и L2) было больше в Al-CPI и цистатине слюны, чем расстояние в других цистатинах (таблица 2). Поскольку цистатин слюны клещей очень похож на Al-CPI в этой локальной области, для ясности мы наложили только структуры Al-CPI с цистатином CEW и цистатином C. Как показано на рис. 2B и C, ядро α-спирали содержит много более плотно прилегает к β-слою в Al-CPI, чем в цистатине CEW и цистатине C; сегмент активного сайта (N, L1 и L2) удаляется от α-спирали и становится более открытым в Al-CPI.
Детальный анализ остатков, участвующих в межмолекулярной границе упаковки, показывает, что Al-CPI имеет некоторые уникальные особенности последовательности, не наблюдаемые в других цистатинах. Al-CPI имеет изолейцин (I29) в середине α-спирали, тогда как аминокислота в этом положении в других цистатинах представляет собой тирозин (рис. 2B). Напротив этого положения находится валин (V91) в Al-CPI, тогда как в других цистатинах вместо него присутствует фенилаланин. Объемные ароматические остатки отталкивают α-спираль от β-листа.Третья позиция — это I106 для Al-CPI, в то время как это серин в других цистатинах. Гидрофобный остаток (изолейцин) поможет упаковать α-спираль ближе к β-листу (чтобы стать гидрофобным ядром), чем гидрофильный остаток, такой как серин. Эти различия в последовательности также существуют в других цистатинах (данные не показаны). Интересно, что на границе раздела между сегментом активного сайта (N, L1 и L2) и α-спиралью Al-CPI содержит в основном полярные остатки, в то время как другие цистатины содержат в основном гидрофобные остатки (рис.2С). Следовательно, по сравнению с сегментом активного сайта Al-CPI, сегмент активного сайта других цистатинов упаковывается ближе к α-спирали.
Взаимодействие между Al-CPI и катепсинами
Докинг-анализ показал, что взаимодействие между Al-CPI и катепсином L в основном затрагивает гидрофобную бороздку в катепсине L (рис. 3A и B). h263 и C25, являясь ключевыми остатками, ответственными за активность катепсина, могут образовывать водородные связи с основными цепями G6, V51 и V52 в Al-CPI (рис.3C и D). Кроме того, P97 и W98 из Al-CPI будут упаковываться против L114, F145, W189 и W193 в катепсине L (фиг. 3E). Эти взаимодействия, выявленные с помощью стыковочного анализа, позволяют предположить, что три области Al-CPI (G6 N-концевого фрагмента, V51 и V52 петли 1 и P97 и W98 петли 2) могут быть важны для связывания Al-CPI с катепсинами. оказывать тормозящее действие.
Рисунок 3. Анализ стыковки Al-CPI с катепсином L.
(A) стыковка между Al-CPI и катепсином L.(B) поворот на 90 ° вокруг оси x с точки зрения (A). (C – E) Подробный анализ взаимодействий между катепсином L и Al-CPI на N-конце (C), петле 1 (D) и петле 2 (E). Остатки ингибитора (Al-CPI) обозначены буквой «i» после порядкового номера, чтобы отличить их от остатков фермента (катепсина).
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0096069.g003
Результаты ферментативного эксперимента показали самую сильную ингибирующую способность Al-CPI к катепсину L, но самую слабую — к катепсину B (рис.1). Чтобы лучше понять молекулярную основу этого различия, мы выполнили расчеты докинга для четырех катепсинов. Al-CPI проявляет наивысшее сродство связывания с катепсином L и самое низкое сродство с катепсином B среди четырех испытанных катепсинов (фиг. 4A и B; таблица 3). Расчеты стыковки подтверждают и дают возможное объяснение экспериментальных данных по ингибированию. Выравнивание последовательностей показывает, что активный сайт хорошо сохраняется для разных катепсинов (фиг. 4C, показано в красном прямоугольнике).Однако катепсин B имеет уникальную последовательность вставки (105–124) (рис. 4C, показано в синем прямоугольнике). Результаты стыковочного анализа показывают, что сегмент вставки катепсина B будет разрушаться с L2 Al-CPI, что приведет к снижению аффинности связывания и ингибирующей активности (фиг. 4B).
Рисунок 4. Структурная основа дифференциальной ингибирующей активности Al-CPI по отношению к катепсину L (кат. L) и катепсину B (кат. B).
(A) Молекулярный докинг был выполнен для Al-CPI и кат. L. (B) Докинг AL-CPI против кат.B предложил сегмент-вставку кат. B потерпит крах с L2 Al-CPI. (C) Выравнивание последовательностей четырех катепсинов, показывающее уникальный сегмент вставки Cat. Б.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0096069.g004
Активность ингибирования протеаз вариантов Al-CPI
Результаты структурного анализа, представленные выше, предполагают, что G6 N-концевого фрагмента, петля 1 и петля 2 Al-CPI являются критическими областями для связывания Al-CPI с протеазами.Чтобы проверить важность этих областей в функции Al-CPI, были созданы мутанты Al-CPI и протестированы на их активность по ингибированию протеаз. Резкие изменения в ингибировании протеаз наблюдались в двойных и комбинированных мутациях Q50E + V52G (мутант 3) и P97G + W98G (мутант 4) (мутант 5). Эти мутанты продемонстрировали значительно сниженную активность ингибирования катептинов (увеличенные значения IC 50 ) (фиг. 5). Мутации в критических сайтах связывания также привели к значительным изменениям расчетной аффинности связывания между вариантами Al-CPI и катепсином L (таблица 3).По сравнению с Al-CPI дикого типа, мутант V52G продемонстрировал слегка пониженную аффинность связывания с катепсином L, а также немного пониженную активность ферментативного ингибирования катепсина C и S. Однако мутации Q50E + V52G (петля 1) привели к большему снижению аффинность и активность ингибирования протеаз, чем одиночная мутация V52G. Из расчета стыковки мутант G6E показал пониженную аффинность связывания с катепсином L в большей степени, чем показанный мутантом V52G (таблица 3). Тем не менее, в ферментативном анализе ингибирующая активность была снижена в меньшей степени у мутанта G6E, чем у мутанта V52G (рис.5). Это несоответствие, вероятно, связано с некоторыми дополнительными эффектами, вызванными изменениями в области V52, которые не были учтены в расчетах стыковки.
Фиг. 5. Ингибирование протеазой Al-CPI дикого типа и мутантов.
IC 50 показаны значения Al-CPI дикого типа и пять мутантных форм катепсина B, C, L и S. Ингибирующую активность Al-CPI и его мутантов анализировали, как описано в Материалах и.
https: // doi.org / 10.1371 / journal.pone.0096069.g005
Обсуждение
Нематоды-паразиты, как известно, модулируют или подавляют иммунные ответы хозяина и, следовательно, защищают от развития аутоиммунных и аллергических заболеваний [2], [39], [40]. Хотя ИПЦ нематодных паразитов были тщательно изучены на предмет их иммуномодулирующей функции, знания об их детальных структурных особенностях все еще отсутствуют. Выяснение структуры и функциональной взаимосвязи паразитарных ИПЦ значительно облегчило бы открытие новой группы лекарств для лечения аллергических заболеваний.С этой целью мы исследовали структурные основы иммуномодулирующей функции CPI из A. lumbricoides . Мы идентифицировали N-концевой сегмент, петлю 1 и петлю 2 как ключевые области для связывания Al-CPI с катепсинами. Эти наблюдения согласуются с теми, о которых ранее сообщалось для других цистатинов [20], [21], [37]. Однако наши результаты далее показали, что только мутации в петле 1 и петле 2 значительно снижают ингибирующую активность Al-CPI. Докинг-анализ между Al-CPI и четырьмя катепсинами продемонстрировал различную аффинность связывания, которая соответствовала активности ингибирования, обнаруженной в ферментативном анализе.Al-CPI обладает меньшей ингибирующей активностью в отношении катепсина B по сравнению с C, L и S. Структурный и стыковочный анализ показал, что специфичность в основном обусловлена вставкой короткого сегмента в катепсин B, вызывая стерические препятствия для связывания Al-CPI. . Эти результаты раскрыли детали потенциального молекулярного взаимодействия между Al-CPI и протеазами, идентифицировали области, критические для функций ингибирования Al-CPI, и предоставили объяснение дифференциальной ингибирующей активности Al-CPI против четырех изученных катепсинов.
По сравнению с другими цистатинами типа 2, мы обнаружили, что цистатины паразитов (как Al-CPI, так и цистатин слюны клещей) имеют две уникальные структурные особенности: более плотное гидрофобное ядро и более открытый сегмент активного центра. Это могло быть связано с их функциями во время эволюции. В жизненном цикле паразита цистатины должны действовать не только на свои собственные протеазы, но и на протеазы хозяина. Относительно более плотное ядро может предотвратить легкое разложение цистатинов в хозяевах.Более открытый сегмент активного сайта может сделать цистатины более гибкими и доступными для связывания с целевой цистеиновой протеазой. Эта гипотеза должна быть подтверждена дальнейшими экспериментами.
В заключение, наши результаты продемонстрировали, что ингибитор цистеиновой протеазы из желудочно-кишечной нематоды человека, A. lumbricoides , имеет особый эффект на различные катепсины. Структурный анализ рекомбинантного белка Al-CPI выявил ключевые сегменты, участвующие в ферментативной функции этой паразитической молекулы.Эти наблюдения могут дать важную информацию о молекулярном механизме иммуносупрессии, связанной с гельминтозными инфекциями, и могут быть полезны для разработки противоаллергических иммуномодулирующих препаратов.
Благодарности
Мы благодарим сотрудников Центра по контролю заболеваний провинции Юньнань, Китай, за помощь в сборе человеческих паразитов, а также технических специалистов Центра инструментов Института биомедицины и здравоохранения Гуанчжоу за выполнение анализа проточной цитометрии.Мы также благодарим сотрудников линии пучка BL17U1 Шанхайского центра синхротронного излучения (SSRF) в Китае за поддержку в сборе данных дифракции рентгеновских лучей.
Вклад авторов
Задумал и спроектировал эксперименты: GM ZS JL. Проведены эксперименты: GM JD ZL SL YL MS GL. Проанализированы данные: GM JD. Написал статью: GM ZS JL.
Ссылки
- 1. Brooker S (2010) Оценка глобального распространения кишечных нематодных инфекций и бремени болезней: сложение чисел — обзор.Int J Parasitol 40: 1137–1144.
- 2. McSorley HJ, Maizels RM (2012) Гельминтные инфекции и иммунная регуляция хозяина. Clin Microbiol Rev 25: 585–608.
- 3. Nacher M, Singhasivanon P, Yimsamran S, Manibunyong W., Thanyavanich N, et al. (2002) Инфекции кишечных гельминтов связаны с увеличением заболеваемости малярией Plasmodium falciparum в Таиланде. J Parasitol 88: 55–58.
- 4. Flohr C, Tuyen LN, Lewis S, Quinnell R, Minh TT, et al.(2006) Плохая санитария и заражение гельминтами защищают от сенсибилизации кожи у вьетнамских детей: перекрестное исследование. J Allergy Clin Immunol 118: 1305–1311.
- 5. Селасси Ф.Г., Стивенс Р.Х., Куллинан П., Причард Д., Джонс М. и др. (2000) Общий и специфический IgE (клещ домашней пыли и кишечные гельминты) у астматиков и контрольной группы из Гондэра, Эфиопия. Clin Exp Allergy 30: 356–358.
- 6. Ньян О.А., Валравен Г.Е., Баня В.А., Миллиган П., Ван дер Санде М. и др.(2001) Атопия, кишечная гельминтозная инфекция и общий сывороточный IgE у взрослых жителей Гамбии в сельских и городских районах. Clin Exp Allergy 31: 1672–1678.
- 7. Dowling DJ, Noone CM, Adams PN, Vukman KV, Molloy SF и др. (2011) Ascaris lumbricoides pseudocoelomic body fluid индуцирует частично активированный фенотип дендритных клеток со способностью стимулировать Th3 in vivo. Int J Parasitol 41: 255–261.
- 8. Джонстон MJ, MacDonald JA, McKay DM (2009) Паразитические гельминты: фармакопея противовоспалительных молекул.Паразитология 136: 125–147.
- 9. Harnett W, Harnett MM (2010) Иммуномодуляторы гельминтов: может ли понимание червя произвести таблетку? Nat Rev Immunol 10: 278–284.
- 10. Дайничи Т., Маэкава Ю., Исии К., Чжан Т., Нашед Б.Ф. и др. (2001) Ниппоцистатин, ингибитор цистеиновой протеазы из Nippostrongylus brasiliensis, подавляет процессинг антигена и модулирует антиген-специфический иммунный ответ. Заражение иммунной 69: 7380–7386.
- 11. Шонемейер А., Люциус Р., Зонненбург Б., Браттиг Н., Сабат Р. и др.(2001) Модуляция человеческих Т-клеточных ответов и функций макрофагов онхоцистатином, секретируемым белком филяриальной нематоды Onchocerca volvulus. J Immunol 167: 3207–3215.
- 12. Хартманн С., Люциус Р. (2003) Модуляция иммунных ответов хозяина цистатинами нематод. Int J Parasitol 33: 1291–1302.
- 13. Riese RJ, Chapman HA (2000) Катепсины и компартментализация в презентации антигена. Curr Opin Immunol 12: 107–113.
- 14. Chapman HA (2006) Эндосомные протеазы в презентации антигена.Curr Opin Immunol 18: 78–84.
- 15. Парк Б., Бринкманн М.М., Спунер Э., Ли С.К., Ким Ю.М. и др. (2008) Протеолитическое расщепление в эндолизосомном компартменте необходимо для активации Toll-подобного рецептора 9. Nat Immunol 9: 1407–1414.
- 16. Тюрк В., Брзин Дж., Котник М., Ленарчич Б., Попович Т. и др. (1986) Цистеиновые протеиназы человека и их белковые ингибиторы стефины, цистатины и кининогены. Biomed Biochim Acta 45: 1375–1384.
- 17. Rawlings ND, Barrett AJ (1990) Эволюция белков надсемейства цистатина.J Mol Evol 30: 60–71.
- 18. Отто HH, Schirmeister T (1997) Цистеиновые протеазы и их ингибиторы. Chem Rev 97: 133–172.
- 19. Барретт А.Дж., Фриц Х., Грабб А., Иземура С., Ярвинен М. и др. (1986) Номенклатура и классификация белков, гомологичных ингибитору цистеин-протеиназы куриному цистатину. Biochem J 236: 312.
- 20. Боде В., Энг Р., Мусил Д., Тиле Ю., Хубер Р. и др. (1988) Рентгеновская кристаллическая структура цистатина белка куриного яйца 2.0A и его возможный способ взаимодействия с цистеиновыми протеиназами.EMBO J 7: 2593–2599.
- 21. Стаббс М.Т., Лабер Б., Боде В., Хубер Р., Джерала Р. и др. (1990) Уточненная рентгеновская кристаллическая структура 2.4A рекомбинантного человеческого стефина B в комплексе с цистеиновой протеиназой папаина: новый тип взаимодействия ингибитора протеиназы. EMBO J 9: 1939–1947.
- 22. Мартин Дж. Р., Крейвен С. Дж., Джерала Р., Кроон-Зитко Л., Зеровник Е. и др. (1995) Трехмерная структура раствора стефина человека A. J Mol Biol. 246: 331–343.
- 23.Альварес-Фернандес M, Liang YH, Abrahamson M, Su XD (2005) Кристаллическая структура человеческого цистатина D, ингибитора цистеинпептидазы с ограниченным профилем ингибирования. J Biol Chem 280: 18221–18228.
- 24. Janowski R, Kozak M, Abrahamson M, Grubb A, Jaskolski M (2005) человеческий цистатин C с замененным доменом 3D с амилоидоподобными межмолекулярными бета-листами. Белки 61: 570–578.
- 25. Schuttelkopf AW, Hamilton G, Watts C, van Aalten DM (2006) Структурная основа редукционно-зависимой активации человеческого цистатина F.J Biol Chem. 281: 16570–16575.
- 26. Orlikowska M, Jankowska E, Kolodziejczyk R, Jaskolski M, Szymanska A (2011) Мутация шарнирной петли может использоваться для контроля замены 3D-домена и амилоидогенеза человеческого цистатина C. J Struct Biol. 173: 406–413.
- 27. Салат Дж., Паесен Г.К., Резакова П., Коцифакис М., Коварова З. и др. (2010) Кристаллическая структура и функциональная характеристика иммуномодулирующего слюнного цистатина мягкого клеща Ornithodoros moubata.Biochem J 429: 103–112.
- 28. Хансен Г., Хайтманн А., Витт Т., Ли Х., Цзян Х. и др. (2011) Структурная основа регуляции активности цистеин-протеазы новым классом ингибиторов протеаз у Plasmodium. Структура 19: 919–929.
- 29. Лю С., Донг Дж., Мэй Дж., Лю Дж., Сюй В. и др. (2011) Кристаллизация и предварительные кристаллографические исследования ингибитора цистеиновой протеазы из паразита нематод человека Ascaris lumbricoides. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 67: 228–230.
- 30. Dolenc I, Turk B, Pungercic G, Ritonja A, Turk V (1995) Олигомерная структура и субстрат, индуцированный ингибированием человеческого катепсина C. J Biol Chem. 270: 21626–21631.
- 31. Leslie AGW, Powell HR (2007) Обработка дифракционных данных с помощью MOSFLM. Развитие методов кристаллографии макромолекул 245: 41–51.
- 32. Collaborative Computational Project N (1994) Пакет CCP4: программы для кристаллографии белков. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 50: 760–763.
- 33. Тепляков А.В.АА (1997) МОЛРЕП: автоматизированная программа для молекулярного замещения. J Appl Cryst 30: 1022–1025
- 34. Муршудов Г.Н., Скубак П., Лебедев А.А., Панну Н.С., Штайнер Р.А. и др. (2011) REFMAC5 для уточнения структур макромолекулярных кристаллов. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 67: 355–367.
- 35. Эмсли П., Коутан К. (2004) Кут: инструменты построения моделей для молекулярной графики. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 60: 2126–2132.
- 36. ДеЛано В. (2002) Система молекулярной графики PyMOL.
- 37. Енко С., Доленц И., Гункар Г., Доберсек А., Подобник М. и др. (2003) Кристаллическая структура Стефина А в комплексе с катепсином H: N-концевые остатки ингибиторов могут адаптироваться к активным сайтам эндо- и экзопептидаз. J Mol Biol 326: 875–885.
- 38. Холм Л., Розенстром П. (2010) Сервер Дали: сохранение карт в 3D. Nucleic Acids Res 38: W545–549.
- 39.Kabeerdoss J, Pugazhendhi S, Subramanian V, Binder HJ, Ramakrishna BS (2011) Воздействие анкилостомы у пациентов с болезнью Крона: исследование случай-контроль. Алимент Pharmacol Ther 34: 923–930.
- 40. Сантьяго ХК, Беннуру С., Бойд А., Эберхард М., Нутман ТБ (2011) Структурная и иммунологическая перекрестная реактивность между филяриатным и клещевым тропомиозином: последствия для гигиенической гипотезы. J Allergy Clin Immunol 127: 479–486.
Шаблоны принадлежности хоста в Гватемале
Хост
ffiliation
o /
Ascaris
FLOCKHART, H.A., CIBULSKIS, R., KARAM,
M. & ALBIEZ,
E.
J.
(1986).
Onchocerca
oolvulus:
фермент
полиморфизм
в
связь с дифференциацией леса
и саванны
штаммы паразита
.
Сделки Королевского
Общества
тропической медицины и гигиены
80,
285-92.
КАЛЬВИН, р.
1.
(1968).
Развитие
человек
и
свинья
Аскариды
свиньи
и кролик.
Журнал
из
Паразитология 54,
1085-91.
GUYATT, H. L., BUNDY, D. A. P., MEDLEY,
G. F. & GRENFELL,
e. р.
(1990).
Взаимосвязь
между частотой
распространения
Ascaris
lumbricoides и распространенностью
и интенсивностью
инфекции
в человеческих сообществах
.
Паразитология 101, 139-45.
cvLLENSTEN, u. & wrLSoN, а. c.
(1987).
Межвидовой
Перенос митохондриальной ДНК и колонизация
Скандинавии мышами. Генетические исследования 49,25-9.
HARTL, D. L.
и
cLARK, e.
г.
(1989).
Принципы
Популяционной генетики. Сандбрланд, Массачусетс:
Sinauer Associates,
Inc.
HAwLEy,
J.
H.
и
e.EANASKEv, R.
1. Q992).
Ascaris suum;
являются трипсином
ингибиторами
вовлечены
в
видоспецифичность
аскарид
нематод? Experimental Parasitology 75,
112-18.
HE, L., MrN, x. T., Lru, G.2., Xu,
p.
и Lr, ш.
(1986).
Предварительные исследования кариотипа Ascaris lumbricoides
и Ascaris suum frorn Guangzhon.
Журнал
из
Паразитология и паразитарные болезни
4, 206-8.
HvMAN,
B. c.
(1988).
Митохондриальная ДНК нематод:
аномалии и применение.
Журнал
нематологии
2O,
523 31.
JAENIKE, f.
(1993).
Быстрая
эволюция
хозяин
специфичность
в
паразитическая нематода
.Эволюционная экология 7, 103-8.
KENNEDY,
M. W.,
QURESHI,
F., HASWELL-ELKINS, M. &
ELKINS, o. е.
(1987).
Гомология и гетерология
секретируемых антигенов
паразитарных
личинок
стадий Ascaris lwnbricoides ar.d Ascaris suum.
Клиническая
и экспериментальная иммунология
67, 2V30.
КоФИЭ, Б.A. K. & DIPEoLU, o. о.
(1983).
A
исследование
человека
и
свиней
Аскаридоз в
сельской местности
на юго-западе
Нигерии. Международный
Журнал
зоонозов tO,
66-70.
KURIMoro, н.
(1974).
Морфологические, биохимические и
иммунологические исследования на
различиях между
Ascaris lumbricoides
Linnaeus, 1758
и
Ascaris suum
Goeze, 7782.
Японский журнал
oJ Parasitology 23,
251 67.
LA ROSA,
c.,
pozro,
E., ROSST,
p.
и MURRELL, K. D.
(1992).
Аллозимный анализ изолятов трихинелл из различных
видов хозяев и
географических
регионов.
Журнал
из
Паразитология 78, 641 6.
LEHMAN, N., EISENHAWER, A., HANSEN, K., MECH, L.
D.,
PETERSON, R.O., GOGAN,
p.
J.
p.
& WAYNE,
н. р.
(1991).
Интрогрессия митохондриальной ДНК койота в
симпатрических
Североамериканских
серых
волков
популяций.
Etolution 45, 104-19.
LESLIE,
J.
F., CAIN, G.
D.,
MEFFE, G.
K.
и VRIJENHOEK,
R. C.
(1980).
Фермент
Полиморфизму Ascaris suum
(Nematoda).
Журнал
из
Паразитология
68, 576-87.
LBWoNTIN, R. c. & HUBBY,
1.
(966).
A
молекулярный
подход к изучению
генетической
гетерозиготности в
природных
популяциях.
II. Количество
вариации
и
степени гетерозиготности
в природных популяциях
из
Drosophila
pseudobscura.
Генетика 54, 595-609.
ЖИЗНЬ, г. вт.
(1989).
Адаптация паразитами
трематода
333
до
локальные
популяции
из
его
улитка
хозяин.Eaolution 43,
1663-7 т.
LoRD, ж. Д. И БУЛЛОК,
в.
г.
(1982)
Поражение свиней у
человек. Nezl England
Journal
of Medicine
306,
1 1 13.
LYDEARD, C.,
MULVEY,
M., AHO,
J.
M. & KENNEDY, PK
(1989).
Генетическая изменчивость среди
природных
популяций
из
печеночных двуусток Fascioloides magna
у белохвостого оленя
, Odocoileus z; irginianus.Канадский
Журнал
из
Зоология 67,2O2l-5.
LYMBERRY, A.
J.,
THOMPSON, R. C. A. и
HOBBS, R. P.
(1990).
Генетическое разнообразие и
генетическое
дифференциация
в
Echinococcus
granulosus (Batsch,
1786) от домашних
и
лесных хозяев
на материке
Австралия из
.Par asitology l0l, 283-9.
LyNcH, M. & CREASE, r.1.
(1990).
Анализ
из
населения
данных обзора ДНК
вариации последовательности.
Molecular
Biology and Eaolution
7, 377-94.
LysEK, H.
(1963).
Вклад
в морфологическую проблему
различий
между Ascaris lumbricoides
Linne, 1758
и
Ascaris
suum
Goeze, 1782.
Acta
S
ocietatis Zoologicae Bohemosloaenicae
27, 97
-l0t.
MALYNIcZ, c.t-.
(1977).
Демографический анализ
из
высокогорная деревня
свиноводство.
In
Десятый Вайгани
Семинар по сельскому хозяйству в тропиках,
(изд.
Enyi,
B.A.C.
& Varghese,
T.)
с.
201-209. Папуа
Новый
Технологический университет Гвинеиl.
Лаэ, Папуа
Новый
Гвинея.
МАУНГ,
г.
(1973).
Ascaris
lumbricoides
Linne, 1758 и
Ascaris suum
Goeze,
1782: морфологические различия
между экземплярами
получены
от
человека
и
.
Юго-Восточная Азия
Journal
of Tropical
Medicine
and
Public
Health
4, 41-5.
MAvR,
E.
(1969).
Животные
Виды
и Eaolution.
Кембридж, Массачусетс: Belknap
Press
из
Гарвард
University
Press.
МТЛЛЕР,
I.
г.
(1991).
RESTSITE:
филогенетическая программа
, которая сортирует исходные данные о сайтах рестрикции.
Журнал
oJ
Наследственность 82, 262-3.
МУТАФОВА, Т.
(1983).
Сравнительное кариологическое исследование
Ascaris lumbricoides
и
Ascaris suum.
Helminthologia 15, 48
56.
NADLER, s.а.
(1987).
Биохимические и иммунологические
систематика некоторых
аскаридоидов
нематод:
генетических
расхождений между
конгенерами.
Журнал
из
Паразитология
73,81.1-16.
NASCETTI, e., ERApELLr, c. И БУЛЛИНИ,
р.
(1979).
Ricerche
различных видов Ascaris lumbricoides
и Ascaris
suum.Rendiconti delle Sedute della
Accademia
Nazionale dei Lincei,
Classe di Scienze
Fisiche,
Matematiche e
Naturali LXVII,
457
-465.
NEvo, E.
(1978).
Генетические
вариации в естественных
популяциях:
паттерны
и теория.
Теоретическая
Популяционная биология 13, 127 77.
NTcKRENT, D.L. & srELL, e. л.
(1990).
Электрофоретические
доказательства дифференциации двух
хозяев
рас
Hemlock Dwarf Mistle
пальца ноги
(Ar
c euthobium
tsug Ens 18
e)
267System Bi.
-80.
OKIMOTO,
R., MACFARLANE,
J.
L.,
CLARY, D. O. &
WoLSTENHoLME, D.
р.
(1992).
Митохондриальные
геномы
двух нематод, Caenorhabditis
elegans и
Ascaris suum.
Генетика
130, 471-98.
PASTEUR, N., PASTEUR, G., BONHOMME,
F.,
CATALAN,
J.
и
BRIrroN-DAVIDIAN,
J.
(1988).
Практический
Изоцим
Генетика.
Chichister:
Ellis
Horwood
Ltd.
Являются ли Ascaris lumbricoides и Ascaris suum одним видом? | Паразиты и переносчики
Паразиты многоклеточных животных отряда Ascaridida (Phylum Nemata: Class Secernentea) подразделяются на несколько семейств, которые встречаются в широком диапазоне хозяев во всем мире [1]. Млекопитающие, от сумчатых до человеческих и нечеловеческих приматов, птиц, рептилий и рыб, служат обычными хозяевами [1–3]. Копролиты игуанодонтов, датируемые 100 миллионами лет назад, оказались положительными на яйца аскарид [4].Хотя встречаются у многих разных хозяев, виды в этой группе морфологически консервативны, с небольшими вариациями между группами [5].
Ascaris lumbricoides Linnaeus 1758 является паразитом Homo sapiens , а Ascaris suum Goeze 1782 встречается у свиней ( Sus scrofa Linnaeus 1758). Эти две аскариды, вероятно, были признаны людьми с доисторических времен из-за их численности, размера взрослых особей, симптомов и распространения. Яйца обычно встречаются в копролитах, кишечном содержимом мумий и в других археологических материалах [6].Из-за их поразительного сходства было предложено несколько гипотез, объясняющих их происхождение от соответствующих хозяев. 1) Первая гипотеза: Ascaris lumbricoides (обычно заражает людей) и Ascaris suum (зарегистрировано в основном от свиней) являются действительными видами. В этом случае эти два вида произошли в результате видообразования от общего предка, вероятно, когда-то до одомашнивания свиней людьми. Нет никаких записей о Ascaris от человекообразных обезьян, поэтому эта гипотеза мало подтверждена.2) Ascaris lumbricoides у человека происходит непосредственно от вида A. suum , обнаруженного у свиней с A. suum , который тогда существовал как постоянный предок. В этом случае вид A. lumbricoides мог возникнуть в результате аллопатрического события смены хозяина (свиньи на человека). 3) Ascaris suum происходит непосредственно от A. lumbricoides с постоянным предком A. lumbricoides и A. suum , которые являются более новыми видами.Точно противоположно 2 выше. Наконец, гипотеза 4) утверждает, что: Ascaris lumbricoides и A. suum являются конспецифичными, эта гипотеза подтверждается исследованиями, показывающими как низкую морфологическую, так и низкую генетическую дивергенцию (низкие генетические дистанции) в нескольких генах. Ascaris lumbricoides считается паразитом с относительно долгой историей ассоциации с Homo sapiens [7, 8], и до настоящего времени ни классическая таксономия, ни молекулярная генетика не смогли установить, существует ли один или два различных вида. .Однако была предложена конкретная принадлежность хоста [9–11]. Представления и теории о происхождении Ascaris spp. будет кратко рассмотрено паразитарное заболевание у человека и свиньи-хозяина.
Паразитологические доказательства
Вероятно, основной причиной появления двух принятых видов, A. lumbricoides и A. suum , было обнаружение взрослых червей в кишечнике двух разных хозяев, человека и свиньи. Яйца, обнаруженные в фекалиях, идентичны морфологически, но взрослые черви двух видов имеют небольшие различия в морфологических характеристиках, которые можно использовать для их различения [12].Попытки экспериментального заражения были успешными в установлении нематод у свиней с помощью яиц червей, собранных у людей, и наоборот, и жизненный цикл паразита завершился у обоих хозяев [13-17] ([см. [11]]). Сообщалось также о случайном лабораторном заражении человека яйцами Ascaris , извлеченными от свиней [18]. Тем не менее, в другом отдельном эксперименте яиц аскарид с типичным для человека генотипом не смогли созреть у свиней [19]. Также было показано, что если предпринимается попытка перекрестного заражения от человека к свиньям, оказывается, что для заражения свиней-хозяев требуется очень большая инфекционная паразитарная нагрузка [7].Таким образом, до сих пор нет единого мнения о возможностях инфицирования этих двух видов Ascaris .
Гипотезы переключения хозяев и последующего видообразования, представленные выше, также были предложены для объяснения происхождения Trichuris trichiura у людей и Trichuris suis у свиней [20]. Однако T. trichiura у людей в настоящее время считается так называемым «семейным видом», который является общим для людей и обезьян и унаследован от общего предка приматов [21].Эту гипотезу подтверждают три аспекта биологии видов Trichuris [20]: а) Trichuris spp. Встречаются у нечеловеческих приматов Старого Света, и наиболее распространенными видами являются T. lemuris у Lemuroidea, T. cynocephalus и T. presbyticus у Cercopithecoidea и T. trichiura у Hominoidea. Этот последний паразит был распространен в другие части мира в результате миграции доисторических людей; б) паразитарная экологическая адаптация хозяина — с учетом более короткого периода до получения патента, созревания яиц и большей продолжительности жизни T.взрослые черви trichiura по отношению к T. suis, T. trichiura лучше адаптированы к человеку-хозяину, чем T. suis к свиньям; в) палеопаразитологические данные показали яиц T. trichiura яиц в археологическом материале человеческого происхождения задолго до одомашнивания свиней [6].
При рассмотрении этих аспектов применительно к Ascaris spp. Факты о людях и свиньях вызывают некоторое противоречие. Ascaris видов менее разнообразны у приматов Старого Света по сравнению с Trichuris spp.и, по сравнению с экологической адаптацией, взрослые черви A. lumbricoides у людей имеют более длительную продолжительность жизни, что свидетельствует о возможной лучшей адаптации к людям, чем A. suum к свиньям. Однако период созревания яиц и предпатентные периоды A. suum у свиней короче по сравнению с A. lumbricoides у людей
Успех экспериментальных инфекций или наличие естественных инфекций у других хозяев, таких как грызуны, собаки и другие животные. -человеческие приматы, среди прочего, были зарегистрированы как для A.suum и / или A. lumbricoides ([19, 22–30] см. [11]). Имеются также записи об инфекциях у приматов, не являющихся людьми, живущих в естественных или аналогичных условиях [23, 26, 29]. В большинстве случаев инфекция была диагностирована с помощью паразитологического анализа кала, поэтому невозможно было различить инфекцию A. suum или A. lumbricoides , так как невозможно различить два вида по их яйцам (см. Выше) . Таким образом, происхождение инфекции Ascaris неясно, если приматы находятся в тесном контакте с дикими свиньями.Южноамериканские дикие свиньи ( Tayassu pecari (Link, 1759) и Pecari tajacu (Linnaeus 1758)) также были инфицированы Ascaris sp. [31, 32]. Однако эти результаты должны вызывать подозрение, поскольку они могут отражать перекрестную инфекцию от домашних свиней или даже людей.
Палеонтологические, археологические и палеопаразитологические свидетельства
Самая старая находка Ascaris spp. яйца у людей были обнаружены на основе археологических материалов, датированных 30 000 лет назад (BP) [33], за много тысяч лет до приручения свиней 10 000 лет назад [34].В этом исследовании не было доказательств наличия свиней в археологическом контексте, но также не было четко подтверждено, что органический осадок имеет человеческое происхождение. Образцы были взяты из пещеры, в которой в прошлом жили как современные люди, так и пещерные медведи, поскольку было идентифицировано костяных останков Ursus spelaeus . Хотя современные медведи заражены аскаридами, авторы пришли к выводу, что яйца были человеческого происхождения [33]. Таким образом, на основании археологического контекста был поставлен диагноз яиц A. lumbricoides.Необходимы дальнейшие исследования, чтобы подтвердить эту крайнюю древность для A. lumbricoides . Эти данные остаются самым старым отчетом о предполагаемом инфицировании человека A. lumbricoides . Следовательно, для подтверждения этих данных и древней ассоциации паразит-хозяин необходимо представить больше образцов для палеопаразитологического анализа.
Люди и свиньи появились как виды за миллионы лет до приручения свиней. Инфраотряд Suina состоит из видов, относящихся к двум семействам — Suidae и Tayassuidae.Палеонтологические данные свидетельствуют о том, что к концу олигоцена (23 миллиона лет назад) Suidae диверсифицировались в Европе, Азии и Африке, а члены семейства Tayassuidae появились в Северной и Южной Америке к концу эоцена (34 миллиона лет назад) [35 Появление человекообразных обезьян датируется периодом от 24 до 16 млн лет, а молекулярные данные указывают на расхождение предков человека и человекообразных обезьян, которое оценивается в 9–7 млн лет [35, 36]. та же среда задолго до того, как произошла одомашнивание свиней, что потенциально способствовало передаче паразитов от одного хозяина к другому.Люди охотились на диких свиней с начала эоцена, но более тесный контакт установился с одомашниванием [34].
После приручения свиней контакт между хозяевами способствовал переносу Ascaris sp. человеческого и свиного происхождения, способствуя адаптации к тому или иному хозяину. Современные примеры этого тесного контакта были зарегистрированы в общинах южноамериканских индейцев [37], где подсосных диких свиней Нового Света ( T. pecari, P. tajacu ) принимали и кормили женщины (рис. 1).Некоторые индийские группы включают ритуалы, в которых поведение свиней включается и разыгрывается молодыми воинами [38]. Существуют древние культурные и религиозные представления о тесном контакте людей и свиней в Европе и Азии [34, 39], в том числе древняя зубная щетка из свиной щетины (рис. 2).
Рисунок 1Уроженец гуахи с северо-востока Бразилии, кормящий грудью дикую свинью . Источник: Писко Дель Гайсо, Фолья де Сан-Паулу — Бразилия, 1992. Авторы получили разрешение от правообладателей Писко Дель Гайсо, Фолья де Сан-Паулу — Бразилия на воспроизведение изображения в этой публикации.
Рисунок 2Зубная щетка происхождения . Авторы подтверждают, что они получили разрешение от Мойзеса Гонсалвеса на воспроизведение изображения в этой публикации. Изображение изначально было опубликовано на http://www.moizazine.com.br.
Принимая во внимание вышеупомянутые обсуждения, аскариды были обнаружены сегодня как у диких свиней, так и у нечеловеческих приматов в естественных или близких к естественным условиям [23, 26, 29]. Это могло произойти и в прошлом.
Данные молекулярной биологии
Первые попытки разделить два вида Ascaris человека и свиньи были направлены на идентификацию конкретных молекулярных маркеров.Исследования в основном проводились в Китае, где высокие показатели распространенности обнаружены как у свиней, так и у людей, а фекалии свиней используются в качестве удобрений [9, 10]. Интерес к этой теме возрос после описания «перекрестных инфекций» в Северной Америке и Дании [9, 18, 40].
Зооноз характеризуется заражением человека-хозяина паразитом дикого или домашнего животного [3]. Относительно Ascaris sp. у домашних свиней из-за частоты применения глистогонных препаратов и высоких доз случаи резистентности были зарегистрированы у нескольких животных [41].Следовательно, зоонозный потенциал и возможные случаи устойчивости к червям могут изменить стратегии общественного здравоохранения по борьбе с аскаридозом в человеческих сообществах [9, 42].
Были проведены молекулярно-эпидемиологические исследования для различения двух видов Ascaris [43]. ПЦР-ПДРФ (полимеразная цепная реакция — полиморфизм длины рестрикционного фрагмента) применяли для идентификации различных профилей рестрикции для Ascaris sp. как человека, так и свиньи, используя ядерную область ITS 1 (внутренний транскрибируемый спейсер-1) в качестве молекулярной мишени [44].В провинциях Китая было обнаружено пять генотипов паразитов (G1-G5) для людей и свиней с использованием одной и той же молекулярной мишени [45]. Хотя генотип G1 связан в основном с людьми, а G3 встречается в основном у свиней, общие генотипы Ascaris были обнаружены у обоих хозяев. Внутрииндивидуальная высокая вариабельность изолятов Ascaris sp. с использованием в качестве мишени области ITS 1 была обнаружена в Бразилии, что привлекло внимание к проблемам использования этой мишени для генотипа Ascaris spp.человеческого и свиного происхождения [46].
Другие молекулярные маркеры были предложены и использованы для изучения молекулярной эпидемиологии Ascaris spp. Митохондриальные маркеры (субъединица 1 цитохром-с-оксидазы ( cox 1) и субъединица 1 НАДН-дегидрогеназы ( nad 1)) были использованы в образцах из шести провинций Китая [47]. Авторы обнаружили для гена cox 1 10 различных гаплотипов Ascaris spp. у человека-хозяина (h2-h20) и 10 для свиней (P1-P10).Для и 11 различных гаплотипов Ascaris spp. были обнаружены у человека-хозяина (h2-h21) и 15 у свиней (P1-P15). Хотя авторы считали низкий генетический поток между этими видами, результаты показали общий гаплотип для Ascaris sp. человеческого и свиного происхождения для гена cox 1. Микросателиты также использовались для изучения молекулярной эпидемиологии Ascaris spp. показывая, что, вероятно, произошла гибридизация между популяциями червей человеческого и свиного происхождения, что может иметь значение для программ контроля Ascaris [42].В последнее время возможны случаи аскаридоза человека от свиней Ascaris sp. были зарегистрированы в Японии [48]. Кроме того, недавние последовательности, доступные в Genbank от людей и нечеловеческих приматов, идентичны генотипам или гаплотипам свиней. В 2011 г. был секвенирован полный геном мтДНК A. lumbricoides , что показало, что полный геном A. lumbricoides mt отличается от A. suum всего на 1,9% [49]. На основании высокого сходства нуклеотидных и аминокислотных последовательностей полных A.suum и A. lumbricoides mt, авторы сочли, что оба могут представлять один и тот же вид.
Перспективы или утопия
Происхождение таниидных ленточных червей, обнаруженных у человека, включая Taenia solium, T. saginata и T. asiatica , было проверено с применением филогенетических систематических методов последовательностей ДНК [50]. Человеческие ленточные черви похожи на виды, встречающиеся у кошачьих, диких псовых и африканских гиен. Типичный жизненный цикл таниид включает плотоядного окончательного хозяина и травоядного промежуточного хозяина; Яйца ленточных червей, которые эти плотоядные животные выводят с фекалиями, попадают в организм травоядных.Гоминиды заразились и стали окончательным хозяином, поедая травоядных животных, инфицированных личинкой ленточного червя. Взрослые особи обычно встречаются у других симпатрических хищников-падальщиков, таких как гиены. После смены хозяев произошло событие видообразования, и люди сохранили два своих собственных вида — Taenia . Следовательно, эти человеческие цестоды адаптировались к свиньям и крупному рогатому скоту в качестве промежуточных хозяев через некоторое время после одомашнивания этих животных. Исследования молекулярной биологии показывают, что Homo erectus интродуцировал T.asiatica в Азии, а другие человеческие виды Taenia были завезены в Америку только после Колумба [51–53]. Генетические и палеопаразитологические данные подтверждают эту гипотезу в связи с тем, что Taenia sp. яйца до сих пор были обнаружены в доколумбовых археологических материалах Южной Америки.
Принимая во внимание данные, представленные выше, «сравнительный метод» потребовал бы широкого изучения генетики Ascaris spp. у современных людей и свиней из разных регионов мы также рекомендуем провести широкий обзор других позвоночных-хозяев после Taenia sp.модель (см. методы в Gardner [54] и Gardner and Jimenez-Ruiz [55]). У Ascaris sp. исследованиями можно включить археологический материал Нового и Старого Света [6], а также восстановить ДНК древних паразитов для сравнения с современными последовательностями.
Методы молекулярной палеопаразитологии были применены к Ascaris spp. [56–58]. Однако для накопления твердых доказательств необходимо исследовать больше образцов, а также другие молекулярные мишени. Другая трудность состоит в том, что копролиты человека встречаются в археологических раскопках в большем количестве, чем копролиты свиней.
Филогенетические отношения нематод, классифицируемых как Ascaridoidea, были оценены Надлером и Хадспетом [59] на основе совокупного экономичного анализа доказательств комбинации морфологии и одного митохондриального и двух ядерных генов. Их исследование показывает, что A. lumbricoides и A. suum являются сестринскими таксонами, имеющими общего предка с Parascaris equorum , большой аскаридой лошадей. Поскольку у этих видов есть самый недавний общий предок, невозможно отнести A.suum или A. lumbricoides в позиции «более производные виды». Надлер и Хадспет [59] отмечают, что в своем исследовании A. lumbricoides имел 7 однозначных молекулярных аутапоморфий, в то время как A. suum имел одну аутапоморфию рДНК, и что уровень генетической дифференциации (генетическая дистанция) был низким, показывая наименьшую попарную аутапоморфию. расстояние между всеми таксонами, включенными в их анализ.
Ингибирование металлопептидазы млекопитающих на защитном барьере паразита аскарид
Abstract
Круглые черви рода аскариды — распространенные паразиты желудочно-кишечного тракта человека.Батарея селективных ингибиторов защищает их от ферментов хозяина и иммунной системы. В данном случае ингибитор металлокарбоксипептидазы (MCP), ACI, был идентифицирован в экстрактах белка из Ascaris с помощью масс-спектрометрии MALDI-TOF с уменьшением интенсивности. Аминокислотная последовательность из 67 остатков ACI не показала значительной гомологии с каким-либо известным белком. Гетерологичная сверхэкспрессия и очистка ACI привели к получению функциональной молекулы с наномолярными константами равновесной диссоциации против MCP, что указывает на предпочтение MCP пищеварительных и тучных клеток A / B-типа.Вестерн-блоттинг и иммуногистохимия обнаружили ACI в стенке тела, кишечнике, женских половых путях и оплодотворенных яйцах Ascaris в соответствии с его целевой специфичностью. Кристаллическая структура комплекса ACI с карбоксипептидазой A1 человека, одной из его потенциальных мишеней in vivo, выявила белок со складкой, состоящей из двух тандемных гомологичных доменов, каждый из которых содержит β-ленту и две дисульфидные связи. Эти домены связаны α-спиральным сегментом и пятой дисульфидной связью.Связывание и ингибирование осуществляется С-концевым хвостом, который входит в воронкообразную полость активного центра фермента и приближается к каталитическому иону цинка. Полученные данные служат основой для биологической функции ACI, которая может иметь важное значение для выживания паразитов во время инфекции.
Более четверти населения поражено гельминтами, передаваемыми через почву, которые ухудшают питание и иммунный ответ на широко распространенные пандемии, такие как СПИД и туберкулез (1, 2).Аскарида Ascaris lumbricoides — наиболее распространенный паразит желудочно-кишечного тракта человека. Он вызывает аскаридоз (3), который широко распространен во всем мире с наибольшей распространенностью в тропических и субтропических регионах, а также в районах с неадекватной санитарией. Аскаридоз возникает при попадании в организм яиц паразитов. Они развиваются в личинок, которые мигрируют через разные ткани и возвращаются в тонкий кишечник, где созревают до взрослых самцов и самок червей. На этой стадии самки ежедневно откладывают тысячи яиц, которые выделяются с фекалиями, тем самым способствуя загрязнению почвы и распространению инфекции [подробности см. В вспомогательной информации (SI), рис.S1]. В течение своего жизненного цикла Ascaris угрожает здоровью человека неспецифическими абдоминальными симптомами, кишечной непроходимостью и перфорацией, желчной коликой, образованием желчных камней, абсцессами печени, панкреатитом и легочной эозинофилией (4, 5). Почти идентичный вид нематоды, Ascaris suum , обнаружен у свиньи. Он оказывает огромное влияние на животноводство, а также может инфицировать приматов и людей, вызывая болезнь, аналогичную A. lumbricoides (6⇓ – 8).
Как часть стратегии защиты от паразитов, круглые черви Ascaris секретируют ряд ингибиторов для воздействия на пищеварительные и связанные с иммунитетом протеазы хозяина, в том числе пепсин, трипсин, химотрипсин / эластаза, катепсины и металлокарбоксипептидазы (MCP) (9⇓⇓ ⇓⇓⇓⇓ – 16). МСР представляют собой цинксодержащие экзопротеазы, которые катализируют гидролиз С-концевых аминокислот из белков и пептидов. Они выполняют широкий спектр физиологически значимых функций у организмов разных типов (17).Эти ферменты были сгруппированы в трибу воронелин протеаз и подразделяются на MCP A / B- и N / E-типа (18). Воронелины A / B-типа человека включают пищеварительные ферменты CPA1, CPA2 и CPB1, а также CPA3 тучных клеток, что связано с воспалительными процессами (19, 20). Биологическое действие MCP специфически модулируется с помощью белковых ингибиторов. К настоящему времени описано семь таких ингибиторов МСР из картофеля и томатов (PCI и MCPI; 38 и 39 остатков соответственно) (21, 22), медицинской пиявки Hirudo medicinalis (LCI; 66 остатков) (23), клещей Rhipicephalus bursa и Haemaphysalis longicornis (TCI и HlTCI; 75 и 77 остатков соответственно) (24, 25), латексин крысы и человека (псевдоним ECI; 222 и 223 остатка соответственно) (26, 27) и кишечные паразиты A.lumbricoides и A. suum (ACI) (12, 13). Хотя первые ингибиторы были тщательно изучены с точки зрения активности и структуры, ACI до сих пор изучалась только по его аминокислотной последовательности. Мы представляем здесь его клонирование, гетерологичную экспрессию, очистку и трехмерную структуру в комплексе с MCP, раскрывая его механизм ингибирования. Мы также сообщаем о его целевой специфичности и локализации in vivo у червей Ascaris , что ведет к более глубокому пониманию опасного для жизни аскаридоза и может открыть путь для разработки лекарств и вакцин.
Результаты и обсуждение
Идентификация, секвенирование и клонирование ACI из
Ascaris .Первоначальные испытания рекомбинантной сверхэкспрессии ACI на основе сообщенной аминокислотной последовательности (12) дали лишь незначительные выходы и две различные формы (обозначенные A и B; см. Рис. S2) с идентичной молекулярной массой (7502,5 Да) и 8 цистеина. остатки, образующие четыре дисульфидные связи. Из этих двух только форма B ингибировала бычью карбоксипептидазу A1 (bCPA1), хотя и слабо ( K i = 5.9 ± 0,2 мкМ) по сравнению с другими зарегистрированными ингибиторами МСР (17). Таким образом, мы попытались проанализировать ACI непосредственно из неочищенного гомогената червей Ascaris . После оценки наличия ингибирующей активности против bCPA1 (см. SI «Материалы и методы ») экстракт подвергали масс-спектрометрии MALDI-TOF со снижением интенсивности (28). Эта процедура дала молекулярную массу 7 724,8 Да для Ascaris MCPI (рис. 1 A и B ), что не соответствовало таковой для указанной последовательности (12).Ингибитор очищали с использованием комбинации аффинной хроматографии и обращенно-фазовой ВЭЖХ. Его 30 N-концевых остатков соответствовали указанной последовательности (12). Однако белок имел 10, а не 8 остатков цистеина, и последующий анализ пептидов, полученных перевариванием эндопротеиназой Lys-C, показал, что С-конец (-GCCWDLL 67 ) был определен ошибочно (-LPWGL 65 ) (12 ). Таким образом, кДНК ACI была клонирована (фиг. 1 C ), и было обнаружено, что она состоит из 467 нуклеотидов с расчетной последовательностью белка из 87 остатков.Первые 20 остатков соответствуют сигнальному пептиду, который предшествует остатку аспартата, обнаруженному на N-конце очищенного ингибитора. Расчетная молекулярная масса выведенного зрелого белка соответствовала молекулярной массе природного ACI, определенной масс-спектрометрией MALDI-TOF, с пятью дисульфидными связями. Поиски сходства последовательностей не выявили гомологии с какой-либо другой последовательностью, о которой сообщалось, за исключением С-конца, который демонстрировал определенное сходство с С-концами других зарегистрированных MCPI (см. Ниже и рис.3 D ).
Рис. 1.Идентификация природного ACI с помощью масс-спектрометрии MALDI-TOF с уменьшением интенсивности и клонирования кДНК ACI. ( A ) Масс-спектры экстракта Ascaris до (контроль) и после добавления смолы CPA-Sepharose (+ CPA). ( Нижний ) Масс-спектр, соответствующий ингибитору, восстановленному после промывки и подкисления образца. ( B ) График относительных интенсивностей молекулярных ионов, присутствующих в масс-спектре экстракта Ascaris до и после взаимодействия с CPA.Для построения графика было проведено десять независимых экспериментов. Молекулярная масса ингибитора, идентифицированная с помощью масс-спектрометрии MALDI-TOF со снижением интенсивности, помечена звездочкой. ( C ) Нуклеотидная и выведенная аминокислотная последовательность ACI. Полноразмерная последовательность кДНК была собрана из двух перекрывающихся клонов, полученных методами 5′- и 3′-RACE (нуклеотиды 1-315 и 179-467 соответственно). Он содержит 5′-нетранслируемую последовательность из 49 нуклеотидов, ORF из 264 нуклеотидов и 3′-нетранслируемую область из 154 нуклеотидов.Канонический сигнал полиаденилирования, AATAAA (подчеркнут), обнаруживается на 12 нуклеотидов выше хвоста поли (A) + . Аминокислотная последовательность зрелого ACI выделена жирным шрифтом. Две изоформы (заключены в рамку) обнаружены в триплетах, кодирующих остатки в положениях 32 и 37, caa / gaa (глутамин / глутамат) и gaa / caa (глутамат / глутамин), соответственно.
Гетерологичная экспрессия и очистка ACI.
Рекомбинантный ACI был сверхэкспрессирован в Escherichia coli как гибридный белок (рис.S3), отщепление которого оставило остаток глицина на N-конце белка-ингибитора (молекулярная масса 7 781,8 Да). На заключительном этапе обращенно-фазовой ВЭЖХ был получен уникальный пик со временем удерживания, эквивалентным таковому для природного ACI. Типичный выход составил ≈10 мг чистого рекомбинантного ACI на 1 л клеточной культуры.
Конформационная устойчивость и активность ACI.
Эксперименты с круговым дихроизмом и спектроскопией ЯМР показали, что конформации природного и рекомбинантного ACI неразличимы.Обе молекулы сохраняли хорошо сложенную конформацию в широком диапазоне хаотропных реагентов и температур и становились денатурированными только при одновременном присутствии денатурирующих и восстанавливающих агентов (рис. S4 и S5). Эта высокая стабильность может быть связана с пятью дисульфидными связями, которые сильно ограничивают структуру ACI, как сообщается для PCI, LCI и TCI (29–31). Константы равновесной диссоциации комплексов природного ACI и рекомбинантного ACI с выбранными MCP неразличимы (данные не показаны).Это соглашение показало, что ACI является сильным связывающимся конкурентным ингибитором воронки A / B-типа, но не N / E-типа, со значениями K, и в наномолярном диапазоне (Таблица 1). В пределах этой активности ингибитор показал отчетливую специфичность в отношении пищеварительных ферментов (CPA1, CPA2 и CPB1) и CPA3 тучных клеток по сравнению с CPA4 и CPB2 в плазме (также называемым TAFIa), которая была значительно выше (в 10-20 раз) K я значения.
Таблица 1. Константы ингибирования( K и ) ACI против МСР типа A / B и N / E воронелинов
Иммунолокализация ACI в
Ascaris .Специфические антитела, продуцируемые против рекомбинантного ACI, использовали для обнаружения белка в экстрактах из тканей взрослых мужчин и женщин Ascaris методом вестерн-блоттинга. Ингибитор был обнаружен в кишечнике и стенках тела самцов и самок червей, а также в яичниках и матке самок червей (рис. S6). Иммуногистохимические исследования подтвердили эти результаты. Антитела четко распознают ингибитор в кишечнике и гиподерме (стенке тела) мужских и женских червей (рис.2). В стенке тела сигнал был особенно сильным вокруг боковых хорд, в которых находятся экскреторные каналы. У самок иммуноокрашивание было слабее в матке, яичнике и яйцеводе, тогда как в оплодотворенных яйцах оно было сильным. В мужской репродуктивной системе (т. Е. Яичках, семявыносящем протоке и семенных пузырьках) маркировки не обнаружено.
Рис. 2.Иммуногистохимическая локализация ACI в Ascaris . ( A ) Срезы взрослых самцов ( слева ) и самок ( справа ) червей, инкубированных с преиммунной сывороткой.Области, которые показаны с усилением в B , C и D , находятся внутри квадратов. (Масштабные линейки, 500 мкм.) ( B ) Увеличенный вид среза взрослого самца червя, инкубированного с преиммунной сывороткой (, слева, ) и антителом против ACI (, справа, ). (Масштабные линейки, 100 мкм.) ( C и D ) Крупным планом вид среза взрослой самки червя, инкубированной с преиммунной сывороткой (, слева, ) и антителом против ACI (, справа, ).[Масштабные линейки, 100 мкм ( C ) и 50 мкм ( D ).] Сокращения: in, кишечник; т. е. семенник; lc, боковая хорда; hd, гиподерма; яйцеклетка, яичник; ут, матка; и, например, яйца.
Структура ACI в комплексе с CPA1 человека.
Анализ кристаллической структуры человеческого CPA1 (hCPA1) в его комплексе с рекомбинантным ACI (рис. 3 A ) показывает, что протеаза соответствует классической α / β-гидролазной укладке A / B- и N / E- цинк-зависимые МСР типа воронелин трибы протеаз (подробное описание структуры hCPA1 см. в SI Materials and Methods ) (17, 18, 32).ACI состоит из структурно подобных тандемных модулей, N-концевого домена (NTD; Val-3I – Ser-26I; остатки ингибитора несут суффикс I) и C-концевого домена (CTD; Thr-40I – Leu-67I), которые соединены соединительным сегментом (CS; Thr-27I – Phe-39I) (рис. 3 A и B ). Каждый домен включает короткий N-концевой сегмент в расширенной конформации, за которым следует поворот на 90 °, который приводит к двойному переплетенному 1,4-витку. После этого цепь сворачивается назад и входит в С-концевую β-ленту (рис.3 A и рис. S7 A ). Внутридоменная стабилизация обеспечивается двумя внутренними дисульфидными связями на домен. CS включает α-спираль (Ile-28I – His-38I), которая связана со второй β-ленточной цепью CTD через пятую дисульфидную связь (Cys-34I – Cys-62I). Два домена взаимодействуют друг с другом через N-конец и кончик плюс вторую нить β-ленты NTD, спираль CS и N-концевой сегмент в расширенной конформации и двойном 1,4-витке CTD (рис.3 A и рис. S7 A ). Доменная архитектура ACI напоминает архитектуру латексина, в которой два тандемных цистатиноподобных модуля связаны спиральным сегментом (33). Однако нет структурного сходства с латексином, кроме совпадения в модульном расположении, и не было обнаружено значительной структурной гомологии с какой-либо структурой, о которой сообщалось. Мы пришли к выводу, что ACI соответствует новой складке и что этот ингибитор мог возникнуть в результате дупликации гена.
Рис. 3.Структура ACI в его комплексе с hCPA1.( A ) График Ричардсона комплекса ACI (NTD — синим, CS — зеленым и CTD — пурпурным) и hCPA1 (α-спирали — желтым, β-тяжи — оранжевым, спирали — белым) в стандартной ориентации для воронок. (18). Регулярные элементы вторичной структуры (ленты для α-спирали; стрелки для β-цепей) и дисульфидные связи показаны для ACI. Каталитический ион цинка металлофермента показан в виде пурпурной сферы. ( B ) Наложение NTD (синяя кривая Cα) и CTD (пурпурная кривая Cα) ACI.Положение дисульфидных связей указывается эллипсоидами. ( C ) Наложение структур экзогенных ингибиторов, проанализированных на сегодняшний день, в комплексе с воронками, PCI [голубой; Банк данных белков (PDB) код 4cpa], TCI (зеленый; код PDB 1zlh), LCI (пурпурный; код PDB 1dtd) и ACI (белый; код PDB ID 3fju) после наложения соответствующих протеазных фрагментов. Для ясности далее изображен только hCPA1 (желтый) в его комплексе с ACI. Эллипсоид указывает на концы С ингибиторов.( D ) Увеличенный вид C в той же ориентации, показывающий только концы C ингибиторов того же цвета, что и в C . Структурная эквивалентность положений хвостов обеспечивается выравниванием. В то время как концевой остаток разрывается при образовании комплекса и занимает карман S 1 ‘ в PCI и LCI, в TCI он расщепляется, но не присутствует в активном сайте. В ACI он вообще не режется, так как занимает подсайт S 1 .
Структурные детерминанты ингибирования hCPA1 через ACI.
ACI ингибирует hCPA1, блокируя доступ к щели активного сайта через интерфейс 690 Å. 2 , образуя 35 тесных контактов, включая 12 водородных связей и 6 гидрофобных взаимодействий (см. Таблицу S1). В образовании комплекса участвует С-концевой хвост (Trp-64I-Leu-67I), кончик (Asn-59I-Lys-60I) и центр (Ile-57I) N-концевой β-ленточной нити CTD и конец CS (Glu-37I – Phe-39I) ACI, т.е. NTD не участвует. Промежуточные сегменты hCPA1 включают петлю воронкообразного ободка, соединяющую цепь β3 со спиралью α2, Lβ3α2, две области Lα4α5, а также Lβ5β6, Lα7α8 и Lβ8α9.Основным детерминантом ингибирования является C-концевой участок ACI, который распространяется и проникает в щель активного сайта (фиг. 3 A и фиг. S7 B ). Эта расширенная конформация удерживается вместе второй дисульфидной связью CTD и π-стэкинг-взаимодействием Trp-64I с Asn-59I Nδ2 (фиг. S7 B ). ACI занимает субсайты расщепления активного центра S 3 , S 2 и S 1 , а С-концевые карбоксилатные атомы кислорода координируют каталитический ион цинка зрелого протеазного фрагмента слегка асимметричным бидентатным образом (2 .06 Å и 2,41 Å соответственно). На загрунтованной стороне щели ион ацетата находится рядом с цинком, частично занимая карман специфичности S 1 ‘ и имитируя С-конец субстрата. Ацетат образует двойной солевой мостик с Arg-145 Nη1 (2,77 Å) и Nη2 (2,94 Å) протеазы. Один из его карбоксилатных атомов кислорода связывает Tyr-248 (2,62 Å), а другие водородные связи Asn-144 Nδ2 (2,86 Å).
Способ, которым ACI ингибирует hCPA1, напоминает действие PCI, LCI и TCI, но не латексина (33–37).Хотя последний полностью экранирует активный сайт своей мишени MCP неспецифическим образом, контактируя с элементами обода воронки, три других ингибитора взаимодействуют с этими элементами, но их С-концевые хвосты выступают в щель активного сайта субстратоподобным образом. , как найдено для ACI (рис. 3 C и D ). Суперпозиция C-концевых остатков четырех ингибиторов, происходящих от эволюционно далеких видов, обнаруживает умеренное сходство последовательностей. Однако, хотя C-концевой остаток отщепляется в PCI, LCI и TCI при образовании комплекса, он остается неизменным в ACI.Это происходит потому, что последний остаток ACI совпадает с предпоследними остатками PCI, LCI и TCI (фиг. 3 D ).
Выводы
Здесь мы всесторонне проанализировали ингибитор ACI в кишечном паразите Ascaris , который первым нацелен на металлопептидазы. Его преимущественное ингибирование MCPs, обнаруженных в кишечнике и тучных клетках слизистой оболочки кишечника хозяина, объясняет, что Ascaris может выжить во враждебной среде в течение многих лет, уклоняясь или подавляя ответы хозяина, которые в противном случае могли бы убить его или вызвать его изгнание.Эти данные согласуются со специфической локализацией ACI в кишечнике и стенке тела самцов и самок червей Ascaris и в оплодотворенных яйцах. Такая локализация совместима с защитой взрослых червей и яиц в кишечнике хозяина и личинок во время миграции.
Структурный анализ показал, что ACI состоит из двух связанных гомологичных тандемных доменов. Ингибирование hCPA1 затрагивает только CTD и предшествующий CS, но не NTD. Этот домен может нацеливаться на другие пищеварительные ферменты, присутствующие в кишечнике хозяина, как сообщается, например, для бифункционального ингибитора α-амилазы / трипсина из индийского пальчатого проса Ragi (38).
Материалы и методы
Подробное описание процедур представлено в SI «Материалы и методы» и в таблице S2. Вкратце, ингибитор ACI был идентифицирован в экстракте Ascaris с помощью масс-спектрометрии с уменьшением интенсивности MALDI-TOF, как описано в ссылке. 28. Затем ингибитор выделяли с помощью аффинной хроматографии на CPA-сефарозе и обращенно-фазовой ВЭЖХ и секвенировали с помощью автоматизированной деградации по Эдману. Полноразмерную кДНК ACI клонировали методами ОТ-ПЦР и 5 ‘/ 3’-RACE, как описано в ссылке.24. Рекомбинантный ACI был сверхэкспрессирован в клетках E. coli Origami с использованием вектора pET-32a, pET-32a-ACI, который содержит слияние тиоредоксина и гексагистидина с последующим сайтом расщепления протеазой вируса травления табака (TEV). . Слитый белок очищали с помощью аффинной хроматографии Ni 2+ и затем расщепляли протеазой TEV. Ингибитор очищали до гомогенности с помощью RP-HPLC. Природный и рекомбинантный ACI анализировали с помощью спектрометрии КД и ЯМР в нативных и денатурирующих условиях.Их ингибирующая активность была проверена спектрофотометрическими анализами с выбранными хромогенными субстратами, как описано в ссылке. 24. Природный ACI был обнаружен у взрослых мужчин и женщин Ascaris , разрезанных в разных тканях или разрезанных на предметных стеклах с помощью вестерн-блоттинга или иммуногистохимии с использованием стандартных протоколов. Комплекс ACI-hCPA1 получали путем инкубации эквимолярных количеств фермента и ингибитора. Кристаллы были получены методом диффузии пара сидя-капля. Структура была решена поиском Паттерсона с использованием координат несвязанного hCPA1 в качестве модели поиска.
Благодарности
Мы благодарим Сильвию Бронсомс и Тибисая Гевару за отличную техническую помощь, Хоакима Кастелла за советы по вскрытию червей Ascaris и Робина Райкрофта за полезный вклад в рукопись. Мы признательны за помощь, оказанную Европейской лабораторией молекулярной биологии и местными контактами по синхротронному излучению Европейского центра синхротронного излучения. Эта работа была поддержана следующими грантами: проект ЕС FP6 Strep LSHG-2006-018830 «CAMP»; Совместный проект ЕС FP7 223101 «AntiPathoGN»; BIO2007-68046, BIO2006-02668 и проект CONSOLIDER-INGENIO 2010 «La Factoría de Cristalización» (CSD2006-00015) от государственных агентств Испании.Финансирование для сбора данных было предоставлено Европейским центром синхротронного излучения. Л.С. является получателем докторской стипендии Министерства науки и инноваций Испании. J.L.A. является бенефициаром исследовательского контракта «Хуан де ла Сьерва», заключенного тем же министерством.
Сноски
Вклад авторов: L.S., F.X.A., F.X.G.-R. и J.L.A. спланированное исследование; L.S., F.X.G.-R. и J.L.A. проведенное исследование; L.S., F.X.A., R.H., F.X.G.-R. и J.L.A. проанализированные данные; и Ф.X.G.-R. и J.L.A. написал газету.
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Размещение данных: координаты атомов и структурные факторы были депонированы в банке данных белков, www.pdb.org (код PDB ID 2FJU). Нуклеотидная последовательность, представленная в этой статье, депонирована в базе данных GenBank (инвентарный номер EU057973).
Эта статья содержит вспомогательную информацию на сайте www.pnas.org/cgi/content/full/0812623106/DCSupplemental.
- Поступило 17 ноября 2008 г.
- © 2009 Национальная академия наук США
RCSB PDB — 1O0S: Кристаллическая структура яблочного фермента Ascaris suum в комплексе с NADH
Кристаллическая структура митохондриальный НАД-яблочный фермент из Ascaris suum в четвертичном комплексе с НАДН, тартронатом и магнием был определен с разрешением 2,0-А. Структура очень напоминает ранее определенную структуру того же фермента в бинарном комплексе с НАД…
Кристаллическая структура митохондриального НАД-яблочного фермента из Ascaris suum в четвертичном комплексе с НАДН, тартронатом и магнием была определена с разрешением 2,0А. Структура очень похожа на ранее определенную структуру того же фермента в бинарном комплексе с НАД. Однако в кофермент-связывающем кармане активного центра наблюдается значительная разница с никотинамидным кольцом молекулы НАДН, вращающимся на 198 градусов по связи C-1-N-1 в активный центр, не вызывая значительного перемещения другого каталитического центра. остатки.Обсуждаются последствия этого конформационного изменения никотинамидного кольца для каталитического механизма. Структура также выявляет карман связывания для иона двухвалентного металла в активном сайте и сайт связывания для тартроната, расположенный в высоко положительно заряженной среде внутри интерфейса субъединицы, который отличается от активного сайта. Сайт связывания тартроната, предположительно аллостерический сайт для активатора фумарата, демонстрирует поразительные сходства и различия с сайтом активатора NAD-яблочного фермента человека, о котором недавно сообщалось.Таким образом, структура обеспечивает дополнительное понимание каталитических, а также аллостерических механизмов фермента.
Ссылки по теме: & nbsp
- Кристаллическая структура яблочного фермента из Ascaris suum в комплексе с никотинамид-аденин-динуклеотидом при разрешении 2,3 A
Coleman, D.E., & NbspRao, G.S.Chars, B.
(2002) Биохимия & nbsp 41: 6928
Организационная принадлежность : & nbsp
Департамент молекулярной биологии и иммунологии Научного центра здоровья Университета Северного Техаса, Форт-Уэрт, Техас 76107, США.