Содержание

Анализ кала на дисбактериоз

Анализ кала на дисбактериоз

Представлены обобщенные сведения о традиционном микробиологическом анализе кала культурально-зависимым способом (бакпосевом).

О новых методиках анализа кишечной микробиоты информация ниже.

Анализ кала на дисбактериоз или Бактериологический посев (посев или бакпосев). Посев - это биологическое исследование испражнений, которое определяет состав и примерное количество микроорганизмов, обитающих в кишечнике человека. Для этого используется внесение частиц кала на разные питательные среды, на которых растут 3 группы микроорганизмов: нормальные (необходимы для переваривания пищи), условно-патогенные (способные при снижении естественной резистентности макроорганизма вызывать заболевания, для которых характерно отсутствие нозологической специфичности) и патогенные (болезнетворные).

Указанное лабораторное исследование используется в медицинской практике с профилактической целью и при подозрении на инфекционное заболевание желудочно-кишечного тракта. 

Данное исследование позволяет определить содержание бактерий в толстом кишечнике. В кишечнике человека содержится огромное количество бактерий, которые активно участвуют в переваривании и усвоении питательных веществ. Анализ кала на дисбактериоз назначается по большей части детям, в таких случаях, когда имеются следующие нарушения работы кишечника: диарея, запор, боли в животе, метеоризм, а также после длительного лечения антибиотиками (антибиотики помимо того, что борются с инфекциями, уничтожают и нормальные бактерии кишечника). Существую три группы бактерий кишечника – «нормальные» бактерии (бифидобактерии, лактобактерии и эшерихии) они активно участвуют в работе кишечника, условно-патогенные бактерии  (энтерококки, стафилококки, клостридии, кандиды) при определенных обстоятельствах могут превратиться в патогенные бактерии и вызвать различные заболевания, и патогенные бактерии (шигелла, сальмонелла) которые при попадании в кишечник вызывают серьезные инфекционные заболевания кишечника.

Нормы анализа кала на дисбактериоз

(КОЕ / г фекалий)

 

Дети до 1 года

Дети старшего возраста

Взрослые

Бифидобактерии

1010 – 1011

109 – 1010

108 – 1010

Лактобактерии

106 – 107

107 – 108

106 – 108

Эшерихии

106 – 107

107 – 108

106 – 108

Бактероиды

107 – 108

107

 – 108

107 – 108

Пептострептококки

103 – 105

105 – 106

105 – 106

Энтерококки

105 – 107

105 – 108

105 – 108

Сапрофитные стафилококки

≤104

≤104

≤104

Патогенные стафилококки

-

-

-

Клостридии

≤103

≤105

≤105

Кандида

≤103

≤104

≤104

Патогенные энтеробактерии

-

-

-

Бифидобактерии

Норма бифидобактерий

Дети до 1 года

1010 – 1011

Дети старшего возраста

109 – 1010

Взрослые

108 – 1010

Около 95% всех бактерий в кишечнике – бифидобактерии. Бифидобактерии участвуют в производстве таких витаминов как В1, В2, В3, В5, В6, В12,К. Помогают всасыванию витамина D, при помощи специальных вырабатываемых ими веществ борются с «плохими» батериями, а также участвуют в усилении иммунитета.

Причины снижения количества бифидобактерий

  • Медикаментозное лечение (антибиотики, нестероидные противовоспалительные средства (НПВС) такие как анальгин, аспирин, слабительные средства)
  • Неправильное питание (избыток жиров или белков или углеводов, голодание, неправильный режим питания, искусственное вскармливание)
  • Кишечные инфекции (дизентерия, сальмонеллез, вирусные инфекции)
  • Ферментопатии (целиакия, лактазная недостаточность)
  • Хронические заболевания ЖКТ (хронический гастрит, панкреатит, холецистит, язвенная болезнь желудка или двенадцатиперстной кишки)
  • Иммунные заболевания (иммунные дефициты, аллергии)
  • Смена климатических зон
  • Стресс

Лактобактерии

Норма лактобактерий

Дети до 1 года

106 – 107

Дети старшего возраста

107 – 108

Взрослые

106 – 108

Лактобактерии занимают около 4-6% от общей массы бактерий кишечника. Лактобактерии являются не менее полезными, чем бифидобактерии. Их роль в организме следующая: поддержка уровня pH в кишечнике, производство большого количества веществ (молочная кислота, уксусная кислота, перекись водорода, лактоцидин, ацидофилин), которые активно используются для уничтожения патогенных микроорганизмов, а также вырабатывают лактазу.

Причины снижения количества лактобактерий

  • Медикаментозное лечение (антибиотики, нестероидные противовоспалительные средства (НПВС) такие как анальгин, аспирин, слабительные средства)
  • Неправильное питание (избыток жиров или белков или углеводов, голодание, неправильный режим питания, искусственное вскармливание)
  • Кишечные инфекции (дизентерия, сальмонеллез, вирусные инфекции)
  • Хронические заболевания ЖКТ (хронический гастрит, панкреатит, холецистит, язвенная болезнь желудка или двенадцатиперстной кишки)
  • Стресс

Эшерихии (E.coli типичные)

Норма эшерихий

Дети до 1 года

107 – 108

Дети старшего возраста

107 – 108

Взрослые

107 – 108

Эшерихии появляются в организме человека с рождения и присутствуют в нем на протяжении всей жизни. Выполняют следующую роль в организме: участвуют в образовании витаминов группы В и витамина К, участвуют в переработке сахаров, вырабатывают антибиотикоподобные вещества (колицины) которые борются с патогенными организмами, усиливают иммунитет.

Причины снижения количества эшерихий

  • Гельминтозы
  • Лечение антибиотиками
  • Неправильное питание (избыток жиров или белков или углеводов, голодание, неправильный режим питания, искусственное вскармливание)
  • Кишечные инфекции (дизентерия, сальмонеллез, вирусные инфекции)

Бактероиды

Норма бактероидов в кале

Дети до 1 года

107 – 108

Дети старшего возраста

107 – 108

Взрослые

107 – 108

Бактероиды участвуют в пищеварении, а именно в переработке жиров в организме. У детей до 6 месяцев в анализах кала не обнаруживаются, их можно обнаружить, начиная с возраста 8-9 месяцев.

Причины увеличения содержания бактероидов

  • Жировая диета (употребление большого количества жиров в пищу)
  • Лечение антибиотиками
  • Кишечные инфекции (дизентерия, сальмонеллез, вирусные инфекции)

Причины снижения содержания бактероидов

  • Лечение антибиотиками
  • Кишечные инфекции (дизентерия, сальмонеллез, вирусные инфекции)

Пептострептококки

Нормальное количество в кале

Дети до 1 года

103 – 105

Дети старшего возраста

105 – 106

Взрослые

105 – 106

В норме пептострептококки живут в толстом кишечнике, при увеличении их количества и  попадании в любую другую область нашего организма, они вызывают воспалительные заболевания. Участвуют в переработке углеводов и молочных белков. Вырабатывают водород, который в кишечнике превращается в перекись водорода и помогает контролировать рН в кишечнике.

Причины увеличения содержания пептострептококков

  • Употребление большого количества углеводов
  • Кишечные инфекции
  • Хронические заболевания ЖКТ

Энтерококки

Норма энтерококков

Дети до 1 года

105 – 107

Дети старшего возраста

105 – 108

Взрослые

105 – 108

Энтерококки участвуют в переработке углеводов, в производстве витаминов, а также играют роль в создании местного иммунитета (в кишечнике). Количество энтерококков не должно превышать количество кишечных палочек, если их количество увеличивается, они могут вызвать ряд заболеваний.

Причины увеличения содержания энтерококков

  • Снижение иммунитета, иммунные заболевания
  • Пищевые аллергии
  • Гельминтозы
  • Лечение антибиотиками (в случае резистентности энтерококков к применяемому антибиотику)
  • Неправильное питание
  • Снижение количества кишечной палочки (эшерихии)

Стафилококки (сапрофитные стафилококки и патогенные стафилококки)

Норма сапрофитных стафилококков

Дети до 1 года

≤104

Дети старшего возраста

≤104

Взрослые

≤104

Норма патогенных стафилококков

Дети до 1 года

-

Дети старшего возраста

-

Взрослые

-

Стафилококки делятся на патогенные и непатогенные. К патогенным относятся: золотистый, гемолитический и плазмокоагулирующий, наиболее опасен золотистый. К непатогенным стафилококкам относятся негемолитический и эпидермальный.

Стафилококк не относится к нормальной микрофлоре кишечника, он попадает в организм из внешней среды вместе с пищей. Золотистый стафилококк, попадая в ЖКТ, обычно, вызывает токсические инфекции.

Причины появления стафилококка 

Стафилококк может попасть в организм человека разными путями, начиная грязными руками, вместе с продуктами питания и заканчивая внутрибольничными инфекциями.

Клостридии

Норма клостридий

Дети до 1 года

≤103

Дети старшего возраста

≤105

Взрослые

≤105

Клостридии участвуют в переработке белков, продуктом их переработки являются такие вещества как индол и скатол, которые по сути являются ядовитыми веществами, однако в небольших количествах эти вещества стимулируют перистальтику кишечника тем самым улучшая функцию эвакуации каловых масс. Однако при увеличении количества клостридий в кишечнике вырабатывается большее количество индола и скатола, что может привести к развитию такого заболевания как гнилостная диспепсия.

Причины увеличения количества клостридий

  • Большое количество белка употребляемого в пищу

Кандида

Норма кандид

Дети до 1 года

≤103

Дети старшего возраста

≤104

Взрослые

≤104

При увеличении количества кандид в кишечнике может развиться бродильная диспепсия, а также заметное увеличение количества кандид может спровоцировать развитие различных видов кандидоза.

Причины увеличения количества кандид

  • Употребление большого количества углеводов в пищу
  • Лечение антибиотиками (без применения в комплексе противогрибковых препаратов)
  • Использование гормональных противозачаточных средств
  • Беременность
  • Сахарный диабет
  • Стресс

Анализ кала на патогенную флору

Анализ кала на патогенную флору является тем же самым анализом кала на дисбактериоз. В бланке с результатами анализов он занимает место – Патогенные энтеробактерии. К группе патогенных энтеробактерий относят Сальмонеллу и Шигеллу как основных возбудителей инфекционных заболеваний кишечника.

Патогенные (болезнетворные) бактерии (pathogenic bacteria,  греч. pathos — страдание и genes — порождающий, рождающийся; греч. bacterion — палочка) - бактерии, паразитирующие на других организмах и способные вызывать инфекционные заболевания человек, среди которых особое место занимают кишечные инфекции. Кишечные инфекции - целая группа заразных заболеваний, которые в первую очередь повреждают пищеварительный тракт. Заражение происходит при попадании возбудителя инфекции через рот, как правило, при употреблении зараженных пищевых продуктов и воды. Всего таких заболеваний более 30, в частности, к ним относятся: холера, брюшной тиф, ботулизм, сальмонеллез, дизентерия и т.п. Среди кишечных заболеваний самое безобидное — это пищевое отравление. Возбудителями кишечных инфекций могут быть как сами бактерии (сальмонеллез, брюшной тиф, холера), так и их токсины (ботулизм). Некоторые бактерии могут вызывать язвенную болезнь и рак желудка, а также хронический гастрит.

 Сальмонелла

В норме сальмонеллы в результате анализа быть не должно!

Вызывает такое заболевание как сальмонеллез, которое проявляется сильным токсическим поражением кишечника. Основными переносчиками являются водоплавающие птицы.
Причины появления сальмонеллы

  • Употребление плохо обработанного или сырого мяса
  • Употребление плохо обработанных или сырых яиц
  • Контакт с переносчиками
  • Контакт с водой зараженной сальмонеллой
  • Грязные руки

Шигелла

В норме шигеллы в результате анализа быть не должно!

Вызывает такое заболевание как дизентерия, которое также поражает кишечник и проявляется сильным токсическим поражением кишечника. Основными путями заражения являются молочные продукты, сырые овощи, зараженная вода, люди больные дизентерией.

Причины появления шигеллы

  • Употребление или контакт с зараженной водой
  • Употребление зараженных продуктов питания
  • Контакт с людьми болеющими дизентерией
  • Грязные руки и контакт с зараженными поверхностями (посуда, игрушки)

Часто задаваемые вопросы

 

Как правильно подготовиться к анализу?

Применение некоторых медикаментов может повлиять на результат анализа кала. Поэтому их применение необходимо приостановить или прекратить в период подготовки к сдаче анализа кала после консультации с вашим врачом.

  • Отменить прием препаратов (после личной консультации Вашего лечащего врача). К препаратам, которые могут повлиять на результаты анализов кала, относятся следующие:
  1. Противодиарейные препараты (Смекта, Неосмектин, Полифан, Имодиум, Энтерол)
  2. Противогельминтные препараты (Немозол, Декарис, Вермокс, Гельминтокс)
  3. Антибиотики - любые виды
  4. Лечебные и очищающие клизмы
  5. Слабительные препараты (Бисакодил, Экстракт сенны, Форлакс, Порталак)
  6. НПВП – нестероидные противовоспалительные препараты (Аспирин, Парацетамол, Ибупрофен)
  • Также нельзя использовать кал который был в контакте с чистящими или дезинфицирующими средствами, которые используются для чистки унитаза, водой или мочой.

 Как правильно собрать кал для анализа?

  1. Помочитесь перед сбором материала, для того чтобы моча не попала в кал.
  2. Необходимо взять чистую, сухую ёмкость, куда будет проводиться дефекация.
  3. Из полученного материала необходимо взять 8-10 см3 (~2 чайные ложки). Кал забирается при помощи специальной «ложки» которая встроена в крышку специального контейнера, который вам должны выдать для сбора кала.
  4. Кал для анализа собирается из разных участков каловых масс (сверху, с боков, изнутри)
  5. Материал (кал) кладется в выданный вам контейнер, и плотно закрывается.
  6. Необходимо подписать контейнер (Ваше имя и фамилию, дату сбора анализа)

Как хранить кал перед отправкой в лабораторию? 

Материал для анализа кала на дисбактериоз и на кишечную инфекцию необходимо доставить в лабораторию в максимально короткие сроки 30-40 минут (максимум 1,5 -2 часа). Чем больше времени прошло со времени сбора материала и момента доставки материала в лабораторию, тем менее достоверны будут анализы. Проблема в том, что большая часть бактерий кишечника являются анаэробными, то есть они живут в среде без кислорода, при контакте с ним умирают. Это может повлиять на достоверность результата. Поэтому хранить хоть какое либо время свыше рекомендуемых максимальных 2 часа, категорически не рекомендуется.


Примечание

Полный (максимально подробный и точный) микробиологический анализ кала (анализ микробиоты толстой кишки) невозможно провести культурально зависимым способом, т.к. не все бактерии можно выделить и культивировать в искусственных условиях. В общем, проблема с микробиомом состоит в том, что мы можем выращивать в лаборатории менее 5% видов микробов, остальные просто слишком привередливы. Сегодня используются более технологичные культурально-независимые методы анализа:

Обзор популярных методов анализа микробиоты

 

Современные анализы кишечной микробиоты проводятся культурально-независимыми способами, среди которых можно выделить два наиболее известных на сегодняшний день в России метода - метод газовой хроматографии масс-спектрометрии микробных маркеров и метагеномный анализ микробиоты с помощью секвенирования нуклеиновых кислот. Обе методики имеют свои преимущества и недостатки (стоимость, время), включая погрешности в самих результатах и ограничения в использовании, а поэтому они совершенствуются до сих пор. Но несмотря на определенные недочеты, указанные технологии при грамотном использовании все же являются мощным инструментарием на пути к достижению целей персонализированнной медицины.

Информация к разделу: Дисбактериоз

См. отдельно: Типичный анализ микробиома кишечника по образцам стула (метод метагеномики)

Будьте здоровы!

 

ССЫЛКИ К РАЗДЕЛУ О ПРЕПАРАТАХ ПРОБИОТИКАХ

  1. ПРОБИОТИКИ
  2. ДОМАШНИЕ ЗАКВАСКИ
  3. БИФИКАРДИО
  4. КОНЦЕНТРАТ БИФИДОБАКТЕРИЙ ЖИДКИЙ
  5. ПРОПИОНИКС
  6. ЙОДПРОПИОНИКС
  7. СЕЛЕНПРОПИОНИКС
  8. МИКРОЭЛЕМЕНТНЫЙ СОСТАВ
  9. ПРОБИОТИКИ С ПНЖК
  10. БИФИДОБАКТЕРИИ
  11. ПРОПИОНОВОКИСЛЫЕ БАКТЕРИИ
  12. ПРОБИОТИКИ И ПРЕБИОТИКИ
  13. СИНБИОТИКИ
  14. РОЛЬ МИКРОБИОМА В ТЕРАПИИ РАКА
  15. АНТИОКСИДАНТНЫЕ СВОЙСТВА
  16. АНТИОКСИДАНТНЫЕ ФЕРМЕНТЫ
  17. АНТИМУТАГЕННАЯ АКТИВНОСТЬ
  18. МИКРОФЛОРА КИШЕЧНОГО ТРАКТА
  19. МИКРОБИОМ ЧЕЛОВЕКА
  20. МИКРОФЛОРА И ФУНКЦИИ МОЗГА
  21. ПРОБИОТИКИ И ХОЛЕСТЕРИН
  22. ПРОБИОТИКИ ПРОТИВ ОЖИРЕНИЯ
  23. МИКРОФЛОРА И САХАРНЫЙ ДИАБЕТ
  24. ПРОБИОТИКИ и ИММУНИТЕТ
  25. МИКРОБИОМ И АУТОИММУННЫЕ БОЛЕЗНИ
  26. ПРОБИОТИКИ и ГРУДНЫЕ ДЕТИ
  27. ПРОБИОТИКИ, БЕРЕМЕННОСТЬ, РОДЫ
  28. ДИСБАКТЕРИОЗ
  29. ВИТАМИННЫЙ СИНТЕЗ
  30. АМИНОКИСЛОТНЫЙ СИНТЕЗ
  31. АНТИМИКРОБНЫЕ СВОЙСТВА
  32. СИНТЕЗ ЛЕТУЧИХ ЖИРНЫХ КИСЛОТ
  33. СИНТЕЗ БАКТЕРИОЦИНОВ
  34. ФУНКЦИОНАЛЬНОЕ ПИТАНИЕ
  35. АЛИМЕНТАРНЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ
  36. ПРОБИОТИКИ ДЛЯ СПОРТСМЕНОВ
  37. ПРОИЗВОДСТВО ПРОБИОТИКОВ
  38. ЗАКВАСКИ ДЛЯ ПИЩЕВОЙ ПРОМЫШЛЕННОСТИ
  39. НОВОСТИ

причины, повышены, понижены, нормы, лечение

Энтерококки – грамположительные микробы, представленные 15 различными видами. Есть непатогенные, полезные виды, условно-патогенные. Большое количество последних может привести к развитию различных заболеваний. Энтерококки имеют круглую форму. Они не могут образовывать вокруг себя капсул и спор.

Различают несколько групп: в 80-90% бактерии представлены Enterococcus faecalis, на втором месте находится Enterococcus faecium. Есть и другие, менее многочисленные виды.

Польза бактерии

Впервые наш организм сталкивается с энтерококками, когда они поступают к нам вместе с материнским молоком. Большая часть остается в тонком и толстом кишечнике.

Количество энтерококков зависит не только от особенностей организма, но и возраста. Чем взрослее человек, тем больше шансов на увеличенное количество бактерий в организме.

В норме на 1 гр. фекалий должно быть не больше 100 млн. бактерий. Если количественные характеристики не выше этой отметки, то:

  • эффективно уничтожается условно-патогенная микрофлора;
  • происходит быстрое усвоение и правильное распределение глюкозы по организму;
  • синтезируются витамины;
  • углеводы начинают расщепляться и перерабатываться;
  • повышается иммунитет.

Некоторые непатогенные виды микробов используется в пищевой промышленности для сбраживания молока, уменьшения количество патогенных микроорганизмов в продуктах питания. Некоторые разновидности используются и в медицине. На их основе делают препараты, позволяющие эффективно бороться с дисбактериозом, кишечными инфекциями.

Опасность

Количество бактерий в количестве, превышающем норму, может привести к развитию болезней. Нарушение естественного баланса может привести к увеличению условно-патогенной микрофлоры.

Патогенными они становятся при появлении в местах нетипичного обитания. Это могут быть почки, мочевыводящие пути и другие органы. Опасность скрывается за целой цепочкой серьезных заболеваний, важно следить за тем, чтобы показатели всегда были в норме.

Показатели нормы

При изучении каловых масс нормальным считается количество:

  • для детей до 1 года – 106 – 107.
  • для детей после 1 года – 107 – 108.
  • для взрослых – 106 – 108.

Причины появления

У детей чаще всего причиной становится прием лекарственных средств, переохлаждение, повреждение целостности слизистой. Иногда в кале появляются бактерии при использовании инвазивных методов диагностики.

У взрослых причин для появления в кале энтерококков больше. Это может быть длительный прием антибиотиков, гормональный дисбаланс у женщин. Иногда наблюдается большое количество бактерий у беременных женщин в результате постоянных скачков эстрогенов и андрогенов.

Обычно заразиться энтерококками невозможно, поскольку они являются естественными обитателями нашего организма. Их увеличение может быть связано с несоблюдением правил личной гигиены, снижением реактивности иммунитета.

Последнее возможно из-за стрессов, наличия различных патологий инфекционного характера. Провоцирующими факторами выступают и чрезмерное увлечение алкогольными напитками, естественное старение человека.

Энтерококки в кале повышены

Бактерия может спровоцировать развитие серьезных проблем со здоровьем. К ним относится:

  • Менингит. Инфекционное заболевание оболочки спинного или головного мозга.
  • Дивертикулит. Болезненный процесс, связанный с образованием на стенках различных образований. Нарушает процессы нормальной моторики кишечника.
  • Патологии мочеполовой системы. При отсутствии лечения могут появиться хронические формы, которые трудно поддаются лечению, становятся причинами рецидивов.
  • Эндокардит. Заболевание сердца, которое может носить острый или хронический характер. Патогенная микрофлора поражает внутреннюю оболочку предсердий, желудочка, клапанного аппарата.
  • Септический артрит. При нем происходит инфекционное поражение суставов.
  • Гастрит. Характеризуется поверхностным воспалением оболочки желудка.
  • Энтерит. Патология, которая в основном затрагивает здоровые клетки тонкой кишки.

В грудничковом возрасте предположить чрезмерное увеличение количества бактерий можно по различным симптомам. К ним относится выделение зловонного кала, диарея, вздутие живота. Ребенок может стать плаксивым, отказаться от еды.

У взрослых признаками увеличения патогенной микрофлоры являются не только симптомы, характерные для той или иной болезни, но и депрессия, слабость, повышенная утомляемость. У мужчин может страдать потенции.

Если понижены?

Иногда показатели снижены. Это может происходить по физиологическим причинам. Это не имеет диагностической информации. Резкий рост может спровоцировать серьезные воспалительные реакции.

Диагностика заболеваний, вызванных бактерией

Выявить причину болезни, спровоцированной увеличенным количеством энтерококков можно только с использованием лабораторных методов исследования.

Кроме анализа кала может потребоваться исследования мочи, мазок. Последний применяется в большинстве случаев у женщин, поскольку бактерии у них нередко становятся причиной вагинитов и других воспалений половых путей.

Если энтерококки появились в большом количестве, то могут потребоваться и анализы крови для определения воспалительной реакции. Остальные методы диагностики подбираются с учетом специфики протекания патологии.

Лечение

За последние 30 лет энтерококки стали устойчивы практически ко всем известным классам антибиотиков. Несмотря на это подобные препараты являются одними из основных для лечения патологии.

Чтобы уменьшить риск развития резистентности используются комбинации различных противомикробных препаратов. Дополнительно проводится посев, чтобы определить степень чувствительности штамма энтерококка к тому или иному препарату.

Чаще всего при легком течении патологии применяются аминогликозиды. Дополнительно могут быть назначены иммуномодуляторы. Способствующие восстановлению защитных свойств организма.

Полезные энтерококки позволяют справляться с патогенной микрофлорой. Поэтому они продаются в форме специальных средств. Пробиотики предназначены для лечения дисбактериоза, восстановления нормальной микрофлоры ЖКТ.

Популярными и известными средствами являются Бифиформ, Линекс. Для создания таких препаратов чаще используют штаммы, которые были селекционированные для пищевой промышленности. Такие штаммы не рассчитаны на слишком длительный период нахождения в организме.

При слишком большом росте энтерококков применяется жидкий бактериофаг. Его можно давать детям первых месяцев жизни. Бактериофаг можно пить или использовать для клизмы.

В заключение отметим, что поддерживать нормальный рост микрофлоры в кишечнике просто, если соблюдать правильный режим питания, совершать прогулки на свежем воздухе.

Врачи напоминают, что вредные привычки снижают защитные силы организма. Поэтому рекомендуется отказаться от них, сделать упор на регулярных видах спорта и закаливания. Особое внимание уделяется грудничкам. У них иммунитет еще сформирован не до конца, поэтому нужно следить за их правильным питанием.

Дисбактериоз (Увеличено количество E. coli Lac(-) и Enterococcus spp.)


Что представляют собой энтерококки?

Энтерококки относятся к семейству энтерококковых — это округлые, иногда более вытянутые грамположительные бактерии. Размещаются на поверхности не по одиночку, а парами или цепочками. Их размер составляет от 0,6 до 2,5 микрометров.

На сегодня выделяют не менее 15-ти видов кокков. Наиболее распространенными является их фекальная разновидность. Для оптимального роста и развития им нужна определенная температура, показатели которой колеблются от 10 до 45 градусов. Наилучшая температура для их жизни и размножения – 35-37 градусов.

Ранее эти грамположительные микроорганизмы относили к стрептококкам. Причина в том, что эти два вида схожи по физиологическим характеристикам. Но уже в 1984 году специалисты начали их различать.

Их также можно назвать условно-патогенными, так как при определенных условиях они могут нанести значительный вред человеку. Одним из таких условий является ослабленная иммунная система. При этом, если энтерококки у взрослого в кале понижены, наблюдается общая ослабленность, восприимчивость к болезням, а если повышены, это говорит о наличии серьезных патологий.



Нормы и отклонения

Нормальными для организма показателями количества бактерий этого семейства являются:

  • микроорганизмов на грамм для детей до года;
  • колониеобразующих единиц для особей от года до 60-ти;
  • энтерококков на грамм для людей старше 60-ти летнего возраста.

Важно! Если энтерококки в кале снижены, это не всегда говорит о патологии. Количество меньше нормы может быть признаком физиологических особенностей конкретного человека.

В организме соотношение фекальных бактерий к энтерококкам фециум составляет 80-90 к 5-10 процентам. Остальное количество приходит на другие разновидности энтерококков. По сравнению с бифидобактериями человека, кокки занимают лишь мизерную часть и относятся к ним как 1 к 100. От общего числа микроорганизмов, что живут в человеке, они составляют лишь 1%.

Все, что переваливает за допустимые показатели, является патологией и может быть опасно для человеческого организма. Среднее количество бактерий на грамм кала составляет 1 миллион. В зависимости от возраста этот показатель уменьшается или увеличивается.


Почему появляются бактерии?

Первые бактерии попадают в организм почти сразу с первым материнским молоком. Они оседают в тонком кишечнике и прямой кишке. В нормальном количестве эти бактерии помогают организму, но если энтерококки в кале у грудничка повышены, возможными причинами этого могли стать:

  • раны и порезы на кожном покрове;
  • несоблюдение элементарных правил гигиены, отчего при кормлении ребенок заражается бактериями от матери;
  • употребление грязных, немытых продуктов;
  • контакт грязных рук со слизистыми оболочками рта;
  • дисбаланс гормонов;
  • питание, небогатое на витамины и микроэлементы;
  • нарушение в обменных процессах;
  • употребление антибиотиков, которые нарушают микрофлору кишечника;
  • отсутствие гигиены половых органов;
  • переохлаждение;
  • заражение гельминтами;
  • сниженная работоспособность иммунной системы.

Важно! Если энтерококки в кале у взрослого повышены, причиной этого может быть злоупотребление алкогольными напитками и начало процесса старения организма.

Причины повышения и понижения энтерококков в кале, способы лечения

Энтерококки – грамположительные микробы, представленные 15 различными видами. Есть непатогенные, полезные виды, условно-патогенные. Большое количество последних может привести к развитию различных заболеваний. Энтерококки имеют круглую форму. Они не могут образовывать вокруг себя капсул и спор.
Различают несколько групп: в 80-90% бактерии представлены Enterococcus faecalis, на втором месте находится Enterococcus faecium. Есть и другие, менее многочисленные виды.

Впервые наш организм сталкивается с энтерококками, когда они поступают к нам вместе с материнским молоком. Большая часть остается в тонком и толстом кишечнике.

Количество энтерококков зависит не только от особенностей организма, но и возраста. Чем взрослее человек, тем больше шансов на увеличенное количество бактерий в организме.

В норме на 1 гр. фекалий должно быть не больше 100 млн. бактерий. Если количественные характеристики не выше этой отметки, то:

  • эффективно уничтожается условно-патогенная микрофлора;
  • происходит быстрое усвоение и правильное распределение глюкозы по организму;
  • синтезируются витамины;
  • углеводы начинают расщепляться и перерабатываться;
  • повышается иммунитет.

Некоторые непатогенные виды микробов используется в пищевой промышленности для сбраживания молока, уменьшения количество патогенных микроорганизмов в продуктах питания. Некоторые разновидности используются и в медицине. На их основе делают препараты, позволяющие эффективно бороться с дисбактериозом, кишечными инфекциями.

Опасность

Количество бактерий в количестве, превышающем норму, может привести к развитию болезней. Нарушение естественного баланса может привести к увеличению условно-патогенной микрофлоры.

Патогенными они становятся при появлении в местах нетипичного обитания. Это могут быть почки, мочевыводящие пути и другие органы. Опасность скрывается за целой цепочкой серьезных заболеваний, важно следить за тем, чтобы показатели всегда были в норме.

Показатели нормы

При изучении каловых масс нормальным считается количество:

  • для детей до 1 года – 106 – 107.
  • для детей после 1 года – 107 – 108.
  • для взрослых – 106 – 108.

Причины появления

У детей чаще всего причиной становится прием лекарственных средств, переохлаждение, повреждение целостности слизистой. Иногда в кале появляются бактерии при использовании инвазивных методов диагностики.

У взрослых причин для появления в кале энтерококков больше. Это может быть длительный прием антибиотиков, гормональный дисбаланс у женщин. Иногда наблюдается большое количество бактерий у беременных женщин в результате постоянных скачков эстрогенов и андрогенов.

Обычно заразиться энтерококками невозможно, поскольку они являются естественными обитателями нашего организма. Их увеличение может быть связано с несоблюдением правил личной гигиены, снижением реактивности иммунитета.

Последнее возможно из-за стрессов, наличия различных патологий инфекционного характера. Провоцирующими факторами выступают и чрезмерное увлечение алкогольными напитками, естественное старение человека.

Энтерококки в кале повышены

Бактерия может спровоцировать развитие серьезных проблем со здоровьем. К ним относится:

  • Менингит. Инфекционное заболевание оболочки спинного или головного мозга.
  • Дивертикулит. Болезненный процесс, связанный с образованием на стенках различных образований. Нарушает процессы нормальной моторики кишечника.
  • Патологии мочеполовой системы. При отсутствии лечения могут появиться хронические формы, которые трудно поддаются лечению, становятся причинами рецидивов.
  • Эндокардит. Заболевание сердца, которое может носить острый или хронический характер. Патогенная микрофлора поражает внутреннюю оболочку предсердий, желудочка, клапанного аппарата.
  • Септический артрит. При нем происходит инфекционное поражение суставов.
  • Гастрит. Характеризуется поверхностным воспалением оболочки желудка.
  • Энтерит. Патология, которая в основном затрагивает здоровые клетки тонкой кишки.

В грудничковом возрасте предположить чрезмерное увеличение количества бактерий можно по различным симптомам. К ним относится выделение зловонного кала, диарея, вздутие живота. Ребенок может стать плаксивым, отказаться от еды.

У взрослых признаками увеличения патогенной микрофлоры являются не только симптомы, характерные для той или иной болезни, но и депрессия, слабость, повышенная утомляемость. У мужчин может страдать потенции.

Если понижены?

Иногда показатели снижены. Это может происходить по физиологическим причинам. Это не имеет диагностической информации. Резкий рост может спровоцировать серьезные воспалительные реакции.

Диагностика заболеваний, вызванных бактерией

Выявить причину болезни, спровоцированной увеличенным количеством энтерококков можно только с использованием лабораторных методов исследования.

Кроме анализа кала может потребоваться исследования мочи, мазок. Последний применяется в большинстве случаев у женщин, поскольку бактерии у них нередко становятся причиной вагинитов и других воспалений половых путей.

Если энтерококки появились в большом количестве, то могут потребоваться и анализы крови для определения воспалительной реакции. Остальные методы диагностики подбираются с учетом специфики протекания патологии.

За последние 30 лет энтерококки стали устойчивы практически ко всем известным классам антибиотиков. Несмотря на это подобные препараты являются одними из основных для лечения патологии.

Чтобы уменьшить риск развития резистентности используются комбинации различных противомикробных препаратов. Дополнительно проводится посев, чтобы определить степень чувствительности штамма энтерококка к тому или иному препарату.

Чаще всего при легком течении патологии применяются аминогликозиды. Дополнительно могут быть назначены иммуномодуляторы. Способствующие восстановлению защитных свойств организма.

Полезные энтерококки позволяют справляться с патогенной микрофлорой. Поэтому они продаются в форме специальных средств. Пробиотики предназначены для лечения дисбактериоза, восстановления нормальной микрофлоры ЖКТ.

Популярными и известными средствами являются Бифиформ, Линекс. Для создания таких препаратов чаще используют штаммы, которые были селекционированные для пищевой промышленности. Такие штаммы не рассчитаны на слишком длительный период нахождения в организме.

При слишком большом росте энтерококков применяется жидкий бактериофаг. Его можно давать детям первых месяцев жизни. Бактериофаг можно пить или использовать для клизмы.

В заключение отметим, что поддерживать нормальный рост микрофлоры в кишечнике просто, если соблюдать правильный режим питания, совершать прогулки на свежем воздухе.

Врачи напоминают, что вредные привычки снижают защитные силы организма. Поэтому рекомендуется отказаться от них, сделать упор на регулярных видах спорта и закаливания. Особое внимание уделяется грудничкам. У них иммунитет еще сформирован не до конца, поэтому нужно следить за их правильным питанием.

Источник: https://svadba1000.ru/zdorove/meditsina/3916-prichiny-povysheniya-i-ponizheniya-enterokokkov-v-kale-sposoby-lecheniya.html

Какие функции выполняют?

К положительным функциям, которые выполняют энтерококки в организме, относят:

  • защиту слизистых от вредоносного воздействия других бактерий;
  • преобразование (ферментирование) углеводов в молочную кислоту;
  • расщепление и переработка углеводов;
  • синтезирование полезных микроэлементов, витаминов;
  • снижение уровня кислотности в желудке;
  • повышение эффективности работы иммунной системы.

Когда представляют опасность?

Энтерококки несут опасность, если их количество значительно превышает показатели нормы. Ненормальным является положение, когда энтерококки в кале у взрослого снижены. Так как эти микробы выполняют важные функции, их уменьшение приводит к снижению работоспособности организма. Если разница с нормальным показателем невелика, ситуация не является критичной.

Превышение уровня бактерий несет опасность и может привести к инфекционным заболеваниям разных систем организма. В зоне риска находятся люди, проходящие курс терапии антибиотиками, или прошедшие курс химиотерапии. Также наиболее восприимчивыми к энтерококкам являются беременные и груднички.

Возможные инфекции

Несмотря на положительное влияние этих бактерий на организм человека, увеличение их количества по какой-то причине может нанести значительный вред. Их интенсивное размножение приводит к ряду заболеваний. С потоком крови с лимфой энтерококки перемещаются во все уголки организма, проникают в органы.

Высокий уровень микроорганизмов в мочеполовой системе приводит к циститу или простатиту. Наиболее распространенное последствие увеличения количества энтерококков в кишечнике – наличие дисбактериоза.

Рост бактерий опасен и для костного мозга, костей, так как приводит к остеомиелиту. Возможны возникновения инфекционных недугов дыхательной системы, септический артрит с эндокардитом и инфекционные болезни ЖКТ.

Бактериальный перитонит, причиной возникновения которого также является рост микробов, может привести к смерти человека. Кокки, кроме своих полезных функций, также вырабатывают аммиак с меркаптаном. В ничтожных количествах они не пагубны для здоровья, но чем их больше становится, тем выше риск получить пищевую токсикоинфекцию. Это приводит к возникновению болезней пищеварительной системы. Больше всего страдает печень, от чего может возникнуть цирроз или даже сепсис.

Своевременная диагностика и лечение помогут предотвратить инфекционные заболевания. Поэтому при первых признаках стоит обратиться к специалистам.

Расшифровка анализа на дисбактериоз

При взгляде на бланкетный лист анализов дисбактериоза, можно заметить длинный список микрофлоры. Не разбирающиеся в медицине люди могут сделать ошибочные выводы и предположения.

Пример анализа на дисбактериоз

Следует отметить, что форма листа анализов может различаться, в зависимости от медучреждения. Сначала могут идти полезные бактерии, затем условно-патогенные и патогенные. Либо в другом порядке.

Мы приводим несколько различных бланков анализа, чтобы вы знали про это, и не пугались, что форма результатов отличается от вашей! Поэтому просто находите строчку в своем листке полученных результатов и сравнивайте значение с нормой, которая приведена здесь на фото.

  1. БИФИДОБАКТЕРИИ. Полезными жителями микрофлоры можно по праву считать представителей бифидобактерий. Оптимальный процент их количества не должен опускаться ниже 95, а лучше составлять все 99%:
  • микроорганизмы бифидобактерий занимаются расщеплением, перевариванием и всасыванием пищевых элементов. Они отвечают за усвоение витаминов,
  • за счет деятельности бифидобактерий кишечник получает должное количество железа и кальция;
  • немалая роль бифидобактерий и в стимуляции отделов кишечника, особенно его стенок (отвечают за устранение токсинов).
  • Переваривание, всасывание, усвоение всех полезных элементов пищи
  • Можно долго говорить о пользе бифидобактерий, но это самые полезные бактерии в нашем кишечнике, чем их больше, тем лучше!

Количественный показатель бифидобактерий в бланке анализов – от 10*7 степени до 10*9 степени. Снижение цифр четко показывает наличие проблемы, в нашем случае – дисбактериоза.

  1. ЛАКТОБАКТЕРИИ. Второе место среди обитателей кишечника занимают лактобактерии. Их процентное соотношение в организме – 5%. Лактобактерии также относятся к положительной группе микрофлоры. Состав: лактобациллы, молекулы кисломолочной среды, представители от стрептококков. Исходя из названия, можно понять, что лактобактерии (кисломолочные вирусы) отвечают за выработку молочной кислоты. Она, в свою очередь, нормализует жизнедеятельность кишечника. Лакто бактерии помогают организму избежать аллергенных атак. Микроорганизмы стимулируют функцию избавления от шлаков.

Бланкетный анализ предполагает строгое количество лактобактерий – от 10*6 степени до 10*7 степени. При снижении этих микроорганизмов организм подвергнется реакции со стороны аллергенов, участятся запоры, и произойдет дефицит лактозы.

  1. КИШЕЧНАЯ ПАЛОЧКА или E. сoli (Эшерихия коли, Escherichia coli), ферментирующие лактозу — еще один житель пространства вашего кишечника. Относятся к энтеробактериям. Несмотря на то, что ей отведено лишь 1% микрофлоры, кишечная палочка очень нужна организму:
    Кишечная палочка
  • она не позволяет расплодиться в вашем кишечнике условно-патогеннным микроорганизмам, борется с ними днем и ночью;
  • кишечная палочка поглощает кислород, тем самым спасая от гибели бифидобактерий и лактобактерий.
  • при ее непосредственном участии происходит выработка витаминов группы В, и усвоение железа и кальция!
  • если произошло снижение кишечной палочки ниже либо больше нормы (т.е. ниже 10 в 7-мой степени и больше 10 в 8-ой степени) — это может говорить о наличии в кишечнике, во-первых дисбактериоза, во-вторых, наличие глистов. Норма — 107—108 кое/г

Е.coli ЛАКТОЗОНЕГАТИВНЫЕ — условно-патогенные бактерии. Их норма 10 в 4-ой степени. Повышение этого значения ведет к дисбалансу кишечной флоры. В частности это запоры, изжога, отрыжка, в животе давит и распирает. Яркие представители этих бактерий — это ПРОТЕИ и КЛЕБСИЕЛЛЫ.

ПРОТЕЙ — факультативный анаэроб, палочковидная, неспороносная, подвижная, грамотрицательная бактерия. Яркий представитель условно-патогенных бактерий.

Условно-патогенные — значит, что их количество в пределах нормы не вызывает нарушение в кишечнике. Как только норма превышена, и эти бактерии расплодились — они становятся патогенными, вредными, возникает дисбактериоз.

КЛЕБСИЕЛЛЫ — условно-патогенный микроорганизм, который является представителем семейства Enterobacteriaceae. Название получила от фамилии немецкого ученого, бактериолога и патологоанатома ее открывшего – Эдвина Клебса.

Е.coli ГЕМОЛИТИЧЕСКИЕ — кишечная палочка присутствует в отделах толстого кишечника, это конкурент бифидо- и лактобактерий. Норма — 0 (ноль). Присутствие ее в кишечнике однозначно говорит и нарушении микрофлоры. Ведет в кожных проблемам, аллергическим реакциям. Вообщем, ничего хорошего наличиие этой палочки вам не принесет.

Пример анализа на дисбактериоз

  1. БАКТЕРОИДЫ.
    Отдельные заключения анализов могут включать в себя список бактероидов. Ошибочно приписывать их к вредным бактериям. На самом деле все довольно просто – их количественный показатель не связан с работоспособностью организма.

    У новорожденных детей они практически отсутствуют, затем постепенно заселяют кишечник. До конца роль их в организме не изучена, но без них невозможно нормальное пищеварение.

  2. ЭНТЕРОКОККИ — именно эти микроорганизмы присутствуют даже у здорового кишечника.
    При оптимальном режиме работы организма процентное соотношение энтерококков не превышает 25% (107).Энтерококк

    Иначе, можно констатировать нарушение микрофлоры. Вместе с тем они — возбудители инфекций мочеполовой сферы.

    Считается, что не превышение их значения относительно нормы — хороший показатель и не стоит беспокоиться.

  3. ПАТОГЕННЫЕ МИКРОБЫ СЕМЕЙСТВА КИШЕЧНЫХ (Патогенные энтеробактерии) — это исключительно вредные бактерии. Здесь и Сальмоне́ллы
    (лат.
    Salmonella
    ), и
    Шигеллы
    (лат.
    Shigella
    ). Они являются возбудителями инфекционных заболеваний сальмонеллёзов, дизентерии, брюшного тифа и прочих. Норма — отсутствие данных микробов вообще. Если они есть — то может быть вялотекущая или проявленная инфекционная зараза. Именно эти микробы часто идут первые в списке результатов анализа на дисбактериоз.
  4. Неферментирующие бактерии — регуляторами всего пищеварительного процесса. Волокна пищи ферментируются, подготавливаются к усвоению всех полезных веществ (кислоты, белки, аминокислоты и т.д.) Отсутствие этих бактерий говорит о том, что вашему кишечнику есть куда стремиться. Пища недостаточно полноценно усваивается. Советует покушать пророщенной пшеницы и отрубей.
  5. ЭПИДЕРМАЛЬНЫЙ (САПРОФИТНЫЙ) СТАФИЛОКОКК – также относится к представителям условно-патогенной среды. Но по аналогии с энтерококками, эти микроорганизмы могут спокойно сосуществовать в здоровом организме. Их оптимальная процентная точка – 25% или 10 в 4-ой степени.
  6. КЛОСТРИДИИ (Clostridium)

    бактерии, в небольшом количестве также присутствующие в нашем кишечнике. При помощи них происходят процессы, связанные с образованием спиртов и кислот. сами по себе безобидны, могут лишь дополнять патогенную флору при ее разрастании выше нормы.
  7. ЗОЛОТИСТЫЙ СТАФИЛОКОКК Эти бактерии являются не чем иным, как микробами внешней среды. К примеру, их можно встретить на кожных или слизистых покровах нашего тела. Даже самая мизерная часть стафилококков может привести к обострениям в кишечнике. Неудивительно, что медицина давно разработала стандарт: стафилококков в бланке с анализами быть не должно. Даже малое их количество может вызвать понос, рвоту, боли в животе.Золотистый стафилококк
    Важной особенностью кишечника является то, что золотистые стафилококки никогда не проявятся сами по себе. Они всецело зависят от количества положительных микроорганизмов и представителей бифидобактерий.

    Полезная микрофлора (бифидо- и лактобактерии) способна подавлять агрессию со стороны стафилококка. Но если он все же попадет в кишечник, то организм подвергнется аллергическим реакциям, гноению и зуду кожи.

    У человека могут возникнуть серьезные проблемы с желудочно-кишечным трактом. В этом случае лучше сразу обратиться к врачу.

  8. ДРОЖЖЕПОДОБНЫЕ ГРИБЫ CANDIDA (Кандида)Грибы Candida albicans
    Candida грибки – обитают в кишечнике человека, в количестве менее 10 в 4-ой степени. Численность может увеличиться, если пациент активно принимает антибиотики.

    Увеличение грибков при общем снижении нормальной микрофлоры приводит к развитию молочницы, как правило, у женщин либо стоматиту (у детей). Заболевание затрагивает слизистые оболочки тела человека: рот и мочеполовую систему.

    Кандидоз – это общее название болезней, связанных с активным ростом и жизнедеятельностью этих грибов (молочница, стоматит и т.д.).

    Бывают случаи, когда анализы не выявляют снижения микрофлоры, при этом наблюдается увеличение грибковых микроорганизмов.

    Такая практика свидетельствует о том, что концентрация грибков проявляется не внутри организма, а во внешней среде. В первую очередь речь идет о кожных покровах, например, возле заднего прохода (ануса).

    Назначается лечение, в ходе которого проблемные участки кожи обрабатываются с помощью мази против грибков.

Остальные микроорганизмы подвергаются анализу только в крайне редких случаях. Самым выделяющимся патогеном этой группы считают синегнойную палочку (Pseudomonas aerugenosa).

Иногда в бланке анализа можно встретить любопытный термин: abs. Но ничего страшного он не обозначает. С помощью такого написания медицинские работники отмечают отсутствие какого-либо элемента микрофлоры. Также в бланке анализа можно встретить понятное всем нам словосочетание «не обнаружено».

Как показывает практика, диагностика состоит из расшифровки сведений 15 – 20 разновидностей бактерий. Это не так много, если учесть, что наш организм состоит из 400 видов микробов. Сданный на анализ кал человека тщательно исследуется на предмет наличия бифидобактерий и возбудителей различных болезней (стафилококков, протей и др.).

Дисбактериоз – это снижение количественного показателя бифидобактерий и одновременное увеличение патогенных микроорганизмов кишечника.

Нормы микрофлоры кишечного тракта

Пример 1- Состав микрофлоры кишечника в норме

  • Нормальная микрофлора:
  • Кишечная палочка — 10 в 6 степени (10*6) или 10 в 7 степени (10*7)
  • Споровые анаэробы — 10*3 и 10*5
  • Лактобацилы — 10 в 6 степени и выше
  • Бифидобактерии — 10 в 7 степени и выше
  • Патогенная и условно‑патогенная микрофлора:

Пример 2 — Состав микрофлоры кишечника в нормеПример 3 — Состав нормальной микрофлоры кишечника у детей

Анализ кала на дисбактериоз. Как это все делать?

  1. Первое, что нужно помнить – это несовместимость антибиотиков с забором кала на посев. Рекомендуется выдержать не менее 12 часов после завершения курса лекарств, и только потом готовить анализы. Сбор кала осуществляется естественным путем, без дополнительной стимуляции отделов кишечника. Не следует ставить клизмы, употреблять барий – материал для исследования получится непригодным.
    Перед тем как собирать кал для анализа, необходимо опорожнить мочевой пузырь. Дефекация должна происходить естественным путем, желательно не в унитаз, а в судно или горшок. В кал не должна попадать моча. Место для сбора фекалий обрабатывается дезинфицирующими средствами и промывается кипяченой водой.
  1. В больнице обычно выдают закрывающийся контейнер с ложечкой.
    В него нужно поместить материал для диагностики дисбактериоза. После того как вы соберете кал в емкость, необходимо сразу же доставить его в лабораторию. Максимально отведенное время для этого – 3 часа. Если не успеваете, то поместите контейнер с калом в холодную среду (но не в холодильник).
  1. Обязательные условия для сбора и хранения фекалий на анализы:
  • запрещается хранить анализы в течение более 5 часов;
  • контейнер должен быть плотно закрытым;
  • дефекация должна проводиться в день исследования кала, а не накануне.

При несоблюдении условий, можно столкнуться с искаженными данными лабораторных исследований.

В таком случае, картина болезни будет неполной, а предположения врача не подтвердятся. Придется сдавать кал на посев по второму разу.

Анализ на дисбактериоз: отрицательные стороны

Если обратиться к медицинской литературе, то можно найти полярные мнения по анализу на дисбактериоз. И для того, чтобы иметь представление не только о достоинствах, но и о недостатках указанного метода, рассмотрим отрицательные стороны. В любом случае, за ваше лечение отвечает врач, именно ему решать каким способом брать анализы.

Лечебная терапия

Лечение инфекционного заболевания подразумевает комплексный подход, который состоит из антибактериальной терапии, употребления препаратов для укрепления иммунитета, физио- и симтоматической терапии. Лечебная терапия может включать и использование народных методов. Если вместе с ростом энтерококков параллельно обнаружены дополнительные заболевания, проводится их лечение.

Легкая форма инфекционного заболевания лечится на протяжении 2-3, максимум 7 дней. Осложненная форма подразумевает длительность терапии до месяца. Несколько дней уходит на лечение, если энтерококки в кале у ребенка понижены.

Назначение антибиотиков и других препаратов происходит исходя из результатов анализа, возраста пациента. Самолечение может усугубить ситуацию и увеличить рост бактерий или снизить деятельность иммунной системы.

У детей

Для получения быстрых положительных результатов необходимо точное определение разновидности бактерии, которая стала возбудителем болезни. Обнаружение энтерококков у ребенка в большом количестве подразумевают употребление Интести-бактериофага в жидком виде. Этот препарат относится к антибактериальным и используется для лечения широкого спектра заболеваний пищеварительного тракта.

Лекарство употребляется в чистом виде, но при первых использованиях возможны осложнения, поэтому его рекомендуют разбавлять кипяченой водой. Если по истечении нескольких дней не обнаружено побочных эффектов, бактериофаг используется без разведения. Для грудничков есть возможность применения клизмы с представленным препаратом. Употреблять его нужно три раза в день перед приемом пищи.

Если от инфекции страдает ребенок старше трехлетнего возраста, перед применением бактериофага следует выпить содовый раствор, состоящий их половины стаканы воды и половины ложки соды.

Представленный метод является не настолько эффективным, как терапия при использовании антибиотиков. Но врачи отдают предпочтение именно этому варианту, так как детская иммунная система только начинает формироваться, а антибиотики могут негативно повлиять на ее работоспособность.

Если у ребенка мало энтерококков в кале, назначают применение препаратов с содержанием этих же кокков и бифидобактерий.

У взрослых

Энтерококки в кале понижены или повышены, что это значит и что с этим делать, решает специалист. Назначение лечения у взрослых подразумевает употребление антибиотиков Рифаксимина, Рокситромицина и Линезолида. Беременным применение антибиотиков не рекомендуется, вместо этого им назначается Интести-бактериофаг.

Укрепление иммунитета происходит посредством Иммунал, Лизобакт с Имудоном. Восстановление нормальной микрофлоры кишечника подразумевает использование Линекса, Аципола, Бифидумабактерина.

Симптоматическая терапия позволяет употребление обезболивающих препаратов вроде Но-шпы, Папаверина. Тошнота и рвота устраняется Мотилиумом, Пипольфеном.

Из народной медицины себя зарекомендовали настои из ромашки, черноплодной рябины. Они обладают противомикробным действием. На стакан кипяченой воды добавляют 1-2 ложки сырья. Пьют его дважды в день за полчаса до еды.

Снижает уровень кокков в организме употребление малины с земляникой, кураги, черники с барбарисом и черной смородины.

Лечение энтерококковой инфекций

Лечение инфекционного заболевания, спровоцированного энтерококками, предусматривает прием жидкого инвести-бактериофага. Схема – трижды в день перед едой.

Для приема новорожденными препарат предварительно разбавляется водой. Если нет возможности напоить ребенка средством, то можно применить клизменное введение бактериофага.

Стоит отметить, что лечение бактериофагами значительно уступает терапии антибиотиками. Но, учитывая, что иммунная система малыша еще только формируется, то это наиболее безопасное средство для детского организма.

Доктор Комаровский по поводу увеличенного показателя уровня энтерококков у детей первого года жизни традиционно имеет собственное мнение. Согласно Комаровскому, превышение общего количества энтерококков над числом кишечных палочек – физиологическая норма, не нуждающаяся в лечении.

Профилактические мероприятия

Конкретных методов против роста энтерококков не существует. Но профилактические меры могут помочь предотвратить изменение их количества и сопутствующие им заболевания. Профилактика включает:

  • наличие гигиены, которая касается не только мытья рук, но и всего тела, особенно, если речь идет о маленьких детях;
  • мытье продуктов питания, фруктов и овощей перед употреблением;
  • отказ от курения, злоупотребления алкоголем;
  • контроль приема антибиотиков и других лекарственных препаратов, так как их частое употребление приводит к дисбактериозу;
  • сохранение организма от переохлаждений;
  • соблюдение режима дня;
  • своевременное лечение.

Энтерококки выполняют важную функцию в деятельности организма. В здоровом состоянии они не приносят дискомфорт, а только улучшают функциональность. Повышение нормы приводят к инфекционным заболеваниям. Поэтому поддержание этих бактерий на нормальном уровне – важное условие для сохранения здоровья.

Особенности бактерии

Основной особенностью энтерококков является то, что они относятся к условно-патогенным микроорганизмам. Их выявлено около 20 видов:

  • pallens;
  • Е. gilvus;
  • Е. faecalis;
  • Е. faecium;
  • Е. avium;
  • Е. casseliflavus;
  • Е. durans;
  • Е. gallinarum;
  • Е. malodoratus;
  • Е. raffinosus
  • Е. mundtii и др.

Некоторые из них являются частью микрофлоры, обязательным компонентом пищевых продуктов. Они способствуют молочнокислому брожению. Их используют в пищевой промышленности для изготовления твёрдых сыров и творога.

В организме человека в основном обитают энтерококки вида:

Эти штаммы энтерококков, вместе с другими аэробными кокками, составляют 25% всей пристеночной микрофлоры тонкой кишки и 5–6% микрофлоры толстой кишки.

Они необходимы, так как:

  • участвуют в синтезе витаминов;
  • расщепляют сложные углеводы;
  • не дают размножаться другим патогенным микроорганизмам;
  • усиливают иммунитет.

Энтерококки входят в состав пробиотиков – лекарственных препаратов, нормализующих микрофлору кишечника:

Для изготовления медикаментов и продуктов питания используют наименее патогенные штаммы энтерококков.

В то же время, именно те штаммы, которые обитают в кишечнике (энтерококки фекалис и фэциум) являются наиболее патогенными для человека. При интенсивном росте колоний возникают гнойно-воспалительные заболевания. Они являются основной причиной развития госпитальных инфекций. При этом лечение их затруднено: энтерококки устойчивы к воздействию желудочного и кишечного сока, проявляют резистентность к большинству антибиотиков. Уменьшается их количество при снижении кислотности желудочного сока.

Если в окружающей среде, особенно на пищевых продуктах, накапливаются эти виды энтерококков, то возрастает риск экзогенного инфицирования. Поэтому работники пищевой промышленности проходят особую медицинскую комиссию. При выявлении повышенного содержания энтерококков они не допускаются к работе.

🧬 Анализ на «дисбактериоз»: пожалуйста, хватит

Прилетели как-то на Землю инопланетяне. Посмотрели: ледники тают, озоновые дыры растут, панды не размножаются. Стали думать, отчего это все. Спустились в московский район Бирюлево. Взяли сотню человек, раздели, пощупали, допросили. Сделали вывод: озоновые дыры — из-за брюнетов (много их попалось), панды не размножаются из-за мужиков — их на летающей тарелке оказалось больше половины. Ну, а глобальное потепление — из-за рубля: у всех жителей Бирюлево в карманах оказалась эта валюта. Улетели инопланетяне к себе домой и по результатам исследования напечатали своими зелеными щупальцами десять кандидатских диссертаций.

Вот как-то так и проводится «анализ на дисбактериоз». Поговорим об этом диагнозе с гастроэнтерологом GMS Clinic Головенко Алексеем.

Что не так с этим исследованием? Его же так часто назначают врачи!

  1. Давайте оговоримся: его назначают врачи только в странах бывшего СССР. За пределами этих государств простой посев стула для выявления дисбаланса микрофлоры не выполняется. Вы не найдете указаний на необходимость этого исследования ни в руководстве WGO по синдрому раздраженного кишечника, ни в рекомендациях ACG (Американской коллегии гастроэнтерологов) по острой диарее, ни в стандарте AAFP (Американской ассоциации семейных врачей) по наблюдению новорожденных с коликами. Ну и, естественно, никакого диагноза «дисбактериоз» нет ни в Международной классификации болезней, ни в хотя бы одном (!) нерусскоязычном учебнике.
  2. В нашем желудочно-кишечном тракте обитает не менее 1000 (тысячи!) видов бактерий, а число всех выявленных видов составляет 2172. Выполняя «анализ кала на дисбактериоз» мы помещаем в питательную среду стул и дожидаемся роста (появления колоний) приблизительно 20 видов бактерий, которые мы выбрали только потому, что они в состоянии расти в этой питательной среде.8 в грамме стула. Ссылок на литературу в стандарте полно, но, что подозрительно, среди них нет ни одной зарубежной публикации. Ну а сами статьи и учебники не описывают, как именно сравнивали микрофлору здоровых и больных людей, то есть как именно был сделан вывод о нормальном содержании той или иной бактерии.
  3. Бактерии, обнаруживаемые в стуле (который формируется в толстой кишке) — это совсем не те же бактерии, что обитают в ротовой полости или тонкой кишке. Кроме того, бактерии в стуле (то есть в просвете кишки) — это совсем не бактерии, обитающие в слизи, защищающей кишечную стенку. Вообще, через наш пищеварительный тракт «пролетает» безумное количество чужеродных бактерий, грибов и вирусов. К счастью, большая их часть не могут подобраться к кишечной стенке: обитающая там пристеночная микрофлора конкурирует с «пришельцами». Мы называем это явление колонизационной резистентностью, и именно ему мы обязаны тем, что первая же проглоченная со стаканом московской воды условно-патогенная бактерия не вызывает у нас понос.
  4. Состав и соотношение кишечных бактерий у каждого человека свои. Изучив (не посевом кала, конечно, а сложнейшими генетическими методами) состав бактерий в стуле, можно, например, угадать принадлежит ли образец жителю Нью-Йорка или побережья Амазонки. Ну, или в каком регионе отдельной страны (например, Дании). проживает человек, отправивший на анализ свои фекалии. В общем, истинный состав кишечной микрофлоры — наши «отпечатки пальцев», и предполагать некую общую норму, а уж тем более судить о «нормальности» флоры всего по 20 видам из 1000 — смешно.
  5. То, будут ли размножаться бактерии на питательной среде, зависит не только от того, какие бактерии в стуле живут, но и от того, как стул собрали (с унитаза, со стерильной бумаги), как хранили (в холодильнике, у батареи, у окна), как быстро доставили в лабораторию. Много ли людей, которым рекомендовали анализ на дисбактериоз читали вот эту инструкцию, согласно которой кал нужно собрать в стерильную посуду, поместить в холодильник и нести в лабораторию не в руках, а в термосе с кубиком льда? Впрочем, даже при совершении этих действий результат анализа на дисбактериоз интерпретировать нормальный врач не может. А значит, не должен и пытаться это сделать.

В питательной среде появились колонии бактерий. К счастью для нас, действительно опасная Сальмонелла растет в питательной среде. Большая часть кишечных бактерий, увы, нет.

Так что, нет такого понятия — «дисбактериоз»?

Конечно, есть. Например, псевдомембранозный колит — тяжелое воспаление толстой кишки после антибиотика — самый настоящий дисбактериоз: погибли конкуренты, и поэтому размножается Clostridium difficile. Только для того, чтобы это лечить, совершенно не нужно констатировать очевидное — состав бактерий в кишке изменился. Достаточно подтвердить инфекцию (выявить токсины C.difficile) и назначить лечение.

Кишечная микрофлора, вне сомнения, влияет на все процессы в нашем организме. Пересадив стул от мыши с ожирением мышке с нормальным весом, у последней мы вызываем ожирение. Состав кишечных бактерий принципиально разный у людей с тревожностью и депрессией. Ну, а добавление пробиотика Bacteroides fragilis мышам, у которых искусственно вызвали аутизм, улучшает их социальные навыки. Прочитайте популярную книгу «Смотри, что у тебя внутри» известного микробиолога Роба Найта: наши знания о микрофлоре колоссальны, но применять их на практике (то есть для лечения болезней) мы пока только начинаем.

Состав бактерий можно и нужно изучать. Этому посвящено амбициозное международное исследование Human Microbiome Project с бюджетом $115 млн. Естественно, никакие «посевы стула» при этом не используются. Для анализа микробных «джунглей» кишечника используются методы метагеномики. Они позволяют описать, сколько уникальных последовательностей ДНК присутствует у конкретного человека, какие группы бактерий преобладают, а какие отсутствуют. К слову, когда такие технологии (например, секвенирование 16S-рРНК появились, выяснилось, что 75% видов, обнаруживаемых при генетическом анализе того же кала, вообще не известны науке.

Стоп. То есть делать посев стула вообще нет смысла?

Я этого не говорил. Мы обязательно выполняем посев стула, если хотим выявить рост по-настоящему вредных бактерий. Например, у человека с кровавой диареей мы пытаемся найти Сальмонеллу или Шигеллу, Кампилобактерию или особую разновидность кишечной палочки. Здесь посев кала жизненно необходим, ведь так мы сможем назначить лечение антибиотиком — убить конкретного возбудителя.

Грамотный врач выполняет диагностический тест только тогда, когда его результат может изменить лечение. Если и при «дефиците» лактобактерий, и при «избытке» кишечной палочки будет назначено одно и то же лекарство или диета, анализ является пустой тратой денег.

Полноценное исследование собственной микрофлоры уже можно сделать на коммерческой основе в США и Европе. Стоит «удовольствие» около 100 евро, и в результате генетического анализа микрофлоры вы получите заключение (например, вот такое) о преобладающих в вашем пищеварительном тракте бактериях. Проблема в том, что и эти результаты невозможно применить на практике. Потому что:

пока у нас НЕТ способа, избирательно менять состав кишечных бактерий.

Предположим, мы однозначно установили, что у человека имеется дефицит какой-то конкретной микроорганизмы (например, лактобактерий). Мы можем:

  • Дать пробиотик (то есть конкретную живую бактерию) и надеяться, что она останется жить в кишечнике.
  • Дать пребиотик (то есть «корм» для бактерии) и надеяться, что это усилит рост именно нужной нам бактерии.
  • Дать антибиотик (яд для бактерии) и надеяться, что погибнет именно чрезмерно размножившаяся бактерия.
  • Пересадить человеку чужую микрофлору — сделать трансплантацию фекальной микробиоты (ввести разбавленный стул здорового человека больному человеку).

Очевидно, избирательным действием можно считать только назначение пробиотика. Максимальная доза лучшего коммерческого пробиотика — это 10 млрд. жизнеспособных бактерий в дозе препарата. В кишечнике обитает около 100 триллионов бактерий. То есть, на каждую бактерию «из аптеки» приходится 10 тысяч бактерий, уже «проживающих» в кишке. Маловероятно, что это ничтожное количество бактерий сможет преодолеть колонизационную резистентность и «заселить» кишку. Кроме того, механизм действия пробиотиков (когда они работают) может вообще быть связан с не с самими бактериями: у трансгенных мышей, предрасположенных в воспалению кишечника это самое воспаление удалось остановить, применяя не «живой» пробиотик, а вообще ДНК и некоторые белки, выделенные из «убитого» температурой препарата.

Ну, а главное: одно дело — теория и лабораторные исследования, другое дело — клинические испытания (то есть изучение эффекта препаратов у людей). Разберем три типовых для России ситуации, когда человеку предлагают сдать «анализ кала на дисбактериоз»:

Колики у новорожденного

Мама жалуется, что ребенок много плачет. К слову, любой ребенок в первые три месяца жизни кричит от 117 до 133 минут в сутки (мета-анализ). Наличие или отсутствие колик (беспричинный крик более 3 часов за день хотя бы 3 дня в неделю), в целом, не влияет на риск задержки развития ребенка. В одном исследовании, простая беседа с родителями о «безопасности» колик уменьшала продолжительность плача с 2,6 до 0,8 часов в день. Дети — эмпаты.

Чаще бывает не так. Выполняется анализ кала на дисбактериоз, там, естественно (норма-то взята с «потолка»), обнаруживаются «отклонения». Назначается пробиотик. И часто ведь помогает: еще бы, ведь частота колик неумолимо снижается с возрастом ребенка. При этом уверенности в том, что пробиотики вообще эффективны при коликах, у нас нет. Многочисленные мета-анализы, посвященные лечению и профилактике этого состояния, не смогли однозначно подтвердить эффективность пробиотиков. Возможно, какое-то полезное действие оказывает пробиотик Lactobacillus reuteri. Вот только для того, чтобы назначить этот препарат, анализ кала на «дисбактериоз» нам совершенно не нужен.

Атопический дерматит у ребенка

Все уверены, что проблемы с кожей — от «живота». Будь это так, наверное, атопический дерматит прекрасно лечился бы пробиотиками. Но этот подход не слишком эффективен. Последний мета-анализ свидетельствует: применение пробиотиков (главным образом, Lactobacillus rhamnosus GG) несколько уменьшает выраженность экземы, но эффект этот весьма символический, а дополнительная терапия пробиотиком не позволяет сократить частоту применения местных стероидов, которые (вместе с увлажнением кожи) остаются основой лечения атопического дерматита. И вновь: назначить этот пробиотик мы можем вне зависимости от «результатов» «анализа на дисбактериоз».

Вздутие и спазмы в животе у взрослого

Вздутие живота чаще всего является проявлением избыточного бактериального роста в тонкой кишке (СИБРа), при котором помогает не пробиотик, а антибиотик, например, рифаксимин. Это состояние диагностируется при помощи специального дыхательного теста. Нередко постоянное вздутие живота является следствием внешнесекреторной недостаточности поджелудочной железы: дефицит ферментов в стуле можно выявить при помощи теста на фекальную эластазу, назначив при снижении постоянную терапию ферментами. Но чаще всего ощущение «вздутия» связано с повышенной чувствительностью кишки (висцеральной гиперчувствительностью), которая развивается у людей с синдромом раздраженного кишечника. Как вы уже догадались, для того, чтобы оценить количество бактерий в тонкой кишке, функцию поджелудочной железы или чувствительность кишки к растяжению, изучать 20 бактерий в кале бессмысленно. Да и эффективность пробиотиков при синдроме раздраженного кишечника вызывает сомнения.

Так нужно хоть в какой-то ситуации сдавать «кал на дисбактериоз»?

Нет. Никогда. Ни при каких обстоятельствах. Мы не лечим вздутие живота, изучая линии на ладони. Мы не лечим сыпь, глядя в хрустальный шар. Мы не делаем бессмысленный анализ на дисбактериоз, чтобы назначить лечение.

Мы ждем, когда доказательная медицина предложит нам эффективные препараты и практические способы понять, что не так с нашими бактериями.

Жду вместе с вами!

Источник: deti.mail.ru

Расшифровка анализа кала на дисбактериоз

Таблица 1. Качественный и количественный состав основной микрофлоры толстого кишечника у здоровых людей (Кое/г Фекалий)

(Отраслевой стандарт 91500.11.0004-2003 "Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника" - УТВЕРЖДЕНО приказом Минздрава России от 09.06.2003 г. N 231)

 

Виды микроорганизмов Возраст, годы        
< 1 1-60   > 60  
Бифидобактерии   1010  - 1011 109 - 1010   108 – 109
Лактобактерии   106  - 107 107 – 108   106  - 107
Бактероиды   107 – 108  109 - 1010   1010  - 1011
Энтерококки  105  - 107 105 – 108   106 – 107
Фузобактерии   < 106     108 – 109  108 – 109
Эубактерии   106  - 107 109 - 1010  109 - 1010 
Пептострептококки  < 105     109 - 1010  1010
Клостридии     <= 103 <= 105 <= 106
Эшерихии (E.coli):                       
E.coli типичные 107 – 108 107 – 108 107 – 108
E.coli лактозонегативные   < 105 < 105 < 105
E.coli гемолитические   0 0 0
Другие условнопатогенные энтеробактерии <*>                         < 104 < 104 < 104
Стафилококк золотистый            0 0 0
Стафилококки (сапрофитный, эпидермальный)                             <= 104 <= 104 <= 104
Дрожжеподобные грибы рода Candida <= 103 <= 104 <= 104
Неферментирующие бактерии <**>                     <= 103 <= 104 <= 104

<*> - представителиродов Klebsiella, Enterobacter, Hafnia, Serratia, Proteus, Morganella, Providecia,

Citrobacter идр.

<**> - Pseudomonas, Acinetobacter идр.

Микроорганизмы, перечисленные в бланке анализа на дисбактериоз, можно разделить на три группы: 

  • молочнокислые бактерии нормальной микрофлоры - преимущественно бифидобактерии и лактобактерии,
  • патогенные энтеробактерии,
  • условно-патогенная флора (УПФ).

 

Молочнокислые бактерии

Основу нормальной микрофлоры кишечника составляют молочнокислые бактерии - бифидобактерии, лактобактерии и пропионовокислые бактерии с преобладанием бифидобактерий, которые выполняют ключевую роль в поддержании оптимального состава биоценоза и его функций. Падение количества бифидобактерий и лактобактерий ниже нормы говорит о наличии проблем в организме. Как минимум, это воспаление на слизистых оболочках и снижение иммунной защиты.

Патогенные энтеробактерии

Патогенные энтеробактерии - это бактерии, способные вызывать острые кишечные инфекции (возбудители брюшного тифа - сальмонеллы, возбудители дизентерии - шигеллы, возбудители йерсиниоза - йерсинии и др.) Их присутствие в кале - это уже не просто дисбактериоз, а показатель опасного инфекционного заболевания кишечника.

Условно-патогенная флора (УПФ)

К условно-патогенной флоре относятся лактозонегативные энтеробактерии, клостридии, различные кокки и др. Суть этих микробов отражена в названии группы: «условно-патогенные». В норме они не вызывают нарушений. Многие из них даже могут быть в определенной степени полезны организму. Но при превышении нормы и/или неэффективности иммунной защиты они могут стать причиной серьезных заболеваний. Конкурируя с полезными бактериями, условно-патогенная флора может войти в состав микробной пленки кишечника и стать причиной функциональных нарушений, воспалительных и аллергических заболеваний.

Возможно попадание условно-патогенной флоры через кишечную стенку в кровь и распространение ее по организму (транслокация), что особенно опасно для детей раннего возраста и лиц с выраженными иммунодефицитами, у которых эти микроорганизмы могут вызвать различные заболевания, в том числе, опасные для жизни.

Пояснения к таблице

Обычно количество обнаруженных бактерий в бланке анализа обозначается числом 10 в какой-либо степени: 103, 105, 106 и т. д. и аббревиатурой КОЕ/г, что означает количество живых, способных к росту бактерий в 1 г фекалий.

Аббревиатура «abs» напротив названия бактерии означает, что данный микроорганизм не был обнаружен в пределах нормы и выше ее, а значения ниже нормы (субнормальные), как несущественные, не смотрели.

Бифидобактерии

Бифидобактерии – это основа нормальной микрофлоры толстого кишечника. В норме их содержание в кишечнике должно быть у детей до года - 1010 - 1011, у взрослых  - 109-1010 КОЕ/г. Заметное снижение количества бифидобактерий - главный признак наличия дисбактериоза и иммунных нарушений.

Дефицит бифидобактерий приводит к росту интоксикации, нарушению процессов углеводного обмена, всасывания и усвоения в кишечнике витаминов, кальция, железа и других микро- и макроэлементов. Без биопленки из бифидобактерий меняется структура и нарушаются функции слизистой оболочки кишечника, уменьшается количество иммунных клеток и их активность, повышается проницаемость кишечника для чужеродных агентов (токсинов, вредоносных микробов и др.). В результате значительно увеличивается токсическая нагрузка на печень и почки, повышается риск развития инфекций и воспалений, авитаминозов и различных микроэлементозов.

Лактобактерии

Лактобактерии, так же как и бифидобактерии, являются одной из главных составляющих нормальной микрофлоры человека. Норма содержания в кишечнике у детей до года - 106  - 107, у взрослых  - 107-108 КОЕ/г. Значительное снижение количества лактобактерий говорит не только о дисбиотических нарушениях, но и о том, что организм находится в состоянии хронического стресса, а также о снижении противовирусной и противоаллергической защиты, нарушениях липидного обмена, обмена гистамина и т. д. Дефицит лактобактерий сильно повышает риск развития аллергических реакций, заболевания атеросклерозом, неврологических нарушений, сердечно-сосудистых заболеваний, может также стать  причиной запоров, развития лактазной недостаточности.

Бактероиды

Бактероиды - условно-патогенные бактерии. Вторая по численности (после бифидобактерий) группа кишечных микроорганизмов, особенно у взрослых (норма - до 1010 КОЕ/г), у детей до года - 107-108. При содержании в пределах нормы они выполняют много полезных для организма функций. Но при нарушении баланса в кишечном микроценозе или при превышении нормы бактероиды могут приводить к многообразным инфекционно-септическим осложнениям. При избыточном росте бактероиды могут подавлять рост кишечной палочки, конкурируя с ней за кислород. Бесконтрольный рост бактероидов и проявление ими агрессивных свойств ограничивают основные компоненты защитной флоры -  бифидобактерии, лактобациллы и пропионовокислые бактерии.

Энтерококки

Энтерококки - наиболее часто встречающиеся в кишечнике здоровых людей условно-патогенные микроорганизмы. Норма содержания для детей до года - 105-107,  для взрослых – 105-108 (до 25% от общего количества кокковых форм). Некоторые специалисты считают их безобидными. На деле же многие энтерококки способны вызывать воспалительные заболевания кишечника, почек, мочевого пузыря, репродуктивных органов не только при превышении ими допустимого количества (при содержании более 107), но и в количестве, соответствующем верхней границе нормы (106-107), особенно у людей со сниженным иммунитетом.

 

Фузобактерии 

Фузобактерии - условно-патогенные бактерии, основные места обитания которых в человеческом организме - толстая кишка и респираторный тракт. В полости рта у взрослого человека содержится 102-104 КОЕ/г фузобактерий. Допустимое количество в кишечнике у детей до года  < 106, у взрослых - 108 – 109.

Некоторые виды фузобактерий при иммунодефицитах могут вызывать вторичные гангренозные и гнойно-гангренозные процессы. При ангине, герпетическом стоматите, гипотрофии у детей, при иммунодефицитных состояниях возможно развитие фузоспирохетоза - некротического воспалительного процесса на миндалинах, слизистой оболочки полости рта.

 

Эубактерии (лат. Eubacterium)  

Относятся к основной резидентной микрофлоре как тонкой, так и толстой кишки человека и составляют значительную часть от всех населяющих желудочно-кишечный тракт  микроорганизмов. Допустимое количество эубактерий в кале здоровых людей: у детей первого года - 106-107 КОЕ/г; у детей старше года и взрослых, включая пожилых - 109-1010 КОЕ/г.

Примерно половина видов эубактерий, обитающих в организме человека, могут участвовать в развитии воспаления ротовой полости, формировании гнойных процессов в плевре и легких, инфекционного эндокардита, артрита, инфекций мочеполовой системы, бактериального вагиноза, сепсиса, абсцессов мозга и прямой кишки, послеоперационных осложнений.

Повышенное содержание эубактерий обнаруживается в фекалиях больных полипозом толстой кишки. Эубактерии редко встречаются у детей, находящихся на грудном вскармливании, но у детей, находящихся на искусственном вскармливании могут выявляться в количестве, соответствующем норме взрослого человека.

 

Пептострептококки

Пептострептококкиотносятся к нормальной микрофлоре человека. Норма содержания в кале у детей до года  < 105, у детей старше года и взрослых - 109 – 1010. В организме здорового человека пептострептококки обитают в кишечнике (в основном, в толстой кишке), ротовой полости, влагалище, дыхательных путях. Обычно пептострептококки являются возбудителями смешанных инфекций, проявляясь в ассоциациях с другими микроорганизмами.

Клостридии

Условно-патогенные бактерии, представители гнилостной и газообразующей флоры, количество которых зависит от состояния местного иммунитета кишечника. Основное место обитания в человеческом организме - толстая кишка. Допустимое количество клостридий у детей до года не более 103, а у взрослых - до 105 КОЕ/мг.

В комплексе с другой условно-патогенной флорой клостридии могут вызывать разжижение стула, понос, повышенное газообразование, которое наряду с тухлым запахом кала (симптомы гнилостной диспепсии) является косвенным признаком повышенной численности и активности этих бактерий. В определенных условиях они могут быть причиной некротического энтерита, вызывать пищевую токсикоинфекцию, сопровождающуюся водянистой диареей, тошнотой, коликами в животе, иногда лихорадкой.

При приеме некоторых антибиотиков клостридии могут вызывать антибиотикоассоциированную диарею или псевдомембранозный колит. Кроме проблем с кишечником, клостридии могут вызывать заболевания мочеполовых органов человека, в частности, острый простатит. Симптомы воспаления, спровоцированного клостридиями во влагалище, имеют сходство с симптомами кандидозного вагинита («молочницы»).

 

E.coli типичные (эшехирии, кишечная палочка типичные), т. е. с нормальной ферментативной активностью

Условно-патогенные микроорганизмы, которые вместе с бифидо- и лактобактериями относятся к группе защитной микрофлоры кишечника. Эта палочка препятствует заселению кишечной стенки чужеродными микроорганизмами, создает комфортные условия для других важных бактерий кишечника, например, поглощает кислород, являющийся ядом для бифидобактерий. Это главная «фабрика витаминов» в организме.

В норме общее содержание кишечной палочки - 107-108 КОЕ/ мг (что соответствует 300-400 млн/г). Повышенный уровень E. coli в кишечнике может стать причиной воспаления, сопровождающегося нарушениями стула и болями в животе. А ее проникновение из кишечника в другие экониши организма (мочевыводящие пути, носоглотку и т. д.) – причиной цистита, заболеваний почек и др.

Снижение этого показателя является сигналом о высоком уровне интоксикации в организме. Сильное снижение количества кишечной палочки типичной (до 105 КОЕ/ мг и ниже) – косвенный признак присутствия паразитов (например, глистов или паразитических простейших - лямблий, бластоцист, амеб и др.). Кроме паразитов, среди самых вероятных причин снижения уровня кишечной палочки существование в организме очагов хронической инфекции, повышенная аллергизация, дисфункции или заболевания различных органов, в первую очередь печени, почек, поджелудочной и щитовидной желез. Чтобы избежать ошибочного диагноза и, соответственно, неправильного лечения, рекомендуется сначала исключить паразитарное заражение.

Кишечная палочка со сниженной ферментативной активностью (E.coli лактозонегативные).

Норма содержания – не более 105 КОЕ/г. Это неполноценная разновидность кишечной палочки, которая прямой опасности обычно не представляет. Но эта палочка - «тунеядец». Она занимает место полноценной E.coli, не выполняя при этом присущих полноценной E.coli полезных функций. В результате организм недополучает необходимые ему витамины, ферменты и другие полезные вещества, синтезируемые полноценными эшерихиями, что в итоге может привести к серьезным обменным нарушениям и даже воспалительным заболеваниям. Присутствие этой палочки в количестве выше допустимой нормы - всегда признак начинающегося дисбактериоза и, наряду со снижением общего количества кишечной палочки, может быть косвенным показателем присутствия в кишечнике паразитических простейших или глистов.

E.coli гемолитическая (гемолитическая кишечная палочка)

Патогенный вариант кишечной палочки. В норме должна отсутствовать. Ее присутствие  требует иммунокоррекции. Может вызывать аллергические реакции и различные кишечные проблемы, особенно у маленьких детей и лиц с ослабленным иммунитетом. Часто образует патогенные ассоциации с золотистым стафилококком, но в отличие от него практически не встречается в составе грудного молока.

Другие условно-патогенные энтеробактерии

(протеи, серрации, энеробактеры, клебсиеллы, хафнии, цитробактеры, морганеллы и др.) Большая группа лактозонегативных энтеробактерий большей или меньшей степени патогенности. Допустимое количество этих микроорганизмов менее 104 КОЕ/г. Большее количество этих бактерий является признаком дисбактериоза. Значительное превышение нормы (более 106) может приводить к воспалительным заболеваниям кишечника (проявляются нарушениями стула, болями), урогенитальной сферы и даже ЛОР-органов, особенно у детей раннего возраста и лиц с пониженным иммунитетом.

Наиболее неприятные бактерии данной группы:

  • Протеи - чаще всего с ними связаны запоры, но они также могут вызывать острые кишечные инфекции, заболевания мочевыводящих путей и почек человека, в частности, острый и хронический простатит, цистит, пиелонефрит.
  • Клебсиеллы - прямые антагонисты (конкуренты) лактобактерий, приводят к развитию аллергий, запоров, проявлениям лактазной недостаточности. Косвенный признак избыточного присутствия клебсиеллы - зеленый стул со слизью, кислый запах кала (симптомы бродильной диспепсии).

 

Стафилококк золотистый (S. aureus)

Один из наиболее неприятных представителей условно-патогенной флоры. В норме должен отсутствовать, особенно у детей. Для взрослых допустимо содержание 103 КОЕ/г.

Даже небольшие количества золотистого стафилококка могут вызвать выраженные клинические проявления (аллергические реакции, гнойничковые кожные высыпания, дисфункции кишечника), особенно у детей первых месяцев жизни. Кроме кишечника и кожных покровов, стафилококки в немалых количествах живут на слизистых оболочках носа и могут вызывать воспалительные заболевания носоглотки, отиты.

Главные условия, от которых зависит степень патогенности стафилококков и восприимчивость к ним организма, -  это активность иммунной защиты организма, а также количество и активность конкурирующих со стафилококком бифидо- и лактобактерий, которые способны нейтрализовать его вредоносность. Чем больше в организме сильных, активных бифидобактерий и лактобактерий, тем меньше вреда от стафилококка (клинических проявлений может не быть, даже если его количество достигло 105 КОЕ/г). Чем больше дефицит бифидо- и лактобактерий и чем слабее иммунная защита организма, тем активнее стафилококк.

В группе риска сладкоежки и люди, имеющие слабый иммунитет. В первую очередь это дети - недоношенные, рожденные в результате проблемной беременности, кесарева сечения, лишенные естественного грудного скармливания, перенесшие антибиотическую терапию. В организм ребенка стафилококки могут попасть через материнское молоко, со слизистых и кожи мамы (тесный контакт).

 

Стафилококки сапрофитный, эпидермальный (S. epidermidis, S. saprophyticus)

Относится к условно-патогенной микрофлоре. При превышении нормальных значений (104 КОЕ/г или 25% от общего количества кокков) эти стафилококки способны вызывать определенные нарушения. Как правило, они выступают в роли вторичной инфекции. Кроме кишечника живут в верхних слоях кожи, на слизистых оболочках рта, носа и наружного уха. Патогенность микроорганизма усиливается при значительном снижении защитных сил организма, при длительных хронических заболеваниях, стрессах, переохлаждении, иммунодефицитных состояниях.

Дрожжеподобные грибы рода Candida

Максимально допустимое количество - до 104. Превышение этого уровня говорит о снижении иммунной защиты организма и очень низком рН в зоне обитания кандиды, а также может быть следствием применения антибиотиков и большого количества углеводов в рационе. При повышенном количестве этих грибов на фоне снижения количества нормальной флоры на слизистых оболочках ротовой полости и половых органов могут появится симптомы кандидоза, чаще называемого молочницей. Инфицирование грибами кишечника на фоне дефицита основных групп кишечных бактерий говорит о системном кандидозе, неработающем иммунитете и повышении риска развития диабета.

Неферментирующие бактерии (в некоторых бланках обозначены как «Прочие микроорганизмы»)

Pseudomonas, Acinetobacter и др. редко встречающиеся в кишечнике человека виды бактерий, самым опасным из которых является синегнойная палочка (Pseudomonas aerugenosa). Максимально допустимое количество у взрослых - не более 104. Как правило, их обнаружение в количестве выше нормы требует антибактериальной терапии и иммуннокоррекции.


Наши пробиотики:

Посмотреть все


E. coli – это бактерия, обычно обнаруживаемая в нижних отделах кишечника теплокровных организмов.


Обзор

Бактерия Escherichia coli (E. coli), продуцирующая шигатоксин часто обнаруживается в кишечнике людей и теплокровных животных. Большинство штаммов E. coli безвредны. Однако некоторые штаммы, такие как энтерогеморрагическая E. coli (STEC), могут вызывать тяжелые болезни пищевого происхождения. Эта бактерия передается человеку, главным образом, при потреблении зараженных пищевых продуктов, таких как сырые или не прошедшие достаточную тепловую обработку продукты из мясного фарша, сырое молоко и загрязненные сырые овощи и ростки.

STEC производит токсины, известные как шига токсины, названные так из-за их сходства с токсинами, производимыми Shigella dysenteriae. Количество бактерий STEC может увеличиваться при температуре от 7°C до 50°С (оптимальная температура 37°С). Количество некоторых бактерий STEC может расти в кислых продуктах с показателем pH вплоть до 4,4, а также в продуктах с минимальной активностью воды (aw) на уровне 0,95.

Бактерии погибают при тщательной тепловой обработке пищевых продуктов - до тех пор, пока все части продуктов не достигнут температуры 70°С или выше. Наиболее значимым для общественного здравоохранения серотипом STEC является E. Coli O157:H7; однако возбудителями спорадических случаев и вспышек заболеваний часто являются и другие серотипы.

Симптомы

Симптомы болезней, вызываемых бактериями STEC, включают абдоминальные спазмы и диарею, которая в некоторых случаях может переходить в кровавую диарею (геморрагический колит). Возможны также лихорадка и рвота. Инкубационный период длится от 3 до 8 дней, при средней продолжительности 3-4 дня. Большинство пациентов выздоравливает в течение 10 дней, но у незначительного числа пациентов (особенно детей раннего возраста и пожилых людей) инфекция может приводить к развитию такой представляющей угрозу для жизни болезни, как гемолитический уремический синдром (ГУС). Для ГУС характерны острая почечная недостаточность, гемолитическая анемия и тромбоцитопения (низкий уровень тромбоцитов в крови).

Люди, страдающие от кровавой диареи или тяжелых абдоминальных спазмов, должны обращаться за медицинской помощью. Антибиотики не являются составной частью лечения пациентов с болезнью, вызванной STEC, и могут повышать риск развития ГУС.

По оценкам, ГУС может развиваться у 10 % пациентов с инфекцией STEC, а коэффициент летальности составляет от 3 до 5 %. Во всем мире ГУС является самой распространенной причиной острой почечной недостаточности у детей раннего возраста. Он может приводить к неврологическим осложнениям (таким как конвульсии, инсульт и кома) у 25 % пациентов и к хроническим заболеваниям почек, обычно нетяжелым, примерно у 50 % выживших пациентов.

Источники и передача инфекции

Имеющаяся о STEC информация относится, в основном, к серотипу O157:H7, так как с биохимической точки зрения его можно легко дифференцировать от других штаммов E. coli. Резервуаром этого патогенного микроорганизма является, в основном, крупный рогатый скот. Кроме того, значительными резервуарами считаются другие жвачные животные (такие как овцы, козы и олени), обнаруживаются и другие инфицированные млекопитающие (такие как свиньи, лошади, кролики, собаки, кошки) и птицы (такие как куры и индейки).

E. coli O157:H7 передается человеку, главным образом, в результате потребления в пищу зараженных пищевых продуктов, таких как сырые или не прошедшие достаточную тепловую обработку продукты из мясного фарша и сырое молоко. Загрязнение фекалиями воды и других пищевых продуктов, а также перекрестное загрязнение во время приготовления пищи (через продукты из говядины и другого мяса, загрязненные рабочие поверхности и кухонные принадлежности) также могут приводить к инфицированию. Примеры пищевых продуктов, явившихся причиной вспышек E. coli O157:H7, включают не прошедшие надлежащую тепловую обработку гамбургеры, копченую салями, непастеризованный свежевыжатый яблочный сок, йогурт и сыр, приготовленный из сырого молока.

Все большее число вспышек болезни связано с потреблением в пищу фруктов и овощей (включая ростки, шпинат, латук, капусту и салат), заражение которых может происходить в результате контакта с фекалиями домашних или диких животных на какой-либо стадии их выращивания или обработки. Бактерии STEC обнаруживаются также в водоемах, (таких как пруды и реки), колодцах и поилках для скота. Они могут оставаться жизнеспособными в течение нескольких месяцев в навозе и осадочных отложениях на дне поилок. Так же была зарегистрирована передача инфекции как через зараженную питьевую воду, так и через воды для рекреационного использования.

Близкие контакты людей являются одним из основных путей передачи инфекции (орально-фекальный путь заражения). Были зарегистрированы бессимптомные носители, то есть лица, у которых не проявляются клинические симптомы болезни, но которые способны инфицировать других людей. Период выделения бактерий STEC у взрослых людей длится примерно одну неделю или менее, а у детей этот период может быть более длительным. В числе значительных факторов риска инфицирования STEC отмечается также посещение ферм и других мест содержания сельскохозяйственных животных, где возможен прямой контакт с ними.

Профилактика

Для профилактики инфекции необходимо соблюдать контрольные меры на всех стадиях продовольственной цепи – от производства сельскохозяйственной продукции на фермах до переработки, обработки и приготовления пищевых продуктов как на коммерческих предприятиях, так и в домашних условиях.

В промышленных условиях

Число случаев заболевания можно уменьшить благодаря проведению разнообразных стратегий по снижению риска в отношении мясного фарша (например, обследование животных перед убоем для предотвращения попадания большого количества патогенных микроорганизмов в места для убоя скота). Надлежащая практика убоя скота и соблюдение гигиены снижают уровень загрязнения туш фекалиями, но не гарантируют отсутствия бактерий STEC в продуктах. Для сведения к минимуму микробиологического заражения крайне важно проводить обучение гигиеническим навыкам при обращении с пищевыми продуктами среди работников ферм, скотобоен и предприятий по производству пищевых продуктов. Единственным эффективным способом уничтожения бактерий STEC в пищевых продуктах является бактерицидная обработка, такая как нагревание (например, тепловая обработка или пастеризация) или облучение.

В домашних условиях

Меры для профилактики инфекции E. coli O157:H7 схожи с мерами, рекомендуемыми для профилактики других болезней пищевого происхождения. Основные практические методики надлежащей гигиены пищевых продуктов, приводимые в "Пяти принципах повышения безопасности пищевых продуктов" ВОЗ, могут способствовать предотвращению передачи патогенных микроорганизмов, вызывающих многие болезни пищевого происхождения, а также защищать от болезней пищевого происхождения, вызываемых STEC.

Пятью важнейшими принципами обеспечения более безопасных пищевых продуктов являются:

Эти рекомендации необходимо выполнять во всех случаях, особенно рекомендацию в отношении "надлежащей тепловой обработки продуктов", при которой температура в середине продуктов достигает, по меньшей мере, 70°C. Необходимо тщательно мыть фрукты и овощи, особенно если они употребляются в пищу в сыром виде. По возможности овощи и фрукты следует чистить. Уязвимым группам населения (таким как дети и пожилые люди) следует избегать потребления в пищу сырых или не прошедших надлежащую тепловую обработку мясных продуктов, сырого молока и продуктов, приготовленных из сырого молока.

Настоятельно рекомендуется регулярное мытье рук, в частности перед приготовлением пищи, едой и после посещения туалета, особенно для людей, ухаживающих за детьми раннего возраста, пожилыми людьми и людьми с ослабленным иммунитетом, так как бактерия может передаваться не только через пищевые продукты, воду и при прямых контактах с животными, но и от человека человеку.

Некоторое количество инфекций STEC возникает в результате контакта с водами для рекреационного использования. Поэтому, важно также защищать такие водоемы, равно как и источники питьевой воды, от попадания в них экскрементов животных.

Производители фруктов и овощей

Публикация ВОЗ «Пять важнейших принципов выращивания более безопасных фруктов и овощей», предназначаемая для сельскохозяйственных работников, выращивающих свежие фрукты и овощи для себя, своих семей и для продажи на местных рынках, содержит основные практические методики для предотвращения микробного загрязнения свежей продукции во время посадки, выращивания, сбора урожая и хранения.

Пятью важнейшими принципами выращивания более безопасных фруктов и овощей являются:

  • Соблюдение надлежащей личной гигиены.
  • Защита полей от загрязнения фекалиями животных.
  • Использование обработанных фекальных отходов.
  • Оценка рисков, связанных с использованием ирригационной воды, и управление этими рисками.
  • Содержание оборудования и помещений для сбора и хранения урожая в чистоте и сухости.

Деятельность ВОЗ

ВОЗ проводит научные оценки для контроля пищевых продуктов на присутствие STEC. Эти оценки служат основанием для международных стандартов на пищевые продукты, руководящих принципов и рекомендаций, разрабатываемых Комиссией Кодекс Алиментариус.

В отношении профилактики ВОЗ разработала глобальную стратегию для уменьшения бремени болезней пищевого происхождения. ВОЗ разработала информационное сообщение "Пять основных правил для обеспечения более безопасных пищевых продуктов". Эти пять правил и связанные с ними учебные пособия являются материалами для стран, которые легко использовать, воспроизводить и адаптировать к различным целевым аудиториям.

ВОЗ способствует укреплению систем безопасности пищевых продуктов путем продвижения надлежащей практики производства и просвещения розничных торговцев и потребителей в отношении надлежащего обращения с пищевыми продуктами и предотвращения их загрязнения.

Во время вспышек E. coli, таких как вспышки, имевшие место в Европе в 2011 году, ВОЗ осуществляет поддержку координации в области обмена информацией и сотрудничества с помощью Международных медико-санитарных правил и в рамках Международной сети органов по безопасности пищевых продуктов (ИНФОСАН) во все мире; ВОЗ осуществляет тесное сотрудничество с национальными органами здравоохранения и международными партнерами, обеспечение технической помощи и предоставление последней информации о вспышках болезни.

 

Дисбактериоз: кишечные баталии

Фото носит иллюстративный характер. Из архива «МВ».

Едва ли найдется человек, у которого никогда не было изжоги, отрыжки, тошноты, боли в животе, метеоризма или нарушений стула. Однако за медпомощью люди обращаются только в том случае, если симптомы регулярно дают о себе знать или проявляются остро. Большинство до поры до времени лечатся самостоятельно, пользуясь распространенными «желудочными» средствами на свое усмотрение. 

Цель — баланс

Пищеварительный тракт — гетерогенная бактериальная экосистема. Вследствие низкого значения pH желудок здорового человека можно считать стерильной средой. 

В кишечнике условия для роста микроорганизмов лучше. В тонком бактерий немного — 104–106/мл (высокое значение pH и быстрый транзит не способствуют увеличению их количества), а в толстом — в 100 000 раз больше.

Кишечник является строго анаэробной системой, богатой питательными веществами, с кислотностью среды от нейтральной до слабощелочной. Его бактериальная экосистема включает от 400 до 500 типов микроорганизмов, которые взаимодействуют. Многие являются компенсалами, помогают расщеплять неперевариваемые соединения, содержащиеся в пище.

У практически здоровых людей около 96% микрофлоры кишечника составляют представители облигатной (т. е. постоянно встречающейся) микрофлоры: бифидо- и лактобактерии, бактероиды, непатогенная кишечная палочка и др. 

Вторая группа, куда входят факультативная (непостоянная) и условно-патогенная микрофлора, занимает лишь 2–4% от общего количества микроорганизмов. При определенных условиях (снижение местного, а тем более общего иммунитета) вызывает внутрикишечные и общие нарушения. Факультативная группа представлена микрококками, протеем, стафилококками, клостридиями, цитробактерами и др. 

Третью группу составляет транзиторная (случайная) патогенная микрофлора: клостридии, синегнойная палочка, грибы рода Candida. На ее долю приходится 0,001–0,01%. 

В процессе постоянного вза­имодействия макро- и микроорганизмов формируется уникальная экосистема, находящаяся в состоянии динамического баланса. Существенную роль играют облигатные и факультативные анаэробы: бифидо-, лакто- и энтеробактерии, а также энтерококки. Бифидобактерии создают кислую среду и тем самым препятствуют размножению вредной микрофлоры. Кроме того, обладают выраженным антагонизмом в отношении патогенов, улучшают процессы пищеварения, поддерживают витаминный баланс и иммунный статус, участвуют в синтезе незаменимых аминокислот.

Нарушение бактериоэкологического равновесия в ЖКТ приводит к формированию дисбактериоза (дисбиоза) кишечника.

Нехорошие перемены 

Дисбактериоз кишечника — это клинико-лабораторный синдром, возникающий при разных патологических состояниях. Характерны изменения количественного и (или) качественного состава нормофлоры, метаболические и иммунологические нарушения; у некоторых пациентов добавляются симптомы поражения кишечника.

Кишечная микрофлора взрослого человека довольно устойчива к переменам в питании. Между тем стоит помнить, что еда, богатая углеводами, стимулирует бифидофлору и ведет к увеличению бактериальной массы толстого кишечника. Белковые блюда не влияют на спектр и количество кишечных бактерий, а жиры угнетают бифидобактерии и энтерококки, но стимулируют размножение бактероидов. «Пищевой» дисбиоз чаще носит временный характер и исчезает при переходе на здоровый сбалансированный рацион.

При заболеваниях местного и общего характера изменяется микробный пейзаж толстой кишки. Дисбактериоз регистрируется у большинства пациентов с поражением ЖКТ инфекционной и неинфекционной природы, после острых вирусных и бактериальных инфекций внекишечной локализации, при хронической воспалительной и аллергической патологии, у страдающих злокачественными заболеваниями и лейкозами, на фоне применения цитостатиков и особенно антибиотиков. Антибиотикозависимые дисбиозы стабильны и требуют активной терапии.

Сдвиги в микрофлоре кишечника вторичны — отражают воздействие факторов, изменяющих статус кишечника или внутренний баланс самого микробиоценоза. Нарушение микробного равновесия может осложнять многие патологические состояния, быть атерогенным явлением, связанным с антибактериальной, гормональной и другой терапией, несбалансированным питанием и т. д. 

Один из частых вариантов (удельный вес порой достигает 31%) дисбактериоза кишечника — кандидозный, при котором имеет место избыточный рост грибов рода Candida. Он нередко ассоциируется с пищевой аллергией и аллергическими заболеваниями вообще, а также с курением.

Лабораторные поиски

Клиническая картина дисбактериоза кишечника вариабельна, а выраженность симптоматики не всегда напрямую зависит от степени дисбиотических нарушений. Ранними и наиболее специфическими симптомами можно считать повышенное газообразование, нарушение переваривания пищи (кишечная диспепсия), изменение характера стула; при развитии дисбактериоза на фоне колита — болевой синдром, патологические примеси в кале (слизь). В более тяжелых случаях добавляются интоксикация, диарея и обезвоживание, снижение массы тела.

В диагностике и трактовке кишечного дисбактериоза большое значение имеет копрологическое исследование, дающее возможность охарактеризовать пищеварительную, ферментовыделительную, всасывательную и двигательную функции кишечника. В последнее время получили распространение методы, основанные на выявлении метаболитов микроорганизмов, — газожидкостная и ионная хроматография. В лабораториях проводят бактериологические исследования фекалий и посев на питательные среды соскобов со слизистых оболочек.

Золотым стандартом диагностики синдрома избыточного роста бактерий считается интестиноскопия с аспирацией содержимого тонкой кишки и посевом аспирата на питательную среду. Но эта методика сложна, требует общей анестезии и хорошей бактериологической базы с возможностью культивирования аэробов и анаэробов, а результат приходится ждать порядка 10 дней.

Синдром избыточного роста бактерий выявляется также по данным дыхательного теста с меченым Н2 — с лактулозой или галактозой. Бактерии разлагают лактулозу, в результате чего освобождается меченый Н2, концентрация которого затем может быть измерена в выдыхаемом воздухе. В норме лактулоза расщепляется лишь микрофлорой в толстом кишечнике. При дисбиозе и тонкая кишка заселяется микроорганизмами, расщепляющими лактулозу. При этом следует исключить ускоренное продвижение субстрата по тонкой кишке.

Посев дуоденального аспирата тоже подтверждает синдром избыточного роста бактерий: при патологии содержание микроорганизмов >106/мл (общее количество бактерий в просвете тощей кишки не превышает 104–106/мл).

Микрофлора различных отделов пищеварительного тракта значительно отличается количественно и качественно.+

Микробиологическое исследование фекалий лишь косвенно может свидетельствовать о микробном неблагополучии, т. к. состав фекальной микрофлоры отражает ситуацию только в толстой кишке, а точнее — в дистальном отделе.

Настрой на победу 

Профилактика и особенно лечение дисбактериоза кишечника должны быть комплексными и предполагать:

  • устранение избыточного бактериального обсеменения тонкой кишки;
  • восстановление нормальной микробной флоры толстой кишки; 
  • улучшение кишечного пищеварения и всасывания;
  • восстановление нормальной моторики кишечника;
  • стимулирование реактивности организма.

Важнейшими нормальными обитателями толстого кишечника человека являются бифидобактерии (вид анаэробных палочковидных грамположительных бактерий) — 3–7% от общей фекальной микрофлоры взрослых. Нужны и лактобактерии.

Восстановлению качества и количества бифидобактерий способствует увеличение в рационе пектинов (растворимых пищевых волокон), а для лактобактерий лучшие продукты — кисломолочные. Антибиотическую активность последних повышают путем добавления никотиновой кислоты (на 1 л — 6–8 мг), тиамина (4–6 мг), токоферола (1–3 мг).

Для профилактики и лечения дисбактериоза широко используются пробиотики и пребиотики.

Пробиотики — это живые микроорганизмы (молочнокислые бактерии, чаще бифидо- или лактобактерии), нормальные обитатели кишечника здорового человека, улучшающие микробный баланс. Обладают антагонистическими свойствами по отношению к патогенам (третья группа): конкурируют за рецепторы на эпителиоцитах, питательные вещества; способны выделять ингредиенты (цитокины, масляную кислоту), ингибирующие рост патогенных бактерий. Монокультуру или комплекс живых микроорганизмов дополняют веществом, стимулирующим их колонизирующую способность и размножение. 

Пробиотики содержатся в молочных продуктах со специальной закваской, кукурузных хлопьях, крупах, черном хлебе.

При наличии бродильных процессов в кишечнике надо ограничивать углеводы, пищевые волокна (клетчатку), при гнилостных — белки и жиры. 

Каждому, у кого высок риск развития дисбиоза, следует избегать цельного молока, бобовых, а также продуктов, богатых эфирными маслами (чеснок, зеленый лук, репа, редька). 

Для стабилизации микрофлоры кишечника в рацион включают морковный сок, сою, дрожжевой, тыквенный, картофельный и рисовый экстракты, молочную сыворотку и молозиво (обладают бифидогенным действием). 

Используют растительные компоненты и при стафилококковом дисбактериозе. Полезны лесная земляника, рябина, малина, черника, шиповник, черная смородина. При протейном дисбактериозе нужны абрикосы и черная смородина; при наличии гнилостных бактерий — клюква и абрикосы. Если имеет место избыточный рост грибов рода Candida, стоит налегать на бруснику, стручковый перец, морковь. 

При торпидно протекающем дисбактериозе рекомендуют дополнять лечение, подключая эффект от приема эвкалипта, календулы, аира, зверобоя. Когда подтвержден грибковый дисбактериоз с бродильной диспепсией, положительное влияние окажет цикорий растворимый. 

Кроме пробиотиков, важное значение в профилактике и лечении дисбактериоза кишечника имеют пребиотики (к ним в основном относят растворимые пищевые волокна класса углеводов: фруктоолигосахариды, галактоолигосахариды). В желудке и тонкой кишке они избегают гидролиза пищеварительными ферментами и достигают толстой кишки в неизменном виде. Там подвергаются ферментации бифидо- и лактобактериями, что приводит к увеличению количества флоры и объема каловых масс. При этом важно подчеркнуть, что фруктоолигосахариды представляют собой энергетический субстрат для представителей нормальной микрофлоры кишечника (бифидо- и лактобактерий). В процессе ферментации образуются короткоцепочечные жирные кислоты (преимущественно уксусная, пропионовая, масляная), которые снижают рН в кишечнике, стимулируют перистальтику.

Укреплению защитного барьера толстой кишки при потреблении пребиотиков способствует и стимуляция выработки в ней слизи. Повышенное слизеобразование энтероцитами может быть следствием снижения рН при возросшем синтезе короткоцепочечных жирных кислот микро­флорой кишечника в ответ на введение пребиотиков. Свойствами пребиотиков в наибольшей степени обладают инулин, лактулоза, лактил, олигосахариды, лактоолигосахариды, хилак форте и др.

Инулин присутствует в клетках цикория, артишока, корней одуванчика, клубней топинамбура, фасоли, петрушки. Наиболее хорошо изучен как бифидогенный фактор — избирательно ускоряет рост и метаболизм бифидобактерий. Прием 5 г/день олигофруктозы или ≤8 г/день инулина обеспечивает значительное изменение состава кишечной микрофлоры, увеличивая численность бифидобактерий и снижая количество патогенов.

Пробиотики и пребиотики могут применяться для профилактики и лечения дисбактериоза кишечника, в т. ч. при назначении эрадикационных схем лечения Helicobacter pylori при гастроэзофагеальной рефлюксной, язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки, эрозивных гастро- и дуоденопатиях.

Применение антибиотиков нежелательно, т. к. они могут усугублять дисбиоз кишечника. Целесо­образно использовать препараты, минимально влияющие на симбиотическую флору и в тоже время подавляющие рост патогенных микроорганизмов. К таким относятся нитрофураны (нифуроксазид, интетрикс) — т. н. кишечные антисептики.

Пациентам с кишечной диспепсией показаны ферментные препараты. Чаще используют панкреатин (мезим форте, трифермент, креон). При стеаторее и гипомоторной дискинезии кишечника к панкреатину добавляют желчные кислоты (панзинорм), при бродильных расстройствах — гемицеллюлозу (фестал, энзистал, дигестал). Для улучшения процессов всасывания можно назначать мембраностабилизирующие препараты (карсил, эссенциале).

При дисбактериозе, особенно в период реабилитации, показаны иммуномодуляторы (натрия нуклеинат, витамины), растительные адаптогены (элеутерококк, женьшень, эхинацея). Когда отмечена тенденция к лейкопении и требуется усилить эпителизацию слизистой оболочки, можно использовать метилурацил и пентоксил (не более двух недель).

Иван Броновец, профессор кафедры кардиологии и внутренних болезней БГМУ, доктор мед. наук
Медицинский вестник, 12 сентября 2016

Энтерококки и их взаимодействие с микробиомом кишечника

ИСТОРИЯ ВОПРОСА

Род Enterococcus состоит из более чем 50 видов, которые можно встретить в различных средах, от почвы до желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) животных и человека до больничной среды ( 1, 2). Первый представитель этого грамположительного рода был выделен в 1899 г. из смертельного случая эндокардита (3, 4). Только в 1984 г. виды энтерококков были признаны генетически отличными от Streptococcus и отнесены к их собственному роду (3, 4, 5).Энтерококки - это грамположительные факультативные анаэробы, которые существуют цепочками или парами и не образуют споры. Они оптимально растут при 35 ° C, гидролизуют эскулин в присутствии 40% солей желчных кислот и обладают отрицательной каталазой (6, 7). Виды энтерококков можно определить с помощью фенотипических тестов, основанных на способности штаммов образовывать кислоту в бульоне маннита и сорбозы и гидролизовать аргинин (8, 9).

Энтерококки обнаруживаются в фекалиях насекомых, птиц, рептилий и млекопитающих (2, 10).Enterococcus faecalis и faecium, получившие название «Entero» в честь их кишечного проживания, были впервые выделены в начале 1900-х годов (11, 12, 13). Основываясь на SNP в 16S рибосомной РНК (рРНК), энтерококки делятся на семь эволюционно различных групп (14). E. faecalis обнаружен у множества различных животных, что позволяет предположить, что с эволюционной точки зрения он был одним из первых колонизаторов кишечника (14). У человека E. faecalis и E. faecium являются наиболее многочисленными видами этого рода, обнаруженными в фекалиях, составляя до 1% кишечной микробиоты взрослых особей (15, 16, 17, 18, 19).

Энтерококки недавно превратились в распространенный нозокомический патоген с множественной лекарственной устойчивостью. С конца 1970-х и 1980-х годов у видов энтерококков развилась повышенная устойчивость к нескольким классам антибиотиков (20, 21, 14). Резистентные энтерококки плотно колонизируют кишечник после лечения антибиотиками, что может истощить желудочно-кишечный тракт из-за большого количества защитных комменсалов (22, 23, 24). Использование антибиотиков увеличило распространение устойчивых к лекарствам энтерококков в больницах, что привело к тому, что энтерококки стали одной из наиболее частых причин инфекций, связанных с больницей (25).

Восстановление кишечной микробиоты до здорового состояния - это новый и развивающийся подход к противодействию продолжающемуся появлению устойчивых к антибиотикам микроорганизмов. Однако манипулирование кишечным микробиомом для предотвращения распространения устойчивых к антибиотикам бактериальных штаммов, а также поддержание чувствительной экосистемы, в состав которой входят энтерококки, является деликатной задачей. Это требует, чтобы мы понимали связь энтерококков с их естественной кишечной средой обитания в контексте двойной жизни энтерококков как комменсалов и внутрибольничных патогенов.Для этого мы обсуждаем путь, который прошли энтерококки, чтобы стать больничными инфекционными агентами с множественной лекарственной устойчивостью, которые обладают разнообразными геномами, что позволяет им выжить в постантибиотической кишечной нише. Имея это в виду, мы можем подумать, как лучше всего управлять кишечной микробиотой или восстанавливать ее, чтобы принести пользу здоровью человека. В этой главе мы обсуждаем 1) клиническое значение энтерококков, 2) развитие устойчивости к антибиотикам, 3) разнообразие геномного состава и среды обитания и 4) взаимодействие с кишечным микробиомом, которое может помочь ограничить его инфекционное распространение.

КЛИНИЧЕСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ

Инфекции

Энтерококки стали ведущим патогеном, ассоциированным с больницей, в конце 1970-х и 1980-х годах (26). В США энтерококки вызывают около 66 000 инфекций ежегодно (27). Энтерококки часто выращивают из смешанных видов инфекций таза, брюшной полости и других мягких тканей (28). Хотя роль энтерококков в этих инфекциях не всегда ясна, их часто лечат антибиотиками. Реже энтерококки могут вызывать менингит и септический артрит у пациентов с сопутствующими заболеваниями или с ослабленным иммунитетом (28).

Что еще более важно с клинической точки зрения, энтерококки являются ведущими причинами бактериемии, эндокардита и инфекций мочевыводящих путей (ИМП) в больницах (20, 26, 29). Энтерококки являются второй по частоте причиной внутрибольничной бактериемии и связаны с общей смертностью примерно 33% (25, 30). Энтерококковой бактериемии часто предшествует плотная колонизация желудочно-кишечного тракта, из которой энтерококки могут перемещаться в кровоток (31, 23). Кроме того, потеря иммунитета слизистых оболочек и нарушение желудочно-кишечного барьера связаны с энтерококковой бактериемией; Факторы риска включают мукозит, инфекцию Clostridium difficile и нейтропению (32, 33, 34).

Более 10% случаев инфекционного эндокардита, наблюдаемых в Северной Америке, вызываются энтерококками, что делает их второй ведущей причиной (35). Из общего числа случаев энтерококкового эндокардита более 35% инфекций приобретаются в стационаре (36). Энтерококки образуют биопленки на поврежденных сердечных клапанах, которые превращаются в структуры, называемые растениями. Протезы также могут служить платформой для роста энтерококков (36). Как и в случае с бактериемией, энтерококки, вызывающие эндокардит, часто являются бывшими обитателями желудочно-кишечного или мочеполового тракта, которые получили доступ к кровотоку (37, 38).Более 10% катетер-ассоциированных ИМП имеют энтерококковое происхождение (29).

Передача и источники инфекционных энтерококков

Внутрибольничные энтерококковые инфекции вызывают особую озабоченность из-за их растущей распространенности и растущей устойчивости к антибиотикам. Энтерококки могут легко распространяться в больничных отделениях (39, 40, 41, 42, 43, 44). Передаче энтерококков в клиническую среду способствуют два ключевых фактора: способность энтерококков выживать за пределами желудочно-кишечного тракта и возможность для медицинских работников непреднамеренно передавать бактерии соседним пациентам.Виды энтерококков могут продолжительное время выживать на больничных поверхностях, таких как медицинские устройства и перила кроватей, создавая фомиты, которые являются основным фактором риска дальнейшего распространения (45, 46). Энтерококки передаются от пациента к пациенту через руки медицинских работников (47, 48). Загрязненные руки медицинского персонала могут переносить устойчивые к ванкомицину энтерококки (VRE) примерно на 1 из каждых 10 чистых поверхностей, к которым прикасаются медицинские работники (49).

Желудочно-кишечный тракт представляет собой основное место, заселенное устойчивыми к антибиотикам энтерококками, и, таким образом, представляет собой важный источник инфекций, связанных с больницей.Загрязнение больниц увеличивается, когда колонизированные пациенты становятся недержанием мочи (50). Плотность VRE в фекалиях пациентов коррелирует с количеством случаев передачи VRE (47). Примерно на каждые 10% увеличения числа пациентов, колонизированных VRE, риск повторного госпитализации пациентов с VRE возрастает на 40% (46). Важным механизмом, с помощью которого госпитализированные пациенты становятся плотно колонизированными VRE, является лечение антибиотиками; как антибиотики способствуют увеличению VRE, подробно описано в последних разделах этой главы.Большинство схем приема антибиотиков с антианаэробной активностью приводят к высокой плотности кишечной ВРЭ (22). Метронидазол увеличивает риск колонизации VRE высокой плотности в 3 раза в когортах пациентов с аллогенной трансплантацией гемопоэтических стволовых клеток (алло-ТГСК) (24). Другие факторы риска колонизации включают использование катетеров в кровотоке или мочевыводящих путях, предшествующее хирургическое вмешательство, продолжительность пребывания в больнице и контакт с пациентами, колонизированными VRE (51, 52, 40, 53, 47, 54).

Лечение

В тяжелых случаях энтерококковых инфекций, таких как инфекции сердечных клапанов, используется комбинированная лекарственная терапия (55, 56).Комбинированное введение пенициллина и стрептомицина (бета-лактама и аминогликозида соответственно) успешно вылечило 80% случаев энтерококкового инфекционного эндокардита (ИЭ), смертность от которых ранее составляла от 20% до 50%, и к 1950-м годам они стали стандартной терапией. (38, 57). Сегодня для лечения ИЭ, вызванного чувствительными к ампициллину и ванкомицину E. faecalis, не имеющими высокой устойчивости к аминогликозидам, гентамицин является предпочтительным аминогликозидом, используемым в комбинации с ампициллином. Ампициллин плюс цефтриаксон является альтернативной терапией для чувствительных к ампициллину бактерий E.faecalis. Этот режим также использовался для лечения изолятов E. faecalis, чувствительных к аминогликозидам, поскольку он связан с аналогичной частотой излечения и меньшей нефротоксичностью по сравнению с терапией ампициллин-гентамицином (58, 59). Хотя изоляты E. faecalis по своей природе устойчивы к цефалоспоринам, два бета-лактамных антибиотика работают синергетически, связывая разные пенциллин-связывающие белки (PBP), ферменты, участвующие в синтезе клеточной стенки бактерий (60). Для устойчивых к ампициллину и ванкомицину изолятов, вызывающих ИЭ, большинство из которых являются E.faecium, даптомицин или линезолид, хотя клинические данные об их эффективности ограничены (61, 62).

Есть несколько других примеров бактерицидного синергизма против энтерококков, и срочно необходимы новые методы лечения антибиотиками для видов с множественной лекарственной устойчивостью (37). Эта клиническая картина вызывает вопрос: как комменсальные энтерококки стали таким опасным патогеном? Пластичность генома энтерококка является ключевым фактором, который позволил бактериям: 1) приобрести черты, которые придают устойчивость к антибиотикам за счет мобильных генетических элементов, 2) со временем диверсифицироваться в клоны, специально адаптированные к условиям больницы, и 3) колонизировать желудочно-кишечный тракт. при большей плотности после воздействия антибиотиков (37).Мы обсудим каждый пункт в следующих трех разделах.

РАЗВИТИЕ УСТОЙЧИВОСТИ К АНТИБИОТИКАМ

Развитие устойчивости к антибиотикам у E. faecium и E. faecalis

Примерно одна треть энтерококковых инфекций в США являются лекарственно-устойчивыми, что составляет 20 000 случаев устойчивости к антибиотикам в год, из которых, по оценкам 1300 пациентов умирают ежегодно (27). E. faecalis вызывал более 90% клинических инфекций до середины 1990-х годов, после чего E. faecium стал более распространенным в клинических условиях (63, 64).Рост числа внутрибольничных штаммов E. faecium связывают с увеличением использования ванкомицина и антибиотиков широкого спектра действия (20, 25, 37, 65). На сегодняшний день в США E. faecium вызывает почти треть всех энтерококковых внутрибольничных инфекций и составляет более 75% всех штаммов VRE, связанных со здравоохранением (29, 27). Большинство инфекций, вызываемых E. faecium, связанных с медицинским оборудованием, устойчивы к ванкомицину и ампициллину (80–87% и 90% соответственно) (25, 66).

VRE возникла в середине 1980-х гг. Сначала в Европе среди домашнего скота, а затем в США в больницах (67, 68).В США устойчивость к гликопептидам развивалась среди адаптированных в больницах изолятов, устойчивых к ампициллину, которые были преобладающими энтерококками в микробиоте кишечника больницы (21, 65). Устойчивые к ванкомицину изоляты были связаны с пероральным приемом ванкомицина для лечения антибиотико-ассоциированной диареи, вызванной C. difficile у госпитализированных пациентов. Следует отметить, что введение ванкомицина внутривенно (IV) не коррелирует с развитием инфекции VRE (69, 22, 24). Ванкомицин при использовании этого пути приводит к низким концентрациям в кишечнике (70).В Европе проблема VRE изначально ограничивалась животноводством. VRE наблюдалась у домашнего скота, регулярно подвергающегося воздействию антибиотиков. Считается, что авопарцин, антибиотик, стимулирующий рост, который также обеспечивает перекрестную устойчивость к ванкомицину, внес свой вклад в рост VRE (71, 72, 73). Впоследствии в 1996 году авопарцин был запрещен к применению, и распространенность ВРЭ у животных снизилась (74, 75, 76). Тем не менее, VRE недавно появился в европейских больницах с изолятами, тесно связанными со штаммами, связанными со здравоохранением, обнаруженными в США (77).

Энтерококки обладают устойчивостью двумя способами: 1) резистентность, которая закодирована в основном геноме всех штаммов энтерококков ( внутренний ), и 2) устойчивость, которая передается между изолятами на мобильных генетических элементах путем горизонтального переноса ( приобретается, ) . Кратко описаны некоторые механизмы, с помощью которых энтерококки развивают устойчивость к ампициллину, ванкомицину и даптомицину.

Устойчивость к антибиотикам: Ампициллин

Бета-лактамы, такие как ампициллин, подавляют рост бактерий, модифицируя и тем самым инактивируя группу ферментов, называемых пенициллин-связывающими белками (PBP).PBP поперечно сшивают боковые цепи пептидогликановых пептидов во время синтеза клеточной стенки. Штаммы энтерококков обладают некоторой внутренней устойчивостью к бета-лактамам, продуцируя пенициллин-связывающий белок 5 (PBP5), который кодируется хромосомами (78, 79). Учитывая их низкое сродство к бета-лактамным препаратам, PBP5 могут продолжать синтез пептидогликана по мере того, как другие PBP модифицируются (80). Повышенная устойчивость к ампициллину связана с мутациями гена, кодирующего PBP5, которые дополнительно снижают сродство белка к бета-лактамным антибиотикам, например, мутации, которые приводят к заменам аминокислот рядом с активным сайтом (81, 82, 83).Устойчивость еще больше усиливается, когда в гене pbp5 присутствуют множественные мутации (83). Мутировавшие аллели могут быть горизонтально перенесены в чувствительные к бета-лактамам штаммы in vitro (84). В целом ген pbp5 отличается по нуклеотидной последовательности примерно на 5% между чувствительными и устойчивыми штаммами (85). Приобретение специфических мутаций гена pbp5 способствовало высокоуровневой устойчивости к ампициллину, которую нозокомиальные изоляты E. faecium разработали в конце 1970-х и 1980-х годах (85, 21, 86).

Устойчивость к антибиотикам: ванкомицин

Гликопептидные антибиотики, такие как ванкомицин, предотвращают синтез клеточной стенки пептидогликана, образуя комплексы с концом пептида D-Ala-D-Ala предшественников пептидогликана, блокируя сайты связывания ферментов. Устойчивые изоляты изменяют предшественники пептидогликана с образованием D-Ala-D-лактата или D-Ala-D-серина с аффинностью связывания лекарственного средства в 1000–7 раз соответственно (87, 88, 65). Эти модификации ингибируют связывание антибиотиков, в то же время позволяя ферментам PBP использовать эти субстраты для построения функциональной клеточной стенки.У энтерококков было идентифицировано 9 кластеров генов, связанных с устойчивостью, большинство из которых кодируется мобильными элементами (65). В ответ на гликопептиды эти опероны устойчивости регулируют экспрессию набора ферментов, которые вместе создают модифицированные предшественники пептидогликана и удаляют те, которые не были изменены. Двумя основными оперонами сопротивления являются VanA и VanB (88). Локусы гена VanA кодируются на Tn1546 или родственных транспозонах, обеспечивая высокий уровень устойчивости к ванкомицину и тейкопланину.Кластеры генов VanB обнаруживаются на транспозонах типа Tn5382 / Tn1549 или на плазмидах в хромосоме, обеспечивая умеренную устойчивость только к ванкомицину. Варианты этих локусов гена устойчивости к ванкомицину обнаружены во всем мире (89).

Устойчивость к антибиотикам: даптомицин

Даптомицин - недавно представленный антибиотик для лечения энтерококков с множественной лекарственной устойчивостью; однако его бактерицидный механизм действия полностью не изучен. Считается, что он изменяет цитоплазматическую мембрану и вызывает деполяризацию кальций-зависимым образом, что приводит к высвобождению ионов калия из клетки и последующей гибели клетки (90, 91).Для энтерококков способность противостоять даптомицину частично является результатом изменений в составе их клеточной мембраны и оболочки. Полногеномное секвенирование пары последовательно изолированных клонов E. faecalis, устойчивых к ванкомицину, первого чувствительного к даптомицину и второго устойчивого, из кровотока одного пациента выявило делеции в рамке считывания в трех генах: cls, gdpD и liaf (92) . cls и gdpD кодируют белки, которые, как считается, играют роль в метаболизме фосфолипидов, а liaF является частью регуляторной системы, которая координирует ответ клеточной оболочки на антибиотики.В экспериментах по повторному секвенированию были обнаружены мутации, связанные с устойчивостью, которые фиксировались всего через две недели после серийного пассажа in vitro с возрастающими концентрациями даптомицина (93). Перенос мутации cls на чувствительные штаммы E. faecalis придает устойчивость к даптомицину (93). Сравнительный анализ секвенирования был проведен на 5 парах устойчивых к ванкомицину штаммов E. faecium, все сначала чувствительные, а затем устойчивые к даптомицину, которые колонизировали желудочно-кишечные тракты пациентов с ТГСК (94).Эти кишечные изоляты VRE подвергались воздействию системного даптомицина, поскольку он частично выводился в кишечник, что подчеркивает способность желудочно-кишечного тракта служить резервуаром для развития устойчивости к антибиотикам даже при низких концентрациях антибиотиков (94). Точечные мутации в гене cls, кодирующем кардиолипинсинтазу, были обнаружены в четырех из пяти пар изолятов.

Устойчивость к антибиотикам: генетика

У некоторых штаммов энтерококков, таких как устойчивые к ванкомицину E.faecalis V583 приобретенные генетические элементы составляют 25% генома (95). У энтерококков есть два основных типа плазмид: феромон-чувствительные и транспозонные. Плазмида pMG2200, чувствительная к феромонам, кодирует устойчивость к ванкомицину VanB-типа (96). VanA-кодирующие феромон-чувствительные плазмиды могут передаваться между E. faecium и E. faecalis (97). Большие области генома E. faecalis могут перемещаться между изолятами in vitro через конъюгативные плазмиды, охватывающие до четверти хромосомы (98).Кроссовер между хромосомной и плазмидной ДНК может происходить за счет последовательностей вставок (также известных как IS-элементы). У E. faecalis чувствительные к феромонам конъюгированные плазмиды, содержащие копии IS256, могут интегрироваться в хромосому реципиентных штаммов in vitro и переносить хромосомную ДНК от донорских изолятов, создавая гибридные геномы (98). Эта пластичность генома энтерококка имеет важное клиническое значение. Например, перенос ДНК между энтерококками привел к появлению нескольких линий мутировавших генов pbp5 , придающих устойчивость к ампициллину у больничных штаммов (84, 85).

Транспозоны встречаются по всему геному энтерококков и бывают трех типов: конъюгативные, семейства Tn3 и составные (фланкирующие последовательности IS). Кластер генов vanA кодируется производным от Tn3 транспозоном Tn1546 (99). Конъюгативные транспозоны семейства Tn916 включают Tn5382 и Tn1549, которые являются основными генетическими элементами, содержащими оперон устойчивости к VanB (100, 101, 102). Ген, кодирующий PBP5, также может передаваться между изолятами энтерококков с помощью конъюгативного транспозона Tn5386 семейства Tn916, несущего кластер VanB (103).

РАЗНООБРАЗИЕ В ГЕНОМНОМ СОСТАВЕ ​​И ОБИТАНИЯХ

Геномное разнообразие, наблюдаемое среди штаммов энтерококков, было хорошо охарактеризовано применением высокопроизводительного полногеномного секвенирования. Первый геном энтерококка, опубликованный в 2002 г., принадлежал E. faecalis V583 (95). Сейчас доступны сотни завершенных или черновых геномов (104). Содержание GC у видов энтерококков может варьировать от 37% до 45%, а размер генома - от 2,7 МБ до 3,6 МБ (105, 106, 107). По сравнению с комменсальными штаммами энтерококков клинические изоляты с множественной лекарственной устойчивостью обладают более крупными геномами за счет приобретения чужеродного генетического материала (107).Связанные с больницей штаммы E. faecalis обычно не имеют систем CRISPR-Cas, которые помогают блокировать фаговые инфекции и расщеплять ДНК, кодируемую плазмидами (107, 108). У 48 штаммов E. faecalis отсутствие системы CRISPR-Cas достоверно коррелировало с устойчивостью к двум или более антибиотикам (108). Изоляты E. faecium с множественной лекарственной устойчивостью также обычно имеют дефицит CRISPR-Cas, хотя эта взаимосвязь была продемонстрирована в небольших исследованиях (108, 109). Элементы IS, такие как IS16, управляют геномной изменчивостью изолятов и, вероятно, способствуют адаптации энтерококков в больницах по мере их перехода от чувствительных к антибиотикам к резистентным (110, 111, 112).Кроме того, рекомбинация является важным механизмом для создания разнообразия (89, 98, 113). Напротив, комменсалы гораздо менее разнообразны; например, E. faecalis OG1RF не содержит каких-либо приобретаемых латерально мобильных элементов и несет локус CRISPR (114).

Популяционная генетика

Филогенетический анализ выявил значительные геномные различия между комменсальными энтерококками человека и эндемичными больничными штаммами. На самом деле нозокомиальные штаммы более тесно связаны с изолятами животных, чем комменсалы человека (107, 115, 116, 117).Полногеномное секвенирование изолятов E. faecium выявило две основные клады, одна из которых состоит из изолятов, полученных от сообщества, от здоровых людей (клада B), а другая - сложный кластер штаммов животного происхождения, а также связанных с больницей штаммов (клада A). Этот раскол между кладами произошел примерно 3000 лет назад, что примерно совпадает с развитием сельского хозяйства и одомашнивания животных, которые предположительно разделили комменсалов животных и человека на отдельные линии (117). Вторая бифуркация произошла почти 75 лет назад в кладе А между современными нозокомиальными штаммами и изолятами животного происхождения (117).Штаммы, устойчивые к ампициллину, чаще встречаются у домашних животных, чем у здоровых людей (118). Штаммы энтерококков животного происхождения могут выступать в качестве резервуара элементов устойчивости к антибиотикам, которые могут быть общими с изолятами человека (119, 120). Например, гены VanA из энтерококков животного происхождения могут латерально передаваться комменсалам человека в кишечнике (121, 122).

Каковы эволюционные отношения между клиническими изолятами энтерококков? Многочисленные исследования использовали мультилокусное типирование последовательностей (MLST) в качестве метода определения структуры популяции энтерококков (123).Процесс основан на секвенировании амплифицированных фрагментов семи генов домашнего хозяйства (113, 124). Первоначальные исследования E. faecium на основе MLST обнаружили отдельный кластер изолятов, который был обогащен у госпитализированных пациентов, названный клональным комплексом 17 (CC17) (89). Изоляты E. faecalis, полученные из больничной среды, также группируются с помощью MSLT, а именно в клональные комплексы C2 и C9, которые обладают большим количеством элементов устойчивости и островных генов патогенности, чем другие кластеры (113, 125, 126, 127). Однако клинический E.faecium, сгруппированные в CC17, не являются строго клональными (111). В филогенетических анализах, основанных на алгоритме eBURST, ложные группировки могут возникать для видов с высокой скоростью рекомбинации, таких как E. faecium (128). Анализ штаммов E. faecium с использованием байесовских моделей выявил три основных родословных, связанных с больницей, что указывает на то, что нозокомиальные изоляты не происходят от одного предкового штамма (116). Скорее, адаптивные черты, характеризующие клинические изоляты, вероятно, были приобретены независимо в разных генетических фонах.Доказательства того, что изоляты, связанные с больницей, происходят от нескольких линий, также можно увидеть, проанализировав последовательность одного элемента устойчивости. Специфические аминокислотные изменения в белке PBP5 являются общими для изолятов из разных типов последовательностей (ST), и вариации последовательности были обнаружены в пределах ST (85). Эти данные указывают на то, что устойчивость к антибиотикам развивалась на фоне множества штаммов энтерококков, которые были готовы к выживанию в условиях больницы.

Среда обитания

Как указывалось ранее, желудочно-кишечный тракт является основным местом обитания энтерококков.У животных E. faecalis, E. faecium, E. hirae и E. durans являются видами энтерококков, наиболее часто обнаруживаемых в микробиоте кишечника (129). Сравнение VRE у животных и людей показало, что штаммы являются специфическими для хозяина (130). Однако изоляты пациентов были обнаружены у таких животных, как собаки и свиньи, и, как обсуждалось выше, адаптированные в больнице штаммы имеют относительно недавнее тесное эволюционное родство с изолятами животных (76). Хотя желудочно-кишечный тракт представляет собой крупнейший резервуар энтерококков, штаммы также были обнаружены в окружающей среде.Считается, что изоляты почвы и воды происходят от фекального загрязнения (6, 131, 132, 133). Энтерококки обладают способностью приспосабливаться к внекишечным условиям, как это обсуждалось в отношении больниц. E. faecalis может выживать в среде с низким содержанием питательных веществ, такой как стерилизованные отходы, до 12 дней (134). Энтерококки часто обнаруживаются в сточных водах, особенно за пределами больниц (135). Неудивительно, что штаммы энтерококков, выделенные из сточных вод, устойчивы к антибиотикам. Изоляты, культивированные из сточных вод еще в 1970-х годах, были устойчивы к тетрациклину (136).В воде энтерококки используются EPA в дополнение к общим колиформным бактериям в качестве маркера фекального загрязнения после обнаружения корреляции между риском пловцов инфицирования ЖКТ и количеством энтерококков, культивируемых в водоеме (137). В 2012 году 24% поверхностных водоемов были классифицированы как поврежденные в Соединенных Штатах, некоторые из них были вызваны энтерококками (133).

В желудочно-кишечном тракте человека энтерококки живут в тонком и толстом кишечнике. Штаммы энтерококков составляют примерно 1% фекальной флоры человека, при этом E.6 бактерий на грамм сырого веса, причем E. faecalis обнаружен в несколько большей численности, чем E. faecium (138, 139). Однако в одном исследовании E. faecalis был обнаружен более чем в 75% проб фекалий, тогда как E. faecium был обнаружен в 100% (140).

Кишечные комменсалы процветают в тонко настроенной микробной экологии, которая развивалась тысячелетиями, способствуя расщеплению питательных веществ и развитию иммунитета слизистых оболочек (141, 142). Было показано, что ранние колонизирующие штаммы комменсальных энтерококков способствуют гомеостазу толстой кишки за счет индуцированной PPARγ1 экспрессии IL-10 и TGF-B in vitro и могут снижать тяжесть инфекционной диареи у детей (143, 144, 145).Нарушения микробиоты кишечника нарушают эти симбиотические отношения, установленные с нашими микробными обитателями, с серьезными последствиями для здоровья. Восприимчивость к инфекциям - это наиболее хорошо задокументированная патология, возникающая в результате изменений микробиоты, особенно в контексте лечения антибиотиками, как подробно описано в следующем разделе.

ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ С МИКРОБИОМ КИШЕЧНИКА

Устойчивость к колонизации, опосредованная микробиотой кишечника

Микробиота кишечника здоровых людей состоит из разнообразного консорциума бактерий (17, 146, 147).В толстой кишке индивиды содержат ряд бактериальных составов, состоящих из сотен различных штаммов микробов, которые в основном относятся к двум основным типам: грамотрицательным Bacteroidetes и грамположительным Firmicutes (17, 148, 149). Помимо различий между людьми, различия в структуре сообщества также обнаруживаются на участках тела, которые демонстрируют разные уровни стабильности с течением времени, например, между стабильной нижней (фекальной) и переменной верхней (оральной) областями пищеварительного тракта (150).

Как отмечалось ранее, введение антибиотиков широкого спектра действия позволяет лекарственно-устойчивым штаммам, таким как VRE, резко увеличиваться в кишечнике, нарушая эту чувствительную микробную экосистему (151, 22, 23, 24). VRE может увеличиваться до 99% микробиоты просвета кишечника как у мышей, получавших антибиотики, так и у госпитализированных пациентов (23). Эта подавляющая колонизация связана с транслокацией в кровоток и, как следствие, бактериемией VRE (23, 24). Фактически у пациентов с алло-ТГСК колонизация VRE была обнаружена у более чем одной трети реципиентов, и у этих пациентов с преобладанием в 9 раз выше риск бактериемии VRE (24).Этот риск сохраняется с течением времени; Введение ампициллина делает мышей восприимчивыми к колонизации VRE на срок до четырех недель после лечения, а VRE стабильно сохраняется в слепой кишке в течение как минимум 60 дней (23). У пациентов резистентные энтерококки могут сохраняться в течение многих лет после воздействия антибиотиков (152).

Концепция устойчивости к колонизации относится к способности микробиоты предотвращать проникновение и рост экзогенных бактерий в ее сложившемся сложном сообществе (15, 153). Лечение антибиотиками устраняет резистентность к колонизации за счет истощения большого количества кишечных комменсальных микроорганизмов, особенно анаэробных бактерий, которые опосредуют эту защиту (15, 154, 155, 156).Облигатные анаэробы, такие как представители рода Barnsiella и Clostridium cluster XIVa, сильно коррелируют с клиренсом VRE в кишечнике после трансплантации фекальных микробов (156, 157). Как облигатные анаэробы обеспечивают надежную защиту от вторжения VRE, полностью не выяснено. Однако существуют широкие механизмы, которые комменсалы могут использовать для обеспечения устойчивости к колонизации и предотвращения инфекции: 1) непрямая элиминация, основанная на стимуляции врожденного иммунитета слизистой оболочки, 2) постоянное поддержание целостности слизистого барьера и 3) прямой антагонизм.

Непрямое ингибирование посредством врожденной иммунной защиты

Кишечные микробы могут стимулировать врожденные рецепторы иммунных клеток и индуцировать продукцию антимикробных пептидов (АМП) в других типах кишечных клеток. Клетки Панета и кишечные эпителиальные клетки продуцируют RegIIIγ, лектин С-типа, управляемый сигнализацией TLR, с бактерицидной активностью против грамположительных бактерий (158, 159, 160). Секретируемый RegIIIγ убивает бактерии, связываясь с пептидогликанами бактериальной клеточной стенки и образуя поры (161).Лечение антибиотиками снижает экспрессию RegIIIγ и у мышей увеличивает восприимчивость к колонизации VRE и бактериемии (162). Пероральное введение LPS имитирует комменсальные микробные сигналы и восстанавливает продукцию RegIIIγ, тем самым повышая устойчивость к VRE (162). Сигнальный путь, управляющий экспрессией RegIIIγ, определяли путем введения бактериального лиганда TLR5, флагеллина. Флагеллин, вводимый внутривенно, стимулирует подмножество CD103 + CD11b + дендритных клеток к выработке IL-23, который запускает IL-22-опосредованное производство RegIIIγ эпителиальными клетками кишечника (163).Таким образом, комменсалы могут работать совместно с иммунной системой слизистых оболочек, подавляя разрастание VRE в экосистеме кишечника.

Непрямое ингибирование посредством поддержания кишечного барьера

Кишечные микробы отделяются от эпителия слизистой оболочки и ее дистальной собственной пластинки слизью, покрывающей эпителиальную поверхность. Эпителий толстой кишки покрыт плотным внутренним слоем муцина толщиной 50 мкм, состоящим в основном из Muc2 и менее плотного внешнего слоя (164). Поддержание здорового эпителиального барьера и физиологии кишечника, такой как выработка желудочного сока, подавляет бактериальную колонизацию желудочно-кишечного тракта (165).Бокаловидные клетки продуцируют муцин, и секреция стимулируется комменсальными бактериями MyD88-зависимым образом (166, 167, 168). После лечения антибиотиками муциновый слой истончается; без прочного физического барьера кишечные микробы могут напрямую проникать в эпителий и потенциально разрушать его (169). Как плотность, так и состав слизистых слоев ограничивают бактериальную инвазию. RegIIIγ связан с муцином и снижает плотность кишечных бактерий рядом с эпителиальными клетками (170, 171, 172).

По сравнению с другими устойчивыми к антибиотикам патогенами, такими как Klebsiella pneumoniae (KP), VRE пространственно отделена от слизистого слоя кишечника и прилегающего эпителия даже после лечения антибиотиками с его заметным снижением муцина (173).Визуализация просвета толстой кишки показывает, что VRE не проникает во внутренний слой муцина и, несмотря на высокую плотность просвета, очень небольшое количество бактерий перемещается в брыжеечные лимфатические узлы (MLN) (173). Интересно, что совместная колонизация мышей VRE и KP, которые могут более глубоко проникать через слизистую оболочку, позволяет VRE получить доступ к MLN, возможно, за счет KP-индуцированных изменений в составе муцина (173). Неповрежденное производство муцина, которое частично регулируется комменсальными микробами, вероятно, ограничивает инвазивный потенциал кишечных энтерококков.

Прямое ингибирование анаэробными комменсалами

В первом подобном исследовании VRE был идентифицирован определенный консорциум комменсалов, способных восстанавливать устойчивость к колонизации у мышей (157). Мышам, получавшим антибиотики, перорально вводили разбавленные дозы фекальной микробиоты из колонии мышей, которые получали ампициллин более пятнадцати лет. Бактериальные изоляты во фракциях с низкими дозами, которые придали устойчивость к VRE, были идентифицированы, культивированы и вводились в дискретных комбинациях мышам, получавшим ампициллин.Посредством серии адаптивных переносов по принципу «один-один-единственный» было обнаружено, что как минимум четыре анаэробных изолята успешно предотвращают и устраняют VRE из кишечника: Blautia producta, Clostridium bolteae, Bacteroides sartorii и Parabacteroides distasonis (157). Из четырехкомменсальной смеси Blautia producta была показана ex vivo как член, который непосредственно ингибирует рост VRE, хотя точный механизм остается неизвестным. Один из возможных механизмов ингибирования - это производство токсичных веществ, таких как бактериоцины, которые представляют собой небольшие молекулы с антимикробной активностью.Штаммы Lactococcus lactis, сконструированные для экспрессии бактериоцинов, значительно ингибировали рост VRE in vitro (174). Пероральное введение продуцирующего бактериоцин Lactococcus lactis MM19 устраняет VRE из кишечника мышей быстрее, чем имитационное лечение (175).

Прямое ингибирование комменсальными энтерококками

Недавние исследования изучали динамику колонизации между энтерококковыми комменсалами и нозокомиальными изолятами в желудочно-кишечном тракте. В то время как резистентные изоляты превосходят чувствительные энтерококки в контексте давления антибиотиков, кишечная колонизация у пациентов снижается после выписки (176).В in vivo конкурентных анализах , в которых сравнивалась способность штаммов E. faecium к колонизации у мышей, леченных антибиотиками, изоляты из клады B (ассоциированные с комменсалом) превосходили изоляты из подклада A1 (полученные из больниц) через две недели (177).

Комменсал Энтерококки разработали сложные защитные механизмы для устранения экзогенных конкурентов энтерококков из кишечника. Гены, кодирующие бактериоцин, обычно содержатся в плазмидах энтерококков. Комменсальные E. faecalis, которые экспрессируют феромон-чувствительную конъюгативную плазмиду, кодирующую бактериоцин bac-21, превзошли VRE, у которого он отсутствовал (178).Эта плазмида, pPD1, также быстро передается наивным кишечным комменсалам путем конъюгации (178). Феромоны - это секретируемые короткие фрагменты сигнального пептида липопротеинов, которые действуют как химические посредники между бактериями и могут опосредовать гибель клеток. Изолят E. faecalis V583 с множественной лекарственной устойчивостью содержит плазмиду pTEF2, которая делает его чувствительным к механизму киллинга, индуцированному производным комменсалом феромоном cOB1 (179). Бактериофаги - это вирусы, которые избирательно заражают и убивают микробы. Учитывая их избирательное уничтожение, фаги могут использоваться в терапевтических целях как противомикробное средство узкого спектра действия.Штаммы E. faecalis, которые содержат бактериофаг ϕV1 / 7 в своем генетическом репертуаре, обладают преимуществом роста по сравнению с родственными бактериями, у которых он отсутствует, из-за опосредованного фагом лизиса конкурентов (180). В мышиной модели бактериемии VRE внутрибрюшинная инъекция фага ENB6 защищала всех мышей при введении вскоре после летального заражения VRE и половине мышей при введении после того, как мыши умирают (181).

Энтерококки как пробиотики

Преимущества использования энтерококков в качестве пробиотиков неоднозначны (182).Учитывая способность изолятов энтерококков делиться мобильными элементами вирулентности в кишечнике, существует опасность распространения устойчивости к антибиотикам, если они переносятся или получены с помощью пробиотиков. Однако штаммы энтерококков, такие как E. faecium SF68 и E. faecalis Symbio-flor, продавались как пробиотики в течение двух десятилетий без заболеваемости и с очень небольшим количеством сообщений о побочных эффектах (182, 183, 184). Энтерококковые пробиотики доказали свою эффективность в снижении инфекционного бремени желудочно-кишечного тракта. Кокрановский метаобзор литературы показал, что E.faecium SF68 для эффективного лечения инфекций ЖКТ (184). Прививка только E. faecium SF68 взрослым и детям с энтеритом сокращает продолжительность болезни (182, 184, 185, 186). Смесь пробиотиков, содержащая E. faecalis, а также Bacillus mesentericus и Clostridium butyricum, сократила тяжесть и продолжительность инфекционной диареи у детей (145). В исследованиях диареи, продолжавшейся 4 дня и более, живой штамм Lactobacillus casei GG имел больший лечебный эффект (0,59), чем живой Enterococcus SF68 (0.2), хотя в первом во всех исследованиях было почти вдвое больше участников (184).

Трансплантация фекальной микробиоты и пробиотики как лечение колонизации VRE

Учитывая рост устойчивости к антибиотикам, трансплантация фекальной микробиоты (FMT) является привлекательной альтернативной терапией для лечения устойчивых к антибиотикам патогенов и областью активных исследований. FMT чрезвычайно эффективен при лечении хронической трудноизлечимой инфекции C. difficile (187). Вторичный анализ исследования с участием пациентов с рецидивирующим C.difficile показала, что FMT человеческого происхождения может уменьшить колонизацию VRE (188). Однако риск непреднамеренной передачи патогенных микроорганизмов через FMT не является незначительным, тем более что многие составляющие микробиоты были идентифицированы, если не охарактеризованы, совсем недавно. Эта проблема особенно актуальна для пациентов, колонизированных VRE, которые часто имеют ослабленный иммунитет. В этой области активно изучаются методы совершенствования сбора перенесенных бактерий и определения критических членов FMT, нацеленных на инфекционных агентов (189, 190).

На сегодняшний день количество клинических испытаний влияния пробиотиков на носительство VRE в кишечнике ограничено. В рандомизированном исследовании 21 почечного пациента с VRE в желудочно-кишечном тракте прием йогурта с добавкой Lactobacillus rhamnosus GG снизил плотность VRE до предела обнаружения у всех пациентов, получавших пробиотик (191). Бремя VRE уменьшилось в течение трехнедельного перорального приема L. rhamnosus GG в рандомизированном клиническом исследовании с участием 61 ребенка (192). Этот эффект не наблюдался при пятинедельном введении L.rhamnosus Lcr35 в рандомизированном исследовании девяти пациентов (193). Двухнедельный курс введения L. rhamnosus GG 11 пациентам с сопутствующими заболеваниями также не повлиял на колонизацию VRE (194). Исследования энтерококковых пробиотиков не продемонстрировали их способности ограничивать колонизацию устойчивыми к лекарствам энтерококками. В проспективном когортном исследовании с участием более 500 госпитализированных пациентов смесь из 10 штаммов, содержащая E. faecium и многочисленные изоляты Lactobacillus, не предотвратила резистентность к ампициллину E.faecium (195).

Оптимальный дизайн консорциумов пробиотиков использует доклинические мышиные модели для скрининга кандидатов и последующих механистических исследований. Исследования микробиома основаны на глубоком секвенировании гена 16S рРНК и дробовиком для профилирования бактериальных сообществ кишечника и прогнозирования кандидатов-комменсалов, которые придают устойчивость к колонизации, в экспериментах по восстановлению микробиоты с временным рядом. Экологическое моделирование микробиоты с использованием данных секвенирования 16S точно предсказало колебания в составе микробиоты после введения клиндамицина и C.difficile и предложил анаэроб Coprobacillus в качестве комменсала, способного подавлять рост энтерококков (196). In vivo эксперименты по адаптивному переносу позволяют исследователям дополнительно выяснить механизмы устойчивости к колонизации, обеспечиваемые восстановленными комменсалами. В модели инфекции C. difficile у мышей Clostridium scindens защищал мышей, получавших антибиотики, от колонизации C. difficile, восстанавливая уровни вторичных солей желчных кислот, которые ингибируют рост патогена (190).Как лучше всего применить эти результаты для лечения пациентов из группы риска, еще предстоит определить. В многообещающем исследовании фазы 1b перорально вводимые капсулы из 50 живых спор Firmicutes человеческого происхождения предотвращали рецидив инфекции C. difficile, в то время как клиническое исследование фазы II не показало эффективности (197, 198). Ключевой вопрос, стоящий перед переводом оптимальных комбинаций бактерий в терапию пациента, - это то, что требуется для высокой эффективности трансплантации. Исследование, которое определило минимальный консорциум для VRE у мышей, подчеркивает эту проблему (157).Успешная колонизация Blautia producta у мышей, получавших ампициллин, потребовала адаптивного переноса трех дополнительных комменсалов. Bacteroides sartorii и Parabacteroides distasonis инактивируют ампициллин за счет продукции β-лактамазы, которая имеет решающее значение для выживания чувствительных к ампициллину изолятов в желудочно-кишечном тракте, в то время как Clostridium bolteae поддерживает приживление Blautia producta неизвестным механизмом (157). Регулирование местной среды кишечника путем инактивации лекарств пробиотиками имеет особое значение для предотвращения колонизации VRE у пациентов, которые в настоящее время получают антибиотики (199).Комменсалы пробиотиков могут ограничивать колонизацию патогенов в кишечнике, с самого начала смягчая разрушительные эффекты антибиотиков. Было показано, что штамм Bacteroides thetaiotaomicron, продуцирующий цефалоспориназу, предотвращает разрастание VRE в кишечнике за счет инактивации цефтриаксона и, таким образом, смягчения любых значительных изменений микробиоты (200).

Другой открытый вопрос - следует ли адаптировать консорциум защитных микробов к индивидуальным пациентам, и если да, то как масштабировать такую ​​конструкцию.Учитывая падающую стоимость глубокого секвенирования, профилирование микробиоты пациентов может происходить регулярно в клинической практике. В контексте VRE пациенты с различной степенью нарушения иммунной системы и историей лечения могут извлечь выгоду из персонализированных изменений минимально определенного защитного консорциума. Например, пациенты, которые недавно получали антибиотики, могут испытывать дефицит питательных веществ, которые необходимы бактериям, опосредующим резистентность, для выживания в кишечнике, что требует дополнительных изолятов для поддержки успешного приживления.Мышиные модели не будут масштабируемым подходом для тестирования этих индивидуальных модификаций. В эту эпоху глубокого секвенирования мы потенциально можем интегрировать данные о диете, режимах лечения и микробиоме кишечника для создания алгоритмов машинного обучения, которые могут оценить риск колонизации VRE у пациента и оптимизировать комбинации пробиотиков. Включение информации о составе и функции микробиома улучшило прогнозы гликемического ответа людей после еды и помогло разработать диетические вмешательства для лучшего гликемического контроля (201).Такие основанные на данных подходы могут помочь адаптировать доклинические результаты к отдельным пациентам в широком масштабе, чтобы успешно снизить их восприимчивость к колонизации VRE.

Энтерококковые инфекции: основы практики, история вопроса, патофизиология

  • de Perio MA, Yarnold PR, Warren J, et al. Факторы риска и исходы, связанные с энтерококковой бактериемией, не связанной с Enterococcus faecalis и Enterococcus faecium. Инфекционный контроль Hosp Epidemiol . 2006 27 января (1): 28-33. [Медлайн].

  • О'Дрисколл Т., Crank CW. Устойчивые к ванкомицину энтерококковые инфекции: эпидемиология, клинические проявления и оптимальное лечение. Устойчивость к лекарствам от инфекций . 2015. 8: 217-30. [Медлайн]. [Полный текст].

  • Курвалин П. Устойчивость к ванкомицину грамположительных кокков. Клин Инфекция Дис . 2006 г. 1. 42 Приложение 1: S25-34. [Медлайн].

  • Зиверт Д.М., Рикс П., Эдвардс Дж. Р., Шнайдер А., Патель Дж., Сринивасан А. и др.Устойчивые к противомикробным препаратам патогены, связанные с инфекциями, связанными со здравоохранением: сводка данных, представленных в Национальную сеть безопасности здравоохранения в Центрах по контролю и профилактике заболеваний, 2009-2010 гг. Инфекционный контроль Hosp Epidemiol . 2013 января 34 (1): 1-14. [Медлайн]. [Полный текст].

  • Deshpande LM, Fritsche TR, Moet GJ, et al. Устойчивость к противомикробным препаратам и молекулярная эпидемиология устойчивых к ванкомицину энтерококков из Северной Америки и Европы: отчет программы антимикробного надзора SENTRY. Диагностика микробиологических инфекций . 2007 июн 58 (2): 163-70. [Медлайн].

  • Klibi N, Ben Slama K, Sáenz Y, et al. Обнаружение факторов вирулентности в изолятах Enterococcus faecalis и Enterococcus faecium с высокой устойчивостью к гентамицину из тунисской больницы. Банка Микробиол . 2007 марта 53 (3): 372-9. [Медлайн].

  • Long JK, Choueiri TK, Hall GS, Avery RK, Sekeres MA. Даптомицин-резистентный Enterococcus faecium у пациента с острым миелоидным лейкозом. Mayo Clin Proc . 2005 Сентябрь 80 (9): 1215-6. [Медлайн].

  • Смит-младший, Парикмахер К.Е., Раут А., Отуалеб М., Сакулас Г., Рыбак М.Дж. Комбинации β-лактама с даптомицином обеспечивают синергизм против устойчивых к ванкомицину Enterococcus faecalis и Enterococcus faecium. J Антимикробный препарат Chemother . 2015 июн. 70 (6): 1738-43. [Медлайн].

  • Хиндлер Дж. А., Вонг-Берингер А., Чарльтон С. Л., Миллер С. А., Келесидис Т., Карвалью М. и др. Активность даптомицина в комбинации с β-лактамами, гентамицином, рифампицином и тигециклином in vitro в отношении нечувствительных к даптомицину энтерококков. Противомикробные агенты Chemother . 2015 Июль 59 (7): 4279-88. [Медлайн].

  • Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC). Устойчивый к ванкомицину Staphylococcus aureus - Нью-Йорк, 2004 г. MMWR Morb Mortal Wkly Rep . 2004 апр 23, 53 (15): 322-3. [Медлайн].

  • Chang S, Sievert DM, Hageman JC, Boulton ML, Tenover FC, Downes FP, et al. Заражение устойчивым к ванкомицину Staphylococcus aureus, содержащим ген устойчивости к vanA. N Engl J Med . 2003, апрель. 348 (14): 1342-7. [Медлайн].

  • Лимбаго Б.М., Каллен А.Дж., Чжу В., Эггерс П., Макдугал Л.К., Альбрехт В.С. Отчет о 13-м изоляте устойчивого к ванкомицину Staphylococcus aureus из США. Дж. Клин Микробиол . 2014 Март 52 (3): 998-1002. [Медлайн].

  • Сакка В., Циодрас С., Галани Л. и др. Факторы риска и предикторы смертности у пациентов, колонизированных устойчивыми к ванкомицину энтерококками. Клин Микробиол Инфекция . 2008 14 января (1): 14-21. [Медлайн].

  • Шмидт-Хибер М., Блау И.В., Шварц С. и др. Усиленные стратегии борьбы с устойчивыми к ванкомицину энтерококками у пациентов с ослабленным иммунитетом. Инт Дж. Гематол . 2007 августа 86 (2): 158-62. [Медлайн].

  • Андерсон А.С., Йонас Д., Хубер И., Каригианни Л., Вёльбер Дж., Хеллвиг Э. и др. Enterococcus faecalis из пищевых продуктов, клинических образцов и оральных участков: преобладание факторов вирулентности в связи с образованием биопленок. Фронтальный микробиол . 2015. 6: 1534. [Медлайн].

  • Wisplinghoff H, Bischoff T, Tallent SM, Seifert H, Wenzel RP, Edmond MB. Нозокомиальные инфекции кровотока в больницах США: анализ 24 179 случаев из проспективного общенационального эпиднадзора. Клин Инфекция Дис . 2004 г., 1. 39 (3): 309-17. [Медлайн].

  • Brusch JL. Микробиология инфекционного эндокардита и клинические корреляты: грамположительные организмы. Бруш JL, изд. Инфекционный эндокардит: лечение в эпоху внутрисосудистых устройств . Informa Healthcare; 2007.

  • Цинь X, Сингх К.В., Вайншток GM, Мюррей BE. Влияние генов fsr Enterococcus faecalis на продукцию желатиназы и сериновой протеазы и вирулентность. Заражение иммунной . 2000 Май. 68 (5): 2579-86. [Медлайн]. [Полный текст].

  • Lee do K, Kim Y, Park KS, et al. Противомикробная активность мупироцина, даптомицина, линезолида, хинупристина / далфопристина и тигециклина в отношении устойчивых к ванкомицину энтерококков (VRE) из клинических изолятов в Корее (1998 и 2005 гг.). Дж Биохим Мол Биол . 2007 30 ноября. 40 (6): 881-7. [Медлайн].

  • Ceci M, Delpech G, Sparo M, Mezzina V, Sánchez Bruni S, Baldaccini B. Клинические и микробиологические особенности бактериемии, вызванной Enterococcus faecalis. J Инфекция разработчиков . 2015 30 ноября. 9 (11): 1195-203. [Медлайн].

  • DiazGranados CA, Zimmer SM, Klein M, et al. Сравнение смертности, связанной с устойчивыми к ванкомицину и чувствительными к ванкомицину энтерококковыми инфекциями кровотока: метаанализ. Клин Инфекция Дис . 2005 авг. 1. 41 (3): 327-33. [Медлайн].

  • Erlandson KM, Sun J, Iwen PC, et al. Влияние более сильнодействующих антибиотиков хинупристин-далфопристин и линезолид на показатели исходов у пациентов с устойчивой к ванкомицину бактериемией Enterococcus. Клин Инфекция Дис . 2008 г. 1. 46 (1): 30-6. [Медлайн].

  • Батлер КМ. Энтерококковая инфекция у детей. Семинар Педиатр Инфекция Дис . 2006 июл.17 (3): 128-39.[Медлайн].

  • Стивенс МП, Эдмонд МБ. Эндокардит, вызванный устойчивыми к ванкомицину энтерококками: описание случая и обзор литературы. Клин Инфекция Дис . 2005 октября 15. 41 (8): 1134-42. [Медлайн].

  • Макдональд Дж. Р., Олейсон Л., Андерсон Д. Д. и др. Энтерококковый эндокардит: 107 случаев из объединенной базы данных международного сотрудничества по эндокардиту. Ам Дж. Мед . 2005 июл.118 (7): 759-66. [Медлайн].

  • Хан З., Сиддики Н., Саиф М.В. Enterococcus Faecalis Инфекционный эндокардит и колоректальная карцинома: становление новых ассоциаций. Гастроэнтерологический центр . 2018 июн.11 (3): 238-240. [Медлайн]. [Полный текст].

  • Pericàs JM, Corredoira J, Moreno A, García-País MJ, Falces C, Rabuñal R, et al. Связь между Enterococcus faecalis инфекционным эндокардитом и колоректальным новообразованием: предварительные результаты когорты из 154 пациентов. Ред. Esp Cardiol (Англ. Ред.) .2017 июн. 70 (6): 451-458. [Медлайн]. [Полный текст].

  • Chatterjee I., Iredell JR, Woods M, et al. Значение энтерококков для отделения интенсивной терапии. Реаниматологическое лечение . 2007 марта 9 (1): 69-75. [Медлайн].

  • Berk SL, Verghese A, Holtsclaw SA, Smith JK. Энтерококковая пневмония. Возникновение у пациентов, получающих схемы антибиотиков широкого спектра действия и энтеральное питание. Ам Дж. Мед . 1983, январь, 74 (1): 153-4. [Медлайн].

  • Claeys KC, Zasowski EJ, Lagnf AM, Rybak MJ. Сравнение результатов между пациентами с одним и несколькими положительными культурами крови на энтерококк: инфекция против иллюзии ?. Am J Инфекционный контроль . 2016 г. 1. 44 (1): 47-9. [Медлайн].

  • Bouza E, Kestler M, Beca T., Mariscal G, Rodríguez-Créixems M, Bermejo J, et al. Оценка NOVA: предложение снизить потребность в чреспищеводной эхокардиографии у пациентов с энтерококковой бактериемией. Клин Инфекция Дис . 2015 15 февраля. 60 (4): 528-35. [Медлайн].

  • Berge A, Krantz A, Östlund H, Nauclér P, Rasmussen M. Оценка DENOVA эффективно выявляет пациентов с мономикробной бактериемией Enterococcus faecalis, у которых нет необходимости в эхокардиографии. Инфекция . 2019 Февраль 47 (1): 45-50. [Медлайн]. [Полный текст].

  • Peterson SC, Lau TTY, Ensom MHH. Комбинация цефтриаксона и ампициллина для лечения энтерококкового эндокардита: качественный систематический обзор. Энн Фармакотер . 2017 июн. 51 (6): 496-503. [Медлайн].

  • Фернандес-Идальго Н., Альмиранте Б., Гавальда Дж., Гургуи М., Пенья С., де Аларкон А. и др. Ампициллин плюс цефтриаксон так же эффективен, как ампициллин плюс гентамицин для лечения инфекционного эндокардита, вызванного энтерококками. Клин Инфекция Дис . 2013 май. 56 (9): 1261-8. [Медлайн].

  • Gavaldà J, Len O, Miró JM, Muñoz P, Montejo M, Alarcón A, et al. Краткое сообщение: лечение эндокардита Enterococcus faecalis ампициллином плюс цефтриаксон. Энн Интерн Мед. 2007 г., 17 апреля. 146 (8): 574-9. [Медлайн].

  • Beganovic M, Luther MK, Rice LB, Arias CA, Rybak MJ, LaPlante KL. Обзор комбинированной антимикробной терапии инфекций кровотока Enterococcus faecalis и инфекционного эндокардита. Клин Инфекция Дис . 2 июля 2018 г. 67 (2): 303-309. [Медлайн].

  • Смит-младший, Парикмахер К.Е., Раут А., Отуалеб М., Сакулас Г., Рыбак М.Дж. Комбинации β-лактама с даптомицином обеспечивают синергизм против устойчивых к ванкомицину Enterococcus faecalis и Enterococcus faecium. J Антимикробный препарат Chemother . 2015. 70 (6): 1738-43. [Медлайн].

  • Хиндлер Дж. А., Вонг-Берингер А., Чарльтон С. Л., Миллер С. А., Келесидис Т., Карвалью М. и др. Активность даптомицина в комбинации с β-лактамами, гентамицином, рифампицином и тигециклином in vitro в отношении нечувствительных к даптомицину энтерококков. Противомикробные агенты Chemother . 2015 Июль 59 (7): 4279-88. [Медлайн].

  • Senneville E, Caillon J, Calvet B, Jehl F. На пути к определению оптимальной дозы даптомицина: уроки, извлеченные из экспериментальных и клинических данных. Int J Антимикробные агенты . 2016 Январь 47 (1): 12-9. [Медлайн].

  • Ramaswamy DP, Amodio-Groton M, Scholand SJ. Использование даптомицина в лечении устойчивых к ванкомицину энтерококковых инфекций мочевыводящих путей: серия коротких случаев. БМК Урол . 2013 16 июля. 13 (1): 33. [Медлайн]. [Полный текст].

  • Gavaldà J, Len O, Miró JM, et al. Краткое сообщение: лечение эндокардита Enterococcus faecalis ампициллином плюс цефтриаксон. Энн Интерн Мед. 2007 г., 17 апреля. 146 (8): 574-9. [Медлайн].

  • Falagas ME, Vouloumanou EK, Samonis G, Vardakas KZ. Фосфомицин. Clin Microbiol Ред. . 2016 29 апреля (2): 321-47. [Медлайн]. [Полный текст].

  • Cunha BA. Антимикробная терапия Streptococcus pneumoniae с множественной лекарственной устойчивостью, энтерококков, устойчивых к ванкомицину, и устойчивых к метициллину Staphylococcus aureus. Мед Клин Север Ам . 2006 ноябрь 90 (6): 1165-82.[Медлайн].

  • Smith PF, Booker BM, Ogundele AB, et al. Сравнительная активность даптомицина, линезолида и хинупристина / далфопристина in vitro против грамположительных бактериальных изолятов из крупного онкологического центра. Диагностика микробиологических инфекций . 2005 июл.52 (3): 255-9. [Медлайн].

  • Плоскер Г.Л., Фиггитт Д.П. Линезолид: фармакоэкономический обзор его использования при серьезных грамположительных инфекциях. Фармакоэкономика . 2005 г.23 (9): 945-64. [Медлайн].

  • Велиссариу ИМ. Линезолид у детей: последние патенты и достижения. Диск с последними патентами на антиинфекционные препараты . 2007 января, 2 (1): 73-7. [Медлайн].

  • Кайнер М.А., Девасия Р.А., Джонс Т.Ф. и др. Ответ на возникающую инфекцию, приводящую к вспышке энтерококков, устойчивых к линезолиду. Emerg Infect Dis . 2007 июл.13 (7): 1024-30. [Медлайн].

  • Pogue JM, Paterson DL, Pasculle AW, et al.Определение факторов риска, связанных с выделением устойчивых к линезолиду штаммов ванкомицин-устойчивых энтерококков. Инфекционный контроль Hosp Epidemiol . 2007 декабря 28 (12): 1382-8. [Медлайн].

  • Пуциака Д.Д., Скиффингтон С., Миллер К.Б. и др. Даптомицин в лечении ванкомицин-резистентной бактериемии Enterococcus faecium у пациентов с нейтропенией. J Заражение . 2007 июнь 54 (6): 567-71. [Медлайн].

  • Бритт Н.С., Поттер Е.М., Патель Н., Стид МЭ.Сравнение эффективности и безопасности линезолида и даптомицина при устойчивой к ванкомицину энтерококковой инфекции кровотока: национальное когортное исследование пациентов с проблемами ветеранов. Клин Инфекция Дис . 2015 15 сентября. 61 (6): 871-8. [Медлайн].

  • Arias CA, Panesso D, McGrath DM, Qin X, Mojica MF, Miller C и др. Генетические основы устойчивости энтерококков к даптомицину in vivo. N Engl J Med . 2011 сентябрь 8. 365 (10): 892-900. [Медлайн].

  • Vouillamoz J, Moreillon P, Giddey M, et al.Эффективность даптомицина при лечении экспериментального эндокардита, вызванного чувствительными энтерококками и множественной лекарственной устойчивостью. J Антимикробный препарат Chemother . 2006 декабрь 58 (6): 1208-14. [Медлайн].

  • Каругати М., Байер А.С., Миро Дж.М., Парк Л.П., Гимарайнш А.С., Скоутелис А. и др. Терапия высокими дозами даптомицина при левостороннем инфекционном эндокардите: проспективное исследование международного сотрудничества по эндокардиту. Противомикробные агенты Chemother . 2013 декабрь.57 (12): 6213-22. [Медлайн]. [Полный текст].

  • Draghi DC, Benton BM, Krause KM, Thornsberry C, Pillar C, Sahm DF. Сравнительное эпиднадзорное исследование активности телаванцина против недавно собранных грамположительных клинических изолятов со всех концов Соединенных Штатов. Противомикробные агенты Chemother . 2008 июл.52 (7): 2383-8. [Медлайн]. [Полный текст].

  • Kosowska-Shick K, Clark C, Pankuch GA, McGhee P, Dewasse B, Beachel L. Активность телаванцина против стафилококков и энтерококков, определенная с помощью исследований MIC и отбора устойчивости. Противомикробные агенты Chemother . 2009 Октябрь 53 (10): 4217-24. [Медлайн]. [Полный текст].

  • Кори Г.Р., Каблер Х, Мехра П., Гупта С., Overcash JS, Порвал А. и др. Одноразовая доза оритаванцина при лечении острых бактериальных инфекций кожи. N Engl J Med . 2014, 5 июня. 370 (23): 2180-90. [Медлайн].

  • Prokocimer P, De Anda C, Fang E, Mehra P, Das A. Тедизолид фосфат против линезолида для лечения острых бактериальных инфекций кожи и кожных структур: рандомизированное исследование ESTABLISH-1. ЯМА . 2013 13 февраля. 309 (6): 559-69. [Медлайн]. [Полный текст].

  • Moran GJ, Fang E, Corey GR, Das AF, De Anda C., Prokocimer P. Тедизолид в течение 6 дней по сравнению с линезолидом в течение 10 дней при острых бактериальных инфекциях кожи и кожных структур (ESTABLISH-2): рандомизированный, двойной слепое, фаза 3, испытание не меньшей эффективности. Ланцет Инфекция Дис . 2014 5 июня. [Medline].

  • Manley KJ, Fraenkel MB, Mayall BC, et al. Пробиотическая терапия устойчивых к ванкомицину энтерококков: рандомизированное контролируемое исследование. Med J Aust . 2007 May 7. 186 (9): 454-7. [Медлайн].

  • [Рекомендации] Wilson W, Taubert KA, Gewitz M, et al. Профилактика инфекционного эндокардита: рекомендации Американской кардиологической ассоциации: рекомендации Комитета по ревматической лихорадке, эндокардиту и болезни Кавасаки, Совета по сердечно-сосудистым заболеваниям у молодежи и Совета по клинической кардиологии, Совета по сердечно-сосудистой хирургии и анестезии Американской кардиологической ассоциации и Междисциплинарная рабочая группа по исследованию качества медицинской помощи и результатов. Тираж . 2007 Октябрь 9. 116 (15): 1736-54. [Медлайн].

  • [Директива] Strausbaugh LJ, Siegel JD, Weinstein RA. Предотвращение передачи бактерий с множественной лекарственной устойчивостью в медицинских учреждениях: рассказ о 2 руководящих принципах. Клин Инфекция Дис . 2006 15 марта. 42 (6): 828-35. [Медлайн].

  • Сингх Н., Леже М.М., Кэмпбелл Дж. И др. Контроль устойчивых к ванкомицину энтерококков в отделении интенсивной терапии новорожденных. Инфекционный контроль Hosp Epidemiol .2005 26 июля (7): 646-9. [Медлайн].

  • Huskins WC, Huckabee CM, O'Grady NP, et al. Вмешательство для снижения передачи резистентных бактерий в отделениях интенсивной терапии. N Engl J Med . 2011, 14 апреля. 364 (15): 1407-18. [Медлайн].

  • Guglielmo BJ, Dudas V, Maewal I, et al. Влияние серии вмешательств по назначению ванкомицина на использование и распространенность устойчивых к ванкомицину энтерококков. Jt Comm J Qual Безопасность пациента . 2005 Август.31 (8): 469-75. [Медлайн].

  • де Брюин Массачусетс, Райли Л.В. Влияет ли вмешательство по назначению ванкомицина на устойчивую к ванкомицину энтерококковую инфекцию и колонизацию в больницах? Систематический обзор. BMC Инфекция Дис . 2007 10 апреля, 7:24. [Медлайн].

  • Drees M, Snydman DR, Schmid CH, et al. Предыдущее загрязнение окружающей среды увеличивает риск приобретения устойчивых к ванкомицину энтерококков. Клин Инфекция Дис . 2008 г. 1 марта.46 (5): 678-85. [Медлайн].

  • Eckstein BC, Adams DA, Eckstein EC, et al. Снижение контаминации Clostridium Difficile и устойчивыми к ванкомицину Enterococcus на поверхностях окружающей среды после вмешательства по улучшению методов очистки. BMC Инфекция Дис . 21 июня 2007 г., 7:61. [Медлайн].

  • Vernon MO, Hayden MK, Trick WE и др. Хлоргексидина глюконат для очищения пациентов в отделении интенсивной терапии: эффективность контроля источников для снижения бионагрузки устойчивых к ванкомицину энтерококков. Арк Интерн Мед. . 2006 13 февраля. 166 (3): 306-12. [Медлайн].

  • Фридкин С.К., Эдвардс Дж. Р., Курвал Дж. М. и др. Влияние ванкомицина и цефалоспоринов третьего поколения на распространенность устойчивых к ванкомицину энтерококков в 126 отделениях интенсивной терапии для взрослых в США. Энн Интерн Мед. 2001, 7 августа. 135 (3): 175-83. [Медлайн].

  • Aljefri DM, Avedissian SN, Rhodes NJ, Postelnick MJ, Nguyen K, Scheetz MH. Ванкомицин: область под кривой и острая травма почек: метаанализ. Клин Инфекция Дис . 2019 13 ноября. 69 (11): 1881-1887. [Медлайн]. [Полный текст].

  • Баддур Л.М., Уилсон В.Р., Байер А.С. и др. Инфекционный эндокардит у взрослых: диагностика, антимикробная терапия и лечение осложнений: научное заявление Американской кардиологической ассоциации для медицинских работников. Тираж . 2015 13 октября 132 (15): 1435-86. [Медлайн].

  • Mazuski JE, Tessier JM, May AK, Sawyer RG, Nadler EP, Rosengart MR, et al.Общество хирургических инфекций пересмотрело руководство по ведению внутрибрюшных инфекций. Хирургическая инфекция (Larchmt) . 2017 18 января (1): 1-76. [Медлайн].

  • Enterococcus - обзор | Темы ScienceDirect

    Enterococcus spp

    Энтерококки - это α- или негемолитические грамположительные бактерии, которые обычно обладают антигенами группы D Лансфилда, являются комменсалами желудочно-кишечного тракта человека и других животных и являются важными внутрибольничными патогенами.Они образуют пары или короткие цепочки организмов и не могут быть морфологически отличимы от стрептококков. Энтерококки выживают в суровых условиях окружающей среды; они растут в среде, содержащей 6,5% NaCl, могут расти при температуре от 10 ° C до 45 ° C (от 50 ° F до 113 ° F) и гидролизуют эскулин в присутствии 40% солей желчных кислот. Род Enterococcus был отделен от Streptococcus в середине 1980-х годов на основе результатов экспериментов по гибридизации ДНК. 35

    Энтерококки часто устойчивы к большому количеству различных классов противомикробных препаратов, и энтерококковые инфекции с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ), особенно те, которые также устойчивы к ванкомицину (устойчивые к ванкомицину энтерококки или VRE), являются серьезной проблемой. в медицине человека.Имея большое клиническое значение, резистентность энтерококков возникает в результате как внутренних, так и приобретенных механизмов резистентности. Внутренняя устойчивость к низким уровням большинства β-лактамных противомикробных препаратов возникает из-за того, что энтерококки обладают низкоаффинными пенициллин-связывающими белками (PBP). Таким образом, пенициллины обычно обладают бактериостатическим, а не бактерицидным действием против энтерококков. Энтерококки также имеют низкую внутреннюю резистентность к аминогликозидам, которая возникает в результате снижения поглощения лекарств. Однако поглощение аминогликозидов увеличивается, когда энтерококки подвергаются воздействию β-лактамов, что объясняет синергетическую активность этой комбинации.Энтерококки устойчивы к триметоприм-сульфаметоксазолу, потому что они используют экзогенно продуцируемый фолат. Таким образом, даже если микроорганизмы оказываются чувствительными к триметоприм-сульфаметоксазолу in vitro (при недостатке экзогенного фолата), препарат не эффективен in vivo. Поэтому многие лаборатории не сообщают о минимальных ингибирующих концентрациях для этой комбинации организм-лекарство. Устойчивость энтерококков к другим противомикробным препаратам, таким как макролиды и ванкомицин, может быть результатом механизмов приобретенной устойчивости.Обширная множественная лекарственная устойчивость хорошо задокументирована у энтерококков, выделенных от собак и кошек, но в литературе имеется лишь несколько сообщений об энтерококках с приобретенной устойчивостью к ванкомицину от собак. Они были из Великобритании, Новой Зеландии и США. 36-38 Все остальные исследованные изоляты были чувствительны к ванкомицину. Напротив, на VRE приходится около 30% энтерококковых инфекций у людей из Европы и Северной Америки. 39

    Лаборатории клинической микробиологии часто не проводят различий между видами Enterococcus , поскольку для окончательной идентификации может потребоваться генетическое типирование.Некоторые лаборатории используют биохимические методы для идентификации Enterococcus faecalis и Enterococcus faecium, , которые являются наиболее распространенными видами у людей и различаются по своей эпидемиологии, чувствительности к противомикробным препаратам и свойствам вирулентности. E. faecium с большей вероятностью покажет высокий уровень устойчивости к пенициллинам и карбапенемам, чем E. faecalis , и, как следствие, у людей прогноз для серьезных инфекций E. faecium может быть хуже, чем для Э.faecalis инфекций. 40 Однако E. faecalis с большей вероятностью будет производить биопленки, чем E. faecium . 41 Хотя большинство инфекций у людей были E. faecalis, произошло тревожное увеличение распространенности инфекций MDR E. faecium . В частности, появились устойчивые к ампициллину и фторхинолонам штаммы E. faecium , которые принадлежат к адаптированным к больницам штаммам, известным как клональный комплекс 17 (CC17).Изоляты CC17 были обнаружены у собак, но их профиль гена вирулентности и профили чувствительности к антимикробным препаратам отличались от таковых у изолятов человека. 42

    У здоровых собак и кошек энтерококки могут быть обнаружены на коже, в полости рта, носовой полости и желудочно-кишечном тракте. В Соединенных Штатах наиболее распространенным видом у собак, по-видимому, является E. faecalis, , что составляет 68% из 155 изолятов. 43 У кошки это был Enterococcus hirae , что составляло 52% от 121 изолята. 43 Препараты, содержащие штамм E. faecium SF68, были исследованы в качестве пробиотиков у собак и кошек, но результаты оказались неоднозначными. 44-46 Некоторые исследования показывают, что добавление в пищу этого пробиотика может стимулировать местную и системную иммунную функцию у собак и кошек. 47,48

    Хотя они менее патогенны, чем многие стрептококки, в энтерококках были идентифицированы важные факторы вирулентности, которые позволяют им проникать в ткани и вызывать заболевание.К ним относятся цитолизин, желатиназа и сериновая протеаза, а также несколько поверхностных белков (например, белок Ace, который позволяет организму прикрепляться к компонентам соединительной ткани, таким как коллаген). Энтерококки также содержат пили, которые играют важную роль в соблюдении режима лечения. Способность многих энтерококков образовывать биопленки означает, что их очень трудно искоренить, поскольку они сопротивляются фагоцитозу и противомикробным препаратам. 41 Как и у людей, двумя наиболее распространенными видами Enterococcus , вызывающими заболевания у собак и кошек, являются E.faecalis и E. faecium . 36,49 Остальные показаны во вставке 34-2.

    Поскольку энтерококки обладают естественной устойчивостью к ряду противомикробных препаратов, лечение антибиотиками широкого спектра действия (которые уничтожают конкурирующие бактерии в желудочно-кишечном тракте) приводит к заселению энтерококками. Развитию энтерококковых ИМП может способствовать повторное использование противомикробных препаратов для лечения рецидивирующих ИМП, когда основная причина инфекции не устранена или не может быть устранена.Энтерококки могут загрязнять больничную среду и в течение длительного времени сохраняться на таких фомитах, как дверные ручки, стетоскопы и устройства для мониторинга, а также на руках, перчатках и одежде персонала больницы. Инокуляция может происходить через мочевые, внутривенные или другие инвазивные устройства, или организмы могут попадать в организм из поврежденного желудочно-кишечного тракта. Тяжелое сопутствующее заболевание и подавление иммунитета могут предрасполагать к инфекции. Помимо кожи и ИМП, энтерококки могут быть выделены от собак и кошек с ИМП, пиодермией и наружным отитом, холангиогепатитом, панкреатитом, абсцессами печени, перитонитом, маститом, бактериемией и эндокардитом, раневыми инфекциями и дискоспондилитом.Были редкие сообщения о желудочно-кишечных заболеваниях, связанных с энтерококковой инфекцией желудочно-кишечного тракта у собак и кошек. У пораженных кошек связь с диареей подтверждалась наличием больших матов энтерококков в слизистой оболочке желудочно-кишечного тракта. 52,53 Часто энтерококки выделяют из поражений при смешанных инфекциях с другими желудочно-кишечными микроорганизмами.

    Энтерококк - обзор | ScienceDirect Topics

    Значение рода и отдельных видов в пищевой промышленности

    Энтерококки могут считаться обязательной частью кишечной полости человека и животных.Таким образом, эти бактерии были полезны как индикаторы плохой гигиены воды и пищевых продуктов. Однако использование энтерококков в качестве «гигиенических индикаторов» требует более глубокого знания их микробной экологии. Например, E. faecium широко распространен в кишечнике людей и других животных, тогда как E. faecalis чаще ассоциируется с людьми. Однако оба вида широко распространены в окружающей среде и также связаны с растениями. В овощных продуктах интерпретация результатов энтерококковой инфекции затруднена, поскольку многие штаммы остаются неопределенными, а также из-за видов энтерококков, ассоциированных с растениями, таких как E.mundtii или E. casseliflavus могут встречаться вместе с энтерококками фекального происхождения, такими как E. faecalis или E. faecium . При таком широком распространении неудивительно, что энтерококки встречаются в различных продуктах питания, особенно в продуктах животного происхождения.

    Ценность большинства Enterococcus spp. поскольку индикаторы фекального загрязнения пищевых продуктов также ограничиваются их способностью выживать в неблагоприятных условиях окружающей среды, таких как экстремальный pH, температура и соленость.Это означает, что эти бактерии могут противостоять нормальным условиям производства продуктов питания. Следовательно, хотя энтерококки остаются хорошими индикаторами фекального загрязнения питьевой воды и некоторых молочных продуктов, таких как йогурт, масло и сухое молоко, они могут рассматриваться как организмы-индикаторы фекалий в других продуктах питания только в широком смысле, поскольку наличие и значимость их присутствие может варьироваться в зависимости от вида, среды обитания и технологии производства пищи.

    У домашней птицы небольшое количество энтерококков (менее 5000 см −2 кожи груди) свидетельствует о хорошей технике потрошения и соблюдении правил гигиены.В молочных продуктах, подвергнутых жесткой термической обработке, таких как йогурт, пастеризованные кремы, сухое молоко и масло, энтерококки могут рассматриваться как индикаторы повторного заражения. Подсчет энтерококков более надежен, чем подсчет кишечной палочки, как показатель санитарного качества сбитого сливочного масла. Это связано с тем, что энтерококки лучше, чем колиформные бактерии, способны выживать в неблагоприятной микросреде соленого масла. Кроме того, количество энтерококков может быть более надежным индикатором санитарного качества йогурта, чем количество колиформ, поскольку колиформные бактерии инактивируются в среде с низким pH; тогда как энтерококки - нет.

    В йогурте, в котором энтерококки представляют собой постоянную часть термодурической микрофлоры порчи, итальянские руководящие принципы указывают допустимые уровни этих бактерий 10–100 КОЕ г –1 . В сливочном масле количество энтерококков менее 10 колоний на грамм продукта считается достаточно строгим для хорошо управляемого завода по производству масла. Смысл присутствия энтерококков в сырах зависит от разных сырных технологий. В сырах энтерококки обнаруживаются в мягких и полутвердых сырах, приготовленных как из сырого, так и из пастеризованного молока.В сырых молочных сырах энтерококки, присутствующие в сыром молоке и / или в натуральных молочных заквасках, могут развиваться во время производства и созревания сыра и, в зависимости от различных технологий, могут представлять преобладающую микрофлору, обнаруженную в сыре. Нет данных о приемлемом уровне энтерококков в этих сырах. В пастеризованных молочных сырах присутствие энтерококков нежелательно, поскольку они могут вызвать проблемы с порчей. В этих сырах, которые обычно представляют собой свежие или мягкие сыры, можно рассматривать наличие более 10–100 КОЕ на г –1 энтерококков из-за плохих гигиенических условий при производстве сыра.

    Сообщалось о том, что несколько штаммов Enterococcus видов, связанных с пищевыми системами, таких как E. faecium и E. faecalis , продуцируют антибактериальные белки (бактериоцины), ингибирующие порчу пищевых продуктов или патогенные бактерии, такие как Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, Vibrio cholerae, Clostridium spp. и Bacillus spp. Энтерококковые бактериоцины, которые, как доказано, вырабатываются при производстве сыра или колбасы, могут обеспечить полезную защиту от нежелательных бактерий в пищевой промышленности.

    Многие специалисты по пищевой гигиене неохотно соглашаются с наличием энтерококков в пищевых продуктах, поскольку нет единого мнения о том, могут ли энтерококки в полной мере считаться GRAS (общепризнанными безопасными) микроорганизмами. Потенциальная патогенность этих бактерий в последнее время стала предметом споров, несмотря на долгую историю присутствия энтерококков в пищевых продуктах, которые не вызывали проблем со здоровьем.

    Энтерококки обычно обладают относительно низкой вирулентностью, но возникло множество штаммов E.faecium и E. faecalis , устойчивый ко всем доступным в настоящее время антибиотикам, создает серьезные проблемы в клинической терапии. Присутствие и постоянное использование антибиотиков в качестве пищевых добавок или терапевтических агентов привело к отбору микробной флоры с множественными, часто передаваемыми детерминантами устойчивости. Устойчивые к антибиотикам энтерококки, стафилококки и даже молочнокислые бактерии вошли в пищевую цепь человека. Образование биогенных аминов, особенно тирамина, к E.faecalis и других видов энтерококков. Декарбоксилирующие энтерококки могут найти подходящие условия для производства биогенных аминов в ряде ферментированных пищевых продуктов, включая сыр, мясо и рыбные продукты.

    Lactobacillus paracasei CNCM I-3689 снижает устойчивость энтерококков, устойчивых к ванкомицину, и способствует устойчивости Bacteroidetes в кишечнике после введения антибиотика.

  • 1.

    Sommer, F. & Backhed, F. Микробиота кишечника - хозяева развития и физиологии хозяина. Nat Rev Microbiol 11 , 227–238 (2013).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 2.

    Qin, J. et al. . Каталог микробных генов кишечника человека, созданный путем метагеномного секвенирования. Nature 464 , 59–65 (2010).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 3.

    Li, J. и др. . Интегрированный каталог эталонных генов микробиома кишечника человека. Nat Biotechnol 32 , 834–841 (2014).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 4.

    Round, J. L. & Mazmanian, S. K. Микробиота кишечника формирует иммунные реакции кишечника во время здоровья и болезни. Nat Rev Immunol 9 , 313–323 (2009).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 5.

    Чоу, Дж., Тан, Х. и Мазманиан, С. К. Патобионты желудочно-кишечной микробиоты и воспалительных заболеваний. Curr Opin Immunol 23 , 473–480 (2011).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 6.

    Weinstein, J. W. et al. . Устойчивые энтерококки: проспективное исследование распространенности, заболеваемости и факторов, связанных с колонизацией в университетской больнице. Infect Control Hosp Epidemiol 17 , 36–41 (1996).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 7.

    Alverdy, J. et al. . Кишечный сепсис возникает, когда правильный патоген с правильными генами вирулентности встречается с правильным хозяином: доказательства in vivo экспрессии вирулентности в Pseudomonas aeruginosa . Ann Surg 232 , 480–489 ​​(2000).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 8.

    Liss, B.J. и др. . Колонизация кишечника и инфекции кровотока из-за резистентных к ванкомицину энтерококков (VRE) и продуцирующих бета-лактамазы расширенного спектра действия Enterobacteriaceae (ESBLE) у пациентов с гематологическими и онкологическими злокачественными новообразованиями. Инфекция 40 , 613–619 (2012).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 9.

    Montassier, E., Batard, E., Gastinne, T., Potel, G. & de La Cochetiere, M. F. Недавние изменения бактериемии у онкологических больных: систематический обзор эпидемиологии и устойчивости к антибиотикам. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 32 , 841–850 (2013).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 10.

    Сартелли М. Акцент на внутрибрюшных инфекциях. World J Emerg Surg 5 , 9 (2010).

    Артикул PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 11.

    Montravers, P. et al. . Клинические и микробиологические профили внебольничных и внутрибрюшных инфекций: результаты проспективного обсервационного исследования EBIIA во Франции. J Antimicrob Chemother 63 , 785–794 (2009).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 12.

    Magill, S. S. et al. . Обследование распространенности инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, по нескольким штатам. N Engl J Med 370 , 1198–1208 (2014).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 13.

    Мендес Р. Э. и др. . Продольный (2001–14 гг.) Анализ энтерококков и ВРЭ, вызывающих инвазивные инфекции, в больницах Европы и США, включая современный (2010–13 гг.) Анализ активности оритаванцина in vitro . J Antimicrob Chemother 71 , 3453–3458 (2016).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 14.

    Джонс, Р. Н. и др. . Отчет о программе наблюдения за резистентностью для отдельных европейских стран (2011 г.). Diagn Microbiol Infect Dis 78 , 429–436 (2014).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 15.

    Убеда, К. и др. . Устойчивый к ванкомицину Enterococcus доминирование кишечной микробиоты становится возможным благодаря лечению антибиотиками у мышей и предшествует инвазии кровотока у людей. J Clin Invest 120 , 4332–4341 (2010).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 16.

    Taur, Y. et al. . Доминирование кишечника и риск бактериемии у пациентов, перенесших аллогенную трансплантацию гемопоэтических стволовых клеток. Clin Infect Dis 55 , 905–914 (2012).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 17.

    Remschmidt, C. и др. . Надзор за использованием антибиотиков и устойчивостью к ним в отделениях интенсивной терапии (ТОРИ). Dtsch Arztebl Int 114 , 858–865 (2017).

    PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 18.

    Сиверт, Д. М. и др. . Устойчивые к противомикробным препаратам патогены, ассоциированные с инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи: сводка данных, переданных в национальную сеть безопасности здравоохранения в центрах по контролю и профилактике заболеваний, 2009–2010 гг. Инфекционный контроль Hosp Epidemiol 34 , 1–14 (2013).

    Артикул PubMed Google Scholar

  • 19.

    Лейк, Дж. Г. и др. . Распространение патогенов и устойчивость к противомикробным препаратам среди педиатрических инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, по данным Национальной сети безопасности здравоохранения, 2011–2014 гг. Infect Control Hosp Epidemiol 39 , 1–11 (2018).

    Артикул PubMed Google Scholar

  • 20.

    Buffie, C.G. и Pamer, E.G. Устойчивость к колонизации, опосредованной микробиотой, против кишечных патогенов. Nat Rev Immunol 13 , 790–801 (2013).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 21.

    Derrien, M. & Vlieg, vanH. J. E. Судьба, активность и влияние проглоченных бактерий в микробиоте кишечника человека. Trends Microbiol 23 , 354–366 (2015).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 22.

    Лоули Т. Д. и Уокер А. В. Устойчивость к кишечной колонизации. Иммунология 138 , 1–11 (2013).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 23.

    Sohn, K. M., Cheon, S. & Kim, Y. S. Может ли трансплантация фекальной микробиоты (FMT) искоренить фекальную колонизацию с помощью устойчивых к ванкомицину энтерококков (VRE)? Инфекционный контроль Hosp Epidemiol 37 , 1519–1521 (2016).

    Артикул PubMed Google Scholar

  • 24.

    Stripling, J. et al. . Потеря резистентности к ванкомицину Enterococcus Фекальное доминирование у пациента с трансплантатом органа Clostridium difficile Колит после трансплантации фекальной микробиоты. Открытый форум Infect Dis 2 , ofv078, https://doi.org/10.1093/ofid/ofv078 (2015).

    Артикул PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 25.

    Крузе, Л., Риготтье-Гойс, Л. и Серрор, П. Возможное использование пробиотических и комменсальных бактерий в качестве неантибиотических стратегий борьбы с устойчивыми к ванкомицину энтерококками. FEMS Microbiol Lett 362 , fnv012, https://doi.org/10.1093/femsle/fnv012 (2015).

    Артикул PubMed Google Scholar

  • 26.

    Manley, K. J., Fraenkel, M. B., Mayall, B. C. и Power, D. A. Пробиотическая обработка устойчивых к ванкомицину энтерококков: рандомизированное контролируемое исследование. Med J Aust 186 , 454–457 (2007).

    PubMed Google Scholar

  • 27.

    Szachta, P., Ignys, I. & Cichy, W. Оценка способности пробиотического штамма Lactobacillus rhamnosus GG устранять состояние желудочно-кишечного носителя устойчивых к ванкомицину энтерококков у колонизированных детей. J Clin Gastroenterol 45 , 872–877 (2011).

    Артикул PubMed Google Scholar

  • 28.

    Caballero, S. и др. . Совместные комменсалы восстанавливают устойчивость к колонизации устойчивым к ванкомицину Enterococcus faecium . Клеточный микроб-хозяин 21 , 592–602 (2017).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 29.

    Дубберке, Э. Р. и др. . Удаление резистентного к ванкомицину Enterococcus одновременно с введением микробиотического препарата, нацеленного на рецидивирующую инфекцию Clostridium difficile . Открытый форум Infect Dis 3 , ofw133, https://doi.org/10.1093/ofid/ofw133 (2016).

    Артикул PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 30.

    Turpin, W., Humblot, C., Thomas, M. & Guyot, J. P. Лактобациллы как многогранные пробиотики с плохо раскрытыми молекулярными механизмами. Int J Food Microbiol 143 , 87–102 (2010).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 31.

    Archambaud, C. и др. . Влияние лактобацилл на листериоз, приобретенный перорально. Proc Natl Acad Sci USA 109 , 16684–16689 (2012).

    ADS CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 32.

    Laval, L. et al. . Lactobacillus rhamnosus CNCM I-3690 и комменсальная бактерия Faecalibacterium prausnitzii A2-165 проявляют защитные эффекты, аналогичные индуцированной гипер проницаемости барьера у мышей. Кишечные микробы 6 , 1–9 (2015).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 33.

    Grompone, G. et al. . Противовоспалительный штамм Lactobacillus rhamnosus CNCM I-3690 защищает от окислительного стресса и увеличивает продолжительность жизни у Caenorhabditis elegans . PLoS One 7 , e52493, https://doi.org/10.1371/journal.pone.0052493 (2012).

    ADS CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 34.

    Донски, К. Дж., Ханрахан, Дж. А., Хаттон, Р. А. и Райс, Л. Б. Влияние парентерального введения антибиотика на устойчивость устойчивого к ванкомицину Enterococcus faecium в желудочно-кишечном тракте мышей. J Infect Dis 180 , 384–390 (1999).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 35.

    Rigottier-Gois, L. et al. . Поверхностный рамнополисахарид Epa Enterococcus faecalis является ключевым фактором, определяющим колонизацию кишечника. J Infect Dis 211 , 62–71 (2015).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 36.

    Kuch, A. et al. . Понимание чувствительности к противомикробным препаратам и популяционной структуры современных изолятов Enterococcus faecalis человека из Европы. Журнал антимикробной химиотерапии 67 , 551–558 (2012).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 37.

    Наллапаредди, С. Р., Венсян, Х., Вайншток, Г. М. и Мюррей, Б. Е. Молекулярная характеристика широко распространенной, патогенной и устойчивой к антибиотикам линии происхождения Enterococcus faecalis и распространение его предполагаемого острова патогенности. J. Bacteriol. 187 , 5709–5718 (2005).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 38.

    Matos, R.C. et al. . Enterococcus faecalis Динамика профага и вклад в патогенные признаки. PLoS Genet 9 , e1003539, https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003539 (2013).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 39.

    Бутель, М. Дж. Пробиотики, кишечная микробиота и здоровье. Med Mal Infect 44 , 1–8 (2014).

    Артикул PubMed Google Scholar

  • 40.

    Millette, M. et al. . Способность молочнокислых бактерий человека, продуцирующих низин и педиоцин, уменьшать колонизацию кишечника устойчивыми к ванкомицину энтерококками. Appl Environ Microbiol 74 , 1997–2003 (2008).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 41.

    Kommineni, S. и др. . Продукция бактериоцина усиливает нишевую конкуренцию энтерококков в желудочно-кишечном тракте млекопитающих. Природа 526 , 719–722 (2015).

    ADS CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 42.

    Кристенсен, Н. Б. и др. . Изменения в составе фекальной микробиоты при добавлении пробиотиков у здоровых взрослых: систематический обзор рандомизированных контролируемых исследований. Genome Med 8 , 52, https://doi.org/10.1186/s13073-016-0300-5 (2016).

    Артикул PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 43.

    МакФарланд, Л. В. Использование пробиотиков для коррекции дисбактериоза нормальной микробиоты после болезни или разрушительных событий: систематический обзор. BMJ Open 4 , e005047 (2014).

    Артикул PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 44.

    Дерриен, М. и Вейга, П. Переосмысление диеты для помощи симбиозу человека и микробов. Trends Microbiol 25 , 100–112 (2017).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 45.

    Зоммер, Ф., Андерсон, Дж. М., Бхарти, Р., Раес, Дж. И Розенштиль, П. Устойчивость кишечной микробиоты влияет на здоровье и болезни. Nat Rev Microbiol 15 , 630–638 (2017).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 46.

    Лоули, Т. Д. и др. . Лечение антибиотиками мышей-носителей Clostridium difficile вызывает состояние суперседдера, опосредованную спорами передачу и тяжелое заболевание у хозяев с ослабленным иммунитетом. Infect Immun 77 , 3661–3669 (2009).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 47.

    Buffie, C.G. et al. . Глубокие изменения микробиоты кишечника после однократного приема клиндамицина приводят к устойчивой восприимчивости к колиту, индуцированному Clostridium difficile . Infect Immun 80 , 62–73 (2012).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 48.

    Джамп, Р. Л. и др. . Метаболомический анализ позволяет идентифицировать биомаркеры устойчивости к колонизации у мышей, получавших клиндамицин, на основе кишечной микробиоты. PLoS One 9 , e101267, https://doi.org/10.1371/journal.pone.0101267 (2014).

    ADS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 49.

    Джернберг, С., Лофмарк, С., Эдлунд, К. и Янссон, Дж. К. Долгосрочное экологическое воздействие введения антибиотиков на микробиоту кишечника человека. ISME J 1 , 56–66 (2007).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 50.

    Pham, T. A. et al. . Эпителиальное IL-22RA1-опосредованное фукозилирование способствует устойчивости кишечной колонизации к условно-патогенным микроорганизмам. Клеточный микроб-хозяин 16 , 504–516 (2014).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 51.

    Xiao, L. et al. . Каталог метагенома кишечника мыши. Nat Biotechnol 33 , 1103–1108 (2015).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 52.

    Мазманян, С. К., Лю, К. Х., Цианабос, А. О. и Каспер, Д. Л. Иммуномодулирующая молекула симбиотических бактерий направляет созревание иммунной системы хозяина. Cell 122 , 107–118 (2005).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 53.

    Ubeda, C. et al. . Кишечная микробиота, содержащая видов Barnesiella , лечит устойчивую к ванкомицину Enterococcus faecium колонизацию. Infect Immun 81 , 965–973 (2013).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 54.

    Stiefel, U., Nerandzic, M. M., Pultz, M. J. & Donskey, C.J. Колонизация желудочно-кишечного тракта бактериями, продуцирующими цефалоспориназу, сохраняет устойчивость к колонизации против устойчивых к ванкомицину Enterococcus и Clostridium difficile , обработанных цефалином диффициле. Антимикробные агенты Chemother 58 , 4535–4542 (2014).

    Артикул PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 55.

    Deshpande, A. и др. . Влияние фидаксомицина по сравнению с ванкомицином на восприимчивость к кишечной колонизации с помощью устойчивых к ванкомицину энтерококков и Klebsiella pneumoniae у мышей. Противомикробные агенты Chemother 60 , 3988–3993 (2016).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 56.

    Nerandzic, M. M., Mullane, K., Miller, M. A., Babakhani, F.& Donskey, C.J. Снижение накопления и чрезмерного роста устойчивых к ванкомицину энтерококков и видов Candida у пациентов, получавших фидаксомицин, по сравнению с ванкомицином при инфекции Clostridium difficile . Clin Infect Dis 55 (Приложение 2), S121–126 (2012).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 57.

    Hildebrand, F. et al. . Энтеротипы, связанные с воспалением, генотип хозяина, клетки и межиндивидуальные эффекты влияют на вариабельность кишечной микробиоты у обычных лабораторных мышей. Биология генома 14 , R4 (2013).

    Артикул PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 58.

    Фогт, С. Л., Пена-Диаз, Дж. И Финлей, Б. Б. Химическая коммуникация в кишечнике: эффекты метаболитов, генерируемых микробиотой, на желудочно-кишечные бактериальные патогены. Анаэроб 34 , 106–115 (2015).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 59.

    Льюис Б. и Пеймер Э. Г. Терапия на основе микробиоты для лечения Clostridium difficile и кишечных инфекций, устойчивых к антибиотикам. Annu Rev Microbiol 71 , 157–178 (2017).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 60.

    Buffie, C.G. et al. . Прецизионное восстановление микробиома восстанавливает опосредованную желчной кислотой устойчивость к Clostridium difficile . Природа 517 , 205–208 (2015).

    ADS CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 61.

    Ривера-Чавес, Ф. и др. . Истощение клостридий, продуцирующих бутират, из кишечной микробиоты способствует аэробному расширению просвета сальмонелл . Клеточный микроб-хозяин 19 , 443–454 (2016).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 62.

    Бегли М., Гахан К. Г. и Хилл К. Взаимодействие между бактериями и желчью. FEMS Microbiol Rev 29 , 625–651 (2005).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 63.

    Reichardt, N. et al. . Филогенетическое распределение трех путей производства пропионата в кишечной микробиоте человека. ISME J 8 , 1323–1335 (2014).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 64.

    Джонс, Р. М. и др. . Симбиотические лактобациллы стимулируют пролиферацию эпителия кишечника посредством NOx-опосредованного образования активных форм кислорода. EMBO J 32 , 3017–3028 (2013).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 65.

    Cliffe, L. J. et al. . Ускоренный оборот кишечных эпителиальных клеток: новый механизм изгнания паразитов. Наука 308 , 1463–1465 (2005).

    ADS CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 66.

    Scheb-Wetzel, M., Rohde, M., Bravo, A. & Goldmann, O. Новые сведения об антимикробном эффекте тучных клеток против Enterococcus faecalis . Infect Immun 82 , 4496–4507 (2014).

    Артикул PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 67.

    Вентилятор, Д. и др. . Активация HIF-1альфа и LL-37 комменсальными бактериями подавляет колонизацию Candida albicans . Nat Med 21 , 808–814 (2015).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 68.

    Brandl, K. et al. . Устойчивые к ванкомицину энтерококки используют вызванный антибиотиками врожденный иммунный дефицит. Nature 455 , 804–807 (2008).

    ADS CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 69.

    Киннебрю М.А. и др. . Бактериальный флагеллин стимулирует Toll-подобный рецептор 5-зависимую защиту от устойчивой к ванкомицину инфекции Enterococcus . J Infect Dis 201 , 534–543 (2010).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 70.

    Sahm, D. F. и др. . In vitro исследования чувствительности устойчивых к ванкомицину Enterococcus faecalis . Антимикробный. Агенты Chemother. 33 , 1588–1591 (1989).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 71.

    Godon, J. J., Zumstein, E., Dabert, P., Habouzit, F. & Moletta, R. Молекулярное микробное разнообразие анаэробного дигестора, определенное анализом последовательности малых субъединиц рДНК. Appl Environ Microbiol 63 , 2802–2813 (1997).

    CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 72.

    Sim, K. et al. . Улучшенное обнаружение бифидобактерий с оптимизированным пиросеквенированием на основе гена 16S рРНК. PLoS One 7 , e32543, https://doi.org/10.1371/journal.pone.0032543 (2012).

    ADS CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 73.

    Капорасо, Дж. Г. и др. . QIIME позволяет анализировать данные секвенирования сообщества с высокой пропускной способностью. Nat. Методы 7 , 335–336 (2010).

    CAS Статья PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 74.

    Livak, K. J. & Schmittgen, T. D. Анализ данных относительной экспрессии генов с использованием количественной ПЦР в реальном времени и метода 2 (-Delta Delta C (T)). Методы 25 , 402–408 (2001).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 75.

    Rajkumar, T. et al. . Оценка экспрессии гена 7 позволяет прогнозировать лучевую реакцию при раке шейки матки. BMC Cancer 9 , 365, https://doi.org/10.1186/1471-2407-9-365 (2009).

    Артикул PubMed PubMed Central Google Scholar

  • 76.

    Lan, A. et al. .Повышенная индукция апоптоза Propionibacterium freudenreichii TL133 в криптах слизистой оболочки толстой кишки крыс, ассоциированных с микробиотой человека, получавших 1,2-диметилгидразин. Br J Nutr 100 , 1251–1259 (2008).

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • E. Coli (для родителей) - Nemours Kidshealth

    Что такое инфекция

    E. Coli ?

    E.coli - это тип бактерий, которые обычно обитают в кишечнике, где они помогают организму расщеплять и переваривать пищу, которую мы едим. Но определенные типы (или штаммы) E. coli заразны и передаются через зараженную пищу или воду или от других инфицированных людей или животных.

    Инфекции, вызываемые бактериями E. coli ( Escherichia coli ), могут вызвать тяжелую кровавую диарею. Некоторые случаи могут привести к серьезным проблемам со здоровьем. К счастью, у большинства здоровых людей, заболевших инфекцией, не возникают серьезные проблемы, и они выздоравливают самостоятельно без лечения.

    Как возникают инфекции

    E. Coli ?

    Чаще всего кишечная палочка распространяется, когда кто-то ест пищу, содержащую бактерии. К продуктам риска относятся:

    • Недоваренный говяжий фарш (например, в гамбургерах)
    • продукты, выращенные на навозе (коров, овец, коз или оленей) или промытые в зараженной воде
    • непастеризованные молочные или соковые продукты

    Бактерии также могут передаваться от человека к человеку через немытые руки и поверхности, купаясь в загрязненной воде и прикасаясь к животным на фермах или в контактных зоопарках.

    Каковы признаки инфекции

    E. Coli ?

    Некоторые виды бактерий E. coli вырабатывают токсин (ядовитое вещество), способный повредить слизистую оболочку тонкой кишки. Это может привести к сильным спазмам желудка, рвоте и диарее (часто с кровью). Когда это происходит, люди могут обезвоживаться.

    Симптомы обычно появляются через 3–4 дня после контакта человека с бактериями и проходят примерно через неделю.

    - это

    г.Coli Инфекции заразны?

    Инфекция E. coli заразна, по крайней мере, до тех пор, пока у человека есть диарея, а иногда и дольше.

    Какие проблемы могут возникнуть?

    Большинство людей полностью выздоравливают от инфекции E. coli . Но у некоторых может развиться серьезная проблема с почками и кровью, называемая гемолитико-уремическим синдромом (ГУС) .

    Признаки HUS включают:

    • уменьшение мочеиспускания (моча)
    • бледность или припухлость
    • синяки необъяснимого происхождения
    • кровотечение из носа или десен
    • крайняя усталость
    • изъятия

    HUS может быть опасным для жизни и требует лечения в больнице.

    с1

    Как лечится инфекция

    E. Coli ?

    Врач может взять образец стула, чтобы найти бактерий E. coli . Анализы крови могут использоваться для проверки возможных осложнений.

    Антибиотики бесполезны и даже могут нанести вред. Точно так же противодиарейные лекарства могут увеличить риск осложнений, и их не следует использовать.

    Дети с инфекцией E. coli должны как можно больше отдыхать и пить много жидкости, чтобы избежать обезвоживания.Тем, кто стал обезвоженным, может потребоваться госпитализация для внутривенного введения жидкостей, а тем, у кого ГУС, может потребоваться диализ из-за почечной недостаточности и / или переливание крови.

    Выздоравливая после инфекции, дети могут вернуться к своей обычной деятельности после того, как две культуры стула будут свободны от бактерий. Не позволяйте детям пользоваться бассейнами или водными горками в течение 2 недель после того, как все симптомы исчезнут.

    Можно ли предотвратить заражение

    E. Coli ?

    Вспышки E. coli были связаны с широким спектром пищевых продуктов, такими как свежий шпинат, гамбургеры, говяжий фарш, болонский орех, фундук, фасованные сыры, тертый салат и фасованное тесто для печенья.

    Безопасное приготовление пищи может иметь большое значение для защиты вашей семьи от инфекций E. coli :

    • Хорошо готовьте мясо, пока оно не достигнет температуры не менее 160 ° F / 70 ° C в самом толстом месте.
    • Тщательно очистите все, что соприкасается с сырым мясом.
    • Выбирайте пастеризованные соки и молочные продукты.
    • Очищайте сырые продукты перед употреблением в пищу.

    Научите своих детей важности регулярного и тщательного мытья рук, особенно после посещения туалета, прикосновения к животным или игры на улице, а также перед едой или приготовлением пищи.Им следует избегать глотания воды во время плавания.

    Когда мне позвонить врачу?

    Позвоните своему врачу, если у вашего ребенка есть какие-либо симптомы инфекции E. coli , особенно боль в животе или длительная, тяжелая или кровавая диарея.

    Немедленно позвоните, если у вашего ребенка появляются признаки обезвоживания, например, меньше обычного мочеиспускания, или гемолитико-уремического синдрома, особенно если у вашего ребенка недавно было желудочно-кишечное заболевание.

    Что такое E.Коли-инфекция? Симптомы, причины, диагностика, лечение и профилактика

    Согласно прошлым исследованиям, дети младшего возраста, пожилые люди и люди с ослабленной иммунной системой с большей вероятностью испытают тяжелые симптомы STEC или заболеют ГУС.

    Осложнения, вызванные HUS При HUS токсины E. coli разрушают эритроциты в процессе, называемом гемолизом. Поврежденные эритроциты образуют сгустки и могут закупорить фильтрующую систему почек, что может привести к опасной для жизни почечной недостаточности.От HUS страдают примерно от 5 до 10 процентов людей с STEC. Как правило, ГУС развивается примерно через семь дней после появления первых симптомов инфекции E. coli и после того, как диарея начинает стихать.

    Дополнительные симптомы включают:
    • Уменьшение частоты мочеиспускания
    • Сильная усталость
    • Потеря цвета щек
    • Маленькие, необъяснимые синяки
    • Отек лица, рук, ног или тела, согласно данным Mayo Clinic

    • Потеря цвета внутри нижних век

    Лица с серьезным диагнозом E.coli (имеется в виду диарея, продолжающаяся более трех дней, с высокой температурой, кровавым стулом или сильной рвотой) или инфекция, которая переросла в HUS, следует госпитализировать и оказывать поддерживающую терапию, например внутривенное введение жидкостей, переливание крови или диализ почек.

    Большинство людей, у которых развивается ГУС, выздоравливают в течение нескольких недель, но некоторые страдают необратимым повреждением почек или даже смертью.

    E. Coli и дети В то время как люди любого возраста могут быть инфицированы E.coli, у детей в возрасте до 5 лет вероятность развития тяжелых симптомов, включая ГУС, выше, чем у других.

    Как и у взрослых, инфекции E. coli у детей обычно проявляются в виде пищевого отравления и ИМП, хотя есть и другие проблемы, связанные с E. coli , которые вызывают особую озабоченность у детей:
    • Менингит у новорожденных An Инфекция E. coli является одной из наиболее частых причин бактериального менингита новорожденных, инфекции оболочек, окружающих головной и спинной мозг младенца.Он обнаруживается в 30 процентах всех случаев инфицирования с ранним началом. Матери передают E. coli своим детям во время схваток и родов, согласно статье, опубликованной в марте 2015 года в клиниках перинатологии .
      Энтерококки в кале повышены у взрослого: Анализ кала на дисбактериоз

    Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *