Содержание

Пробиотики Нормофлорины – лечение дисбактериоза

Назад к списку

30.05.2012

    1. Характеристика
    2. Заболевания
    3. Симптомы
    4. Лечение

Энтеробактерии. Характеристика.

Энтеробактерии (лат. enterobacteriaceae) — семейство грамотрицательных (как и другие протеобактерии) палочкообразные (бациллы), споронеобразующие бактерии, длиной 1-5 мкм, со жгутиками для передвижения. Эти бактерии — факультативные анаэробы, расщепляют углеводы с образованием муравьиной кислоты и других конечных продуктов формиатного брожения. Некоторые из них могут разлагать лактозу.

Множество представителей семейства являются частью микрофлоры кишечника человека и животных

. Они представляют большое число нормальной микрофлоры человеческого организма и значительное количество патогенных микробов: сальмонелла, кишечная палочка, чумная палочка и др. Энтеробактерии определяют в различных отделах желудочно-кишечного тракта здорового человека: в тощей кишке – от 0 до 103 КОЕ/мл, в подвздошной — от 102 до 106 КОЕ/мл. В норме в составе факультативной микрофлоры кишечника они не должны превышать количество 104 КОЕ/г.

Другая часть этих бактерий обнаруживается в воде и почве или паразитирует на различных растениях и животных. Хорошо изучена кишечная палочка — модельный организм, используемый в молекулярной биологии  и генетике, в связи с  изученностью её генетики и биохимии.

Энтеробактерии в воде и почве месяцами остаются жизнеспособными, но за несколько минут гибнут от дезинфектантов и при очень высоких температурах через 1 час.

Эти бактерии вырабатывают сахаролитические, протеолитические и др. ферменты, определение которых имеет таксонометрическое значение. Образуют индол, а глюкозу, лактозу, маннит ферментируют до  кислоты и газа.

Факторами патогенности являются:

  • эндотоксин, который освобождается после разрушения микробных клеток и адгезины,
  • цитотоксин,
  • экзотоксин.

Бактерии могут проникать в макрофаги и размножаться в них. Патологический процесс усугубляется на фоне  снижения активности фагоцитоза, падения барьерной функции тканей. Снижение в кишечнике полезной нормофлоры и нарушение колонизационной и защитной функции может приводить к проникновению в лимфу и кровь. Коли-бактериозы возникают при снижении количества полезной микрофлоры кишечника и иммунитета. После перенесённого заболевания невосприимчивость не формируется.

Какие заболевания вызывают энтеробактерии?

энтреробактерии e.coli

Группа энтеробактерий включающая: сальмонеллы, шигеллы, эшерихии, клебсиеллы, собственно энтеробактер, серрации, протей, морганеллы, провиденции и иерсинии в норме обитают в желудочно-кишечном тракте человека, но при снижении защитных свойств слизистой кишечника, могут вызывать инфекции желудочно-кишечного тракта или других органов.

Энтеробактерии — представители родов citrobacier, ewardsiella, enterobacter, escherichia, hafnia, klebsiella, proteus, providencia, salmonella, serratia, yersinia вызывают инфекции мочеполовой системы (в том числе циститы, пиелонефриты, цервициты и т.п.). До 80% бактерий, обнаруживаемых в моче — энтеробактерии.

Энтеробактерии

становятся причиной различных заболеваний человека. Условно – патогенные бактерии вызывают гнойно-воспалительные процессы различной локализации: как эндогенные процессы — развиваются инфекции мочевыводящих путей (уретрит, цистит, пиелонефрит), половой системы (вагинит, трихомиоз, цервицит), дыхательных путей (пневмония), желудочно-кишечного тракта (холециститы, сальмонеллез, дизентерия, чума) и другие, так называемые коли-бактериозы, а как экзогенные – нагноение ран. Разные формы ОКЗ – острых кишечных заболеваний обусловлены патогенным действием различных энтеробактерий и чем агрессивнее токсины бактерий, тем тяжелее состояние, особенно у маленьких детей.

Escherichia coli – кишечная палочка в норме определяется в желудочно-кишечном тракте и синтезирует секреторные иммуноглобулины и колицины. Они тормозят рост некоторых патогенных энтеробактерий и препятствуют проникновению их в слизистую оболочку стенки кишечника. E. сoli

участвует синтезе витамина К (свертываемость). Некоторые патогенные штаммы кишечной палочки могут поражать слизистую кишечника, что проявляется кровавым водянистым поносом или диареей путешественников.

У детей диарея, вызываемая патогенной энтерогеморрагической кишечной палочкой, может осложняться гемолитико-уремическим синдромом и почечной недостаточностью. Эта бактерия может поражать кровь, желчный пузырь, легкие, мочевыводящие пути и кожу. У новорожденных детей, особенно недоношенных, кишечная палочка может стать патогенным возбудителем бактериемии и менингита.

Инфекции, обусловленные клебсиеллами (Klebsiella), энтеробактериями (Enterobacteriaceae) и серрациями (Serratia), обычно встречаются в больницах, чаще при снижении способности бороться против инфекций.

Эти бактерии также часто поражают мочевыводящие, половые органы. Пневмония, вызванная клебсиеллами, наиболее распространена у больных сахарным диабетом и у злоупотребляющих алкоголем и  имеет часто тяжелое течение.

Симптоматика инфекций, вызываемых энтеробактериями.

Симптомы инфекционного заболевания могут быть различны, в зависимости от места развития воспалительного процесса, однако все больные жалуются на общую слабость, повышение температуры, проявления интоксикации и боли в месте заболевшего органа. Для определения патогенных энтеробактерий обязательно нужно сдать анализы –   кровь, мочу, мокроту, мазки или кал, в зависимости от локализации воспалительного процесса, пройти до обследование, для выявления функциональных нарушений.

Важно соблюдать правила личной гигиены, следить за качеством, чистотой овощей-фруктов, питаться, учитывая индивидуальные особенности, избегать контакта с инфекционными больными и поддерживать свой иммунитет в норме.

Как быстро восстановиться после инфекции?

Восстановление и сохранение достаточного количества полезной нормофлоры кишечника – лакто- и бифидобактерий, способствует защите слизистой кишечника от проникновения патогенных бактерий и их токсинов в кровь и лимфу, выведению токсинов, созданию среды, в которой патогенные микроорганизмы не могут продолжать свою жизнедеятельность и выводятся из организма человека. Важно, что продукты жизнедеятельности полезных бактерий помогают иммунитету сохранять активность в борьбе с вредными бактериями.

Синбиотический биокомплекс Нормофлорины – содержащий живые активные лакто- и бифидобактерии и их метаболиты с противовоспалительным, антисептическим, иммуногенным и питательным действием на слизистые  за многие годы зарекомендовал себя, как активный  помощник и борец против патогенных бактерий для малышей и взрослых, беременных и больных с различными заболеваниями

. Достаточно быстро при употреблении Нормофлоринов снимается интоксикация и восстанавливается функция кишечника, общее самочувствие.

Рекомендуется: как можно раньше начать принимать Нормофлорины в возрастных дозировках – Л – за 10-15 мин до еды утром (+ обед при запорах), Д – обед или вечер за 20 мин до еды, Б – на ночь или в микроклизме. Длительность приема 3-4 недели, до полного восстановления функции кишечника и улучшения общего самочувствия. Желательно 10-14 дней натощак принимать сорбенты – для выведения токсинов – зостерин или пекто, они уменьшают гнилостные, бродильные процессы, повышенное газообразование, улучшают работу кишечника.

Важно закрепить эффект восстановления микрофлоры, улучшить работу поджелудочной железы, печени, кишечника, иммунитет – для этого хорошо далее в течение месяца использовать функциональное питание – Гармония жизни. В её составе также содержатся живые полезные лакто- и бифидобактерии, их метаболиты и пектин. Вкусно, полезно и эффективно!

Назад к списку

Дисбактериоз


Общее понятие о дисбактериозе

 


Дисбактериоз — это нарушение состава и свойств микрофлоры. Возникнуть он может где угодно: и в носоглотке, и в кишечнике, и во влагалище. Но дисбактериоз кишечника диагностируется намного чаще, чем все другие варианты дисбактериоза вместе взятые. Неудивительно, что часто употребляя слово «дисбактериоз», и врачи, и больные почти всегда подразумевают именно дисбактериоз кишечника.
В кишечнике обитают различные полезные бактерии, обеспечивающие нормальную работу нашего организма: молочнокислые бактерии, кишечная палочка, различные виды кокков и многие другие. Постоянство состава этой микрофлоры очень важно для поддержания хорошего здоровья. С ее помощью осуществляется защитная функция в случае попадания микробов, которые содержатся в недоброкачественной пище, грязных овощах и фруктах; иммунная, которая стимулирует выработку антител, повышая иммунитет человека; синтез незаменимых для человека витаминов (например, витамина К, который играет важную роль в системе свертывания крови). 

Однако, когда вследствие различных причин, о которых далее пойдет речь, происходят нарушения микрофлоры кишечника, развивается «дисбактериоз».

Причины возникновения дисбактериоза


Наиболее частой причиной дисбактериоза является лечение антибактериальными препаратами (антибиотики, сульфаниламиды и т.д.). Ведь совершенно очевиден тот факт, что практически невозможно убить «плохие» микробы, оставив при этом в неприкосновенности «хорошие». Однако не только антибиотики бывают «виновниками» дисбактериоза. По большому счету, любые препараты и любые способы терапии, подавляющие иммунитет, способствуют развитию дисбактериоза (кортикостероидные гормоны, лучевая терапия, использование средств, подавляющих рост опухолей и т.п.).

Еще одна причина дисбактериоза — нарушения питания. Это и однообразная пища, и различные злоупотребления (жирным, сладким), и тяга населения к экспериментам над собой (голодание, уринотерапия, кефирная диета, яблочные дни, банановые недели).
Обусловливают возникновение дисбактериоза и такие заболевания, как гастриты, дуодениты, язвы, панкреатиты, колиты. Вполне естественно также, что к дисбактериозу может привести любое оперативное вмешательство на органах системы пищеварения.
Инфекционные болезни и наличие паразитов тоже относятся к числу причинных факторов появления дисбактериоза кишечника.
У детей первого года жизни дисбактериоз может быть следствием необоснованно раннего введения прикорма.

Проявления дисбактериоза


К основным проявлениям дисбактериоза относятся следующие:
синдром желудочно-кишечной диспепсии: нарушения со стулом, как правило, диарея, но могут быть и запоры. Больные также жалуются на урчание в животе, вздутие, неприятный вкус во рту, отрыжку, тошноту, изжогу.
Болевой синдром: боли в животе различного характера.
Аллергический синдром. Проявляется практически у всех больных дисбактериозом. Выражается, как правило, в том, что человек не может переносить какие-то продукты. Вскоре после употребления в пищу таких продуктов у больных появляется тошнота, жидкий стул, вздутие, аллергические реакции: крапивница, кожный зуд, отек.
Синдром нарушенного кишечного всасывания. Характеризуется, во-первых, упорной диареей, а во-вторых, признаками, очевидными для конкретных нарушений. И если процессы нарушения всасывания длятся долго, то четко обозначаются общие признаки нездоровья человека: падает иммунитет, на фоне чего начинается частые заболевания носоглотки, бронхов, легких, кожи, суставов.
От синдрома нарушенного кишечного всасывания в прямой зависимости находится другой — синдромокомплекс витаминной недостаточности.
Аноректальный синдром. Чаще всего развивается у людей при длительном лечении антибиотиками. Ему предшествует общее плохое самочувствие: слабость, головная боль, отсутствие аппетита. Затем может подняться температура, начинается понос и тупая боль в аноректальной области.

Какую опасность таит «простой» дисбактериоз?

При дисбактериозе «расцветает» патогенная микрофлора, плохо (или полностью) не усваиваются необходимые организму питательные вещества и микроэлементы. В кишечнике накапливается огромное количество токсических веществ, которые, всасываясь в кровь, поражают все органы и ткани. Снижается эффективный синтез витамина Д в организме, противовирусная и противоопухолевая защита, нарушается местный иммунитет.  
Вследствие этого «простейший» дисбактериоз кишечника может явиться первопричиной поражения органов и тканей и вызывать многие заболевания, например, панкреатит, сахар 1000 ный диабет, жировой гепатоз, цирроз, желчекаменную болезнь.
Дисбактериоз кишечника может также привести к экземе, псориазу, атопическому дерматиту, бронхиальной астме, пищевой и поливалентной аллергии, иммунодефициту, изменению состава крови, заболеваниям щитовидной железы, центральной нервной системы и даже психическим заболеваниям!

Диагностика и лечение

Наиболее распространенный метод диагностики — бактериологический посев кала на дисбактериоз. С его помощью удается оценить довольно широкий спектр условно-патогенных микроорганизмов, выявить дефицит бифидо- и лактобактерий. Проводят также копрологическое исследование (копрограмму) – биологическое исследование кишечного содержимого.

Как расшифровать бланк анализа на дисбактериоз?

Бифидобактерии.
Основные представители нормальной кишечной микрофлоры, количество которых в кишечнике должно быть 95 – 99%. Существенное снижение количества бифидобактерий – всегда признак выраженного дисбактериоза.

Кишечная палочка с нормальной ферментативной активностью (эшерихии).
Количество кишечной палочки среди других бактерий не превышает 1%, но роль ее очень важна, поскольку этот микроб: во-первых, является главным конкурентом условно-патогенной флоры, препятствуя заселению чужеродными микробами кишечной стенки; во-вторых, кишечная палочка забирает из просвета кишечника кислород, который является ядом для бифидобактерий и лактобактерий, таким образом, создаются комфортные условия для основных бактерий кишечной флоры.
Снижение общего количества кишечной палочки может быть признаком присутствия в кишечнике небактериальных паразитов (глистов, простейших, которые также нуждаются в кислороде, обделяя им кишечную палочку).

Гемолизирующая кишечная палочка.
В норме должна отсутствовать. Она может вызывать аллергические и кишечные проблемы, очень распространена в окружающей среде (правда, практически никогда не встречается в грудном молоке), вызывает проблемы у ослабленных детей, требует иммунокоррекции. Следует отметить, что термин «гемолизирующая» не означает, что имеется какое-то влияние на кровь. Условно-патогенная флора при дисбактериозе не должна преодолевать кишечную стенку и попадать в кровь. Это возможно только при крайне выраженных формах дисбактериоза у детей с выраженными иммунодефицитами, как правило, представляющих угрозу для жизни. К счастью, такие состояния встречаются нечасто.

Кокковые формы в общей сумме микробов.
Самыми безобидными представителями условно-патогенной флоры являются энтерококки. Они наиболее часто встречаются в кишечнике у здоровых людей, их количество до 25% не представляет угрозы здоровью. Если количество превышает 25%, это чаще всего связано со снижением нормальной флоры. В редких случаях повышение количества энтерококков является главной причиной дисфункции, связанной с дисбактериозом.

Золотистый стафилококк (S. aureus).
Один из самых неприятных (наряду с гемолизирующей кишечной палочкой, протеем и клебсиеллой) представителей условно-патогенной флоры. Даже небольшие его количества могут вызвать выраженные клинические проявления, особенно у детей первых месяцев жизни. Поэтому обычно в нормах, приведенных в бланке анализа, указывается, что его быть не должно.
Патогенность золотистого стафилококка напрямую зависит от состояния нормальной флоры: чем больше бифидобактерий, лактобактерий и нормальной кишечной палочки, тем меньше вреда от стафилококка. Присутствие его в кишечнике может приводить к аллергическим реакциям, гнойничковым кожным высыпаниям, дисфункции кишечника. Стафилококки являются распространенными микробами окружающей среды, в частности, они в больших количествах живут на коже и слизистых оболочках верхних дыхательных путей. Ребенку они могут попадать через грудное молоко. Наиболее подвержены заражению стафилококками ослабленные дети (проблемная беременность, недоношенность, кесарево сечение, искусственное вскармливание, применение антибиотиков – факторы риска ослабления функций иммунной системы).

Лактозонегативные энтеробактерии.
Большая группа условно-патогенных бактерий большей или меньшей степени патогенности. Их количество не должно превышать 5%. Наиболее неприятными бактериями из этой группы являются протеи (чаще всего с ними связаны запоры) и клебсиеллы (являются прямыми антагонистами (конкурентами) лактобактерий, что приводит к развитию аллергии и запоров, а также к проявлениям лактазной недостаточности). Часто в бланке анализа указывается общее количество лактозонегативных энтеробактерий.

Грибы рода Candida.
Допустимо присутствие до 104. Повышение этого параметра может быть после применения антибиотиков. Если количество грибов повышено, а количество нормальной кишечной флоры резко снижено, при этом отмечается кандидоз (молочница) видимых слизистых оболочек (ротовая полость, половые органы) – это проявления системного кандидоза, то есть имеется инфицирование грибами кишечника.

Лечение дисбактериоза – дело непростое, требует от врача достаточной квалификации, а от пациента – терпения. В качестве компонентов терапии используется определенная диета и фармакологические средства.
Выбор диеты и лекарств обусловлен конкретным вариантом болезни, который уточняется причиной, жалобами и симптомами, анализами. Основной, но далеко не единственный способ лечения — выяснить, каких бактерий не хватает и восполнить недостачу с помощью так называемых эубиотиков — лекарственных средств, представляющих собой высушенные и специальным образом обработанные кишечные микробы. Попадая в кишечник, эти микробы оживают и начинают выполнять свою работу.
Применяют также ферменты (фестал, мезим, энзистал, панзинорм и т.д.), витамины. Особенностью некоторых вариантов дисбактериоза является не снижение общего количества микроорганизмов, а значительное преобладание какого-нибудь одного микроба, например, стафилококка. В такой ситуации приходится использовать антибиотики, подавляющие именно стафилококк.
Лечение дисбактериоза не представляет особых проблем только тогда, когда, во-первых, устраняется первопричина болезни и, во-вторых, давность заболевания не очень велика (не более полугода). Но, в любом случае, излечить дисбактериоз быстро невозможно.

 

Страница не найдена |

Страница не найдена |

404. Страница не найдена

Архив за месяц

ПнВтСрЧтПтСбВс

14151617181920

21222324252627

28      

       

       

       

     12

       

     12

       

      1

3031     

     12

       

15161718192021

       

25262728293031

       

    123

45678910

       

     12

17181920212223

31      

2728293031  

       

      1

       

   1234

567891011

       

     12

       

891011121314

       

11121314151617

       

28293031   

       

   1234

       

     12

       

  12345

6789101112

       

567891011

12131415161718

19202122232425

       

3456789

17181920212223

24252627282930

       

  12345

13141516171819

20212223242526

2728293031  

       

15161718192021

22232425262728

2930     

       

Архивы

Мар

Апр

Май

Июн

Июл

Авг

Сен

Окт

Ноя

Дек

Метки

Настройки
для слабовидящих

Микробиом человека: возрастные изменения и функции

Введение

Согласно современным представлениям, «микробиом» включает в себя единый микробно-тканевый комплекс, который образуют микроколонии бактерий, грибы, вирусы, простейшие и продуцируемые ими метаболиты, а также слизь (муцин), эпителиальные клетки слизистой оболочки и их гликокаликс, клетки стромы слизистой оболочки (фибробласты, лейкоциты, нейроэндокринные клетки, клетки микроциркуляторного русла и прочее) [1].

До последнего времени изучение состава и функциональной активности микробиоты человека было крайне ограничено в связи с невозможностью культивирования подавляющего большинства микроорганизмов на питательных средах. Однако развитие таких технологий, как секвенирование 16S рибосомальной РНК, а также полногеномное секвенирование позволило (в рамках двух проектов по изучению микробиома человека Human Microbiome Project и Metagenomics of Human Intestinal Tract) получить колоссальную по своим масштабам и значению информацию о составе и метаболической активности микробиоты.

На сегодняшний день считается, что соотношение микробных клеток к клеткам человека составляет 1:1, а суммарное количество клеток в составе микробиоты человека равно 1013—1014. Эти данные основаны на оценке общего количества бактериальных клеток в толстой кишке (примерно 1013), в которой, как известно, наблюдается наивысшая плотность бактериальной колонизации [2—4].

В различных отделах пищеварительного тракта состав и численность микробиоты значительно различаются (рис. 1). Наиболее скудным является микробное сообщество желудка, в котором обнаруживают представителей родов Lactobacillus, Stomatococcus, Sarcina в количестве до 102 в 1 г содержимого. В тонкой кишке, за исключением дистальных отделов подвздошной кишки, количество микроорганизмов не превышает 104—105 клеток на 1 г. Численность микроорганизмов в дистальных отделах подвздошной кишки значительно возрастает, достигая 107—108 на 1 г. При этом в проксимальных отделах тонкой кишки обнаруживаются преимущественно грамположительные аэробные бактерии, в дистальных — грамотрицательные энтеробактерии и анаэробы. Микробиота толстой кишки представлена в основном анаэробными бактериями — их общее количество достигает огромных значений — 1013 на 1 г содержимого [1—4].

Рис. 1. Численность и основные представители микробиоты различных отделов пищеварительного тракта человека [2].

Бактерии, входящие в состав микробиоты желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) человека, условно можно разделить на представителей облигатной (около 90%), факультативной (около 10%) и транзиторной (менее 1%) микрофлоры.

К облигатной микрофлоре, постоянно присутствующей в организме человека, выполняющей важную роль в его метаболизме и защите его от возбудителей инфекционных заболеваний, относятся преимущественно анаэробные бактерии, обитающие в толстой кишке (Bifidobacterium, Propionibacterium, Bacteroides). Видовое разнообразие облигатной флоры невелико, крайне консервативно, однако численность (по сравнению с другими представителями) максимальна.

К факультативной (сопутствующей) микрофлоре относятся условно-патогенные бактерии, доля которых в норме не превышает 10% (Escherichia, Enterococcus, Fusobacterium, Peptostreptococcus, Clostridium, Eubacterium и др. ). Количественный и качественный состав факультативной флоры подвержен значительным изменениям в зависимости от внешних факторов.

Транзиторная флора составляет менее 1%, представлена стафилококками, клостридиями, протеями, дрожжеподобными грибами и др., в основном состоит из микроорганизмов, занесенных извне и транзитом проходящих ЖКТ. Некоторые представители транзиторной флоры могут обладать высоким адгезивным или токсигенным потенциалом, приводя (при ослаблении защитных функций облигатной микрофлоры) к развитию кишечных инфекций [1, 4].

Представители облигатной микробиоты образуют микроколонии, так называемую пристеночную флору, функционирующую в тесной взаимосвязи с кишечной стенкой. Облигатные анаэробы (бифидобактерии, бактероиды, пропионовокислые бактерии и др.) занимают нишу в непосредственном контакте с эпителием, далее располагаются аэротолерантные анаэробы (лактобациллы и др.), еще выше — факультативные анаэробы, а затем — аэробы [1].

Следует отметить, что бактерии, обитающие в просвете кишки (около 5% от микробной популяции) и являющиеся основными представителями фекальной микрофлоры, не взаимодействуют со слизистой оболочкой. Субстратом для жизнедеятельности полостной микрофлоры являются неперевариваемые пищевые волокна, на которых она и фиксируется. Состав полостной флоры крайне непостоянен, зависит от поступления пищевых веществ и множества других факторов. Полостная флора доминирует в фекальной микрофлоре, что заставляет с особой осторожностью оценивать изменения в различных микробных популяциях, выявляемых при бактериологическом исследовании кала [1].

Крайне важным вопросом при изучении микробиома человека является геном микроорганизмов (в связи с их огромным разнообразием и принадлежностью к разным родам, видам и прочее), который содержит, по меньшей мере, в 50—100 (а по некоторым оценкам в 200) раз больше генов по сравнению с геномом организма-хозяина. Генетическое разнообразие, которое привносит в организм человека микробиота, обусловливает возникновение дополнительных (не закодированных в организме хозяина) ферментативных путей метаболизма, влияя на функционирование организма, процессы адаптации, реактивность [4—6].

Микробиом не только дополняет человеческий генный пул, но и демонстрирует значительно бóльшие пластичность и изменчивость по сравнению с человеческим геномом. Это означает, что состав микробиоты может быстро изменяться, реагируя на иммунную агрессию организма-хозяина, инфекции, новые компоненты пищевого рациона, прием антибиотиков, многие другие факторы. Способность микробиоты быстро приспосабливаться к изменяющимся условиям внешней среды путем изменения своего состава и ферментативной активности в свою очередь обеспечивает лучшую адаптацию человеческого организма к неблагоприятным факторам [6].

Сложно переоценить роль микробиоты в развитии и функционировании иммунной системы организма-хозяина. Существует точка зрения, известная как «гигиеническая теория». Данная теория гласит, что быстрый рост аллергических и аутоиммунных заболеваний, наблюдаемый в последние десятилетия в экономически развитых странах, можно объяснить нарушением формирования микробного разнообразия у современных детей как следствие улучшения гигиенических условий, чрезмерного использования дезинфектантов, моющих средств, антибиотиков. Ограничение контакта с микроорганизмами в ранние периоды развития кишечника ребенка приводит впоследствии к неспособности организма поддерживать необходимый уровень иммунологической толерантности и развитию аллергических и аутоиммунных заболеваний [4, 7—9].

Несмотря на многообразие микроорганизмов, обитающих в просвете ЖКТ человека, известно, что более 90% кишечных бактерий у здоровых лиц представлены двумя основными типами (phyla) — Firmicutes и Bacteroidetes. Типы Actinobacteria и Proteobacteria представлены в меньшей мере (рис. 2).

Рис. 2. Преобладающие типы бактерий различных локусов организма [21].

К типу Bacteroidetes относятся грамотрицательные бактерии, принадлежащие почти к 20 родам, к типу Firmicutes — грамположительные бактерии, принадлежащие более чем к 200 родам. Подавляющее большинство лиц в человеческой популяции имеют схожие пропорции каждого из этих типов [6]. Однако на видовом и особенно штаммовом уровне микробиота каждого человека индивидуальна [4, 10, 11].

Следует отметить, что по сей день не существует понятия «нормальной» микробиоты, поскольку состав ее индивидуален, вариабелен и зависит от возраста, пола, расы, места обитания, характера питания и многих других факторов [12].

Энтеротипы

В зависимости от доминирующего рода бактерий в составе микробиоты предложено условное выделение 3 основных ее типов — «энтеротипов». Впервые термин «энтеротип» появился в публикации журнала «Nature» в 2011 г., получив с тех пор широкое распространение [13].

Энтеротипы отличаются не только составом, но и главными метаболическими путями извлечения энергии из пищевых субстратов. Так, энтеротип 1 (тип с преобладанием бактерий рода Bacteroides) характеризуется высокой сахаролитической активностью, энтеротип 2 (тип с преобладанием бактерий рода Prevotella) — способностью расщеплять гликопротеины слизи, энтеротип 3 (тип с преобладанием бактерий рода Ruminococcus) — расщеплением гликопротеинов и трансмембранным транспортом углеводов.

Основным из ключевых положений концепции об энтеротипах является устойчивость и постоянство микробного состава энтеротипа. Если состав микробиоты и подвержен изменениям в ответ на внешние факторы (прием антибиотиков, изменения пищевого рациона), то происходит это на уровне видового и штаммового разнообразия, но не приводит к смене доминирующего рода бактерий в составе энтеротипа. Считалось, что энтеротипы не имеют континентальной или национальной специфичности, изначально определяясь путем родоразрешения, методом вскармливания в грудничковый период и рационом питания в семье. Преобладающий род бактерий в составе микробиома толстой кишки наделялся способностью определять характер метаболизма пищевых и лекарственных веществ и даже склонность к некоторым заболеваниям [13]. Большое количество экспериментальных и клинических исследований посвящено поиску ассоциаций между различными заболеваниями и энтеротипами. Так, например, обнаружено, что ожирение чаще наблюдается у лиц с преобладанием бактерий типа Firmicutes (энтеротип 3).

Тем не менее в настоящее время накапливается все больше данных, ставящих под сомнение концепцию энтеротипов. Считается, что столь категоричное разделение микробиоты человека на 3 энтеротипа слишком условно, тогда как в большинстве случаев имеет место некий промежуточный вариант, изменяющийся в зависимости от внешних факторов, прежде всего от характера питания, между типами с преобладанием бактерий рода Bacteroides и Prevotella [14—21].

Более того, вопреки предыдущим представлениям о значительной устойчивости энтеротипов, в некоторых экспериментальных работах наглядно показана возможность изменения энтеротипа в течение нескольких дней с дальнейшим сохранением «нового» доминирующего рода бактерий. Так, в работе D. Knights и соавт. под названием «Переосмысливая концепцию энтеротипов» (Rethinking «enterotypes») показана возможность быстрой смены энтеротипа Ruminococcus на энтеротип с преобладанием Bacteroides, а также энтеротипа Bacteroides на энтеротип Prevotella [17]. В целом у большинства наблюдаемых субъектов с течением времени (5—10 лет) зафиксирована смена энтеротипа, что поставило под сомнение идею об устойчивости и постоянстве энтеротипов, а значит и целесообразность подобной классификации [14, 17].

В связи с этим возник закономерный вопрос о правомочности рассмотрения тех или иных энтеротипов как маркеров, ассоциированных с развитием определенных заболеваний. Требуются дальнейшие исследования для ответа на указанные вопросы, однако уже сейчас очевидно, что взаимодействия между бактериальными родами в составе микробиоты кишечника значительно сложнее, чем представлялось ранее.

Микробиота здорового человека и ее развитие в течение жизни

Становление микробиоты человека начинается еще в период внутриутробного развития в полости матки. Бактерии обнаруживаются в околоплодной жидкости, пупочном канатике, оболочках плода, плаценте и меконии. Видовой состав этих бактерий в большей степени соответствует микробиоте кишечника и ротовой полости матери (например, Fusobacterium spp. и Bacteroides spp.). Предполагается, что бактерии из полости рта через микроповреждения слизистой оболочки могут попадать в системный кровоток, гематогенным путем достигать плаценты и колонизировать ее [22].

Существуют работы, показывающие ассоциацию между заболеваниями периодонта у матери и повышением риска преждевременных родов и внутриутробных инфекций плода [22, 23]. Таким образом, микробиом матери может быть как источником первых бактерий, колонизирующих ЖКТ плода, так и причиной патологических состояний. В ходе ряда исследований выявлены следующие перинатальные факторы, оказывающие негативное влияние на микробиоту новорожденного и/или плаценты: чрезмерный набор массы тела и избыточное содержание жира в рационе матери во время беременности, инфекционные заболевания, стрессы, сахарный диабет [22, 23].

Активное заселение пищеварительного тракта микробами начинается в процессе родов, и происходит это за счет бактерий, входящих в состав микробиоты влагалища, кожи, кишечника, ротовой полости матери (Lactobacillus, Prevotella, Sneathia). Способ родоразрешения в значительной мере определяет видовой состав микробиоты младенцев. У детей, рожденных посредством кесарева сечения, заселение кишечника бактериями рода Bacteroides и Bifidobacterium запаздывает, по меньшей мере, на 1 мес по сравнению с детьми, рожденными естественным путем (рис. 3). В составе микробиоты таких детей доминируют виды, колонизирующие кожные покровы, а не родовые пути матери, такие как Staphylococcus, Corynebacterium и Propionibacterium, наблюдается активное размножение бактерий вида Clostridium difficile. Для микробиоты детей, родившихся посредством кесарева сечения, характерно снижение микробного разнообразия, у них повышен риск развития аллергических и аутоиммунных заболеваний, таких как бронхиальная астма, аллергический ринит, целиакия и прочее [22, 23].

Рис. 3. Факторы, влияющие на состав микробиоты ЖКТ в течение жизни [23].

Большое значение для состава микробиоты кишечника имеет также срок родоразрешения. У недоношенных детей наблюдается снижение разнообразия кишечной микробиоты, низкое содержание лакто- и бифидобактерий (Lactobacillus spp., Bacteroides spp. и Bifidobacterium spp). Считается, что это может быть связано не столько с недоношенностью, сколько с применением антибиотиков, пребыванием в палатах интенсивной терапии и другими ятрогенными факторами. Нарушение состава кишечной микробиоты у недоношенных детей ассоциировано с развитием некротизирующего энтероколита, тяжелых воспалительных процессов в ЖКТ [22, 23].

Роль питания в раннем детском возрасте в формировании микробиоты толстой кишки

В 1-й год жизни микробиота младенцев характеризуется относительно невысоким микробным разнообразием. Постепенно, в зависимости от метода вскармливания и обширности контакта с окружающей средой (наличие животных в доме, число братьев и сестер, гигиенические условия, применение антибиотиков), таксономическое разнообразие микробиоты толстой кишки значительно обогащается (см. рис. 3) [22, 23]. Большое значение в становлении микробиоты кишечника ребенка имеет метод вскармливания (грудное вскармливание или искусственные смеси). Грудное молоко не стерильно, оно содержит до 600 видов различных бактерий, численность бактерий в 1 мл молока достигает 103—104. Большую часть бактерий грудного молока составляют бактерии родов Lactobacillus, Leuconostoc, Streptococcus, Enterococcus, Lactococcus, Weissella, Bifidobacterium. Кроме того, в грудном молоке могут присутствовать грамотрицательные бактерии Serratia, Pseudomonas, а также типичные представители микробиома полости рта Veillonella, Leptotrichia, Prevotella [24—30].

Одним из компонентов грудного молока являются олигосахариды (галактоолигосахариды). Незначительно расщепляясь в тонкой кишке, они достигают толстой кишки преимущественно в непереваренном виде, где ферментируются Bifidobacterium с образованием короткоцепочечных жирных кислот (КЦЖК) и молочной кислоты. Таким образом, присутствие в молоке олигосахаридов обусловливает размножение в кишечнике детей, находящихся на грудном вскармливании, грамположительных бактерий типа Actinobacteria (преимущественно бифидобактерий), сдерживающих размножение бактерий других типов [20, 22, 23, 31, 32].

Большинство современных молочных смесей обогащено олигосахаридами, что теоретически должно способствовать развитию бактерий рода Bifidobacterium. Однако у детей, находящихся на искусственном вскармливании, обнаруживаются такие изменения состава микробиоты толстой кишки, как чрезмерное развитие представителей Bacteroides и Clostridium, увеличение доли условно-патогенных видов бактерий, например Escherichia coli, Clostridium difficile [33—36]. Вероятно, влияние грудного молока на становление микробиоты толстой кишки младенца обусловлено не только олигосахаридами. Помимо них, грудное молоко содержит иммуноглобулины IgA и IgG, антимикробные вещества — лизоцим и лактоферрин, интерлейкин (ИЛ) ИЛ-10, лимфоциты, фактор роста опухоли TGF-β, модулирующие работу иммунной системы ребенка и влияющие на состав микроорганизмов, которые смогут прижиться в его ЖКТ [29, 37—39]. Известно, что добавление к рациону искусственно вскармливаемых детей пастеризованного человеческого молока способствует становлению микробиоты, близкой по составу к таковой у детей, находящихся на грудном вскармливании [36].

После введения прикорма в рацион ребенка происходит значительное изменение микробного сообщества толстой кишки, характеризующееся снижением доли Bifidobacterium наряду с активизацией размножения бактерий, ферментирующих полисахариды (типов Bacteroidetes или Firmicutes) [40—42].

Примерно к 3 годам у ребенка формируется взрослый тип микробиоты, который в отсутствие тяжелых заболеваний, кардинальных изменений в диетических пристрастиях или длительного приема антибиотиков характеризуется постоянством состава на уровне доминирующего типа бактерий.

Влияние антибиотикотерапии в раннем детском возрасте на формирование микробиоты толстой кишки

Применение антибиотиков в раннем детском возрасте приводит к значительному снижению микробного разнообразия, обеднению представителей преобладающего типа Actinobacteria с одновременным увеличением доли Proteobacteria, а также селекции антибиотикорезистентных штаммов [43—45].

В работе S. Tanaka и соавт. проанализирован результат антибиотикотерапии препаратами широкого спектра действия в течение первых 4 дней жизни детей [46]. Согласно полученным данным, в 1-ю неделю в составе микробиоты толстой кишки наблюдалось снижение доли Bifidobacterium наряду с патологической колонизацией Enterococcus. В течение последующего месяца зафиксирован избыточный рост Enterobacteriaceae и Enterococcus.

В целом данные эпидемиологических исследований свидетельствуют о том, что применение антибиотиков в раннем детском возрасте сопровождается значительными изменениями еще несформированной микробиоты, нередко приводя к непрогнозируемым и серьезным последствиям. Известно, что лечение антибиотиками повышает у детей риск развития таких заболеваний, как астма, экзема, сахарный диабет 1-го типа, воспалительные заболевания кишки, ожирение и др. [47].

Факторы, оказывающие влияние на состав микробиоты взрослых людей

Кроме возраста, на состав микробиоты человека влияют такие факторы, как пол, пищевые предпочтения, социально-экономический статус и уровень образования, прием антибиотиков и прочее. Имеют значение и географические различия, предположительно связанные с характером питания. У взрослого человека со сформировавшейся микробиотой характер питания не является главным фактором, определяющим ее состав, но некоторые бактериальные таксоны (например, энтеротип 1 с преобладанием бактерий рода Bacteroidetes) могут быстро реагировать на изменения пищевого рациона [48].

Так, употребление в пищу продуктов с высоким содержанием пищевых волокон приводит к увеличению в составе микробиоты доли определенных видов бактерий (Roseburia, Blautia, Eubacterium rectale, Faecalibacterium prausnitzii), ферментирующих растительные волокна с образованием бутирата, а также некоторых бактерий, относящихся к типам Actinobacteria (Bifidobacteria, Lactobacilli) и Bacteroidetes [49—52]. Известно, что доминирующими бактериями в микробиоте вегетарианцев являются Prevotella, Clostridium clostridioforme и Faecalibacterium prausnitzii [50, 53]. По сравнению с лицами, употребляющими животные продукты, у вегетарианцев наблюдается снижение доли бактерий, принадлежащих к Bacteroides, Bifidobacteria, Enterobacteriaceae species [54].

Высокобелковая диета характеризуется увеличением активности протеолитических бактерий, таких как, например, Bacteroides spp. [49, 50]. Богатая жирами диета приводит к синтезу большого количества желчных кислот, что в свою очередь способствует размножению тех бактерий, которые метаболизируют эти кислоты, и угнетает размножение других видов [49, 50]. Диеты с преобладанием животных продуктов способствуют развитию бактерий, устойчивых к желчным кислотам, таких как Bacteroides, Alistipes и Bilophila, а также бутират-продуцирующих клостридий [50, 53].

Таким образом, преобладание в пищевом рационе одного из макронутриентов (белков, жиров, углеводов) детерминирует развитие определенных видов бактерий в составе микробиоты толстой кишки (рис. 4) [22, 23].

Рис. 4. Развитие определенных видов бактерий в составе микробиоты толстой кишки в зависимости от преобладания в пищевом рационе одного из макронутриентов (белков, жиров, углеводов) [58].

Например, «западная диета», распространенная в экономически развитых странах Европы и Северной Америки, изобилует жирами, рафинированными углеводами, животными белками на фоне крайне низкого содержания растительных волокон. Такая диета ассоциирована со снижением микробного разнообразия, увеличением доли Bacteroides и снижением бактерий рода Prevotella [49].

В развивающихся странах с низким социально-экономическим статусом (особенно в сельской местности) пищевой рацион жителей, напротив, богат растительными волокнами, сложными углеводами (за счет наличия большого количества свежих овощей, фруктов и цельнозерновых продуктов). Микробиота толстой кишки людей, проживающих в данных регионах, характеризуется разнообразием видов бактерий (Prevotella, Succinivibrio, Treponema), ферментирующих полисахариды и образующих КЦЖК [22, 23, 53, 55, 56].

КЦЖК, образующиеся в процессе ферментации пищевых волокон, являются ключевыми субстратами в энергетическом метаболизме колоноцитов, играют важнейшую роль в нормальном функционировании барьерной функции кишки, модулируют работу иммунной системы организма-хозяина. Считается, что низкой продукцией КЦЖК у людей, предпочитающих «западную диету», можно объяснить возросшую распространенность аллергических и аутоиммунных заболеваний в экономически развитых странах [57].

Развитие определенных видов бактерий в составе микробиоты толстой кишки в зависимости от преобладания в пищевом рационе одного из макронутриентов (белков, жиров, углеводов) представлено на рис. 4 [58].

Возможность влияния на состав микробиоты и ее метаболическую активность путем изменения характера питания (увеличение доли свежих овощей и фруктов в рационе, применение пищевых волокон, способствующих развитию бутиратпродуцирующей флоры) представляется перспективным направлением современной медицины.

Микробиом у людей пожилого возраста

Микробиом ЖКТ у пожилых людей характеризуется тенденцией к снижению доли бактерий, относящихся к типу Bacteroidetes и роду Bifidobacteria, с одновременным увеличением доли бактерий Firmicutes [59]. Согласно данным нескольких исследований, редукция бактерий видов Bacteroides spp., Prevotella spp., Faecalibacterium prausnitzii наряду с увеличением бактерий семейства Enterobacteriaceae ассоциирована со снижением качества жизни у людей пожилого возраста [59—61]. Считается, что факторами, способствующими изменениям микробиоты кишки в пожилом возрасте, являются прием большого количества медикаментов, изменения гормонального статуса и рациона питания, тяжелые соматические заболевания, пребывание в пансионах для престарелых лиц [62]. Кроме того, неблагоприятные сдвиги состава микробиоты полости рта, происходящие в пожилом возрасте, также оказывают значительное влияние на состояние микробиоты ЖКТ [63].

Функции кишечной микробиоты

Симбиотические отношения между кишечной микробиотой и макроорганизмом включают метаболические, иммунные и нейроэндокринные взаимодействия. Доказано, что микробиота задействована в важнейших процессах жизнедеятельности организма, таких как обмен веществ, развитие, дифференцировка и колонизационная резистентность эпителия, формирование врожденной и адаптивной иммунной систем. Микробиота обеспечивает трофику кишечного эпителия, синтез витаминов, метаболизм пищевых компонентов, холестерина, желчных кислот, регулирует моторику кишечника [4].

Основные функции микробиоты кишечника и связанные с ней ключевые метаболиты представлены в таблице [64].

Метаболиты кишечной микробиоты и их функции [64]

Многие хронические заболевания, например ожирение, воспалительные заболевания кишки, сахарный диабет, метаболический синдром, атеросклероз, неалкогольная болезнь печени и даже цирроз и гепатоцеллюлярная карцинома, ассоциированы с развитием дисбаланса в составе микробиоты ЖКТ (рис. 5) [64].

Рис. 5. Заболевания, ассоциированные с нарушением микробиома [12].
ВЗК — воспалительные заболевания кишечника.

Механизмы, в силу которых симбиотические микроорганизмы могут способствовать или, напротив, препятствовать развитию перечисленных заболеваний, включают следующее [1, 4, 12, 64]:

— увеличение энергетической ценности пищи за счет бактериальной ферментации нутриентов, не подвергающихся расщеплению ферментами пищеварительного тракта человека;

— влияние на аппетит;

— метаболизм ксенобиотиков;

— метаболизм желчных кислот;

— синтез витаминов;

— синтез КЦЖК;

— обеспечение колонизационной резистентности слизистой оболочки кишки и синтез антимикробных веществ;

— участие в развитии и созревании местного иммунитета слизистой оболочки пищеварительного тракта и иммунной системы организма-хозяина;

— участие в развитии и созревании нервной системы;

— регуляция метаболизма липидов и гомеостаза глюкозы.

Метаболизм веществ и энергии

Анализ образцов фекалий человека с использованием секвенирования 16S рибосомальной РНК и методов метагеномного секвенирования показал значительное расширение путей метаболизма белков, полисахаридов, аминокислот, ксенобиотиков и микроэлементов за счет ферментов, синтезируемых микробиотой кишечника [12].

Доказано, что кишечная микробиота значительно повышает эффективность расщепления и усвоения пищевых веществ. И если раньше так называемое симбионтное пищеварение, происходящее при содействии микрофлоры, считалось прерогативой жвачных животных, то теперь стало очевидно, что в процессе бактериальной ферментации неперевариваемых углеводов в анаэробных условиях образуются КЦЖК (уксусная, пропионовая и масляная кислоты), являющиеся важнейшими энергетическими субстратами для эпителиальных тканей человека [12].

Известно, что до 70% молекул АТФ колоноциты синтезируют из КЦЖК, преимущественно бутирата. В целом ферментация бактериями непереваренных пищевых волокон способствует более эффективному извлечению энергии (на 10%) из пищи. В норме микробиота кишечника синтезирует около 50—100 ммоль/л КЦЖК в день, которые практически полностью всасываются в кишечнике [12].

Всосавшиеся в кровоток из просвета кишки КЦЖК оказывают многообразное действие на функционирование различных органов и систем макроорганизма. Например, активизируют моторику кишки, являясь субстратами для глюконеогенеза и липогенеза, регулируют липидный и углеводный обмен в печени, активность воспалительных процессов [12].

Метаболизм желчных кислот

Как известно, в организме человека желчные кислоты синтезируются в печени из холестерина, конъюгируются с таурином или глицином (первичные желчные кислоты) и выделяются в двенадцатиперстную кишку, участвуя в эмульгировании и абсорбции жиров. В дальнейшем 95% первичных желчных кислот реабсорбируется в дистальной части подвздошной кишки, в то время как оставшиеся 5% неабсорбированных первичных желчных кислот подвергаются трансформации (деконъюгации) до вторичных желчных кислот (дезоксихолевая кислота и литохолевая кислота) с участием гидролаз кишечных бактерий (преимущественно за счет ферментов Clostridium perfringens и Clostridium scindens). Часть вторичных желчных кислот в последующем вновь реабсорбируется в печень, где происходит их конъюгация. Неабсорбированные желчные кислоты выводятся с калом.

Важно, что первичные и вторичные желчные кислоты способны активировать ядерный фарнезоидный рецептор Х (FXR) в ядре клеток организма-хозяина. Данный рецептор регулирует синтез желчных кислот, метаболизм глюкозы и даже процессы аутофагии печеночных клеток. Кроме того, вторичные желчные кислоты обладают мощным антимикробным действием, ингибируя рост и размножение бактерий.

Взаимодействие микробиоты с иммунной и нервной системами

Кишечный барьер, состоящий из нескольких функциональных компонентов, включающих физические (эпителиальные и слизистые слои), биохимические (ферменты и антимикробные белки) и иммунологические (IgA и эпителиальные иммунные клетки) факторы, служит границей между внешним миром и внутренней средой организма. Повышение проницаемости кишечного барьера для микробных метаболитов и других компонентов, содержащихся в полости кишки, ведет к развитию воспалительных или патологических иммуновоспалительных реакций [64].

Для поддержания кишечного гомеостаза и толерантности иммунной системы к бактериям-симбионтам разграничения патогенов и комменсальных микробов необходимы соблюдение очень тонкого баланса между регуляторными (Т-лимфоциты супрессоры) и эффекторными (Т-лимфоциты хелперы) клетками, гармоничное сочетание «иммунологической толерантности и продуктивного иммунного ответа». Значительную роль в созревании иммунной системы и развитии иммунологической толерантности отводят кишечной микробиоте.

Исследования, проведенные на мышах-гнотобионтах (безмикробные животные, с рождения выращиваемые в стерильных условиях), показали, что у таких животных имеются тяжелые нарушения развития лимфоидной ткани кишки и других иммунокомпетентных органов, а также нарушена продукция антител [65, 66].

Известно, что некоторые условно-патогенные микроорганизмы, такие как Bacteroides fragilis, Bifidobacterium infantis и Firmicutes, способствуют привлечению в стенку кишки регуляторных Т-лимофцитов (Т-супрессоров), продуцирующих противовоспалительные ИЛ, подавляя развитие патологических иммунных реакций. Такое «толерантное» состояние иммунной системы позволяет симбиотическим микроорганизмам мирно существовать, тесно контактируя с эпителиоцитами кишечной стенки, не вызывая иммунной агрессии со стороны организма-хозяина [64].

В то же время из экспериментов на мышах известно, что так называемые нитевидные бактерии, напротив, обладают мощным иммуностимулирующим действием, активируя Т-хелперы 17, индуцируя продукцию ими провоспалительных ИЛ-17 и ИЛ-22, тем самым усиливая антимикробную защиту и резистентность слизистой оболочки кишки к Citrobacter rodentium [67].

Таким образом, правильное взаимодействие Т-супрессоров/Т-хелперов 17, регулируемое в том числе микробными метаболитами, имеет важнейшее значение в поддержании целостности кишечного барьера, иммунологической толерантности, предотвращении развития патологических иммунных реакций, и в то же время препятствует инвазии патогенов.

Конечно, не все представители микробиоты кишки ведут к здоровому и правильному развитию и функционированию кишечного барьера, некоторые из них, напротив, могут вызывать воспалительные процессы, приводить к возникновению злокачественных новообразований. Однако на современном этапе развития учения о микробиоте наше понимание данных процессов еще далеко от совершенства [12].

Интересно, что кишечная микробиота играет немаловажную роль в созревании и нормальном функционировании нервной системы организма-хозяина.

Механизмы влияния микробиоты на функционирование центральной нервной системы (ЦНС) связаны с выработкой молочной кислоты, аммиака, КЦЖК, нейротрансмиттеров. Так, например, в процессе ферментации углеводов некоторыми молочнокислыми бактериями образуется D-лактат, который в случае повышения кишечной проницаемости способен оказывать нейротоксическое действие [4].

Аммиак — нейротоксин, продуцируемый из мочевины под действием бактериальной уреазы. Аммиак обладает прямыми нейротоксическими свойствами, изменяет функцию гематоэнцефалического барьера, тормозит синтез серотонина и допамина [4].

КЦЖК, продуцируемые микробиотой, напротив, оказывают позитивное влияние на функционирование нервной системы, принимая участие в созревании микроглии (резидентных макрофагов) ЦНС. Исследования, проведенные на мышах с дефектом развития рецепторов к КЦЖК, показали нарушение созревания микроглии в ЦНС у таких животных. В то же время колонизация кишечника мышей гнотобионтов нормальной микробиотой приводила к созреванию первоначально незрелой микроглии [68, 69].

Известно также, что некоторые бактерии способны синтезировать гормоны и нейротрансмиттеры, такие как ацетилхолин и гамма-аминомасляную кислоту (ГАМК), норадреналин, серотонин, мелатонин, допамин, глутамин [4]. Серотонин, продуцируемый микробиотой кишечника, участвует в регуляции перистальтики кишки, рвотного рефлекса и восприятии боли через спинальные афферентные нейроны [4]. Выделение серотонина и других биогенных аминов обусловливает влияние микробиоты кишки на настроение, аппетит, пищевые пристрастия человека [4].

ГАМК — антистрессорный медиатор, продуцируется в больших количествах микробиотой кишки, образуя единый пул с эндогенной фракцией ГАМК. Изменение уровня ГАМК у пациентов с синдромом раздраженного кишечника, возможно, объясняет склонность больных к повышенной возбудимости и тревожности, а также пониженный болевой порог у данной группы пациентов по сравнению со здоровыми субъектами.

Колонизационная резистентность

Еще одной важной ролью микробиоты кишечника является формирование колонизационной резистентности, предотвращающей инвазию патогенных микроорганизмов в слизистую оболочку кишки.

Колонизационная резистентность обеспечивается способностью нормальной микрофлоры адгезироваться на эпителии кишечника, которая образует на ней пристеночный слой и тем самым препятствует прикреплению патогенных и условно-патогенных микроорганизмов. Другой механизм создания колонизационной резистентности связан с синтезом микробиотой кишки антимикробных веществ (органических кислот, перекиси водорода и других биологически активных субстанций), а также с конкуренцией с патогенными микроорганизмами за источники питания [4].

Заключение

До последнего времени изучение состава и функциональной активности микробиоты человека было ограничено в связи с невозможностью культивирования подавляющего большинства микроорганизмов на питательных средах. Однако развитие таких технологий, как секвенирование 16S рибосомальной РНК, а также полногеномное секвенирование, позволило значительно расширить понимание роли кишечной микробиоты и ее уникальных метаболитов в регуляции различных физиологических функций макроорганизма, включая обеспечение колонизационной резистентности слизистых оболочек, метаболизм, развитие и гомеостаз иммунной и нервной систем.

Интерес к микробиому человека за последние десятилетия существенно вырос, и все же на современном этапе развития учения о микробиоте понимание данных процессов еще далеко от совершенства, что обусловливает необходимость дальнейших исследований.

Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

Дисбактериоз, E coli лактозонегативные повышены у взрослого — Вопрос гастроэнтерологу

Если вы не нашли нужной информации среди ответов на этот вопрос, или же ваша проблема немного отличается от представленной, попробуйте задать дополнительный вопрос врачу на этой же странице, если он будет по теме основного вопроса. Вы также можете задать новый вопрос, и через некоторое время наши врачи на него ответят. Это бесплатно. Также можете поискать нужную информацию в похожих вопросах на этой странице или через страницу поиска по сайту. Мы будем очень благодарны, если Вы порекомендуете нас своим друзьям в социальных сетях.

Медпортал 03online.com осуществляет медконсультации в режиме переписки с врачами на сайте. Здесь вы получаете ответы от реальных практикующих специалистов в своей области. В настоящий момент на сайте можно получить консультацию по 74 направлениям: специалиста COVID-19, аллерголога, анестезиолога-реаниматолога, венеролога, гастроэнтеролога, гематолога, генетика, гепатолога, гериатра, гинеколога, гинеколога-эндокринолога, гомеопата, дерматолога, детского гастроэнтеролога, детского гинеколога, детского дерматолога, детского инфекциониста, детского кардиолога, детского лора, детского невролога, детского нефролога, детского онколога, детского офтальмолога, детского психолога, детского пульмонолога, детского ревматолога, детского уролога, детского хирурга, детского эндокринолога, дефектолога, диетолога, иммунолога, инфекциониста, кардиолога, клинического психолога, косметолога, липидолога, логопеда, лора, маммолога, медицинского юриста, нарколога, невропатолога, нейрохирурга, неонатолога, нефролога, нутрициолога, онколога, онкоуролога, ортопеда-травматолога, офтальмолога, паразитолога, педиатра, пластического хирурга, подолога, проктолога, психиатра, психолога, пульмонолога, ревматолога, рентгенолога, репродуктолога, сексолога-андролога, стоматолога, трихолога, уролога, фармацевта, физиотерапевта, фитотерапевта, флеболога, фтизиатра, хирурга, эндокринолога.

Мы отвечаем на 97.37% вопросов.

Оставайтесь с нами и будьте здоровы!

Энтеробактер — обзор | SCIENDICIRECT TEMICS

Enterobacter Aerogenes (1960) Klebsiella Mobilis (1971)
Aerobacter Aerogenes (1958)
повсеместливый в окружающей среде, происходит в продуктах питания и оппортунистические инфекции (бактериемия).
Enterobacter Agglomerans (1972) Pantoea Agglomerans (1989)
Bacillus Agglomerans (1888)
Erwinia Herbicola (1964)
Erwinia Milletiae (1937)
повсеместливый в окружающей среде , встречается в пищевых продуктах и ​​оппортунистических инфекциях (бактериемия).
Enterobacter amnigenus (1981) Lelliottia amnigena (2013)
Группа h4 Izard et al. (1980)
Выделено из воды, сырого молока, сливок, испанской свиной колбасы Клинические инфекции зарегистрированы у взрослых.
Enterobacter arachidis (2010) Kosakonia arachidis (2013) Выделен из арахиса.
Enterobacter asburiae (1988) CDC Энтеросолюбильная группа 17 Выделен из клинических случаев (ассоциированных с внебольничной пневмонией), выделен из сельскохозяйственной техники.
Enterobacter CanceOgenus (1988) Enterobacter Taylorae (1985)
Erwinia Cancecogena (1966)
CDC Enteric Group 19
Изолированные из деревьев, воды и продуктов питания и из клинических случаев (остеомиелит бактериемия, холангит и пневмония).
Enterobacter cloacae (1960) (типовой вид рода) Enterobacter cloacae subsp. Cloacae (2005)
Aerobacter Cloacae (1958)
Cloaca Cloacae (1919)
бактерия Cloacae (1896)
Bacillus Cloacae (1890)
Изолированные от детской еды, сточных вод, почва, больница среды, клинические случаи (включая менингит, некротизирующий энцефалит, бактериемию у новорожденных/младенцев).
Enterobacter cowani (2001) Kosakonia cowani (2013)
Группа NIH 42
Выделен из клинических образцов.
Enterobactersolvens (1988) Enterobacter cloacae subsp. Despolvens (2005)
Erwinia Dissollens (1948)
Aerobacter Respolvens (1945)
Phytomonas Dissolvens (1926)
Aplanobacter Respolvens (1926)
Pseudomonas Dissollens (1922)
Бактерия растворения (1922)
Повсеместно распространен в окружающей среде, связан с использованием растений и биомассы для производства 2,3-бутандиола.
Enterobacter gergoviae (1980) Pluralibacter gergoviae (2013) Выделен из воды и из клинических случаев у младенцев и детей.
Enterobacter helveticus (2007) Cronobacter helveticus (2013) Выделен из детского питания, фруктового порошка. В клинических случаях не сообщается.
Enterobacter Hormaechei (1990) CDC Enteric Group 75 , изолированные от носокомиальных инфекций, включая сепсис у младенцев, иногда ошибаются для Cronobacter инфекции
Enterobacter Intermedius (1980) Kluyvera intermedia (2005)
Группа h2 Izard et al.(1980)
Изолирован от природной среды, воды.
Enterobacter kobei (1997) Группа NIH 21 Выделен из пищи, зарегистрирован один случай нозокомиального уросепсиса.
Enterobacter ludwigii (2005) Выделен из почвы, растений.
Enterobacter mori (2011) Ассоциируется с бактериальным увяданием на Morus alba (тутовое дерево).
Enterobacter NIMIPRESTRUGRUCTURRUCTORIS (1988) Lelleiottia NimiPressurrenturancularis (2013)
Erwinia NimiPressurgress (1969)
Erwinia Nimipressurgress (1945)
Изолированные с деревьев, растений. В клинических случаях не сообщается.
Enterobacter oryzae (2009) Kosakonia oryzae (2013) Выделен из риса.
Enterobacter pulveris (2008) Cronobacter pulveris (2013) Выделен из фруктового порошка, детских смесей и производственной среды.В клинических случаях не сообщается.
Enterobacter pyrinus (1993) Pluralibacter pyrinus (2013) Связан с бурой пятнистостью листьев груши.
Enterobacter radicincitans (2005) Kosakonia radicincitans (2013) Способствует росту корней растений. Связан со случаем остеомиелита.
Enterobacter sakazakii (1980) Cronobacter spp.(2008) ( E. sakazakii была идентифицирована как группа, состоящая как минимум из семи видов, которые были переименованы в новый род, Cronobacter , включая следующие: C. sakazakii , C. malonaticus , C , MUATJENSII , C. TURICENSIS , C. DUBLINENSIS , C. Universalis , C. Condimenti )
Желто-пигментированные Enterobacter Cloacae (Pre-1980)
вездесущий в сухих средах, включая сушеные еда.Ассоциируется с заболеваниями у новорожденных (менингит, некротизирующий энтероколит, бактериемия) и считается возбудителем пищевого происхождения в детских смесях.
Enterobacter soli (2011) Выделен из почвы; разрушает лигнин.
Enterobacter turicensis (2007) Cronobacter zurichensis (2013) Выделен из фруктового порошка. В клинических случаях не сообщается.

Переосмысление резидентности кишечного микробиома и Enterobacteriaceae у здоровых взрослых людей

  • Caugant DA, Levin BR, Selander RK.Генетическое разнообразие и временная изменчивость в популяции E. coli человека-хозяина. Генетика. 1981; 98: 467–90.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Джернберг С., Лофмарк С., Эдлунд С., Янссон Дж. К. Долгосрочные экологические последствия применения антибиотиков для микробиоты кишечника человека. ISME J. 2007; 1: 56–66.

    КАС Статья Google Scholar

  • Джонсон Дж.Р., Клаботс С., Кусковски М.А.Совместное использование нескольких хозяев, долгосрочная персистенция и вирулентность клонов Escherichia coli от членов семьи человека и животных. Дж. Клин Микробиол. 2008; 46: 4078–82.

    Артикул Google Scholar

  • Зитомерский Н.Л., Койн М.Дж., Комсток Л.Е. Продольный анализ распространенности, поддержания и ответа IgA на виды порядка Bacteroidales в кишечнике человека. Заразить иммун. 2011;79:2012–20.

    КАС Статья Google Scholar

  • Уэлч Р.А., Берланд В., Планкетт Г. 3-й, Редфорд П., Реш П., Раско Д. и др.Обширная мозаичная структура выявлена ​​по полной последовательности генома уропатогенной Escherichia coli . Proc Natl Acad Sci USA. 2002;99:17020–4.

    КАС Статья Google Scholar

  • Caporaso JG, Lauber CL, Costello EK, Berg-Lyons D, Gonzalez A, Stombaugh J, et al. Движущиеся изображения микробиома человека. Геном биол. 2011;12:R50.

    Артикул Google Scholar

  • Дэвид Л.А., Матерна А.С., Фридман Дж., Кампос-Баптиста М.И., Блэкберн М.С., Перротта А. и др.Образ жизни хозяина влияет на микробиоту человека в ежедневных временных масштабах. Геном биол. 2014;15:R89.

    Артикул Google Scholar

  • Мартинес И., Мюллер К.Э., Уолтер Дж.Долгосрочный временной анализ фекальной микробиоты человека выявил стабильное ядро ​​доминирующих видов бактерий. ПЛОС ОДИН. 2013;8:e69621.

    КАС Статья Google Scholar

  • Мехта Р.С., Абу-Али Г.С., Дрю Д.А., Ллойд-Прайс Дж., Субраманиан А., Лоххед П. и др. Стабильность фекального микробиома человека в когорте взрослых мужчин. Нат микробиол. 2018;3:347–55.

    КАС Статья Google Scholar

  • Faith JJ, Guruge JL, Charbonneau M, Subramanian S, Seedorf H, Goodman AL, et al. Долгосрочная стабильность микробиоты кишечника человека. Наука. 2013;341:1237439.

    Артикул Google Scholar

  • Jayasinghe TN, Hilton C, Tsai P, Apple B, Shepherd P, Cutfield WS и др. Долгосрочная стабильность кишечного микробиома на протяжении 46 лет жизни Билли Эппл. Hum Microbiome J. 2017; 5–6:7–10.

    Артикул Google Scholar

  • Сюэ З., Кейбл М.Э., Марко М.Л.Влияние методов секвенирования и анализа ДНК на анализ бактериального сообщества гена 16S рРНК молочных продуктов. мсфера. 2018;3:e00410-18.

  • Lagier JC, Armougom F, Million M, Hugon P, Pagnier I, Robert C, et al. Микробная культуромика: смена парадигмы в изучении микробиома кишечника человека. Клин Микробиол Инфект. 2012;18:1185–93.

    КАС Статья Google Scholar

  • Бактериология JCotICOS.Существующее положение семейства Enterobacteriaceae Rahn 1937. Int J Syst Bacteriol. 1981; 31:104.

    Артикул Google Scholar

  • Робин Ф., Бейрути Р., Бонакорси С., Аисса Н., Брет Л., Бриу Н. и др. Инвентаризация Enterobacteriaceae , продуцирующих бета-лактамазы расширенного спектра действия, во Франции по оценке многоцентрового исследования. Противомикробные агенты Chemother. 2017;61:e01911-16.

  • Клермон О., Кристенсон Дж.К., Денамур Э., Гордон Д.М.Новый взгляд на метод филотипирования Clermont Escherichia coli : повышение специфичности и обнаружение новых филогрупп. Environ Microbiol Rep. 2013; 5:58–65.

    КАС Статья Google Scholar

  • Мохапатра Б.Р., Мазумдер А. Сравнительная эффективность пяти различных методов повторной ПЦР для различения популяций Escherichia coli в водной среде. Технологии водных наук. 2008; 58: 537–47.

    КАС Статья Google Scholar

  • Walk ST, Alm EW, Gordon DM, Ram JL, Toranzos GA, Tiedje JM, et al.Загадочные линии рода Escherichia. Appl Environ Microbiol. 2009; 75: 6534–44.

    КАС Статья Google Scholar

  • Козич Дж. Дж., Весткотт С. Л., Бакстер Н. Т., Хайлендер С. К., Шлосс П. Д. Разработка стратегии секвенирования с двойным индексом и конвейера курирования для анализа данных последовательности ампликона на платформе секвенирования MiSeq Illumina. Appl Environ Microbiol. 2013;79:5112–20.

    КАС Статья Google Scholar

  • Schloss PD, Westcott SL, Ryabin T, Hall JR, Hartmann M, Hollister EB, et al.Представляем mothur: открытое, независимое от платформы, поддерживаемое сообществом программное обеспечение для описания и сравнения микробных сообществ. Appl Environ Microbiol. 2009;75:7537–41.

    КАС Статья Google Scholar

  • Edgar RC, Haas BJ, Clemente JC, Quince C, Knight R. UCHIME повышает чувствительность и скорость обнаружения химер. Биоинформатика. 2011;27:2194–200.

    КАС Статья Google Scholar

  • Рогнес Т., Флури Т., Николс Б., Айва К., Маэ Ф.VSEARCH: универсальный инструмент с открытым исходным кодом для метагеномики. Пир Дж. 2016;4:e2584.

    Артикул Google Scholar

  • Cole JR, Wang Q, Fish JA, Chai B, McGarrell DM, Sun Y и др. Проект базы данных рибосом: данные и инструменты для высокопроизводительного анализа рРНК. Нуклеиновые Кислоты Res. 2014; 42 (выпуск базы данных): D633–42.

    КАС Статья Google Scholar

  • Оксанен Дж., Гийом Бланше Ф., Френдли М., Киндт Р., Лежандр П., МакГлинн Д. и др. Веган: экологический пакет сообщества. Пакет R версии 2.5-2. 2018.

  • Махлер М., Руссо П., Стройф А., Хуберт М., Хорник К. Основы и расширения кластерного анализа. Пакет R версии 2.0,7-1. 2018.

  • Робертс Д.В. labdsv: Ординация и многомерный анализ для экологии. 1,8-0. 2016.

  • Оксанен Дж., Бланше Ф.Г., Киндт Р., Лежандр П., Минчин П.Р., О’Хара Р. и др. Пакет «веганский». Версия 2. 2013.

  • Махлер М., Руссеу П., Стройф А., Хуберт М. Хорник KJRpv. Кластер: основы и расширения кластерного анализа. 2012;1:56.

    Google Scholar

  • Каммингс Д.Х., Дженкинс Д.Дж., Виггинс Х.С.Измерение среднего времени прохождения пищевых остатков через кишечник человека. Кишка. 1976; 17: 210–8.

    КАС Статья Google Scholar

  • Макартур Р. О характере размножения перелетных птиц Северной Америки. Аук. 1959; 76: 318–25.

    Артикул Google Scholar

  • Отсутствие D. Значение миграции. Естественная регуляция численности животных.Оксфорд, Великобритания: Издательство Оксфордского университета; 1954. с. 243–54.

    Google Scholar

  • Саважо М.А. Среда обитания Escherichia coli , типы клеток и молекулярные механизмы генного контроля. Я Нат. 1983; 122: 732–44.

    КАС Статья Google Scholar

  • Туррони С., Рампелли С., Бьяджи Э., Консоланди С., Северньини М., Пеано С. и др. Временная динамика микробиоты кишечника у людей, живущих в замкнутом пространстве, 520-дневное наземное космическое моделирование, MARS500. Микробиом. 2017;5:39.

    Артикул Google Scholar

  • Кауфманн Ф.Окунь BJAPMS. Uber die Coliflora des gesunden Menschen. 1943; 20: 201–20.

    Google Scholar

  • Sears HJ, Brownlee I, Uchiyama JK. Персистенция отдельных штаммов Escherichia coli в кишечном тракте человека. J Бактериол. 1950; 59: 293–301.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Уоллик Х., Стюарт, Калифорния. Антигенные отношения Escherichia coli , выделенных от одного человека.J Бактериол. 1943; 45: 121–6.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Nowrouzian FL, Wold AE, Adlerberth I. Штаммы Escherichia coli , принадлежащие к филогенетической группе B2, обладают превосходной способностью сохраняться в кишечной микрофлоре младенцев. J заразить Dis. 2005; 191:1078–83.

    КАС Статья Google Scholar

  • Чжао С., Либерман Т.Д., Пойет М., Кауфман К.М., Гиббонс С.М., Груссин М. и др.Адаптивная эволюция кишечных микробиомов здоровых людей. Сотовый хозяин и микроб. 2019.

  • Kim M, Oh HS, Park SC, Chun J. На пути к таксономической согласованности между средней идентичностью нуклеотидов и сходством последовательностей генов 16S рРНК для демаркации видов прокариот.Int J Syst Evol Microbiol. 2014; 64 (часть 2): 346–51.

    КАС Статья Google Scholar

  • Константинидис К.Т., Тиедже Дж.М. Геномные идеи, которые расширяют определение вида прокариот. Proc Natl Acad Sci USA. 2005; 102: 2567–72.

    КАС Статья Google Scholar

  • Ветровский Т., Балдриан П. Изменчивость гена 16S рРНК в бактериальных геномах и ее последствия для анализа бактериального сообщества. ПЛОС ОДИН. 2013;8:e57923.

    КАС Статья Google Scholar

  • Роджерс Б.А., Кеннеди К.Дж., Сиджабат Х.Е., Джонс М., Коллиньон П., Патерсон Д.Л. Длительное носительство резистентной E. coli вернувшимися путешественниками: клональность, факторы риска и характеристики бактерий. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2012;31:2413–20.

    КАС Статья Google Scholar

  • Бейли Дж. К., Пиньон Дж. Л., Анантам С., Холл Р. М.Распределение комменсалов человека Escherichia coli филогенетических групп. Дж. Клин Микробиол. 2010;48:3455–6.

    Артикул Google Scholar

  • Лескат М., Клермон О., Вёртер П.Л., Глодт Дж., Дион С., Скурник Д. и др. Комменсальные штаммы Escherichia coli в Гвиане демонстрируют высокое генетическое разнообразие с зависимой от хозяина структурой популяции. Environ Microbiol Rep. 2013; 5:49–57.

    КАС Статья Google Scholar

  • Sears HJ, Brownlee I.Дальнейшие наблюдения за персистенцией отдельных штаммов Escherichia coli в кишечном тракте человека. J Бактериол. 1952; 63: 47–57.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Рихтер ТКС, Михальски Ю.М., Занетти Л., Теннант С.М., Чен В.Х., Раско Д.А. Реакция популяции кишечной палочки Escherichia coli человека на патогенные и антибиотические нарушения. mSystems. 2018;3:e00047-18.

  • Уолд А.Э., Каугант Д.А., Лидин-Янсон Г., де Ман П., Сванборг К.Резидентные штаммы кишечной палочки Escherichia coli часто проявляют уропатогенные характеристики. J заразить Dis. 1992; 165:46–52.

    КАС Статья Google Scholar

  • Фретер Р., Брикнер Х., Фекете Дж., Викерман М.М., Кэри К.Е.Выживание и имплантация Escherichia coli в кишечном тракте. Заразить иммун. 1983; 39: 686–703.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Перейра Ф.К., Берри Д. Микробные питательные ниши в кишечнике. Окружающая среда микробиол. 2017;19:1366–78.

    Артикул Google Scholar

  • Бранш В.К. мл., Янг В.М., Робинет Х.Г., Мэсси Э.Д.Влияние продукции колицина на Escherichia coli в нормальном кишечнике человека. Proc Soc Exp Biol Med. 1963; 114: 198–201.

    КАС Статья Google Scholar

  • Чанг Дж, Ю Дж, Ли Х, Рю Х, Пак К, Пак ЙДж.Распространенность и характеристики неферментирующих лактозу Escherichia coli в изолятах мочи. J заразить Chemother. 2014;20:738–40.

    Артикул Google Scholar

  • Джонсон Т.Дж., Элнекаве Э., Миллер Э.А., Муньос-Агуайо Дж., Флорес Фигероа С., Джонстон Б. и др. Филогеномный анализ внекишечной патогенной Escherichia coli последовательности типа 1193, новой клональной группы с множественной лекарственной устойчивостью. Противомикробные агенты Chemother.2019;63:e01913-18.

  • Скрининг фекального носительства MCR-продуцирующих Enterobacteriaceae у здоровых людей и пациентов первичного звена | Устойчивость к противомикробным препаратам и инфекционный контроль

    Всего из селективных чашек было получено 62 изолята. Из них 18 были устойчивы к колистину (МИК >2 мг/л), в том числе Hafnia (H.) alvei ( n  = 9), E. coli ( n  = 3), Enterobacter (E. .) клоаки ( n  = 4), Klebsiella (K.) pneumoniae ( n  = 1) и Raoultella (R.) ornithinolytica ( n  = 1).

    H. alvei и E. coli были идентифицированы с использованием API 32 E, R. ornithinolytica с помощью секвенирования 16S рРНК, K. pneumoniae и E. cloacae с помощью секвенирования rpoB 903. Устойчивые изоляты произошли от 16 (1,5%) здоровых людей и 2 (3,8%) пациентов первичной медицинской помощи (таблица 1).Из пациентов первичной помощи оба были мужчинами, а средний возраст составлял 54,5 года. Основными заболеваниями были диабет (2/2, 100%) и сердечно-сосудистые заболевания (2/2, 100%). Оба (100%) обращались в больницу в качестве амбулаторных пациентов для диагностической рентгенографии или колоноскопии. Ни у одного из пациентов не было недавней истории путешествий или лечения противомикробными препаратами в течение 6 месяцев до отбора проб. Ни одна из профессиональных профессий больных не была связана с тесным контактом с сельским хозяйством.

    Таблица 1 Устойчивые к колистину энтеробактерии, выделенные из фекальной флоры 1091 здорового человека и 53 пациентов первичной медико-санитарной помощи

    Результаты ПЦР-скрининга для mcr-1 и mcr-2 остались отрицательными для всех 62 изолятов.

    В этом исследовании представлен первый отчет о появлении резистентных к колистину Enterobacteriaceae в фекальной флоре здоровых людей и пациентов первичной медико-санитарной помощи в Швейцарии и Европе. Отсутствие продуцентов МКР в фекальной флоре здоровых людей, а также пациентов первичного звена представляет большой эпидемиологический интерес. Это указывает на то, что риск передачи генов mcr от животных, продуктов питания или окружающей среды в настоящее время очень низок в сообществе, несмотря на то, что колистин используется для лечения инфекций у домашнего скота. Действительно, недавно были получены данные о том, что продуктивные животные в Швейцарии не представляют собой резервуар мкр-1 или мкр-2 , поэтому риск передачи от домашнего скота человеку может быть исключен [11]. Напротив, 25,8% (частично импортированных) образцов мяса птицы в розничных магазинах Швейцарии содержат mcr-1 , содержащих штаммов E. coli [12]. Несмотря на эту потенциальную угрозу для здоровья населения, риск передачи генов mcr-1 из пищевых продуктов человеку представляется очень низким даже для лиц, работающих в пищевой промышленности, о чем свидетельствуют представленные здесь данные.Этот вывод коррелирует с предыдущими сообщениями о низкой распространенности (<1%) инфекций людей MCR-продуцирующими штаммами Enterobacteriaceae в Швейцарии [9]. До сих пор продуценты MCR редко выявлялись в образцах стула здоровых людей, и сообщения в настоящее время ограничены азиатскими странами [13, 14]. Необходимо провести дополнительные исследования, чтобы постоянно оценивать распространение генов mcr среди кишечных бактерий у животных, пищевых продуктов и людей. Наконец, фекальное носительство клинически значимых бактерий, таких как E.coli, E. cloacae и K. pneumoniae с вероятной нетрансмиссивной резистентностью к колистину могут вызывать озабоченность, если такие бактерии приобретут плазмиды множественной лекарственной устойчивости.

    Высокий уровень фекального носительства расширенной бета-лактамазы, продуцирующей Enterobacteriaceae, среди взрослых пациентов, поступивших в специализированные больницы в Дар-эс-Саламе, Танзания | BMC Infectious Diseases

  • Rupp ME, Fey PD. Enterobacteriaceae, продуцирующие бета-лактамазы расширенного спектра (БЛРС): рекомендации по диагностике, профилактике и медикаментозному лечению.Наркотики. 2003;63(4):353–65.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • Isendahl J, Turlej-Rogacka A, Manjuba C, Rodrigues A, Giske CG, Nauclér P. Фекальное носительство ESBL-продуцирующих E. coli и K. pneumoniae у детей в Гвинее-Бисау: больница -Основанное кросс-секционное исследование. Конли Дж., редактор. ПЛОС Один. 2012;7(12):e51981.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • Schwaber MJ, Lev B, Israel A, Solter E, Smollan G, Rubinovitch B, et al.Сдерживание общенациональной вспышки резистентной к карбапенемам Klebsiella pneumoniae в израильских больницах с помощью вмешательства, осуществляемого на национальном уровне. Клин Инфекция Дис. 2011;52(7):848–55.

    ПабМед Статья Google Scholar

  • Andriatahina T, Randrianirina F, Hariniana ER, Talarmin A, Raobijaona H, Buisson Y, et al. Высокая распространенность фекального носительства Escherichia coli и Klebsiella pneumoniae, продуцирующих бета-лактамазы расширенного спектра, в педиатрическом отделении на Мадагаскаре. BMC Infect Dis. 2010;10:204.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • Woerther PL, Burdet C, Chachaty E, Andremont A. Тенденции фекального носительства β-лактамаз расширенного спектра у людей в обществе: к глобализации CTX-M. Clin Microbiol Rev. 2013;26(4):744–58.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • Вальверде А., Гриль Ф., Коке Т.М., Пинтадо В., Бакеро Ф., Кантон Р. и др.Высокая частота колонизации кишечника микроорганизмами, продуцирующими бета-лактамазы расширенного спектра, при бытовых контактах с инфицированными внебольничными пациентами. Дж. Клин Микробиол. 2008;46(8):2796–9.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • Деста К., Вольдемануэль Ю., Азаж А., Мохаммод Х., Десален Д. , Шимелис Д. и др. Высокая скорость колонизации желудочно-кишечного тракта энтеробактериями, продуцирующими расширенный спектр β-лактамаз, у госпитализированных пациентов: появление карбапенемазопродуцирующих K.pneumoniae в Эфиопии. ПЛОС Один. 2016;11(8):16.

    Артикул Google Scholar

  • Oduro-Mensah D, Obeng-Nkrumah N, Bonney EY, Oduro-Mensah E, Twum-Danso K, Osei YD, et al. Генетическая характеристика антибактериальной резистентности, связанной с БЛРС ТЕМ-типа, у Enterobacteriaceae в больнице третичного уровня в Гане. Энн Клин Микробиол Антимикроб. 2016;15:29.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • Сонда Т., Кумбуру Х., ван Цветселар М., Алифрангис М., Лунд О., Кибики Г. и др.Метаанализ оценок доли энтеробактерий, продуцирующих расширенный спектр бета-лактамаз, в больницах Восточной Африки. Противомикробная защита от инфекций. 2016;5:18.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • Мшана С.Е., Камугиша Э., Мирамбо М., Чакраборти Т., Лямуя Э.Ф. Распространенность полирезистентных грамотрицательных микроорганизмов в больнице третичного уровня в Мванзе, Танзания. Примечания BMC Res. 2009;2(1):49.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • Мойо С.Дж., Абуд С., Касуби М., Лямуя Э.Ф., Маселле С.И. Устойчивость к противомикробным препаратам среди продуцентов и непродуцентов бета-лактамаз расширенного спектра в мочевых изолятах в больнице третичного уровня в Танзании. Примечания BMC Res. 2010;3(1):348.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • Маньяхи Дж., Мати М.И., Маджиго М., Мойо С., Мшана С.Е., Лямуя Э.Ф.Преобладание бактериальных патогенов с множественной лекарственной устойчивостью, вызывающих инфекции области хирургического вмешательства, в Национальной больнице Мухимбили, Танзания. Примечания BMC Res. 2014;7:500.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • Лаутенбах Э., Хан Дж., Сантана Э., Толомео П., Билкер В.Б., Маслоу Дж. Колонизация штаммами Escherichia coli и Klebsiella, продуцирующими расширенный спектр β-лактамаз, у жителей учреждения длительного ухода. Infect Control Hosp Epidemiol.2012;33(3):302–4.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • Wilson G, McCabe D. Использование агаров, содержащих антибиотики, для выделения организмов, продуцирующих β-лактамазы расширенного спектра действия, в отделениях интенсивной терапии. Клин Микробиол Инфект. 2007;13(4):451–3.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • Чизбро М. Районная лабораторная практика в тропических странах, часть 2. 2-е изд. Издательство Кембриджского университета; 2006. с. 440р.

    Книга Google Scholar

  • Wayne P. Стандарты характеристик M100-S25 для определения чувствительности к противомикробным препаратам; 2015.

    Google Scholar

  • Kurz MSE, Bayingana C, Ndoli JM, Sendegeya A, Durst A, Pfüller R, et al. Интенсивное догоспитальное носительство и дальнейшее приобретение ESBL-продуцирующих Enterobacteriaceae среди пациентов и лиц, осуществляющих уход за ними, в больнице третичного уровня в Руанде.Trop Med Int Heal. 2017 фев; 22 (2): 210–20.

    КАС Статья Google Scholar

  • Теллевик М.Г., Бломберг Б., Коммедаль О., Масель С.Ю., Лангеланд Н., Мойо С.Дж. Высокая распространенность фекального носительства энтеробактерий, продуцирующих БЛРС, среди детей в Дар-эс-Саламе, Танзания. ПЛОС Один. 2016;11(12):e0168024.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • Катерегга Дж. Н., Кантуме Р., Атухайре С., Любова М. Н., Ндукуи Дж. Г.Фенотипическая экспрессия и распространенность энтеробактерий, продуцирующих БЛРС, в образцах, взятых у пациентов в различных отделениях больницы Мулаго. Уганда BMC Pharmacol Toxicol. 2015;16(1):14.

    ПабМед Статья Google Scholar

  • Канафани З. А. М., Арай Г., Канаан М., Канджи С. Эпидемиология и факторы риска для организмов, продуцирующих бета-лактамазы расширенного спектра: исследование случай-контроль в центре третичной медицинской помощи в Ливане. Am J Infect Control.2005;33(6):326–32.

    ПабМед Статья Google Scholar

  • Джагги Н., Сиссодия П., Шарма Л. Борьба с бактериями с множественной лекарственной устойчивостью в больнице третичного уровня в Индии. Противомикробная защита от инфекций. 2012;1(1):23.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • Tham J, Odenholt I, Walder M, Brolund A, Ahl J, Melander E. Escherichia coli, продуцирующая бета-лактамазы расширенного спектра, у пациентов с диареей путешественников.Scand J Infect Dis. 2010;42(4):275–80.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • Tham J, Walder M, Melander E, Odenholt I. Продолжительность колонизации Escherichia coli, продуцирующей бета-лактамазы расширенного спектра, у пациентов с диареей путешественников. Scand J Infect Dis. 2012;44(8):573–7.

    ПабМед Статья Google Scholar

  • Фуда Р., Солиман М.С., Эль-Анани М.Г., Абадир М., Солиман Г.Распространенность и факторы риска бактериальной колонизации MRSA, ESBL и MDR при поступлении в отделение интенсивной терапии Египта. J Infect Dev Cries. 2016;10(4):329–36.

    ПабМед Статья Google Scholar

  • Ибрагим МЭ, Билал НЭ, Хамид МЭ. Escherichia coli с повышенной множественной лекарственной устойчивостью из больниц в штате Хартум, Судан. Afr Health Sci. 2012;12(3):368–75.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Сангаре С.А., Майга А.И., Гиндо И., Майга А., Камара Н., Савадого С. и др.Распространенность продуцирующих бета-лактамазы расширенного спектра Enterobacteriaceae, выделенных из культур крови в Африке. Médecine Mal Infect. 2015;45(9):374–82.

    КАС Статья Google Scholar

  • Marbou WJT, Kuete V. Бактериальная резистентность и иммунологические профили у ВИЧ-инфицированных и неинфицированных пациентов в больнице Mbouda AD LUCEM в Камеруне. J заразить общественное здравоохранение. 2017;10(3):269–76.

    ПабМед Статья Google Scholar

  • Шаумбург Ф., Алаби А., Кокоу С., Гробуш М.П., ​​Кок Р., Каба Х. и др.Высокое бремя энтеробактерий, продуцирующих лактамазы расширенного спектра, в Габоне. J Антимикробная химиотерапия. 2013;68(9):2140–3.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • Lonchel CM, Melin P, Gangoué-Piéboji J, Assoumou M-CO, Boreux R, Mol P. Enterobacteriaceae, продуцирующие β-лактамазы расширенного спектра, в камерунских больницах. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2013;32(1):79–87.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • Наджука С.Ф., Катит Д.П., Каджумбула Х.М., Джолоба М.Л., Эссак С.Ю.Профили антимикробной чувствительности Escherichia coli и Klebsiella pneumoniae, выделенные от амбулаторных больных в городских и сельских районах Уганды. Примечания BMC Res. 2016;9:235.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • Границы | Причины, последствия и перспективы в вариациях плотности колонизации кишечника полирезистентными энтеробактериями

    Введение

    Микробиота относится к микроорганизмам (бактериям, археям и дрожжам), которые колонизируют поверхности эпителия и слизистых оболочек, подвергающиеся воздействию внешней среды: кожу, ротоглотку, влагалище и кишечник.Микробиота, населяющая кишечник, от двенадцатиперстной кишки до прямой кишки, определяется как кишечная микробиота. Его состав и плотность различаются по пищеварительному тракту, при этом в толстой кишке содержится гораздо более плотная и сложная микробиота, чем в верхних отделах кишечника (Stearns et al., 2011). Состав этой кишечной микробиоты, хотя и не полностью, отражает состав фекалий (Durban et al., 2011; Stearns et al., 2011). У человека кишечная микробиота состоит из 10 13 до 10 14 микробных клеток, что превышает общее количество клеток, составляющих организм хозяина (Whitman et al. , 1998). Большинство кишечных бактерий являются строгими анаэробными бактериями, которые редко являются патогенами человека. И наоборот, энтеробактерии составляют небольшую часть кишечной микробиоты (1/10 4 ), но являются основными патогенами человека, чья неуклонно растущая устойчивость к антибиотикам представляет серьезную угрозу для здоровья.

    Расширение знаний о составе кишечной микробиоты и влиянии антибиотиков стало очевидным в последнее десятилетие благодаря значительным технологическим усовершенствованиям в секвенировании ДНК (секвенирование следующего поколения; Qin et al., 2010; Детлефсен и Релман, 2011 г.; Таур и др., 2012). Антибиотики оказывают двоякое действие на микробиоту кишечника: (i) потеря бактериального разнообразия и (ii) избыточный рост резистентных бактерий в нишах, оставленных восприимчивыми бактериями. Таким образом, лечение антибиотиками может увеличить плотность и относительную численность резистентных бактерий в кишечной микробиоте. Действительно, высокая плотность и/или высокая относительная численность резистентных бактерий могут быть связаны с повышенным риском инфицирования или передачи инфекции от пациента к пациенту. В этом обзоре мы рассматриваем этот вопрос, уделяя особое внимание энтеробактериям с множественной лекарственной устойчивостью (ММЭ). Наконец, мы рассмотрим недавние достижения в стратегиях поддержания MDRE при низкой плотности кишечника.

    Описание микробиоты кишечника человека

    Состав кишечной микробиоты

    Микробиота кишечника человека состоит из девяти бактериальных отделов, что намного меньше числа, наблюдаемого в почвах (не менее 20 отделов; Ley et al., 2006).Большинство кишечных колонизаторов не растут вне кишечника и передаются через прямые контакты от человека к человеку. Дети наследуют свою микробиоту от своих матерей (Dominguez-Bello et al., 2010), а кишечная микробиота у однояйцевых близнецов очень похожа (Turnbaugh et al., 2010). Проект MetaHIT, обширное метагеномное исследование, направленное на создание исчерпывающего каталога генов, присутствующих в кишечной микробиоте, показал, что из фекалий 124 человек было обнаружено, что 18 видов являются общими для всех людей, а 57 присутствовали у ≥90 человек. % особей (Qin et al., 2010). Среди этих 57 видов наиболее многочисленными были представители типов Bacteroidetes и Firmicutes, однако среди отдельных особей наблюдались до 2000-кратные различия в относительной численности видов. Фекальные энтеробактерии, которые в основном состоят из Escherichia coli , являются субдоминантными бактериями, составляющими от 10 8 до 10 9 колониеобразующих единиц (КОЕ) на грамм фекалий.

    Барьерный эффект регулирует плотность колонизации среди бактериальных популяций кишечной микробиоты

    Кишечная микробиота в основном состоит из прокариот, даже если присутствуют и эукариоты, такие как грибы.Тем не менее, кишечная микробиота играет роль органа у человека и обеспечивает различные преимущества своему хозяину. Одним из преимуществ является барьерный эффект или устойчивость к колонизации, которая относится к способности кишечной микробиоты предотвращать устойчивую колонизацию экзогенными бактериями (Ducluzeau et al. , 1977; Vollaard and Clasener, 1994). Большинство проглоченных бактерий проходят только через пищеварительный тракт и не колонизируют пациента в течение значительного периода времени (Buck and Cooke, 1969; Cooke et al., 1972). Барьерный эффект в основном основан на том факте, что эндогенная кишечная микробиота оставляет очень мало ниш (доступных питательных веществ и мест прикрепления) для использования экзогенными бактериями (Vollaard and Clasener, 1994). Кишечная микробиота также участвует в поддержании гомеостаза эпителия кишечника (Rakoff-Nahoum et al., 2004) и способствует ангиогенезу (Stappenbeck et al., 2002). Более того, была предложена связь между кишечной микробиотой и метаболическими нарушениями; в частности, низкое видовое разнообразие кишечной микробиоты было связано с такими заболеваниями, как ожирение, воспалительные заболевания кишечника, атопия и диабет (Ley et al., 2005; Тернбо и др., 2006 г.; Раунд и Мазманян, 2009 г.; Цинь и др., 2012).

    Кишечная микробиота является огромным резервуаром генов резистентности

    Секвенирование нового поколения еще не изменило способ исследования устойчивости к антибиотикам, возможно, потому, что гены устойчивости, которые могут содержаться в субдоминантных бактериях, остаются недоступными для современных методов секвенирования (Lagier et al. , 2012b). Однако кишечный тракт является основным резервуаром устойчивых к антибиотикам бактерий, в том числе бактерий с естественной устойчивостью и бактерий с приобретенными генами, придающими устойчивость, переносимыми мобильными генетическими элементами, такими как плазмиды, конъюгативные транспозоны или интегративные и конъюгативные элементы (ICEs; Sommer et al., 2009). Разнообразие генов резистентности среди кишечных бактерий (т. е. кишечного резистома) нельзя эффективно оценить с помощью обычных методов, основанных на культивировании на агаризованной среде с добавлением антибиотиков, поскольку большинство кишечных бактерий нельзя культивировать обычными методами. Использование различных питательных сред, атмосферных условий и идентификация с помощью масс-спектрометрии («культуромика») позволило составить реестр видов бактерий, включая многие новые виды кишечной микробиоты, в количестве, даже превышающем количество, обнаруженное с помощью пиросеквенирования (Lagier et al., 2012а). До сих пор этот метод не рассматривал вопрос о глобальной устойчивости микробиоты к антибиотикам.

    В настоящее время лучшее описание разнообразия присутствующих генов устойчивости было получено с использованием независимых от культуры методов (Sommer et al., 2009). Соммер и др. (2009) клонировали метагеном образцов фекалий в восприимчивую E. coli и высевали его на агаризованную среду с добавлением различных антибиотиков. Применительно к ночной аэробной культуре фекалий 95% идентифицированных генов имели> 90% нуклеиновую идентичность с последовательностями в GenBank, обнаруженными в патогенных бактериях.В самом деле, неоднократно сообщалось, что гены, идентифицированные в аэробной фракции, встречаются на мобильных генетических элементах 6′)-Ib , bla AmpC ] обнаружены в патогенных бактериях, таких как энтеробактерии. И наоборот, при применении к метагеному фекалий без предшествующей аэробной культуры средняя общая идентичность снизилась до 60,7%. Таким образом, кишечный резистом можно разделить на (i) «резидентный» резистом, состоящий из генов устойчивости, естественно присутствующих в постоянных членах кишечной микробиоты, таких как ген бета-лактамазы из Bacteroides sp.и (ii) вариабельный резистом, состоящий из экзогенных генов, присутствующих у транзиторных бактерий или приобретенных путем латерального переноса (Wellington et al., 2013). Обогащение вариабельного резистома происходит при попадании резистентных бактерий через пищу (Ruimy et al., 2010) или фекальные опасности (Tangden et al., 2010). Хотя экзогенные бактерии могут не колонизироваться из-за барьерного эффекта кишечной микробиоты (также называемого «резистентностью к колонизации»), их гены устойчивости могут быть переданы резидентным бактериям посредством горизонтального переноса генов во время транзита (Duval-Iflah et al., 1980).

    Энтеробактерии с множественной лекарственной устойчивостью: в центре внимания бета-лактамы

    Антибиотики широко используются с 1950-х годов, при этом параллельно увеличивается доля резистентных бактерий (Clatworthy et al. , 2007). Действительно, бактерий не стало больше и не меньше с тех пор, как появились антибиотики; тем не менее, есть более устойчивые бактерии. Между 1950 и 1980 годами постоянное открытие новых и более сильнодействующих антибиотиков давало медицине постоянное преимущество перед ростом устойчивости бактерий.Пока новые антибиотики были доступны на регулярной основе, резистентность не была реальной проблемой, потому что у клиницистов всегда были препараты, к которым бактерии были восприимчивы для лечения пациентов. Тем не менее, сопротивление никогда не снижалось, и оно получило выгоду от обширных международных обменов, распространявшихся по всему миру (MacPherson et al., 2009). Между тем разработка новых эффективных антибиотиков почти прекратилась (Spellberg et al., 2004). Эффективность бета-лактамов, наиболее широко используемого семейства антибиотиков во всем мире, в настоящее время подвергается сомнению из-за распространения так называемых «плохих микробов», например.g., энтеробактерии, Pseudomonas aeruginosa и Acinetobacter baumannii , которые продуцируют бета-лактамазы широкого спектра действия (таблица 1; Peterson, 2009). До начала 2000-х годов такие резистентные бактерии выделялись почти исключительно в медицинских учреждениях и не поражали пациентов в сообществе. Были разработаны успешные меры по борьбе с их распространением в медицинских учреждениях, которые в настоящее время являются частью обычной медицинской помощи (Lucet et al., 1999). Однако ситуация резко изменилась с появлением и распространением в сообществе энтеробактерий, продуцирующих бета-лактамазы расширенного спектра СТХ-М-типа (БЛРС; Pitout, Laupland, 2008).Встречаемость бета-лактамаз CTX-M особенно заметна в развивающихся странах, возможно, из-за неконтролируемого потребления антибиотиков и субоптимальных гигиенических условий жизни (Ruppe et al., 2009; Woerther et al., 2011).

    ТАБЛИЦА 1. Основные приобретенные бета-лактамазы, продуцируемые грамотрицательными бациллами кишечной микробиоты.

    Терапевтические возможности для пациентов, инфицированных ESBL-продуцирующими энтеробактериями (ESBL-E), по-прежнему ограничены несколькими антибиотиками, включая карбапенемы. Таким образом, рост ESBL-E подпитывает цикл повышенного потребления карбапенемов. Этот цикл приводит к диссеминации резистентных к карбапенемам энтеробактерий (CRE). Устойчивость энтеробактерий к карбапенемам возникает либо за счет потери порина (Skurnik et al., 2010), либо за счет фермента, гидролизующего карбапенем («карбапенемаза»; Queenan and Bush, 2007; Nordmann et al., 2009; Kumarasamy et al., 2010; Poirel et al. ., 2012). Есть две основные проблемы, связанные с CRE. Во-первых, карбапенемазы являются производными бета-лактамаз классов A, B и D, и некоторые из них неоднократно обнаруживались у пациентов, не госпитализировавшихся в анамнезе или не выезжавших за границу (Vaux et al., 2011) или в окружающей среде, например, в водопроводной воде в Индии (Walsh et al., 2011). Распространение CRE в сообществе было бы чрезвычайно трудно остановить, как это наблюдается для CTX-M. Во-вторых, очень немногие антибиотики не обладают активностью в отношении CRE, а инфекции, вызванные некоторыми из этих бактерий, не поддаются лечению с помощью имеющегося у нас арсенала средств. ВОЗ классифицировала устойчивость к антибиотикам как одну из трех основных современных угроз для здоровья. Более эффективный контроль ESBL-E должен привести к уменьшению использования карбапенемов, что, в свою очередь, должно замедлить распространение карбапенемаз.

    Антибиотики как причина изменения плотности кишечной колонизации резистентных бактерий

    Количественное воздействие: потеря разнообразия

    Действие антибиотиков на микробиоту кишечника зависит от (i) концентрации антибиотика в толстой кишке (люминальной и слизистой) и/или его активных метаболитов и (ii) активности этих концентраций в отношении присутствующих видов бактерий. Рост восприимчивых бактерий будет либо сдерживаться (бактериостатический эффект), либо погибать (бактерицидный эффект; Dethlefsen et al., 2008; Антонопулос и др., 2009). Таким образом, степень и стойкость воздействия антибиотиков на кишечную микробиоту в значительной степени зависят от лекарств (Nord et al., 1984; Taur et al., 2012). Даже антибиотики одного и того же семейства и спектра действия могут оказывать очень разное действие в зависимости от скорости их кишечной экскреции (Brautigam et al., 1988; Michea-Hamzehpour et al., 1988). Используя секвенирование следующего поколения, Детлефсен и Релман (2011) точно наблюдали разнообразие фекалий трех здоровых субъектов в течение 300 дней, в течение которых они получали 2 × 5-дневные курсы ципрофлоксацина, на 60-й и 250-й дни.Ципрофлоксацин вызывал потерю разнообразия и сдвиг в составе сообщества, происходящий в течение 3–4 дней после начала приема препарата. Этот эффект был несколько неожиданным, поскольку большая часть микробиоты состоит из анаэробов, слабочувствительных к ципрофлоксацину (Nord and Edlund, 1989). Однако концентрации ципрофлоксацина, которые накапливаются в толстой кишке во время лечения (Fantin et al., 2009), настолько высоки, что, скорее всего, превышают минимальные ингибирующие концентрации. На устранение возмущения, вызванного использованием антибиотиков, ушли недели; кроме того, состав микробиоты кишечника оставался измененным по сравнению с исходным состоянием.

    У новорожденных, которых лечили комбинацией ампициллина и гентамицина, типы Actinobacteria и Firmicutes, включая бактерии с потенциально полезными свойствами ( Bifidobacterium и Lactobacillus ), были заменены Proteobacteria, включая Enterobacteriaceae (Fouhy et al., 2012). Этот эффект может быть важен, учитывая, что Proteobacteria обогащены мобильными генетическими элементами, включая гены, кодирующие устойчивость к антибиотикам (Baquero et al., 2013).Увеличение Proteobacteria сохранялось через 8 недель. Действительно, у пациентов, перенесших аллогенную трансплантацию гемопоэтических стволовых клеток, метронидазол (антибиотик с широким спектром действия против анаэробов) сильно снижал разнообразие кишечной микробиоты (Taur et al., 2012). У мышей, получавших комбинацию амоксициллина, метронидазола и висмута, состав кишечной микробиоты был изменен, но расстройство разрешилось в течение 2 недель; напротив, у мышей, получавших цефоперазон, цефалоспорин широкого спектра действия, выздоровление заняло примерно 6 недель (Antonopoulos et al. , 2009). Таким образом, устойчивость состава кишечной микробиоты, вероятно, будет различаться в зависимости от типа назначаемого антибиотика.

    Качественное воздействие: эффект потери барьера

    Как описано выше, барьерный эффект в основном вызывают анаэробы (Ducluzeau et al., 1977; Vollaard and Clasener, 1994). Таким образом, антибиотики с высокой активностью в отношении анаэробов, такие как клиндамицин, сильно влияют на способность микробиоты предотвращать колонизацию экзогенными микроорганизмами (van der Waaij et al., 1971). В исследовании Donskey et al. (2000), 13 ванкомицин-резистентных энтерококков (VRE)-носителей получали антибиотики, активные в отношении анаэробов, а 10 VRE-носителей получали антибиотики, слабо активные в отношении анаэробов. Поразительно, что средняя плотность ВРЭ (выраженная в log КОЕ/г фекалий) значительно увеличилась (на 2,2 log) у пациентов, получавших антибиотики, активные в отношении анаэробов, тогда как средняя плотность снизилась на 0,6 log у пациентов, получавших антибиотики с минимальной активность в отношении анаэробов. В последующем исследовании та же группа сообщила, что плотность резистентных грамотрицательных бактерий также увеличивалась при воздействии антибиотиков, которые были активны против анаэробов (Bhalla et al., 2003). В последнем случае устойчивые бактерии заняли ниши, которые, по-видимому, были оставлены анаэробами (рис. 1).

    РИСУНОК 1. Схематическое представление эффектов различных схем антибиотикотерапии на кишечную микробиоту в отношении энтеробактерий с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУЭ). Синие, зеленые и красные кружки обозначают анаэробы, чувствительные к антибиотикам энтеробактерии и MDRE соответственно. (A,B) Антибиотики, активные против анаэробов (например, метронидазол, клиндамицин, ванкомицин) в составе MDRE-не носителя (A) и в составе MDRE-носителя (B) . (C,D) Антибиотики, не обладающие активностью в отношении анаэробов, но активные в отношении энтеробактерий (например, фторхинолоны, цефепим, котримоксазол) в составе MDRE-не носителя (C) и в составе MDRE-носителя ( Г) . (E) Антибиотики, обладающие активностью как против анаэробов, так и против энтеробактерий (например, цефтриаксон, ко-амоксиклав) в составе носителя MDRE. DC, плотность колонизации MDRE; RA, относительная распространенность MDRE.

    Барьерный эффект также можно изучить, рассмотрев один вид, например E. coli . У здоровых добровольцев популяция E. coli состоит из переменного количества клонов разной численности: доминантных и субдоминантных клонов (Lidin-Janson et al., 1978). Когда эти штаммы E. coli имеют разную чувствительность, воздействие антибиотиков изменит их соответствующие пропорции и будет способствовать росту резистентных штаммов по сравнению с восприимчивыми (рис. 1). Недавно сообщалось об этом явлении для фторхинолонов, которые вызывают резкое снижение общего количества кишечных энтеробактерий во время лечения. Доступные ниши затем могут быть заняты резистентными энтеробактериями, которые изначально присутствовали в низких концентрациях в фекалиях (Fantin et al. , 2009) или в результате нового приобретения (de Lastours et al., 2012). Если общее количество энтеробактерий остается неизменным, то увеличивается относительная численность резистентных энтеробактерий (рис. 1).

    Последствия повышенной плотности колонизации для инфекций

    Антибиотики повышают риск инфекций, вызванных резистентными энтеробактериями

    Несколько исследований показали, что пациенты с инфекциями, вызванными резистентными бактериями, в последнее время с большей вероятностью принимали антибиотики (Ben-Ami et al., 2009). Действительно, связь между воздействием антибиотиков и устойчивой к антибиотикам инфекцией может заключаться в кишечной микробиоте, поскольку антибиотики способствуют избыточному росту резистентных бактерий (т. е. увеличивают плотность резистентных бактерий). Интересно, что связь между применением антибиотиков и инфекциями, вызванными резистентными бактериями, также обнаружена для антибиотиков, мало влияющих на анаэробы, например котримоксазола или хинолонов, что позволяет предположить, что не только чрезмерный рост резистентных бактерий в нишах, оставленных анаэробами пустыми, увеличивает риск заражения резистентными бактериями, но более вероятно увеличение относительной численности резистентных бактерий (т. е., увеличение доли резистентных бактерий) в определенных нишах (рис. 1). MDRE обладают широкой устойчивостью к антибиотикам, причем не только к бета-лактамам, но и ко многим другим антибиотикам, включая, среди прочего, фторхинолоны, аминогликозиды или ко-тримоксазол (Pitout, 2009). Таким образом, МДРЭ могут разрастаться и повышать риск их вовлечения в дальнейшее инфицирование практически при любом воздействии антибиотиков.

    Инфекции мочевыводящих путей

    Инфекции мочевыводящих путей (ИМП) являются наиболее распространенными бактериальными инфекциями (Hooton, 2012) и чаще всего вызываются энтеробактериями, особенно E.палочка . Имеются некоторые свидетельства того, что в большинстве случаев заражающий клон происходит из кишечной микробиоты (Yamamoto et al., 1997), даже если его не всегда удается обнаружить в стуле при появлении симптомов (Moreno et al., 2008). . Конкретные штаммы E. coli обладают способностью (благодаря факторам вирулентности) колонизировать уретру и мочевой пузырь, вызывая цистит; другие способны далее колонизировать мочеточник, вызывая пиелонефрит (Plos et al. , 1995). Согласно этой «теории вирулентности», некоторые штаммы E.coli может вызывать ИМП, даже если они субдоминируют в кишечнике (низкая относительная распространенность). В качестве альтернативы, относительная численность различных клонов E. coli , присутствующих в фекалиях, также может играть ключевую роль в патогенезе ИМП, поскольку доминантный клон E. coli будет иметь максимальную вероятность колонизировать мочевыводящие пути (Moreno et al., 2008). У 42 женщин с циститом, вызванным E. coli , Moreno et al. (2008) сравнили штамм, вызывающий ИМП, с 30 случайно выбранными колониями из сопутствующих образцов стула.У 90% женщин клоны мочи обнаруживались в кале. У 71% женщин клон мочи, который присутствовал в фекалиях, также был доминирующим клоном фекалий. Клоны мочи преимущественно принадлежали к филогруппам В2 и D и имели повышенное содержание факторов уровирулентности. Для одного данного фекального клона предикторами инфекции было то, что клон мочи принадлежал к филогруппе B2 и был доминирующим. Таким образом, результаты этого исследования примирили теории доминирования и вирулентности.

    Бактериемия

    Транслокация определяется как попадание жизнеспособных местных бактерий из желудочно-кишечного тракта в мезентериальные лимфатические узлы (Berg and Garlington, 1979).Этот проход является первым шагом для бактерий, которые оседают в других местах, таких как кровоток, или вызывают вторичные формы инфекций, например, в сердечных клапанах. Бактериальная транслокация может быть частью нормальных физиологических процессов у здоровых людей, но в ограниченной степени и без вредных последствий. Напротив, устойчивая транслокация наблюдается у субъектов со специфическими дефицитами, такими как нейтропения, голодание или геморрагический шок, и затем приводит к тяжелым септическим последствиям (Tancrede and Andremont, 1985; Youssef et al., 1998). Ключевым моментом, определяющим бактериальную транслокацию, является плотность кишечника: транслоцирующие бактерии в основном доминируют в кишечной микробиоте (Youssef et al. , 1998; Taur et al., 2012). Кроме того, сообщалось о транслокации энтеробактерий у иммунокомпетентных мышей, подвергшихся воздействию пенициллина, клиндамицина и метронидазола (Berg, 1981). В том же отчете измеренная плотность энтеробактерий в кишечнике увеличилась на 3–5 log. Таким образом, антибиотики, увеличивающие плотность резистентных бактерий, увеличивают риск их транслокации.

    Перекрестная передача от пациента к пациенту

    В упомянутом выше исследовании Donskey et al. (2000), окружающая среда 10 пациентов с ВРЭ была исследована на наличие ВРЭ. Образцы окружающей среды от 21 пациента были проанализированы и сопоставлены в соответствии с плотностью VRE в кишечнике. Поразительно, но при плотности менее 4 log КОЕ/г стула ВРЭ были обнаружены в среде пациента только в одном из девяти наборов образцов (11%). И наоборот, когда плотность составляла ≥4 log КОЕ/г стула, VRE обнаруживались в 10 из 12 наборов (83%).Другие исследования показали, что пациенты могут заразиться устойчивыми бактериями от бывшего обитателя комнаты в результате сохранения бактерий на поверхностях окружающей среды (Datta et al. , 2011). Хотя ни одно исследование не показало, что перекрестная передача происходит реже, когда плотность устойчивых бактерий была низкой, результаты Donskey et al. (2000) поддерживают это мнение. На сегодняшний день данные по MDRE отсутствуют.

    Перспективы: как снизить плотность колонизации резистентных бактерий (таблица 2; рисунок 2)

    Селективное обеззараживание пищеварительного тракта

    ТАБЛИЦА 2.Варианты модуляции плотности и относительной численности энтеробактерий с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУЭ) в кишечной микробиоте.

    РИСУНОК 2. Схематическое изображение растворов, используемых для поддержания низкой плотности колонизации энтеробактерий с множественной лекарственной устойчивостью в кишечной микробиоте. Синий, зеленый и красный, соответственно, представляют анаэробы, чувствительные к антибиотикам энтеробактерии и MDRE. (A) Селективная дезинфекция пищеварительного тракта (SDD) уничтожает все энтеробактерии, включая MDRE. (B) Трансплантация фекальной микробиоты (ТФМ) восстанавливает исходную кишечную микробиоту или кишечную микробиоту от здорового донора после вызванных антибиотиками нарушений. (C) Инактивация антибиотиков в толстой кишке (ACI) инактивирует антибиотики и их остатки, когда они достигают толстой кишки. (D) Программа рационального использования антибиотиков (ASP) отдает предпочтение антибиотикам с минимальным воздействием на микробиоту кишечника.

    Селективное обеззараживание пищеварительного тракта (СДД) направлено на удаление МДРЕ из просвета кишечника и предотвращение дальнейшего инфицирования и распространения.При SDD пациент получает перорально и/или парентерально антибиотики широкого спектра действия в течение короткого времени с целью эрадикации большинства потенциально патогенных бактерий и/или резистентных бактерий из кишечной микробиоты, при этом максимально щадя анаэробы. SDD в основном использовался для элиминации всех энтеробактерий у пациентов с риском инфекций, например, в онкогематологии и интенсивной терапии. В 1985 году SDD успешно применялась во Франции для борьбы с крупной вспышкой, связанной с MDRE (Brun-Buisson et al., 1989). Схема SDD включала пероральный прием неомицина, колистина и налидиксовой кислоты. Частота инфекций, вызванных MDRE, снизилась, но общая частота внутрибольничных инфекций не уменьшилась.

    Совсем недавно сравнивали два режима деконтаминации: селективную деконтаминацию ротоглотки (SOD: ротоглоточное местное введение тобрамицина, колистина и амфотерицина B, противогрибкового агента) и SDD (SOD + внутривенное введение цефотаксима), каждый из которых вводили в течение 4 дней (de Смет и др., 2011). SDD и SOD вызвали небольшое снижение смертности по сравнению с контрольной группой.Неожиданно у пациентов, получавших SDD, было меньше энтеробактерий, устойчивых к ципрофлоксацину, цефтазидиму или аминогликозидам, чем в группе стандартного лечения. В более позднем исследовании авторы показали, что при отсутствии грамотрицательных бацилл в кишечной микробиоте частота бактериемии, вызванной грамотрицательными бациллами, снижалась в три раза (Oostdijk et al. , 2011). Однако, если пациенты продолжали колонизироваться, частота бактериемии не отличалась от таковой у пациентов, получавших стандартную помощь (Oostdijk et al., 2011).

    Недавно опубликованный анализ post hoc был сосредоточен на подгруппе из 507 пациентов с определяемыми грамотрицательными бациллами в кишечной микробиоте до SDD (Oostdijk et al., 2012). Как и ожидалось, показатели эрадикации энтеробактерий различались в зависимости от характера резистентности. Разница была статистически значимой для резистентности к аминогликозидам (62% против 81% в группе стандартного лечения; p <0,05), но была отмечена только тенденция к устойчивости к цефалоспоринам третьего поколения (73% против 81%).80% в группе стандартного ухода; р = 0,053). В исследовании не упоминалось, были ли уничтожены резистентные к колистину бактерии или нет. Действительно, SDD поднимает вопрос об использовании антибиотика последней инстанции, колистина, с риском выбора MDRE в микробиоте, которая также будет устойчива к препарату (Kumarasamy et al. , 2010). До сих пор SDD в основном изучался в странах с низкой распространенностью MDRE (de Smet et al., 2011; Overdewest et al., 2011), и этот риск может быть намного выше в странах, где он высок.

    В исследовании, проведенном в Израиле, стране с высокой распространенностью бактерий, продуцирующих карбапенемазы типа Klebsiella pneumoniae (KPC), была проверена 7-дневная схема колистин + гентамицин SDD у пациентов, колонизированных такими бактериями (Saidel-Odes и др., 2012). Результаты показали, что на 7-й день (в конце SDD) бактерии, продуцирующие KPC, больше не обнаруживались в фекалиях у 61% пациентов по сравнению с 16% в группе плацебо. Тем не менее, когда SDD был прекращен, бактерии, продуцирующие KPC, снова могли быть обнаружены у некоторых ранее отрицательных пациентов, что позволяет предположить, что концентрации этих бактерий были ниже предела обнаружения культуры во время применения SDD.Тем не менее, поддержания низких концентраций MDRE в кишечнике при отсутствии полной эрадикации может быть достаточно для предотвращения дальнейших инфекций или перекрестной передачи. Интересно, что среди извлеченных KPC-продуцирующих бактерий не возникло резистентности к колистину или гентамицину.

    Инактивация антибиотиков в кишечнике

    Вместо того, чтобы убивать устойчивые бактерии, другим подходом было бы предотвращение их чрезмерного роста путем инактивации антибиотиков в кишечнике во время лечения.Вводимые перорально антибиотики в основном всасываются в проксимальном отделе тощей кишки, однако их часть достигает толстой кишки, где плотность бактерий максимальна. Вводимые парентерально антибиотики фильтруются печенью, и часть их выделяется через желчный пузырь в тощую кишку, а затем достигает толстой кишки. Таким образом, возникла концепция создания препаратов или бета-лактамаз, способных инактивировать антибиотики в толстой кишке, но не раньше.

    Защитный эффект рекомбинантной бета-лактамазы P1A был оценен у 34 добровольцев, принимавших ампициллин (Tarkkanen et al., 2009). В группе ампициллина без P1A в кишечной микробиоте было отмечено снижение Bifidobacterium , Streptococcus , Lactobacillus и увеличение E. coli и дрожжей. Наоборот, в группе ампициллин + Р1А существенных изменений в составе кишечной микробиоты не наблюдалось. Кроме того, относительное количество резистентных к ампициллину E. coli увеличилось с 2,1% в начале исследования до >72,7% на 5-й день только при применении ампициллина, в то время как в группе ампициллин + P1A оно оставалось ниже 10%.В дополнение к целенаправленным стратегиям инактивации было показано, что адсорбенты, такие как введение активированного угля в толстую кишку, эффективны для улавливания ципрофлоксацина на крысиной модели (Khoder et al., 2010). Ожидается, что дальнейшие клинические исследования позволят оценить эффективность такой стратегии.

    Пробиотики и трансплантация фекальной микробиоты

    Пробиотики определяются как живые микроорганизмы, которые могут приносить пользу здоровью своего хозяина. Наиболее часто используемыми пробиотиками являются молочнокислые бактерии, , бифидобактерии , E.coli Nissle 1917 или Saccharomyces boulardii , дрожжи. Неизвестно, могут ли эти пробиотики оказывать барьерное действие на резистентные бактерии. В исследовании, проведенном в Новой Зеландии, E. coli Nissle конкурировали с фторхинолонорезистентной E. coli у пожилых жителей, и результаты показали, что в конечном итоге не было различий в отношении носительства фторхинолонорезистентной E. coli . между группой Nissle и группой плацебо (Tannock et al., 2011). Еще одна растущая обеспокоенность по поводу пробиотиков заключается в том, что по-прежнему мало доказательств того, что массовое употребление одного вида может в значительной степени восстановить всю кишечную микробиоту. Другим потенциальным способом восстановления микробиоты является трансплантация фекальной микробиоты (ТФМ), под которой понимается процесс закапывания жидкой суспензии стула от здорового донора в желудочно-кишечный тракт пациента для восстановления кишечной микробиоты сразу после любого нарушения, такого как что вызвано антибиотиками.

    При содержании мышей с кишечной микробиотой, пораженной антибиотиками, в клетках с мышами без предшествующего воздействия антибиотиков наблюдалось более быстрое восстановление кишечной микробиоты. Было высказано предположение, что это произошло из-за передачи нормальной микробиоты мышам, получавшим антибиотики, вероятно, посредством копрофагии (Antonopoulos et al., 2009). У людей ТФМ продемонстрировала высокую эффективность у пациентов с рецидивирующими инфекциями, вызванными Clostridium difficile (Gough et al., 2011; van Nood et al., 2013). Основным ограничением ТФМ является его очевидное отталкивание, которое можно преодолеть с помощью ректальных инстилляций вместо оральных путей (Bakken, 2009). Еще одно предостережение заключается в том, что вводимые образцы фекалий могут содержать необнаруженные патогены. Это предостережение можно обойти путем автоматического хранения (Tosh and McDonald, 2012) или с помощью препарата, содержащего смесь определенных штаммов (Hamilton et al., 2012). Недавно это было сделано для снижения плотности VRE у мышей (Ubeda et al., 2013) и MDRE у кур (Nuotio et al., 2013). Однако эти подходы до сих пор не использовались на людях. Если данные подтверждают эффективность FMT в разрешении инфекций C. difficile , необходимы исследования, оценивающие его эффективность в контексте вспышек MDRE для снижения риска их передачи и инфекций.

    Программы рационального использования антибиотиков

    Еще одна стратегия борьбы с вызванными приемом антибиотиков возмущениями и поддержания низкой плотности MDRE заключается в улучшении использования антибиотиков с помощью программ рационального использования антибиотиков (ASP; MacDougall and Polk, 2005).Действительно, эти программы могут быть полезны для кишечной микробиоты на трех уровнях: (i) избегать назначений антибиотиков, когда применение антибиотиков не оправдано (Willemsen et al., 2010), (ii) сократить использование эмпирических антибиотиков широкого спектра до максимально узкий спектр, руководствуясь тестами на чувствительность к антибиотикам (Cosgrove et al., 2007), и (iii) по возможности выбирать антибиотик с наименьшим воздействием на микробиоту кишечника (Lesprit and Brun-Buisson, 2008). В Кокрановском обзоре было показано, что ASP снижают общую устойчивость к антибиотикам, а также C. difficile , что позволяет предположить их роль в сохранении микробиоты кишечника (Davey et al., 2005). Чтобы еще больше сократить использование антибиотиков широкого спектра действия, разрабатываются новые быстрые диагностические тесты, которые выявляют признаки резистентности штаммов в клинических образцах или фекалиях и вызывают интерес у клиницистов (Cuzon et al., 2012).

    Заключение

    Кишечная микробиота должна рассматриваться как орган, с которым плохо обращаются при каждом введении антибиотика.Кишечная микробиота обеспечивает своим хозяевам несколько преимуществ, включая устойчивость к колонизации. Когда он нарушается, резистентные бактерии разрастаются в пустых нишах. Хотя на сегодняшний день доступно мало данных, похоже, что высокая плотность MDRE может увеличить риск дальнейшего инфицирования и передачи инфекции между пациентами. Действительно, контроль уровня МДЭ может стать ключевым моментом в плане лечения в ближайшие несколько лет; ожидаются дальнейшие исследования в этом отношении. С этой точки зрения перспективны простые методы измерения этих количественных параметров, такие как количественная ПЦР вместо серийных разведений (Lerner et al., 2013).

    Заявление о конфликте интересов

    Этьен Руппе: конфликта нет. Антуан Андремон является научным консультантом компании DaVolterra (www.davolterra.com) в рамках французского закона об инновациях и исследованиях.

    Подтверждение

    Работа выполнена при поддержке программы Oseo-Nosobio (www.nosobio.fr).

    Сноски

    Каталожные номера

    Антонопулос, Д. А., Хьюз, С. М., Моррисон, Х. Г., Шмидт, Т. М., Согин, М.Л. и Янг В.Б. (2009). Воспроизводимая динамика сообщества желудочно-кишечной микробиоты после воздействия антибиотиков. Заразить. Иммун. 77, 2367–2375.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Бен-Ами, Р., Родригес-Бано, Дж., Арслан, Х., Питу, Дж. Д., Квентин, К., Кальбо, Э. С. , и соавт. (2009). Многонациональное исследование факторов риска инфицирования энтеробактериями, продуцирующими бета-лактамазы расширенного спектра действия, у негоспитализированных пациентов. клин. Заразить. Дис. 49, 682–690.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Берг, Р. Д. (1981). Стимулирование транслокации кишечных бактерий из желудочно-кишечного тракта мышей при пероральном лечении пенициллином, клиндамицином или метронидазолом. Заразить. Иммун. 33, 854–861.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст

    Берг, Р. Д., и Гарлингтон, А. В. (1979). Транслокация некоторых местных бактерий из желудочно-кишечного тракта в мезентериальные лимфатические узлы и другие органы в модели гнотобиотических мышей. Заразить. Иммун. 23, 403–411.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст

    Бхалла А., Пульц Н. Дж., Рэй А. Дж., Хойен С. К., Экштейн Э. К. и Донски С. Дж. (2003). Антианаэробная антибиотикотерапия способствует избыточному росту антибиотикорезистентных, грамотрицательных палочек и ванкомицинрезистентных энтерококков в стуле колонизированных пациентов. Заразить. Хосп. Эпидемиол. 24, 644–649.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Бротигам, Х.Х., Кноте, Х., и Рангунвала, Р. (1988). Влияние цефотаксима и цефтриаксона на флору кишечника и влагалища после однократного профилактического введения при вагинальной гистерэктомии. Наркотики 35 (Приложение 2), 163–168.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Брун-Бюиссон, К., Легран, П., Раусс, А., Ричард, К., Монтраверс, Ф., Бесбес, М., и соавт. (1989). Обеззараживание кишечника для борьбы с внутрибольничными полирезистентными грамотрицательными бациллами. Исследование вспышки в отделении интенсивной терапии .Аня. Стажер Мед. 110, 873–881.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Косгроув, С. Э., Патель, А., Сонг, X., Миллер, Р.Е., Спек, К., Бановец, А., и соавт. (2007). Влияние различных методов обратной связи с клиницистами после обзора антимикробных препаратов после назначения на основе 12 шагов центров по контролю и профилактике заболеваний для предотвращения устойчивости к противомикробным препаратам среди госпитализированных взрослых. Заразить. Хосп. Эпидемиол. 28, 641–646.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Кузон Г., Наас Т., Богартс П., Глупчински Ю. и Нордманн П. (2012). Оценка ДНК-микрочипа для быстрого обнаружения β-лактамаз расширенного спектра (TEM, SHV и CTX-M), плазмид-опосредованных цефалоспориназ (CMY-2-подобных, DHA, FOX, ACC-1, ACT/MIR и CMY) -1-подобный/МОХ) и карбапенемазы (KPC, OXA-48, VIM, IMP и NDM). J. Антимикроб. Чемотер. 67, 1865–1869 гг.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Датта, Р., Platt, R., Yokoe, D. S., and Huang, S.S. (2011). Вмешательство в очистку окружающей среды и риск заражения организмами с множественной лекарственной устойчивостью от предыдущих обитателей помещения. Арх. Стажер Мед. 171, 491–494.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Дэйви П., Браун Э., Фенелон Л., Финч Р., Гулд И., Хартман Г. и др. (2005). Вмешательства, направленные на улучшение практики назначения антибиотиков стационарным больным. Кокрановская система базы данных. преп. CD003543.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    де Ластур, В., Камбау, Э., Гийяр, Т., Маркад, Г., Чау, Ф., и Фантен, Б. (2012). Разнообразие индивидуальных динамических паттернов возникновения резистентности к хинолонам у Escherichia coli из фекальной флоры здоровых добровольцев, подвергшихся воздействию ципрофлоксацина. Дж. Заражение. Дис. 206, 1399–1406.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    де Смет, А. M., Kluytmans, J.A., Block, H.E., Mascini, E.M., Benus, R.F., Bernards, A.T., et al. (2011). Селективная деконтаминация пищеварительного тракта и селективная деконтаминация ротоглотки и устойчивость к антибиотикам у пациентов в отделениях интенсивной терапии: открытое, групповое, рандомизированное, перекрестное исследование. Ланцет Заражение. Дис. 11, 372–380.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Детлефсен, Л., Хьюз, С., Согин, М.Л., и Релман, Д.А. (2008).Всепроникающее воздействие антибиотика на микробиоту кишечника человека , выявленное с помощью глубокого секвенирования 16S рРНК. PLoS Биол. 6:e280. doi: 10.1371/journal.pbio.0060280

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Детлефсен, Л., и Релман, Д. А. (2011). Неполное восстановление и индивидуальная реакция микробиоты дистального отдела кишечника человека на повторное воздействие антибиотиков. Проц. Натл. акад. науч. США 108 (доп.1), 4554–4561.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Домингес-Белло М.Г., Костелло Э.К., Контрерас М., Магрис М., Идальго Г., Фиерер Н. и др. (2010). Способ родоразрешения определяет приобретение и структуру исходной микробиоты в различных средах обитания новорожденных. Проц. Натл. акад. науч. США 107, 11971–11975.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Донски, К.J., Chowdhry, T.K., Hecker, M.T., Hoyen, C.K., Hanrahan, J.A., Hujer, A.M., et al. (2000). Влияние антибактериальной терапии на плотность ванкомицинрезистентных энтерококков в стуле колонизированных больных. Н. англ. Дж. Мед. 343, 1925–1932 гг.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Ducluzeau, R., Ladire, M., Callut, C., Raibaud, P., and Abrams, G.D. (1977). Антагонистический эффект чрезвычайно чувствительных к кислороду клостридий из микрофлоры обычных мышей и Escherichia coli против Shigella flexneri в пищеварительном тракте гнотобиотических мышей. Заразить. Иммун. 17, 415–424.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст

    Дурбан А., Абеллан Дж. Дж., Хименес-Эрнандес Н., Понсе М., Понсе Дж., Сала Т. и др. (2011). Оценка микробного разнообразия кишечника по фекалиям и слизистой прямой кишки. Микроб. Экол. 61, 123–133.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Duval-Iflah, Y., Raibaud, P., Tancrede, C., and Rousseau, M. (1980). R-плазматический перенос от Serratia liquefaciens к Escherichia coli in vitro и in vivo в пищеварительном тракте гнотобиотических мышей, связанный с фекальной флорой человека. Заразить. Иммун. 28, 981–990.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст

    Фантен Б., Дюваль Х., Массиас Л., Алавуан Л., Чау Ф., Рету С. и др. (2009). Дозировка ципрофлоксацина и возникновение резистентности у комменсальных бактерий человека. Дж. Заражение. Дис. 200, 390–398.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Фухи, Ф. , Гинан, К.М., Хасси, С., Уолл, Р., Райан, К.А., Демпси, Э.М., и соавт. (2012). Высокопроизводительное секвенирование выявило неполное кратковременное восстановление микробиоты кишечника младенцев после парентерального лечения антибиотиками ампициллином и гентамицином. Антимикроб. Агенты Чемотер. 56, 5811–5820.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Гоф, Э., Шейх, Х., и Мангес, А. Р. (2011). Систематический обзор трансплантации кишечной микробиоты (фекальная бактериотерапия) при рецидивирующей инфекции Clostridium difficile . клин. Заразить. Дис. 53, 994–1002.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Гамильтон, М. Дж., Вейнгарден, А.Р., Садовски М.Дж. и Хоруц А. (2012). Стандартизированный замороженный препарат для трансплантации фекальной микробиоты при рецидивирующей инфекции Clostridium difficile . утра. Дж. Гастроэнтерол. 107, 761–767.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Ходер, М., Цапис, Н., Домерг-Дюпон, В., Гетен, К., и Фатталь, Э. (2010). Удаление остаточного ципрофлоксацина из толстой кишки у крыс с помощью активированного угля, заключенного в гранулы пектината цинка. евро. Дж. Фарм. науч. 41, 281–288.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Кумарасами, К.К., Толеман, М.А., Уолш, Т.Р., Багариа, Дж., Батт, Ф., Балакришнан, Р., и соавт. (2010). Появление нового механизма устойчивости к антибиотикам в Индии, Пакистане и Великобритании: молекулярное, биологическое и эпидемиологическое исследование. Ланцет Заражение. Дис. 10, 597–602.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Лажье, Дж.С., Армугом Ф., Миллион М., Хьюгон П., Панье И., Роберт С. и др. (2012а). Микробная культуромика: смена парадигмы в изучении микробиома кишечника человека. клин. микробиол. Заразить. 18, 1185–1193.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст

    Лажье, Дж. К., Миллион, М., Хьюгон, П., Армугом, Ф., и Рауль, Д. (2012b). Микробиота кишечника человека : репертуар и вариации. Перед. Клетка. Заразить. микробиол. 2:136. doi: 10.3389/fcimb.2012.00136

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Лернер, А., Романо Дж., Хмельницкий И., Навон-Венеция С., Эдгар Р. и Кармели Ю. (2013). Ректальные мазки подходят для количественной оценки носительства KPC-продуцирующих резистентных к карбапенемам Enterobacteriaceae (CRE). Антимикроб. Агенты Чемотер . 57, 1474–1479.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Лей, Р. Э., Бакхед, Ф., Тернбо, П., Лозупоне, К. А., Найт, Р. Д., и Гордон, Дж. И. (2005). Ожирение изменяет микробную экологию кишечника. Проц.Натл. акад. науч. США 102, 11070–11075.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Лидин-Янсон Г., Кайсер Б., Линкольн К., Оллинг С. и Ведель Х. (1978). Однородность фекальной колиформной флоры нормальных школьниц, характеризующаяся серологическими и биохимическими свойствами. Мед. микробиол. Иммунол. 164, 247–253.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Люсет, Дж. К., Декре, Д., Fichelle, A., Joly-Guillou, M.L., Pernet, M., Deblangy, C., et al. (1999). Борьба с длительной вспышкой энтеробактерий, продуцирующих бета-лактамазы расширенного спектра, в университетской больнице. клин. Заразить. Дис. 29, 1411–1418.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    МакФерсон, Д. В., Гушулак, Б. Д., Бейн, В. Б., Бала, С., Губбинс, П. О., Холтом, П., и др. (2009). Мобильность населения, глобализация и устойчивость к противомикробным препаратам. Аварийный. Заразить. Дис. 15, 1727–1732 гг.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст

    Michea-Hamzehpour, M., Auckenthaler, R., Kunz, J., and Pechere, J.C. (1988). Влияние однократной дозы цефотаксима или цефтриаксона на фекальную флору человека. Двойное слепое исследование . Наркотики 35(Прил. 2), 6–11.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Морено, Э., Андреу, А., Пиграу, К., Кусковски, М., Джонсон, Дж., и Пратс, Г. (2008). Взаимосвязь между штаммами Escherichia coli , вызывающими острый цистит у женщин, и фекальными штаммами E.coli популяция хозяина . Дж. Клин. микробиол. 46, 2529–2534.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Nord, C.E., and Edlund, C. (1989). Клиническое действие новых хинолонов: влияние на нормальную микрофлору. Дж. Чемотер. 1, 18–23.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст

    Нуотио, Л. , Шнейц, К., и Нильссон, О. (2013). Эффект конкурентного исключения в уменьшении появления Escherichia coli , продуцирующих β-лактамазы расширенного спектра действия, в слепой кишке цыплят-бройлеров. Поулт. науч. 92, 250–254.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Оостдейк, Э. А., Де Смет, А. М., Кесечиоглу, Дж., и Бонтен, М. (2012). Деконтаминация цефалоспоринрезистентных энтеробактерий при селективной дезактивации пищеварительного тракта в отделениях интенсивной терапии. J. Антимикроб. Чемотер . 67, 2250–2253.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Остдейк, Э. А., Де Смет, А.М., Кесекиоглу Дж., Бонтен М.Дж. и голландская группа исследователей SOD-SDD. (2011). Роль кишечной колонизации грамотрицательными бактериями как источника реанимационной бактериемии. Крит. Уход Мед. 39, 961–966.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Овердевест И. , Виллемсен И., Рейнсбургер М., Юстас А., Сюй Л., Хоуки П. и др. (2011). Гены бета-лактамаз расширенного спектра Escherichia coli в курином мясе и людях, Нидерланды. Аварийный. Заразить. Дис. 17, 1216–1222.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Pitout, JD (2009). IPSAT P1A, бета-лактамазная терапия класса А для предотвращения индуцированного пенициллином нарушения кишечной микрофлоры. Курс. мнение расследование Наркотики 10, 838–844.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст

    Plos, K., Connell, H., Jodal, U., Marklund, B.I., Marild, S., Wettergren, B., et al. (1995). Кишечный носитель P fimbriated Escherichia coli и предрасположенность к инфекциям мочевыводящих путей у детей раннего возраста. Дж. Заражение. Дис. 171, 625–631.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Qin, J., Li, R., Raes, J., Arumugam, M. , Burgdorf, K.S., Manichanh, C., et al. (2010). Каталог микробных генов кишечника человека, созданный с помощью метагеномного секвенирования. Природа 464, 59–65.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Цинь Дж., Ли Ю., Цай З., Ли С., Чжу Дж., Чжан Ф. и др. (2012). Метагеномное исследование ассоциации кишечной микробиоты при диабете 2 типа. Природа 490, 55–60.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Ракофф-Наум С., Паглино Дж., Эслами-Варзанех Ф., Эдберг С. и Меджитов Р. (2004). Распознавание комменсальной микрофлоры толл-подобными рецепторами необходимо для гомеостаза кишечника. Сотовый 118, 229–241.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Руми Р., Брисабуа А., Бернеде К., Скурник Д., Барнат С., Арле Г., и другие. (2010). Органические и обычные фрукты и овощи содержат эквивалентное количество грамотрицательных бактерий, проявляющих устойчивость к антибактериальным агентам. Окружающая среда. микробиол. 12, 608–615.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Ruppe, E., Hem, S., Lath, S., Gautier, V., Ariey, F., Sarthou, J.L., et al. (2009). Бета-лактамазы CTX-M в Escherichia coli при внебольничных инфекциях мочевыводящих путей, Камбоджа. Аварийный.Заразить. Дис. 15, 741–748.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Сайдель-Одес, Л., Полачек, Х., Пелед, Н., Ризенберг, К., Шлеффер, Ф., Трабелси, Ю., и соавт. (2012). Рандомизированное двойное слепое плацебо-контролируемое исследование селективной деконтаминации пищеварительного тракта с использованием перорального гентамицина и перорального полимиксина Е для эрадикации резистентного к карбапенемам Klebsiella pneumoniae . Заразить. Хосп. Эпидемиол. 33, 14–19.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Скурник Д. , Nucci, A., Ruimy, R., Lasocki, S., Muller-Serieys, C., Montravers, P., et al. (2010). Появление резистентной к карбапенемам гафнии: падение последнего солдата. клин. Заразить. Дис. 50, 1429–1431.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Спеллберг Б., Пауэрс Дж. Х., Брасс Э. П., Миллер Л. Г. и Эдвардс Дж. Э. мл. (2004). Тенденции в разработке противомикробных препаратов: последствия для будущего. клин. Заразить. Дис. 38, 1279–1286.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Стаппенбек Т.С., Хупер Л.В. и Гордон Дж.И. (2002). Регуляция развития кишечного ангиогенеза местными микробами через клетки Панета. Проц. Натл. акад. науч. США 99, 15451–15455.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Stearns, J.C., Lynch, M.D., Senadheera, D.B., Tenenbaum, H.C., Goldberg, M.B., Cvitkovitch, D. G., et al. (2011).Бактериальная биогеография пищеварительного тракта человека. науч. Респ. 1, 170.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Тангден Т., Карс О., Мелхус А. и Лоудин Э. (2010). Поездки за границу являются основным фактором риска колонизации Escherichia coli , продуцирующей бета-лактамазы расширенного спектра типа CTX-M: проспективное исследование с участием шведских добровольцев. Антимикроб. Агенты Чемотер. 54, 3564–3568.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Таннок, Г.В., Тионг И.С., Прист П., Манро К., Тейлор С., Ричардсон А. и соавт. (2011). Тестирование пробиотического штамма Escherichia coli Nissle 1917 (Mutaflor) на его способность уменьшать носительство полирезистентной E. coli пожилыми пациентами в учреждениях длительного ухода . Дж. Мед. микробиол. 60, 366–370.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Таркканен А. М., Хейнонен Т., Йоги Р., Ментула С., Ван Дер Рест М. Э., Донски К.Дж. и др. (2009). Рекомбинантная бета-лактамаза Р1А предотвращает возникновение антимикробной резистентности микрофлоры кишечника здоровых людей при внутривенном введении ампициллина. Антимикроб. Агенты Чемотер. 53, 2455–2462.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Таур, Ю., Ксавье, Дж. Б., Липума, Л., Убеда, К., Голдберг, Дж., Гобурн, А., и соавт. (2012). Доминирование кишечника и риск бактериемии у пациентов, перенесших аллогенную трансплантацию гемопоэтических стволовых клеток. клин. Заразить. Дис. 55, 905–914.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Тернбо, П.Дж., Лей, Р.Е., Маховальд, М.А., Магрини, В., Мардис, Э.Р., и Гордон, Дж.И. (2006). Связанный с ожирением кишечный микробиом с повышенной способностью собирать энергию. Природа 444, 1027–1031.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Тернбо, П. Дж., Айва, К., Фейт, Дж. Дж., Мчарди, А. С., Яцуненко, Т., Ниази Ф. и др. (2010). Организационные, генетические и транскрипционные вариации в глубоко секвенированных кишечных микробиомах однояйцевых близнецов. Проц. Натл. акад. науч. США 107, 7503–7508.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Убеда, К., Буччи, В., Кабальеро, С., Джукович, А., Туссен, Н.К., Эквинда, М., и соавт. (2013). Кишечная микробиота , содержащая Barnesiella , излечивает устойчивые к ванкомицину колонии Enterococcus faecium . Заразить. Иммун . 81, 965–973.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    ван дер Ваай, Д., Бергуис-Де Врис, Дж. М., и Леккеркерк, Л.-В. (1971). Колонизационная резистентность пищеварительного тракта у обычных мышей и мышей, получавших антибиотики. Дж. Хиг. (Лондон.) 69, 405–411.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    ван Нуд, Э. , Вриз, А., Ньюдорп, М., Фуэнтес, С., Зотендаль, Э. Г., Де Вос, В.М. и др. (2013). Дуоденальное вливание донорского кала при рецидивах Clostridium difficile . Н. англ. Дж. Мед . 368, 407–415.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Во, С., Карбон, А., Тиоле, Дж. М., Ярлье, В., и Куаньяр, Б. (2011). Появление Enterobacteriaceae, продуцирующих карбапенемазы, во Франции, с 2004 по 2011 год. Euro Surveill. 16, номер: 19880.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст

    Уолш, Т.Р., Уикс, Дж., Ливермор, Д.М., и Тоулман, Массачусетс (2011). Распространение NDM-1 положительных бактерий в окружающей среде Нью-Дели и его последствия для здоровья человека: исследование распространенности в окружающей среде. Ланцет Заражение. Дис. 11, 355–362.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Wellington, E., Boxall, A., Cross, P. , Feil, E., Gaze, W., Hawkey, P., et al. (2013). Роль природной среды в возникновении антибиотикорезистентности грамотрицательных бактерий. Ланцет Заражение. Дис. 13, 155–165.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Виллемсен И., Ван Дер Койдж Т., Ван Бентем Б., Вилле Дж. и Клютманс Дж. (2010). Целесообразность антимикробной терапии: многоцентровое исследование распространенности в Нидерландах, 2008–2009 гг. Евро Наблюдение. 15, номер: 19715.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст

    Вёртер, П. Л., Анжебо, К., Жакье, Х., Хьюгед, Х. К., Янссенс, А.С., Саяди С. и др. (2011). Массовое увеличение, распространение и обмен генами, кодирующими бета-лактамазы расширенного спектра, среди кишечных энтеробактерий у госпитализированных детей с тяжелым острым недоеданием в Нигере. клин. Заразить. Дис. 53, 677–685.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Ямамото С. , Цукамото Т., Тераи А., Куразоно Х., Такеда Ю. и Йошида О. (1997). Генетические данные, подтверждающие фекально-промежностно-уретральную гипотезу при цистите, вызванном Escherichia coli . Дж. Урол. 157, 1127–1129.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Юсеф М., Аль Шурман А., Чачати Э., Бсоул А. Р. и Андремонт А. (1998). Использование молекулярного типирования для исследования бактериальной транслокации из кишечного тракта у детей с недостаточностью питания и грамотрицательной бактериемией. клин. микробиол. Заразить. 4, 70–74.

    Опубликовано Резюме | Опубликован полный текст | Полный текст перекрестной ссылки

    Границы | Enterobacter aerogenes и Enterobacter cloacae; универсальные бактериальные патогены, противостоящие лечению антибиотиками

    Введение

    Enterobacter — род распространенных грамотрицательных факультативно-анаэробных палочковидных неспорообразующих бактерий, принадлежащих к семейству Enterobacteriaceae . Два его хорошо известных вида, Enterobacter aerogenes и E. cloacae , приобрели клиническое значение в качестве условно-патогенных бактерий и появились в качестве внутрибольничных патогенов у пациентов интенсивной терапии, особенно у тех, кто находится на искусственной вентиляции легких (Mezzatesta et al. ., 2012).

    Enterobacter aerogenes первоначально назывался Aerobacter aerogenes , а позже был включен в род Enterobacter в 1960 году.В 1971 году этот вид было предложено переименовать в Klebsiella mobilis из-за его подвижности, обусловленной перитрихиальными жгутиками, и его генетического родства с родом Klebsiella . Интересно отметить, что фенотипические различия между E. aerogenes и родом Klebsiella включают не только подвижность, но и наличие активности орнитиндекарбоксилазы (ODC) и отсутствие активности уреазы у E. aerogenes (Farmer и другие., 1985). Однако недавно полногеномное секвенирование клинического изолята с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ) (включая колистин) показало возможную реклассификацию вида в род Klebsiella под названием K. aeromobilis (Diene et al. , 2013). E. aerogenes определенного фенотипа можно объяснить горизонтальным приобретением дополнительных генов от других видов Enterobacteriaceae и мобильных элементов, которые быстро интегрировались и транслировались так же легко, как и его собственное наследие предков (Diene et al., 2013). Например, жгутиковые гены и система их сборки были получены в блоке от рода Serratia . Плазмидная конъюгация – это химера транспозонов и генетических элементов (конъюгация, интеграция) различного бактериального происхождения. E. aerogenes также содержит восемь оперонов рРНК и 87 тРНК, связанных со способностью транслировать импортированные гены, которые используют разные кодоны, улучшая его способность использовать свои интегрированные чужеродные гены. E. aerogenes был вовлечен в крупную европейскую вспышку между 1993 и 2003 годами и считается парадигмой условно-патогенных бактерий.

    Виды комплекса E. cloacae широко встречаются в природе, но они также являются патогенами: E. cloacae и E. hormaechei чаще всего выделяют из клинических образцов человека. Так, E. cloacae относится к числу наиболее распространенных Enterobacter sp. вызывает только внутрибольничные инфекции в последнее десятилетие, и много было опубликовано об особенностях антибиотикорезистентности этих микроорганизмов. Несмотря на актуальность E.cloacae как внутрибольничный возбудитель, патогенетические механизмы и факторы, способствующие заболеванию, ассоциированному с комплексом E. cloacae , еще не изучены; это может быть связано с нехваткой и разбросанностью доступной информации. Его способность образовывать биопленки и секретировать различные цитотоксины (энтеротоксины, гемолизины, порообразующие токсины) важны для его патогенности (Mezzatesta et al., 2012). Некоторые генотипы и виды ранее демонстрировали некоторую связь с клиническими образцами, в частности с мочой и мокротой, когда клональные вспышки с представителями E.cloacae встречались редко (Izdebski et al. , 2014). Интересно, что из-за диффузии наиболее часто встречающихся β-лактамаз расширенного спектра (БЛРС) и карбапенемаз у этого вида, E. cloacae теперь стал третьим видом широкого спектра Enterobacteriaceae , вызывающим внутрибольничные инфекции после Escherichia coli и . K. pneumoniae (Potron et al., 2013; Jarlier and INVS, 2014).

    Эпидемиология и инфекции

    Enterobacter aerogenes выделяют в виде клинических образцов человека из дыхательных путей, мочевыводящих путей, крови или желудочно-кишечного тракта (Langley et al., 2001). Эпидемиология этого вида была особенной в Европе: с 1993 г. он регулярно вовлекался во вспышки внутрибольничных инфекций, особенно в Западной Европе (Georghiou et al., 1995; Grattard et al., 1995; Allerberger et al., 1996; Arpin). et al., 1996; Davin-Regli et al., 1996; De Gheldre et al., 1997; Jalaluddin et al., 1998). До 2003 г. E. aerogenes считались важным новым возбудителем МЛУ, особенно в отделениях интенсивной терапии (Bosi et al. , 1999; Chevalier et al., 2008; Рисунок 1). Ситуация 1990-х годов в Европе указывала на распространение эпидемического клона, и с тех пор он широко выявляется в европейских больницах и медицинских учреждениях. Это событие совпало с международным распространением ESBL TEM-24 ( bla TEM-24 ), содержащимся в эпидемической плазмиде (Bosi et al., 1999). Распространенность Enterobacter sp. инфекций в клинических отделениях также увеличилось из-за введения в антибактериальную терапию цефалоспоринов расширенного спектра действия и карбапенемов (Arpin et al., 1996; Анастей и др., 2013). Следствием этой антибиотикотерапии является появление «пан-лекарственных изолятов E. aerogenes », устойчивых к антибиотикам последней линии, таким как карбапенемы, а также к колистину, для которых не было доступных терапевтических вариантов (Chevalier et al., 1999; Thiolas). и др., 2005; Диен и др., 2013). Интересно, что роль механизма оттока в устойчивости E. aerogenes изучалась в течение 8 лет. Это исследование показало заметное увеличение распространенности механизма оттока, чувствительного к ингибитору помпы, в клинических изолятах, собранных в этот период (Chevalier et al., 2008). После появления БЛРС у E. aerogenes и описания мутаций поринов у клинических изолятов эта роль механизма оттока указывает на новый шаг в адаптивной эволюции у E. aerogenes (Charrel et al., 1996; Mallea et al., 1996). и др., 1998; Гайе и др., 2003).

    С 2010 года E. aerogenes во Франции занимает пятое место среди Enterobacteriaceae и седьмое место среди грамотрицательных Bacillus , ответственных за печально известные внутрибольничные инфекции (Carbonne et al., 2013; Фигура 2). Несмотря на присущую ему устойчивость к ампициллину и постоянную экспрессию БЛРС, связанную с другими механизмами резистентности, способствующими фенотипу МЛУ, его распространенность во Франции значительно снизилась (в 20 раз) (Anastay et al., 2013; Jarlier and INVS, 2014). . Его позиция была смещена в контексте внутрибольничных инфекций из-за резкого роста пандемического клона E. coli O25:h5-ST131 наряду с K. pneumoniae и E.cloacae , ESBL и/или штаммы, продуцирующие карбапенемазы. Хотя E. aerogenes чаще вызывает септический шок у пациентов, что приводит к более высокому уровню смертности (Song et al., 2010; Lavigne et al., 2012), E. cloacae в настоящее время является наиболее часто наблюдаемым клиническим изолятом. среди Enterobacter sp. Это может быть связано с распространением актуальных эпидемических плазмид, несущих наиболее распространенные гены резистентности и экспрессирующих новые β-лактамазы или карбапеновые и мазы (рис. 2).

    РИСУНОК 2. Распределение основных видов Enterobacteriaceae -ESBL ( n на 10 000 пациенто-дней): эволюция 2002–2013 гг. по данным французской национальной координации эпиднадзора за MDRB (Carbonne et al., 2013; Jarlier and INVS, 2014) . ENT AER, Enterobacter aerogenes ; ENT CLO, E. cloacae ; ESC COL, E. coli ; KLE PNE, Klebsiella pneumoniae ; TOT ENB, Всего Enterobacteriaceae ; БЛРС, бета-лактамазы расширенного спектра действия.

    Enterobacter cloacae повсеместно распространен в наземной и водной среде (вода, сточные воды, почва и продукты питания). Этот вид встречается в качестве комменсальной микрофлоры в кишечном тракте человека и животных, а также является патогеном для растений и насекомых. Это разнообразие местообитаний отражается генетическим разнообразием E. cloacae (Mezzatesta et al., 2012). В последнее время данные эпидемиологических методов MLST и PFGE выявили мировую циркуляцию нескольких эпидемических клональных комплексов (Izdebski et al., 2014).

    Это также хорошо известный нозокомиальный патоген, вызывающий бактериемию, эндокардит, септический артрит, остеомиелит, инфекции кожи/мягких тканей, а также инфекции нижних дыхательных путей, мочевыводящих путей и внутрибрюшные инфекции (Fata et al., 1996). E. cloacae имеет тенденцию контаминировать различные медицинские, внутривенные и другие медицинские устройства (Dugleux et al., 1991). Внутрибольничные вспышки также были связаны с колонизацией определенного хирургического оборудования и операционных чистящих растворов (Wang et al., 2000). За десять лет неоднократно сообщалось о E. cloacae как внутрибольничном возбудителе в неонатальных отделениях, и было зарегистрировано несколько вспышек инфекции (Fernandez-Baca et al., 2001; Pestourie et al., 2014). В настоящее время изменчивость среди штаммов встречается реже, и вспышки, вызванные клональными E. cloacae , гиперпродуцирующими бета-лактамазу AmpC, и изоляты-носители БЛРС описаны из образцов новорожденных, образцов мочи/фекалий взрослых или из образцов окружающей среды (Pestourie et al., 2014).

    Enterobacter cloacae обладает внутренней устойчивостью к ампициллину, амоксициллину, цефалоспоринам первого поколения и цефокситину вследствие продукции конститутивной β-лактамазы AmpC. Он проявляет высокую частоту ферментативной резистентности к цефалоспоринам широкого спектра действия. Резистентность Enterobacter sp. к цефалоспоринам третьего поколения чаще всего вызывается избыточной продукцией β-лактамаз AmpC, и, таким образом, лечение цефалоспоринами третьего поколения может способствовать отбору мутантов, избыточно продуцирующих AmpC.Сверхпродукция AmpC обусловлена ​​дерепрессией хромосомного гена или приобретением переносимого гена ampC из плазмид или других мобильных элементов. Резистентность, опосредованная плазмидой AmpC, отличается от продукции хромосомных ферментов, поскольку они не индуцируются. Однако они представляют собой проблему из-за растущей распространенности среди клинических изолятов. Фермент придает устойчивость к цефалоспоринам третьего поколения, уреидо- и карбоксипенициллинам и не ингибируется обычными ингибиторами β-лактамаз.Цефалоспорины четвертого поколения сохраняют достаточную активность против дерепрессированных штаммов, но если штаммы также являются продуцентами БЛРС, они становятся устойчивыми к этому классу антибиотиков. Распространенность продуцентов БЛРС и СТХ-М составила примерно 5% изолятов в недавних исследованиях, и БЛРС чаще всего опосредованы плазмидами. Эти характеристики, связанные с частым эндогенным кишечным носительством E. cloacae , могут привести к аномально высоким уровням в кишечнике госпитализированных пациентов, особенно тех, кто получал цефалоспорины (Potron et al., 2013).

    Ферментативный барьер и устойчивость к антибиотикам

    Продукция β-лактамаз является важным механизмом, ответственным за устойчивость к β-лактамам у большинства этих видов. Штаммы E. aerogenes обладают широкой способностью вырабатывать механизмы устойчивости к антибиотикам (Miro et al., 1995). Они естественным образом экспрессируют хромосомную цефалоспориназу β-лактамазного типа AmpC на низком уровне (группа 1 Bush), которая индуцирует устойчивость к цефалоспоринам первого поколения (Freney et al., 1988).Хромосомные приобретенные механизмы резистентности к бета-лактамам вызывают перепроизводство хромосомной цефалоспориназы AmpC: это происходит в результате индукции во время лечения цефалоспоринами третьего поколения или в результате мутации в репрессоре AmpR и вызывает устойчивость почти ко всем бета-лактамам (Preston et al. ., 2000). Кроме того, было описано, что штаммов E. aerogenes , несущих ген цефалоспориназы AmpC, интегрировали ген хромосомного происхождения ( bla CMY-10) в большую плазмиду (130 т.п.н.), способствуя систематической передаче генов даже в отсутствие давления антибиотиков (Lee et al., 2003).

    В 1993 г. появились первые случаи внутрибольничных инфекций, вызванных штаммами с резистентностью к обычным β-лактамным антибиотикам, обусловленным БЛРС (Pitout et al., 1998). Постоянно сообщалось о ESBL TEM-24, связанном с клональным распространением E. aerogenes во Франции (Neuwirth et al., 1996; Bosi et al., 1999; Bertrand et al., 2003). Другие ESBL типа TEM или типа CTX-M (ex CTX-M-2) часто идентифицируются, но TEM-24 остается связанным с предпочтительной конъюгативной плазмидой этого вида (Arpin et al., 2002; Дюмарш и др., 2002; Бьендо и др., 2008 г.; Канамори и др., 2012). Благодаря хорошо описанной модификации экспрессии поринов и недавнему распространению карбапенемаз, содержащих плазмиды, появился ряд устойчивых к имипенему клинических штаммов (Miro et al., 1995; Bornet et al., 2000; Biendo et al., 2008). ; Лавин и др., 2012). Карбапенемазы типов NDM и VIM теперь, как и предполагалось, описаны в E. aerogenes в Индии, а карбапенемазы группы сериновых протеаз как KPC или β-лактамазы класса D, обладающие свойствами карбапенемаз, как типы OXA-48, описаны в Европе/Азии. (Хаджурия и др., 2014; Торрес и др., 2014).

    Подобно E. aerogenes , E. cloacae также обладает естественной устойчивостью к ампициллину, амоксициллин-клавулановой кислоте, цефалотину и цефокситину за счет низкой продукции природной индуцибельной цефалоспориназы группы Буша 1 (класс C). Они способны сверхпродуцировать β-лактамазы AmpC, блокируя репрессию хромосомного гена или приобретая переносимый ген ampC на плазмиды, придающие устойчивость к цефалоспоринам третьего поколения (Nauciel et al., 1985; Захер и Чимолаи, 1997). Только цефепим может сохранять свою активность (Сандерс и Сандерс, 1997). Клиническая резистентность к AmpC составляет 50% изолятов и часто сосуществует с экспрессией ESBL. В 1989 г. появились первые внутрибольничные изоляты, несущие плазмидные БЛРС, вызывающие также устойчивость к цефалоспоринам третьего поколения, за исключением цефамицинов (De Champs et al., 1989). Вместе эти ферменты ответственны за общую устойчивость ко всем бета-лактамам, кроме карбапенемов (Pitout et al., 1997). За последнее десятилетие E. cloacae стал третьим наиболее распространенным Enterobacteriaceae , устойчивым к цефалоспоринам третьего поколения с энтеросолюбильными E. coli и K. pneumoniae (Jarlier and INVS, 2014). Имипенем остается наиболее эффективной молекулой для лечения инфекций E. cloacae . С тех пор различные БЛРС типов TEM, SHV и CTX-M были охарактеризованы у E. cloacae , включая устойчивые к ингибиторам TEM или IRT (для устойчивых к ингибиторам TEM ; Arpin et al., 2002; Сабо и др., 2005 г.; Галас и др., 2008). Однако среди продуцентов ESBL в настоящее время идентифицированы некоторые субклоны, связанные с продукцией CTX-M-3 и 15, в то время как другие типы TEM или SHV (например, SHV-12) также связаны с изолятами, вовлеченными в эпидемические эпизоды. Диффузия E. cloacae , продуцирующих БЛРС CTX-M-15, является следствием широкого распространения идентичных или родственных плазмид, несущих ген CTX-M-15, впервые идентифицированный в эпидемическом клоне E. coli , и CTX- M β-лактамазы в настоящее время являются наиболее распространенными БЛРС во всем мире (Hammami et al., 2012).

    В последние годы были идентифицированы клинические изоляты, резистентные к карбапенемазам (Nordmann et al., 1993; Galani et al., 2005). В 2010 году CDC впервые сообщил о носительстве NDM-1 у E. cloacae от пациентов, получивших медицинскую помощь в Индии. Особенно в Азии были описаны штаммы, несущие металло-β-лактамазы в виде ферментов типа IMP, NDM, GIM, VIM и серинкарбапенемазы типа KPC (Huang et al., 2012; Dai et al., 2013; Hamprecht et al. , 2013; Яскульский и др., 2013). Серинкарбапенемаза типа OXA-48 является наиболее распространенной, поскольку ее ген расположен на плазмиде, связанной с геном bla-CTX-M-15 , кодирующим ESBL, что объясняет ее распространение и связанную с ней резистентность (Potron et al., 2013; Торрес и др., 2014). Наблюдался скачок уровня устойчивости к имипенему у E. cloacae с 0,4 до 8% (Lee et al., 2005; Poirel et al., 2007; Robert et al., 2014). Эпидемическое исследование, касающееся инфекций кровотока E. cloacae , показало 25% выработку металло-β-лактамазы у соответствующих штаммов (Khajuria et al., 2014). Таким образом, снижение чувствительности к карбапенемам у 90 365 изолятов E. cloacae 90 366, полученных в больнице, может быть обусловлено ступенчатым накоплением детерминант МЛУ в разных клонах. На сегодняшний день E. cloacae являются вторыми Enterobacteriaceae , несущими карбапенемазы, и сообщалось о штаммах, коэкспрессирующих две карбапенемазы (Izdebski et al., 2014).

    Что касается аминогликозидов, основной механизм устойчивости Enterobacteriaceae связан с ферментами, модифицирующими аминогликозиды, которые часто кодируются плазмидами, но он также может быть связан с мобильными элементами.Эти ферменты относятся к трем группам: ацетилтрансферазы (ацетилирование аминогруппы/ААС), фосфотрансферазы (фосфорилирование гидроксильной группы/АРН) и аденилилтрансферазы (аденилилирование гидроксильной группы/ААД или ANT). Обмен плазмидами и диссеминация транспозонов способствуют быстрому приобретению фенотипов резистентности (Mezzatesta et al., 2012).

    Устойчивость штамма варьируется от 0 до 51% к гентамицину и от 0 до 34% к амикацину (Sanders and Sanders, 1997).В 2013 г. важное эпидемиологическое исследование подтвердило, что аминогликозид-модифицирующие гены, участвующие в клинической устойчивости к аминогликозидам, представляют собой aac ( 3 ) -IIa , aac ( 6 и 906 6 ,

    -Ib) -Ib. ant ( 2 ») -Ia , гены, придающие устойчивость к тобрамицину, гентамицину и амикацину (Miró et al., 2013). Штаммы часто содержат более одного фермента (Miró et al., 2013). Резистентность этого ферментативного типа связана у 77% клинических изолятов в Китае с другими плазмидными генами ( armA , rmtB ; Huang et al., 2012). Среди них аминогликозид AAC(6′)-Ib является наиболее частой причиной устойчивости к амикацину среди членов семейства Enterobacteriaceae . В предыдущем исследовании было замечено, что более 40% изолятов E. cloacae имели ген aac (6′)-Ib, хотя многие изоляты с этим геном были чувствительны к амикацину и гентамицину, которые были наиболее активный из всех испытанных препаратов (Kim et al., 2009).

    Ферментативная устойчивость к фторхинолонам была недавно описана и связана с двухточечной мутацией аллеля aac ( 6 ′)- Ib [названный aac ( 6 ′)- Ib Ib cr ], ферментативную детерминанту устойчивости к аминогликозидам, которая ацетилирует ципрофлоксацин и норфлоксацин (Huang et al., 2012). Систематическое молекулярное исследование, сообщающее о распространенности и характеристиках aac ( 6 ′) -Ib-cr в Корее, показало высокую распространенность этого механизма (23%) у E. cloacae (Huang et al., 2012). Распространение этого нового ферментативного механизма резистентности происходит, поскольку aac (6′) -Ib-cr тесно связан с bla OXA-1 , IS CR1 и интегроном класса 1. Это подтверждает предыдущий вывод о том, что aac ( 6 ′) -Ib-cr располагался выше по течению от bla OXA-30 (синоним bla OXA-1 ) в комплексе интегронов класса OXA-1 9106 , In37, содержащий IS CR1 (Quiroga et al., 2007). Было продемонстрировано генетическое сцепление между aac ( 6 ′) -Ib-cr и bla CTX-M-15 (Huang et al., 2012).

    Мембранный барьер и устойчивость к антибиотикам

    Порин и мембранная проницаемость

    Карбапенемы являются наиболее эффективными препаратами для лечения серьезных внутрибольничных инфекций, вызванных МЛУ Enterobacteriaceae . Из-за использования имипенема быстро сообщалось о снижении проникновения β-лактамов из-за изменения экспрессии поринов в Е.аэрогены изолятов. Шаррел и др. (1996) показали, что МЛУ-штаммы E. aerogenes демонстрируют характерный фенотип, связанный с измененной экспрессией поринов, а затем последовательные исследования подтвердили описание более частых МЛУ-штаммов у пациентов, получавших β-лактамы (Bornet et al., 2000; Фернандес-Куэнка и др., 2006). Этот механизм устойчивости обратим при прекращении лечения (Bornet et al., 2000) и прогрессирует во время лечения. Среди промежуточных штаммов, чувствительных к имипенему, но устойчивых к эртапенему, наблюдается потеря порина Omp35, но сохраняется экспрессия порина Omp36.При продолжении лечения имипенемом отмечается исчезновение двух поринов и резистентность ко всем карбапенемам (Lavigne et al., 2013). Недавно новый механизм резистентности был обнаружен у клинического штамма, в котором антибиотик не может эффективно транслоцироваться через мутировавший порин (см. Мутации и резистентность к антибиотикам). Кроме того, имипенем и карбапенемазы типа KPC ответственны за резистентность к карбапенемам, связанную со снижением проницаемости мембран (Jaskulski et al., 2013). Проводимость и селективность этих поринов, Omp35 и Omp36, соответствуют свойствам, полученным с OmpC и OmpF E. coli (Bornet et al., 2004; James et al., 2009). Более того, в нескольких исследованиях дополнительно описано снижение продукции этих поринов у резистентных изолятов (Bornet et al., 2000; Yigit et al., 2002; Gayet et al., 2003; Doumith et al., 2009; Tran et al. , 2009). Два основных порина наружной мембраны были идентифицированы у E. cloacae и изучены с помощью анализов набухания липосом (Lee et al., 1992). Эти порины вовлечены в чувствительность к карбапенемам (Raimondi et al., 1991; Lee et al., 1992) и проявляют важную перекрестную антигенность с поринами E. aerogenes в определенных ключевых частях, например, области глазка, вставках мембраны, субъединице связи (Malléa et al., 1995). Кроме того, сообщалось об их соответствующем участии в поглощении β-лактамов и фторхинолонов (Chevalier et al., 2000; James et al., 2009).

    Интересно, что экспрессия порина у Enterobacteriaceae быстро и заметно изменяется под действием различных стрессовых соединений, присутствующих во внешней среде (Dupont et al., 2007). В первые часы инкубации в присутствии салицилата, новобиоцина, норфлоксацина наблюдается значительное увеличение OmpX, и эта сверхэкспрессия негативно контролирует синтез поринов (Dupont et al., 2007).

    Истечение и мембранная проницаемость

    Кроме того, у Enterobacter sp. активен механизм оттока, который участвует в удалении молекул из бактерий, таких как фторхинолоны, тетрациклин и хлорамфеникол. (Маллеа и др., 1998). Этот механизм очень эффективен, поскольку эффлюксный насос AcrAB-TolC может выбрасывать около 80–90% норфлоксацина в течение первых 10–15 мин (Malléa et al., 1998). Интересно, что этот процесс зависит от энергии и требует энергии мембраны (движущая сила протонов), как подробно описано (недавний обзор см. Nikaido and Pages, 2012). Приблизительно 40% клинических штаммов МЛУ имеют активный отток (Chevalier et al., 2008). Описаны эффлюксные гены EefABC и AcrAB-TolC E. aerogenes и изучено их участие в экспорте антибиотиков (Pradel and Pages, 2002; Masi et al., 2005, 2006; Мартинс и др., 2010). В нескольких исследованиях E. cloacae также сообщалось о наличии эффлюксных насосов, принадлежащих семействам RND и MATE (Pérez et al., 2007; He et al., 2011). Кроме того, гены AcrAB–TolC и OqxAB были охарактеризованы в 90 365 штаммах E. cloacae 90 366 с клинической устойчивостью (Pérez et al., 2007, 2012; Veleba et al., 2013). У E. aerogenes и E. cloacae сходство последовательностей и биологическая активность особенно высоки в AcrAB-TolC (Pradel and Pages, 2002; Pérez et al., 2007). Кроме того, различные химические вещества, такие как салицилат, хлорамфеникол и имипенем, также способны запускать генетический каскад, контролирующий экспрессию помпы Enterobacter AcrAB-TolC (Davin-Regli et al., 2008). Регуляция, по-видимому, связана с внутренней концентрацией химических веществ, которая играет ключевую роль во время включения каскада, обеспечивающего экспрессию оттока (Valade et al., 2013).

    MarA действует как ключевой регулятор экспрессии генов поринов, а tolC в Enterobacteriaceae (Levy, 2002; Piddock, 2006; Alekshun and Levy, 2007; Davin-Regli et al., 2008). SoxS является еще одним ключевым регулятором транскрипции, который положительно контролируется окислительным стрессом и может запускать экспрессию MarA (Masi and Pages, 2013). Некоторые Enterobacteriaceae sp., такие как Enterobacter, Klebsiella, Salmonella , имеют дополнительный глобальный регулятор RamA. Он играет стратегическую роль в контроле как поринов, так и экспрессии оттока либо напрямую, либо через каскад MarA. Этот скоординированный контроль притока и оттока напрямую и эффективно регулирует внутриклеточное накопление антибактериальных агентов.Важно отметить, что это внутреннее накопление антибактериальных молекул ниже порога, соответствующего МПК, может способствовать возникновению и приобретению дополнительных механизмов резистентности, таких как мутация-мишень, продукция детоксицирующих ферментов (например, β-лактамаз, ацетилтрансфераз и др.), способствуя расширение фенотипа МЛУ (Nikaido and Pages, 2012; Masi and Pages, 2013).

    Относительно активной структуры эффлюксных насосов, задействованных в E. aerogenes и E.клоаки ; мы можем предположить, что общая структурная организация сохраняется из-за высокой консервативной гомологии между Enterobacter и E. coli . Эта структурная организация может быть аналогична недавнему описанию комплекса AcrAB-TolC в E. coli (Du et al., 2014).

    Мутации и устойчивость к антибиотикам

    Что касается β-лактамных антибиотиков, резистентность из-за целевой мутации возникает случайно у Enterobacter sp.Однако идентифицированные сегодня разнообразные β-лактамазы являются результатом ряда мутаций, последовательно появлявшихся в исходных β-лактамазах ТЕМ-1/2, SHV-1, OXA-1.

    Кроме того, на штаммы, в которых цефалоспориназа AmpC была дерепрессирована, повлияли мутации, влияющие на сайт узнавания промотора AmpR. Наиболее известны и изучены мутации, влияющие на мишень фторхинолонов, а в последнее время — мутации, ответственные за резистентность к полимиксинам. На самом деле, хинолоны широко назначались в качестве противомикробных препаратов из-за их доказанной безопасности, высокой биодоступности при пероральном приеме, множественных утвержденных показаний и бактерицидной активности.Следовательно, в микробной популяции в результате мутаций в областях, определяющих устойчивость к хинолонам (QRDR), в клеточных генах-мишенях gyrA и parC возникло множество аминокислотных изменений, которые обусловили высокий уровень устойчивости. Это один из наиболее распространенных механизмов устойчивости, выявленных среди клинических изолятов Enterobacter , несмотря на недавнюю характеристику генов плазмид-опосредованной устойчивости к хинолонам (PMQR) ( qnrA , qnrS , aac ( 6 ‘) -Ib-cr , qepA и oqxAB ; Park et al., 2009; Канамори и др., 2012). У E. cloacae наблюдаются резистентность к плазмидам QnrA и QnrS, индуцирующая защиту от ДНК-связывания фторхинолонов, но такие механизмы обеспечивают низкий уровень устойчивости, когда они присутствуют отдельно (Corkill et al., 2005; Poirel et al., 2005). ; Huang et al., 2012; Kanamori et al., 2012). Однако такие механизмы PMRQ получили широкое распространение и обнаружены более чем в 60% штаммов, поскольку было обнаружено, что они переносят различные ESBL или β-лактамазы типа AmpC на одной и той же плазмиде (Park et al., 2009; Хуанг и др., 2012). Наконец, ассоциированные с активным оттоком мутации-мишени являются наиболее эффективными механизмами резистентности, приводящими к высоким значениям МИК, в то время как механизмы PMRQ оказывают лишь аддитивное влияние на уровень резистентности к фторхинолонам.

    Наконец, панрезистентность к лекарствам не является исключительным фенотипом у E. aerogenes , поскольку штаммы, устойчивые ко всем антибиотикам, включая замену колистина pmrA , были выделены и описаны как ассоциированные с резистентностью к колистину (Thiolas et al., 2005; Диен и др., 2013).

    Что касается пути проникновения, важно отметить, что в течение последнего десятилетия мы наблюдали появление хорошо локализованной мутации внутри сужения пор Omp36 (OmpC-подобный порин E. aerogenes ), которые вызывают сильную устойчивость к β-лактамы (Dé et al., 2001; Thiolas et al., 2004). Эта специфическая мутация, изменяющая характеристики пор, нарушает диффузию всех β-лактамов, включая цефалоспорины и карбапенемы, представляет собой первый тип адаптивной мутации бактериального порина в резистентных клинических изолятах Enterobacteriacea e (Chevalier et al., 1999; Тиолас и др., 2004). Интересно, что интенсивность модификации МИК, обусловленная специфическими остатками, зависит от структуры и заряда молекул антибиотика. В недавнем исследовании сообщается о молекулярном моделировании и динамике β-лактамов внутри канала дикого типа и мутированного канала во время перемещения молекулы извне в периплазматическое пространство (Vidal et al., 2005; James et al., 2009; Hajjar et al. ., 2010а,б). Эти данные иллюстрируют адаптивное давление, которое управляет отбором и сохранением этих специфических остатков, которые фильтруют диффузию заряженных растворенных веществ.Вовлеченные аминокислоты представляют собой первую защиту от проникновения вредных соединений и подтверждают первые исследования, в которых сообщается о разнице в чувствительности к бета-лактамам в зависимости от порина (Pages et al., 2008).

    Недавно в контексте консорциума IMI-Translocation (www.translocation.eu) были секвенированы геномы различных клинических изолятов, и предварительный анализ показал несколько мутаций в резистентных штаммах, которые расположены в регуляторах и мембранных белках (данные не показано).

    Регуляция мембраноассоциированных механизмов резистентности

    Различные исследования устойчивости к антибиотикам у E. aerogenes и E. cloacae выявили группу регуляторов семейства AraC, включая MarA, RamA, SoxS и RobA, которые связаны с фенотипом низкой чувствительности к нескольким антибиотики и биоциды, индуцируя гиперэкспрессию эффлюксной помпы (обзор см. Davin-Regli et al., 2008; Davin-Regli and Pages, 2012; Pérez et al., 2012). Интересно, что роль marA и ramA была описана также в подавлении поринов и последующей устойчивости к β-лактамам у E. aerogenes , что дополняет фенотип MDR клинически устойчивых штаммов (Chollet et al., 2002, 2004). Недавняя работа показала, что экспрессия другого AraC-регулятора, rarA , вносит вклад в фенотип множественной лекарственной устойчивости, генерируемый через активацию оттока (Veleba et al., 2013). Этот регулятор также играет роль в развитии устойчивости к тигециклину (Veleba et al., 2013). Таким образом, регуляция МЛУ у Enterobacter является достаточно сложной и избыточной (Davin-Regli et al., 2008; Lawler et al., 2013) и способствует быстрой адаптации клинического изолята через баланс поринов и оттока. (Борнет и др., 2000, 2004). Более того, было продемонстрировано, что некоторые регуляторы двухкомпонентной системы (TCS), такие как OmpR-EnvZ, также играют ключевую роль в контроле экспрессии порина в дополнение к OmpX и малым РНКи или белкам, таким как H-NS, которые регулируют OmpF/ Баланс OmpC в E.coli или синтез элементов насоса оттока в E. aerogenes соответственно (Stoorvogel et al., 1991; Masi et al., 2005; Dupont et al., 2007).

    Интересно, что касается генетического контроля экспрессии помпы; активаторы MarA, RamA и RarA, а также репрессоры MarR, RamR и AcrR могут быть тесно связаны на глобальном и локальном уровнях, чтобы совместно организовать устойчивость в клинических изолятах Enterobacter (Davin-Regli et al., 2008). В этот момент также важно отметить, что регулятор RamA описан в Enterobacter , Salmonella , и Klebsiella , но не описан в Escherichia , в отличие от Mar regulon (Lawler et al., 2013).

    Иллюстрация сложной регуляции различных механизмов резистентности у Enterobacter представлена ​​на рисунке 3.

    РИСУНОК 3. Схематическое изображение механизма сопротивления и его регулировки . Представлены разные уровни регуляции: (i) уровни транскрипции и трансляции, контролируемые различными сенсорами [двухкомпонентные системы (TCS), такие как EnvZ/OmpR для поринов], глобальные регуляторы (здесь указаны RamA, MarA, SoxS) и локальные регуляторов (AcrR для насосов оттока и OmpX для поринов), накопление триггерных метаболитов внутри бактериальной клетки также может запускать экспрессию через локальные или другие регуляторы, MicF и MicC представляют собой малые интерферирующие РНК, контролирующие стабильность мРНК поринов.(ii) Трансляционная и окончательная сборка мембраны в функциональной конформации (посредством шаперонов и мембранных факторов. Порины представляют Omp35, Omp36; эффлюксные помпы представляют семейство AcrAB–TolC. IN — бактериальная цитоплазма; OUT — внешняя среда.

    Заключение

    В течение последнего десятилетия мы наблюдали рост и снижение нескольких инфекционных эпизодов, вызванных устойчивыми штаммами Escherichia , Enterobacter , Klebsiella во французских и европейских больницах.Что касается Enterobacter , мы можем отметить последовательные волны E. cloacae , затем E. aerogenes и теперь снова E. cloacae , о которых сообщалось в больничных палатах (Potron et al., 2013). Этот вид бактерий является членом группы ESKAPE, которая недавно была описана как основная причина проблемы инфицирования человека (Boucher et al., 2009; Rice, 2010). Следовательно, важно изучить различные способы, используемые E. aerogenes и E.cloacae для обнаружения и реагирования на изменение условий окружающей среды и присутствие лекарств в среде.

    Интересно, что два вида Enterobacter , aerogenes и cloacae , представляют хорошо сохранившиеся механизмы регуляции, действующие для модуляции экспрессии поринов, интегрированных в наружную мембрану: например, OmpX, небольшой белок наружной мембраны, играет роль в контроле о продукции OmpF-подобного порина (Omp35) и избыточной продукции OmpX сообщается в клинических изолятах, демонстрирующих недостаточность порина (Stoorvogel et al., 1991; Дюпон и др., 2007). Этот контроль белка внешней мембраны (OmpX) на синтез порина внешней мембраны, в дополнение к основному регулятору резистентного каскада, который полностью активен, присутствует в различных клинических изолятах. Это предполагает общий путь эволюции и выбор общего каскада регуляции, участвующего в адаптации мембран к стрессам окружающей среды (Gayet et al., 2003). Что касается переносчиков лекарств, ясно, что система AcrAB-TolC, OqxAB, EmrE, MdfA и MacA присутствуют у двух видов (полное описание см. в банке данных).Кроме того, что касается регуляторов Mar, Ram и Sox, все они сохранены и активны в запуске антибиотикорезистентности. Интересно, что избыточный глобальный регуляторный контроль, Mar и Ram, обнаружен у E. aerogenes и E. cloacae (Veleba et al., 2013). Тесная близость видов подкрепляется наличием сходных регуляторов и адаптивной реакции и подтверждает описание этих видов при инфекции человека и их реакции на антибактериальную терапию.

    Заявление о конфликте интересов

    Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могли бы быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.

    Благодарности

    Мы очень признательны С. Даму за помощь в внимательном прочтении рукописи. Эта работа была поддержана Экс-Марсельским университетом. Исследование, приведшее к обсуждаемым здесь результатам, было проведено в рамках транслокационного консорциума (http://www.translocation.eu) и получил поддержку от совместного предприятия «Инновационные лекарства» в рамках Соглашения о гранте №. 115525, ресурсы, которые состоят из финансового вклада седьмой рамочной программы Европейского Союза (FP/2007–2013) и взносов компаний EFPIA в натуральной форме.

    Каталожные номера

    Allerberger, F., Koeuth, T., Lass-Florl, C., Dierich, M.P., Putensen, C., Schmutzhard, E., et al. (1996). Эпидемиология инфекций, вызванных мультирезистентным Enterobacter aerogenes в университетской больнице. евро. Дж. Клин. микробиол. Заразить. Дис. 15, 517–521. дои: 10.1007/BF016

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Анастей, М., Лажье, Э., Блан, В., и Шардон, Х. (2013). Эпидемиология бета-лактамаз à spectre étendu (BLSE) среди энтеробактерий в больницах юга Франции, 1997–2007 годы. Патол. биол. 61, 38–43. doi: 10.1016/j.patbio.2012.03.001

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Арпин, К., Coze, C., Rogues, A.M., Gachie, J.P., Bebear, C., and Quentin, C. (1996). Эпидемиологическое исследование вспышки, вызванной полирезистентным штаммом Enterobacter aerogenes , в отделении интенсивной терапии. Дж. Клин. микробиол. 34, 2163–2169.

    Реферат PubMed | Академия Google

    Арпин К., Лабиа Р., Дюбуа В., Нури П., Суке М. и Квентин К. (2002). TEM-80, новая резистентная к ингибиторам β-лактамаза в клиническом изоляте Enterobacter cloacae . Антимикроб. Агенты Чемотер. 46, 1183–1189. doi: 10.1128/AAC.46.5.1183-1189.2002

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Бертран, X., Хокке, Д., Буассон, К., Сибор, Э., Плезиат, П., и Талон, Д. (2003). Молекулярная эпидемиология энтеробактерий, продуцирующих β-лактамазы расширенного спектра, в больнице при французском университете. Междунар. Дж. Антимикроб. Агенты 22, 128–133. doi: 10.1016/S0924-8579(03)00098-0

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Бьендо, М., Канарелли Б., Томас Д., Руссо Ф., Хамдад Ф., Аджиде К. и др. (2008). Последовательное появление изолятов Enterobacter aerogenes , продуцирующих β-лактамазы расширенного спектра и продуцирующих карбапенемазы, в университетской больнице. Дж. Клин. микробиол. 46, 1037–1044. doi: 10.1128/JCM.00197-07

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Борнет, К., Давин-Регли, А., Боси, К., Пажес, Дж. М., и Болле, К. (2000). Устойчивость к имипенему Enterobacter aerogenes опосредована проницаемостью наружной мембраны. Дж. Клин. микробиол. 38, 1048–1052.

    Академия Google

    Борнет, К., Сент, Н., Фетначи, Л., Дюпон, М., Давин-Регли, А., Боллет, К., и др. (2004). Omp35, новый порин Enterobacter aerogenes , участвующий в селективной чувствительности к цефалоспоринам. Антимикроб. Агенты Чемотер. 48, 2153–2158. doi: 10.1128/AAC.48.6.2153-2158.2004

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Боси, К., Давин-Регли, А., Борнет, К., Маллеа, М., Паже, Дж. М., и Болле, К. (1999). Большинство штаммов Enterobacter aerogenes во Франции относятся к преобладающим клонам. Дж. Клин. микробиол. 37, 2165–2169.

    Реферат PubMed | Академия Google

    Boucher, H.W., Talbot, G.H., Bradley, J.S., Edwards, J.E., Gilbert, D., Rice, L.B., et al. (2009). Плохие жуки, никаких лекарств: нет ESKAPE! обновление от Общества инфекционных заболеваний Америки. клин. Заразить. Дис. 48, 1–12. дои: 10.1086/595011

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Карбон, А., Арно, И., Мога, С., Марти, Н., Дюмартин, К., Бертран, X., и соавт. (2013). Национальный эпиднадзор за бактериями с множественной лекарственной устойчивостью (MDRB) во Франции через сеть RAISIN: 9-летний опыт. J. Антимикроб. Чемотер . 68, 954–959. doi: 10.1093/jac/dks464

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Шаррель, Р. Н., Паже, Ж. М., Де Микко, П.и Маллеа, М. (1996). Распространенность изменения поринов наружной мембраны у резистентных к β-лактамам антибиотиков Enterobacter aerogenes . Антимикроб. Агенты Чемотер. 40, 2854–2858.

    Академия Google

    Шевалье, Дж., Маллеа, М., и Паже, Дж. М. (2000). Сравнительные аспекты диффузии норфлоксацина, цефепима и спермина через F-пориновый канал Enterobacter cloacae . Биохим. J. 348 (часть 1), 223–227. дои: 10.1042/0264-6021:3480223

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Шевалье, Дж., Mulfinger, C., Garnotel, E., Nicolas, P., Davin-Regli, A., и Pages, JM (2008). Идентификация и эволюция помпы оттока лекарственных средств в клинических штаммах Enterobacter aerogenes , выделенных в 1995 и 2003 гг. PLoS ONE 3:e3203. doi: 10.1371/journal.pone.0003203

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Шевалье, Дж., Паже, Дж. М., и Маллеа, М. (1999). Модификация активности поринов in vivo, придающая устойчивость к антибиотикам Enterobacter aerogenes . Биохим. Биофиз. Рез. Коммуна . 266, 248–251. doi: 10.1006/bbrc.1999.1795

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Шолле, Р., Болле, К., Шевалье, Дж., Маллеа, М., Паже, Дж. М., и Давин-Регли, А. (2002). mar оперон, вовлеченный в множественную лекарственную устойчивость Enterobacter aerogenes . Антимикроб. Агенты Чемотер. 46, 1093–1097. doi: 10.1128/AAC.46.4.1093-1097.2002

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Шолле, Р., Chevalier, J., Bollet, C., Pagès, JM, and Davin-Regli, A. (2004). RamA является альтернативным активатором каскада множественной лекарственной устойчивости у Enterobacter aerogenes . Антимикроб. Агенты Чемотер. 48, 2518–2523. doi: 10.1128/AAC.48.7.2518-2523.2004

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Коркилл, Дж. Э., Энсон, Дж. Дж., и Харт, Калифорния (2005). Высокая распространенность плазмид-опосредованной детерминанты устойчивости к хинолонам qnrA у энтеробактерий с множественной лекарственной устойчивостью из культур крови в Ливерпуле, Великобритания. J. Антимикроб. Чемотер. 56, 1115–1117. doi: 10.1093/jac/dki388

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Дай В., Сун С., Ян П., Хуанг С., Чжан С. и Чжан Л. (2013). Характеристика карбапенемаз, бета-лактамаз расширенного спектра и молекулярная эпидемиология нечувствительных к карбапенемам Enterobacter cloacae в китайской больнице в Чунцине. Заразить. Жене. Эвол. 14, 1–7. doi: 10.1016/j.meegid.2012.10.010

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Davin-Regli, A., Bolla, J.M., James, C.E., Lavigne, J.P., Chevalier, J., Garnotel, E., et al. (2008). Мембранная проницаемость и регуляция «притока и оттока» лекарственных средств у энтеробактериальных патогенов. Курс. Наркотики 9, 750–759. дои: 10.2174/138945008785747824

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Давин-Регли, А., Монне, Д., Со, П., Боси, К., Шаррел, Р. Н., Бартелеми, А., и другие. (1996). Молекулярная эпидемиология приобретения Enterobacter aerogenes : однолетнее проспективное исследование в двух отделениях интенсивной терапии. Дж. Клин. микробиол. 34, 1474–1480.

    Реферат PubMed | Академия Google

    Давин-Регли, А., и Паже, Дж. М. (2012). Перекрестная устойчивость между биоцидами и противомикробными препаратами: новый вопрос. Rev.Sci. Тех. 31, 89–104.

    Реферат PubMed | Академия Google

    Де, Э., Базле, А., Jaquinod, M., Saint, N., Malléa, M., Molle, G., et al. (2001). Новый механизм устойчивости к антибиотикам у Enterobacteriaceae, вызванный структурной модификацией основного порина. Мол. микробиол. 41, 189–198. doi: 10.1046/j.1365-2958.2001.02501.x

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    De Champs, C., Sauvant, M.P., Chanal, C., Sirot, D., Gazuy, N., Malhuret, R., et al. (1989). Проспективное исследование колонизации и инфекции, вызванной членами семейства Enterobacteriaceae, продуцирующими расширенный спектр бета-лактамаз, в отделении интенсивной терапии. J. Антимикроб. Чемотер. 27, 2887–2890.

    Реферат PubMed | Академия Google

    Де Гелдре, Ю., Маес, Н., Рост, Ф., Де Рик, Р., Клевенберг, П., Винсент, Дж. Л., и соавт. (1997). Молекулярная эпидемиология вспышки полирезистентных инфекций Enterobacter aerogenes и появление резистентности к имипенему in vivo. Дж. Клин. микробиол. 35, 152–160.

    Реферат PubMed | Академия Google

    Диене, С. М., Мерхей, В., Henry, M., El Filali, A., Roux, V., Robert, C., et al. (2013). Корневище генома Enterobacter aerogenes с множественной лекарственной устойчивостью показывает, как из-за симпатрического образа жизни создаются новые «жуки-убийцы». Мол. биол. Эвол. 30, 369–383. doi: 10.1093/molbev/mss236

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Думит, М., Эллингтон, М.Дж., Ливермор, Д.М., и Вудфорд, Н. (2009). Молекулярные механизмы, нарушающие экспрессию поринов у устойчивых к эртапенему Klebsiella и Enterobacter spp.клинические изоляты из Великобритании. J. Антимикроб. Чемотер. 63, 659–667. doi: 10.1093/jac/dkp029

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Du, D., Wang, Z., James, N.R., Voss, J.E., Klimont, E., Ohene-Agyei, T., et al. (2014). Структура помпы множественного оттока лекарств AcrAB-TolC. Природа 509, 512–515. doi: 10.1038/nature13205

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Дюглё, Г., Ле Кутур, X., Hecquard, C. и Oblin, I. (1991). Септицемия, вызванная зараженными пакетами для парентерального питания: холодильник как необычная причина. Дж. Родитель. Энт. Нутр. 15, 474–475. дои: 10.1177/01486071

  • 004474

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Dumarche, P., De Champs, C., Sirot, D., Chanal, C., Bonnet, R., and Sirot, J. (2002). Штаммы Enterobacter aerogenes , производные ТЕМ: распространение распространенного клона. Антимикроб.Агенты Чемотер. 46, 1128–1131. doi: 10.1128/AAC.46.4.1128-1131.2002

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Дюпон, М., Джеймс, К.Э., Шевалье, Дж., и Паже, Дж.М. (2007). Ранняя реакция на стресс окружающей среды включает регуляцию OmpX и OmpF, двух порообразующих белков внешней мембраны энтеробактерий. Антимикроб. Агенты Чемотер. 51, 3190–3198. doi: 10.1128/AAC.01481-06

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Фармер, Дж.J. III, Davis, B.R., Hickman-Brenner, F.W., McWorther, A., Huntley-Carter, G.P., Asbury, M.A., et al. (1985). Биохимическая идентификация новых видов и биогрупп энтеробактерий, выделенных из клинических образцов. Дж. Клин. микробиол. 21, 46–76.

    Реферат PubMed | Академия Google

    Фата Ф., Читтивелу С., Тесслер С. и Куппер Ю. (1996). Газовая гангрена руки, вызванная Enterobacter cloacae , у пациента с нейтропенией. Юг.Мед. Дж . 89, 1095–1096. дои: 10.1097/00007611-199611000-00014

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Фернандес-Бака В., Бальестерос Ф., Эрвас Дж. А., Виллалон П. и Альберти С. (2001). Молекулярно-эпидемиологическое типирование изолятов Enterobacter cloacae из отделения интенсивной терапии новорожденных: трехлетнее проспективное исследование. Дж. Хосп. Заразить. 49, 173–182. doi: 10.1053/jhin.2001.1053

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Фернандес-Куэнка, Ф., Родригес-Мартинес, Дж. М., Мартинес-Мартинес, Дж. М. и Паскуаль, Дж. М. (2006). Отбор in vivo Enterobacter aerogenes со сниженной чувствительностью к цефепиму и карбапенемам, связанным со сниженной экспрессией белка наружной мембраны 40 кДа и гиперпродукцией β-лактамазы AmpC. Междунар. Дж. Антимикроб. Агенты 27, 549–552. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2006.01.005

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Френи, Дж., Хассон, М.О., Гавини Ф., Мадье С., Мартра А., Изард Д. и соавт. (1988). Чувствительность к антибиотикам и антисептикам новых видов семейства Enterobacteriaceae. Антимикроб. Агенты Чемотер. 32, 873–876. doi: 10.1128/AAC.32.6.873

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Галани И., Соули М., Хриссули З., Орландоу К. и Джамареллоу Х. (2005). Характеристика нового интегрона, содержащего bla (VIM-1) и aac(6’)-IIc, в клиническом изоляте Enterobacter cloacae из Греции. J. Антимикроб. Чемотер. 55, 634–638. doi: 10.1093/jac/dki073

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Галас М., Декуссер Ж.-В., Бретон Н., Годар Т., Аллуш Т., Пина П. и др. (2008). Общенациональное исследование распространенности, характеристик и молекулярной эпидемиологии энтеробактерий, продуцирующих бета-лактамазы расширенного спектра, во Франции. Антимикроб. Агенты Чемотер. 52, 786–789. doi: 10.1128/AAC.00906-07

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Гайе, С., Шолле, Р., Молле, Г., Паже, Дж. М., и Шевалье, Дж. (2003). Модификация белкового профиля наружной мембраны и данные, свидетельствующие об активной помпе лекарственных препаратов в клинических штаммах Enterobacter aerogenes . Антимикроб. Агенты Чемотер. 47, 1555–1559. doi: 10.1128/AAC.47.5.1555-1559.2003

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Георгиу, П.Р., Хэмилл, Р.Дж., Райт, К.Е., Версалович, Дж., Коут, Т.Т., и Лупски, Дж.Р. (1995). Молекулярная эпидемиология инфекций, вызванных Enterobacter aerogenes : идентификация штаммов, связанных с госпитальными вспышками, с помощью молекулярных методов. клин. Заразить. Дис. 20, 84–94. doi: 10.1093/клиниды/20.1.84

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Граттард, Ф., Поццетто, Б., Табар, Л., Пети, М., Рос, А., и Годен, О. Г. (1995). Характеристика внутрибольничных штаммов Enterobacter aerogenes с помощью ПЦР-анализа с произвольным праймированием и риботипирования. Заразить. Хосп. Эпидемиол. 16, 224–230. дои: 10.2307/30140982

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Хаджар, Э., Бессонов А., Молитор А., Кумар А., Махендран К.Р., Винтерхальтер М. и соавт. (2010а). К скринингу антибиотиков с улучшенными свойствами проникновения через бактериальные порины. Биохимия 49, 6928–6935. дои: 10.1021/bi100845x

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Хаджар, Э., Махендран, К.Р., Кумар, А., Бессонов, А., Петреску, М., Вайнгарт, Х., и соавт. (2010б). Преодоление масштабов времени и масштабов длины: от макроскопического потока к молекулярному механизму диффузии антибиотиков через порины. Биофиз. Дж. 98, 569–575. doi: 10.1016/j.bpj.2009.10.045

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Хаммами С., Бутиба-Бен Бубакер И., Сайдани М., Лахал Э., Бен Хассен А., Камун А. и др. (2012). Характеристика и молекулярная эпидемиология бета-лактамаз расширенного спектра, продуцирующих Enterobacter cloacae , выделенных из тунисской больницы. Микроб. Сопротивление наркотикам. 18, 59–65. doi: 10.1089/mdr.2011.0074

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Хампрехт, А., Пуарель Л., Готтиг С., Зайферт Х., Каасе М. и Нордманн П. (2013). Обнаружение карбапенемазы GIM-1 в Enterobacter cloacae в Германии. J. Антимикроб. Чемотер. 68, 558–561. doi: 10.1093/jac/dks447

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    He, G.X., Thorpe, C., Walsh, D., Crow, R., Chen, H., Kumar, S., et al. (2011). EmmdR, новый член семейства переносчиков лекарств MATE, выделяет хинолоны из Enterobacter cloacae . Арх. микробиол. 193, 759–765. doi: 10.1007/s00203-011-0738-1

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Хуанг, С., Дай, В., Сунь, С., Чжан, X., и Чжан, Л. (2012). Распространенность плазмид-опосредованной резистентности к хинолонам и детерминант резистентности к аминогликозидам среди нечувствительных к карбапенему Enterobacter cloacae . PLoS ONE 7:e47636. doi: 10.1371/journal.pone.0047636

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Издебский Р., Baraniak, A., Herda, M., Fiett, J., Bonten, M.J., Carmeli, Y., et al. (2014). MLST выявляет международные клоны потенциально высокого риска Enterobacter cloacae . J. Антимикроб. Чемотер. 70, 48–56. doi: 10.1093/jac/dku359

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Джалалуддин С., Девастер Дж. М., Шин Р., Джерард М. и Батцлер Дж. П. (1998). Молекулярно-эпидемиологическое исследование внутрибольничных изолятов Enterobacter aerogenes в бельгийской больнице. Дж. Клин. микробиол. 36, 1846–1852 гг.

    Реферат PubMed | Академия Google

    Джеймс, К.Е., Махендран, К.Р., Молитор, А., Болла, Дж.М., Бессонов, А.Н., Винтерхальтер, М., и соавт. (2009). Как бета-лактамные антибиотики попадают в бактерии: диалог с поринами. PLoS ONE 4:e5453. doi: 10.1371/journal.pone.0005453

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Ярлье В. и ИНВС. (2014). Надзор за бактериями с множественной лекарственной устойчивостью во французских медицинских учреждениях BMR-Raisin Network Données 2012 .Сен-Морис: Institut de Veille Sanitaire. Доступно по адресу: http://www.invs.sante.fr

    .

    Академия Google

    Яскульский, М.Р., Медейрос, Б.К., Борхес, Дж.В., Залевски, Р., Фонсека, М.Е., Маринович, Д.Р., и соавт. (2013). Оценка механизмов резистентности к бета-лактамазам расширенного спектра действия, карбапенемазе KPC и поринам в клинических образцах Klebsiella pneumoniae и Enterobacter spp. Междунар. Дж. Антимикроб. Агенты 42, 76–79. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2013.03.009

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Канамори Х., Хисакасу Ю., Ёити Х., Х. Аяко Х., Казуаки А., Кунисима Х. и др. (2012). Молекулярные характеристики β-лактамаз расширенного спектра и детерминант qnr у видов Enterobacter из Японии. PLoS ONE 7:e37967. doi: 10.1371/journal.pone.0037967

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Кхаджурия, А., Прахарадж, А.К., Кумар, М., и Гровер, Н. (2014). Устойчивость к карбапенемам среди видов Enterobacter в больнице третичного уровня в центральной Индии. Чемотер. Рез. Практика. 2014:972646. дои: 10.1155/2014/972646

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Ким, С.Ю., Пак, Ю.Дж., Ю, Дж.К., Ким, Ю.С., и Хан, К. (2009). Распространенность и характеристики aac(6’)-Ib-cr у продуцирующих AmpC Enterobacter cloacae , Citrobacter freundii и Serratia marcescens : многоцентровое исследование из Кореи. Диагн. микробиол. Заразить. Дис. 63, 314–318. doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2008.11.016

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Лэнгли, Дж. М., Ханаковски, М., и Леблан, Дж. К. (2001). Уникальная эпидемиология нозокомиальных инфекций мочевыводящих путей у детей. утра. Дж. Заразить. Контроль 29, 94–98. doi: 10.1067/mic.2001.111537

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Лавин, Дж. П., Сотто, А., Николя-Шанойн, М.H., Bouziges, N., Bourg, G., Davin-Regli, A., et al. (2012). Проницаемость мембран, ключевая функция, связанная с устойчивостью к антибиотикам и вирулентностью в клинических изолятах Enterobacter aerogenes . клин. микробиол. Заразить. 18, 539–545. doi: 10.1111/j.1469-0691.2011.03607.x

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Лавин, Дж. П., Сотто, А., Николя-Чанойн, М. Х., Бузигес, Н., Паже, Дж. М., и Давин-Регли, А. (2013). Адаптивный ответ Enterobacter aerogenes на имипенем: регуляция баланса поринов в клинических изолятах. Междунар. Дж. Антимикроб. Агенты 41, 130–136. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2012.10.010

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Лоулер, А. Дж., Риччи, В., Басби, С. Дж., и Пиддок, Л. Дж. (2013). Генетическая инактивация acrAB или ингибирование оттока индуцирует экспрессию ramA. J. Антимикроб. Чемотер. 68, 1551–1557. doi: 10.1093/jac/dkt069

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Ли, Э. Х., Коллатц, Э., Триас, Дж., и Гутманн, Л. (1992). Диффузия β-лактамных антибиотиков в протеолипосомы, восстановленные наружными мембранами изогенных имипенем-чувствительных и резистентных штаммов Enterobacter cloacae . J. Gen. Microbiol. 138, 2347–2351. дои: 10.1099/00221287-138-11-2347

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Lee, H.K., Park, YJ, Kim, J.Y., Chang, E., Cho, S.G., Chae, H.S., et al. (2005). Распространенность сниженной чувствительности к карбапенемам среди Serratia marcescens , Enterobacter cloacae и Citrobacter freundii и исследование карбапенемаз. Диагн. микробиол. Заразить. Дис. 52, 331–336. doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2005.04.012

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Ли, С.Х., Чон, С.Х., и Пак, Ю.М. (2003). Характеристика blaCMY-10, нового гена β-лактамазы AmpC-типа, кодируемого плазмидой, в клиническом изоляте Enterobacter aerogenes . J. Appl. микробиол. 95, 744–752. doi: 10.1046/j.1365-2672.2003.02040.x

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Леви, С.Б. (2002). Активный отток, общий механизм устойчивости к биоцидам и антибиотикам. Симп. сер. соц. заявл. микробиол. 92, 65С–71С. doi: 10.1046/j.1365-2672.92.5s1.4.x

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Malléa, M., Chevalier, J., Bornet, C.E., Eyraud, A., Davin-Regli, A., Bollet, C., et al. (1998). Изменение поринов и активный отток: две стратегии лекарственной устойчивости in vivo, используемые Enterobacter aerogenes . Микробиология 144, 3003–3009.дои: 10.1099/00221287-144-11-3003

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Маллеа, М., Симонет, В., Ли, Э. Х., Жервье, Р., Коллатц, Э., Гутманн, Л., и соавт. (1995). Биологические и иммунологические сравнения поринов Enterobacter cloacae и Escherichia coli . FEMS микробиол. лат. 129, 273–279. дои: 10.1016/0378-1097(95)00171-Z

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Мартиньш, А., Spengler, G., Martins, M., Rodrigues, L., Viveiros, M., Davin-Regli, A., et al. (2010). Физиологическая характеристика насосной системы оттока чувствительных к антибиотикам и полирезистентных Enterobacter aerogenes . Междунар. Дж. Антимикроб. Агенты 36, 313–318. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2010.06.036

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Маси, М., и Паже, Дж. М. (2013). Структура, функция и регуляция белков внешней мембраны, участвующих в транспорте лекарств у Enterobactericeae: случай OmpF/C – TolC. Открытый микробиол. Дж. 7, 22–33. дои: 10.2174/1874285801307010022

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Маси, М., Паже, Дж. М., и Прадель, Э. (2006). Производство загадочного эффлюксного насоса EefABC у устойчивых к хлорамфениколу мутантов Enterobacter aerogenes . J. Антимикроб. Чемотер. 57, 1223–1226. doi: 10.1093/jac/dkl139

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Маси, М., Паже, Ж.М., Виллар К. и Прадель Э. (2005). Оперон помпы оттока многих лекарств eefABC репрессируется H-NS в Enterobacter aerogenes . J. Бактериол. 187, 3894–3897. doi: 10.1128/JB.187.11.3894-3897.2005

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Меззатеста, М.Л., Гона, Ф., и Стефани, С. (2012). Комплекс Enterobacter cloacae : клиническое значение и возникающая устойчивость к антибиотикам. Будущее микробиол. 7, 887–902.doi: 10.2217/fmb.12.61

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Миро Э., Алонсо К., Наварро Ф., Мирелис Б. и Пратс Г. (1995). Резистентность к имипенему en Enterobacter aerogenes . Энферм. инфекции микробиол. клин. 13, 278–282.

    Академия Google

    Миро Э., Грюнбаум Ф., Гомес Л., Ривера А., Мирелис Б., Колл П. и др. (2013). Характеристика аминогликозид-модифицирующих ферментов в клинических штаммах Enterobacteriaceae и характеристика плазмид, участвующих в их диффузии. Микроб. Сопротивление наркотикам. 19, 94–99. doi: 10.1089/mdr.2012.0125

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Nauciel, C., Philippon, A., Ronco, E., Pilliot, J., Guenoonou, M., Paul, G., et al. (1985). Septicémies à Enterobacter cloacae и E. aerogenes : появление устойчивых вариантов. Presse Med. 14, 673–676.

    Академия Google

    Нойвирт, К., Сибор, Э., Лопес, Дж., Печинот, А., и Казмерчак, А.(1996). Вспышка продуцирующего ТЕМ-24 штамма Enterobacter aerogenes в отделении интенсивной терапии и распространение бета-лактамазы расширенного спектра среди других членов семейства Enterobacteriacae. Дж. Клин. микробиол. 34, 76–79.

    Реферат PubMed | Академия Google

    Никайдо, Х., и Паже, Дж. М. (2012). Эффлюксные помпы широкой специфичности и их роль в мультирезистентности грамотрицательных бактерий. FEMS микробиол. Ред. 36, 340–363. дои: 10.1111/j.1574-6976.2011.00290.x

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Нордманн П., Мариотт С., Наас Т., Лабиа Р. и Николя М. Х. (1993). Биохимические свойства карбапенем-гидролизующей бета-лактамазы из Enterobacter cloacae и клонирование гена в Escherichia coli . Антимикроб. Агенты Чемотер. 37, 939–946. doi: 10.1128/AAC.37.5.939

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Паже, Ж.М., Джеймс, К.Э., и Винтерхальтер, М. (2008). Порин и проникающий антибиотик: барьер селективной диффузии грамотрицательных бактерий. Нац. Преподобный Микробиолог. 6, 893–903. doi: 10.1038/nrmicro1994

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Парк, Ю.-Дж., Ю, Дж.-К., Ким, С.-И., Ли, К., и Аракава, Ю. (2009). Накопление плазмид-опосредованных генов устойчивости к фторхинолонам, qepA и qnrS1, в Enterobacter aerogenes , совместно продуцирующих RmtB и β-лактамазу класса А LAP-1. Энн. клин. лаборатория науч. 39, 55–59.

    Реферат PubMed | Академия Google

    Перес, А., Канле, Д., Латаса, К., Поса, М., Бесейро, А., Томас Мдель, М., и другие. (2007). Клонирование, секвенирование нуклеотидов и анализ эффлюксного насоса AcrAB-TolC Enterobacter cloacae и определение его участия в устойчивости к антибиотикам в клиническом изоляте. Антимикроб. Агенты Чемотер. 51, 3247–3253. doi: 10.1128/AAC.00072-07

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Перес, А., Poza, M., Aranda, J., Latasa, C., Medrano, F.J., Tomás, M., et al. (2012). Влияние активаторов транскрипции SoxS, RobA и RamA на экспрессию мультилекарственного эффлюксного насоса AcrAB-TolC в Enterobacter cloacae . Антимикроб. Агенты Чемотер. 56, 6256–6266. doi: 10.1128/AAC.01085-12

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Пестури, Н., Гарнье, Ф., Барро, О., Беду, А., Плой, М. К., и Мунье, М. (2014). Вспышка AmpC β-лактамазы, гиперпродуцирующей Enterobacter cloacae , в отделении интенсивной терапии новорожденных французской клинической больницы. утра. Дж. Заразить. Контроль 42, 456–458. doi: 10.1016/j.ajic.2013.11.005

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Пиддок, LJ (2006). Клинически значимые хромосомно-кодируемые оттоки множественной лекарственной устойчивости у бактерий. клин. микробиол. Ред. 19, 382–402. doi: 10.1128/CMR.19.2.382-402.2006

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Pitout, JD, Sanders, C.C., and Sanders, W.E. Jr. (1997).Устойчивость к противомикробным препаратам с упором на устойчивость к бета-лактамам грамотрицательных бактерий. утра. Дж. Мед. 103, 51–59. doi: 10.1016/S0002-9343(97)00044-2

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Pitout, J.D.D., Thomson, K.S., Hanson, N.D., Ehrhardt, A.F., Coudron, P., and Sanders, C.C. (1998). Плазмид-опосредованная резистентность к цефалоспоринам расширенного спектра среди штаммов Enterobacter aerogenes . Антимикроб. Агенты Чемотер. 42, 596–600.

    Реферат PubMed | Академия Google

    Пуарель, Л., Ван Де Лу, М., Маммери, Х., и Нордманн, П. (2005). Ассоциация плазмид-опосредованной резистентности к хинолонам с бета-лактамазой расширенного спектра VEB-1. Антимикроб. Агенты Чемотер. 49, 3091–3094. doi: 10.1128/AAC.49.7.3091-3094.2005

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Потрон, А., Пуарель, Л., Рондино, Э., и Нордманн, П. (2013). Межконтинентальное распространение Enterobacteriaceae, продуцирующих β-лактамазу OXA-48, за 11-летний период, с 2001 по 2011 год. евро. Наблюдение. 18:20549. doi: 10.2807/1560-7917.ES2013.18.31.20549

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Прадель, Э., и Паже, Дж. М. (2002). Эффлюксная помпа AcrAB-TolC способствует множественной лекарственной устойчивости внутрибольничного патогена Enterobacter aerogenes . Антимикроб. Агенты Чемотер. 46, 2640–2643. doi: 10.1128/AAC.46.8.2640-2643.2002

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Престон, К.Э., Радомски, К.С.А., и Венеция, Р.А. (2000). Нуклеотидная последовательность хромосомного гена ampC Enterobacter aerogenes . Антимикроб. Агенты Чемотер. 44, 3158–3162. doi: 10.1128/AAC.44.11.3158-3162.2000

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Кирога, М. П., Андрес, П., Петрони, А., Солер Бистуэ, А. Дж., Герьеро, Л., Варгас, Л. Дж., и соавт. (2007). Сложные интегроны класса 1 с различными вариабельными областями, включая aac(6’)-Ib-cr, и новый аллель qnrB10, ассоциированный с ISCR1, в клинических изолятах энтеробактерий из Аргентины. Антимикроб. Агенты Чемотер . 51, 4466–4470. doi: 10.1128/AAC.00726-07

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Раймонди А., Траверсо А. и Никайдо Х. (1991). У устойчивых к имипенему и меропенему мутантов Enterobacter cloacae и Proteus rettgeri порины отсутствуют. Антимикроб. Агенты Чемотер. 35, 1174–1180. doi: 10.1128/AAC.35.6.1174

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Роберт, Дж., Pantel, A., Mérens, A., Lavigne, J.P., Nicolas-Chanoine, M.H., и Группа по изучению резистентности к карбапенемам ONERBA. (2014). Показатели заболеваемости продуцирующими карбапенемазы клиническими изолятами Enterobacteriaceae во Франции: проспективное общенациональное исследование 2011–2012 гг. J. Антимикроб. Чемотер. 69, 2706–2712. doi: 10.1093/jac/dku208

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Сандерс, В.Е., и Сандерс, К.С. (1997). Enterobacter spp.: патогены, готовые процветать на рубеже веков. клин. микробиол. Ред. 10, 220–241.

    Академия Google

    Сонг, Э.-Х., Пак, К.-Х., Джанг, Э.-Ю., Ли, Э.-Дж., Чонг, Ю.-П., Чо, О.-Х., и др. др. (2010). Сравнение клинических и микробиологических характеристик пациентов с бактериемией Enterobacter cloacae и Enterobacter aerogenes : проспективное наблюдательное исследование. Диагностика. микробиол. Заразить. Дис. 66, 436–440. doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2009.11.007

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Стоорфогель, Дж., ван Бассель, М.Дж., Томмассен, Дж., и ван де Клундерт, Дж.А. (1991). Молекулярная характеристика белка внешней мембраны Enterobacter cloacae (OmpX). J. Бактериол. 173, 156–160.

    Академия Google

    Сабо, Д., Мелан, М.А., Худжер, А.М., Бономо, Р.А. Худжер, К.М., Бетел, К.Р., и соавт. (2005). Молекулярный анализ одновременной продукции двух бета-лактамаз расширенного спектра SHV-типа в клиническом изоляте Enterobacter cloacae с использованием генотипирования однонуклеотидного полиморфизма. Антимикроб. Агенты Чемотер. 49, 4716–4720. doi: 10.1128/AAC.49.11.4716-4720.2005

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Тиолас, А., Болле, К., Ла Скола, Б., Рауль, Д., и Паже, Дж. М. (2005). Последовательное появление у больного штаммов Enterobacter aerogenes , устойчивых к имипенему и колистину. Антимикроб. Агенты Чемотер. 49, 1354–1358. doi: 10.1128/AAC.49.4.1354-1358.2005

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Тиолас, А., Борнет, К., Давин-Регли, А., Пажес, Дж. М., и Боллет, К. (2004). Устойчивость к имипенему, цефепиму и цефпирому связана с мутацией осмопорина Omp36 Enterobacter aerogenes . Биохим. Биофиз. Рез. коммун. 317, 851–856. doi: 10.1016/j.bbrc.2004.03.130

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Торрес, Э., Лопес-Сереро, Л., Дель Торо, доктор медицины, и Паскуаль, А. (2014). Первое обнаружение и характеристика изолята Enterobacter aerogenes , продуцирующего OXA-48. Энферм. инфекции микробиол. клин. 32, 469–470. doi: 10.1016/j.eimc.2013.10.008

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Tran, Q.T., Dupont, M., Lavigne, J.P., Chevalier, J., Pagès, J.M., Sotto, A., et al. (2009). Возникновение механизма оттока и варианта цефалоспориназы в популяции изолятов Enterobacter aerogenes и Klebsiella pneumoniae , продуцирующих бета-лактамазы расширенного спектра действия. Антимикроб.Агенты Чемотер. 53, 1652–1656. doi: 10.1128/AAC.00822-08

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Валаде, Э., Давин-Регли, А., Болла, Ж.-М., и Паже, Ж.-М. (2013). «Бактериальная мембрана, ключ к контролю притока и оттока лекарств», в Antibiotics: Targets, Mechanisms and Resistance , eds CO Gualerzi, L. Brandi, A. Fabbretti, and CL Pon (Weinheim: Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. КГаА), 217–240. дои: 10.1002/9783527659685.ch9

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Велеба, М., Де Маджумдар, С., Хорнси, М., Вудфорд, Н., и Шнайдерс, Т. (2013). Генетическая характеристика устойчивости к тигециклину у клинических изолятов Enterobacter cloacae и Enterobacter aerogenes . J. Антимикроб. Чемотер. 68, 1011–1018. doi: 10.1093/jac/dks530

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Ван, С. А., Токарс, Дж. И., Бианчин, П. Дж., Карсон, Л. А., Ардуино, М. Дж., Смит, А. Л., и другие. (2000). Enterobacter cloacae инфекции кровотока, связанные с зараженным человеческим альбумином. клин. Заразить. Дис. 30, 35–40. дои: 10.1086/313585

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Yigit, H., Anderson, G.J., Biddle, J.W., Steward, C.D., Rasheed, J.K., Valera, L.L., et al. (2002). Резистентность к карбапенемам клинического изолята Enterobacter aerogenes связана со сниженной экспрессией аналогов порина OmpF и OmpC. Антимикроб. Агенты Чемотер. 46, 3817–3822. doi: 10.1128/AAC.46.12.3817-3822.2002

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Захер, А., и Чимолаи, Н. (1997). Профили типирования ERIC-PCR Enterobacter cloacae остаются стабильными после развития развитой резистентности к цефалоспоринам. Междунар. Дж. Антимикроб. Агенты 9, 165–167. дои: 10.1016/S0924-8579(97)00046-0

    Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

    Анализ кала: Бактериальный посев (для родителей)

    Что это такое

    Образец стула (фекалий) может предоставить врачам ценную информацию о том, что происходит, когда у ребенка возникают проблемы с желудком, кишечником или другой частью желудочно-кишечного тракта (ЖКТ).Посев кала помогает врачу определить наличие бактериальной инфекции в кишечнике.

    Лаборант помещает небольшие образцы стула в стерильную пластиковую посуду с питательными веществами, которые стимулируют рост определенных бактерий. Целевые бактерии будут расти только в том случае, если они уже находятся в образце стула. Если образуются бактериальные колонии, техник оценивает их с помощью микроскопа и химических тестов для идентификации организма.

    Почему это сделано

    Врач может запросить посев кала для поиска болезнетворных бактерий, таких как:

    Иногда обнаруживаются и другие бактерии.

    Посев кала может быть назначен, если у вашего ребенка диарея в течение нескольких дней или диарея с примесью крови, особенно если в вашем районе произошла вспышка болезни пищевого происхождения, если ваш ребенок недавно ел недоваренное мясо, яйца или непастеризованное молоко, или если ваш ребенок недавно путешествовал по некоторым местам за пределами Соединенных Штатов.

    р

    Подготовка

    В отличие от большинства других лабораторных анализов, образец стула обычно собирают родители дома, а не медицинские работники в больнице или клинике.Никакой специальной подготовки не требуется, но сообщите своему врачу, если ваш ребенок недавно принимал антибиотики.

    Процедура

    Врач или больничная лаборатория обычно предоставляют письменные инструкции о том, как собрать образец стула. Если инструкции не предоставлены, вот советы по сбору образца стула у вашего ребенка:

    • Обязательно наденьте защитные перчатки и вымойте после этого свои руки и руки ребенка.
    • Многие дети с диареей, особенно маленькие дети, не всегда могут заранее предупредить родителей о приближении дефекации.Поэтому для сбора образца стула используется пластиковая крышка в форме шляпы. Это улавливающее устройство можно быстро поместить над унитазом или под попку ребенка, чтобы собрать образец. Использование улавливающего устройства может предотвратить загрязнение стула туалетной водой. Еще один способ собрать образец стула — неплотно накрыть сиденье унитаза полиэтиленовой пленкой. Затем поместите образец стула в чистый герметичный контейнер, прежде чем доставить его в лабораторию.
    • Полиэтиленовую пленку также можно использовать для подгузника младенца или малыша, который еще не ходит в туалет.Повязка должна быть размещена так, чтобы моча попадала на подгузник, а не на пленку.
    • Ваш ребенок не должен мочиться в контейнер. Если возможно, попросите вашего ребенка опорожнить мочевой пузырь перед дефекацией, чтобы образец стула не был разбавлен мочой.
    • Стул необходимо поместить в чистые сухие пластиковые банки с завинчивающимися крышками. Вашего ребенка могут попросить предоставить образец стула один или несколько раз. Для достижения наилучших результатов стул следует доставить в лабораторию в течение нескольких часов.
    р

    Чего ожидать

    Когда образец поступает в лабораторию, лаборант смазывает образцы стула веществом, стимулирующим рост, внутри стерильных чашек. Каждая из этих чашек хранится при температуре, обеспечивающей самый быстрый рост целевых бактерий.

    Если бактериальные колонии не образуются, тест отрицательный, что означает отсутствие признаков бактериальной инфекции. Но если бактериальные колонии все-таки образуются, техник исследует их под микроскопом и может провести химические тесты, чтобы идентифицировать их более конкретно.

    Получение результатов

    Как правило, результат посева кала сообщается в течение 24–48 часов.

    Риски

    Со сбором образцов стула не связано никаких рисков.

    Помощь вашему ребенку

    Сбор кала безболезненный. Скажите ребенку, что сбор стула не повредит, но делать это нужно осторожно. Ребенок, который достаточно взрослый, может быть в состоянии собрать образец в одиночку, чтобы избежать смущения. Расскажите ребенку, как это сделать правильно.

    Если у вас есть вопросы

    Если у вас есть вопросы о культуре кала, поговорите со своим врачом.

    Энтеробактерии в кале у взрослого: Дисбактериоз кишечника
  • Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован.