Содержание

Дисбактериоз кишечника: симптомы, лечение, причины, профилактика

Оглавление:

Общие сведения

​В норме в желудочно-кишечном тракте проживает масса бактерий, которые выполняют самые разнообразные полезные функции: расщепляют растительную клетчатку, синтезируют витамины группы В, сдерживают размножение патогенных микроорганизмов и др. При дисбактериозе происходит изменение качественного и количественного состава микрофлоры кишечника —  популяция полезных бифидо- и лактобактерий существенно уменьшается, а количество патогенных микроорганизмов растет.

Причины дисбактериоза кишечника

  • длительный бесконтрольный прием антибиотиков;
  • перенесенная острая кишечная инфекция;
  • несбалансированное питание;
  • хронические заболевания желудочно-кишечного тракта;
  • злоупотребление алкоголем;
  • тяжелые иммунодефициты (при лейкозе, СПИДе, лечении злокачественных опухолей лучевой и химиотерапией).

Симптомы дисбактериоза кишечника

​Симптомы  и проявления обычно связаны с заболеванием или состоянием, которое вызвало дисбактериоз, и являются неспецифичными:

Что можете сделать Вы

​Лечение дисбактериоза – это длительный процесс. Поэтому ваша основная задача скрупулезно соблюдать назначения врача.

Лечение

Что может сделать врач

Диагностикой и лечением дисбактериоза, как правило, занимается терапевт. Для постановки диагноза требуется наличие определенной клинической картины, а также результаты следующих анализов: копрограмма (общий анализ кала) и микробиологический посев кала. Но для назначения грамотного лечения необходимо не только установить наличие дисбактериоза, но и выявить его причину. В каждом конкретном случае могут потребоваться разный набор дополнительных исследований.

Лекарственные препараты, используемые при дисбактериозе, разделяют на пробиотики и пребиотики.

Пробиотики содержат в себе живые микроорганизмы — молочнокислые бактерии, чаще бифидо- или лактобактерии,  которые относятся к нормальным обитателям кишечника здорового человека. Пребиотики – это вещества, создающие среду для роста полезных бактерий. В большинстве случаев для лечения дисбактериоза бывает достаточно вновь заселить кишечник здоровой микрофлорой. А она сама победит патогенные микроорганизмы. Иногда все же для борьбы с патогенной флорой приходится использовать антибиотики. Лечение проводится не менее 4-6 недель с последующим контролем эффективности терапии.

Профилактика

Немаловажное значение для профилактики дисбактериоза имеет рациональный режим питания и сбалансированный состав пищи. При назначении антибиотиков параллельно рекомендуется применять препараты, поддерживающие рост и развитие нормальной микрофлоры. Будущим мамам следует знать, что вскармливание грудным молоком защищает малышей от дисбактериоза с самого рождения.

Эффективное лечение дисбактериоза | Клиника китайской медицины ТАО

Кишечник здорового человека содержит не менее 300 видов микроорганизмов, представляющих собой индивидуальную для каждого картину микромира. Состав микрофлоры формируется в первые несколько суток после рождения ребенка и изменяется на протяжении жизни в зависимости от множества обстоятельств (заболеваний, состояния иммунитета, питания, приема лекарственных препаратов). Нарушение микробного равновесия (изменение количественного и качественного состава микрофлоры) и есть дисбактериоз кишечника.

Читать полностью

Дисбактериоз

Дисбактериоз кишечника. Причины

В настоящее время известно множество факторов, способствующих нарушению микрофлоры кишечника. В частности, следует отметить частое возникновение дисбиоза после перенесенных острых кишечных инфекций, после применения антибиотиков, способных подавлять не только патогенную, но и нормальную флору. Дисбактериоз кишечника нередко сопровождает аллергические заболевания, воспалительные болезни пищеварительной системы (язвенная болезнь желудка и кишечника, панкреатит, холецистит, колит). Провоцирующими факторами являются стресс, нерациональное питание, заболевания почек, анемия, опухоли.

Важно помнить, что дисбактериоз может носить как явный характер (сопровождаться нарушениями стула), так и быть скрытым (на его наличие могут указывать заболевания желудочно-кишечного тракта, частые простудные и инфекционные заболевания).

Представители традиционной китайской медицины связывают возникновение этого патологического состояния с нарушением энергетического баланса, ослаблением защитных сил организма.

Проявления дисбактериоза кишечника

Первым на возникновение дисбактериоза реагирует желудочно-кишечный тракт. У пациента возникает нарушение стула (понос, запор), метеоризм (вздутие и урчание в животе), позывы к дефекации, нередко, ложные и болезненные, ощущение неполного опорожнения кишечника, тошнота, рвота, неприятный привкус во рту, отрыжка, угнетение аппетита, боли в животе. Продолжительное течение патологического процесса сопровождается симптоматикой общей слабости, утомляемости, нарушением сна и работоспособности, головной болью, раздражительностью, снижением веса, анемией. У детей дисбактериоз вызывает аллергические высыпания на коже, зуд и сухость кожных покровов.

Лечение дисбактериоза

Лечение дисбактериоза кишечника необходимо начинать с выявления причины и ее коррекции. Немаловажное значение имеет нормализация питания пациента, обязательными компонентами которого должны стать крупы, свежие овощи и фрукты, орехи, кисломолочные продукты, создающие благоприятные условия для роста и размножения нормальной микрофлоры кишечника — пребиотики. Кроме того, необходимо исключить влияние ряда факторов: например, антибиотики и сульфаниламидные препараты угнетают не только патогенные микроорганизмы, но и нормальную микрофлору, а в результате обильно размножаются микробы, попадающие извне или особо устойчивые к лекарственным средствам. Европейская медицина предлагает для лечения дисбактериоза комплекс лекарственных препаратов, содержащих живые микроорганизмы, генноинженерные штаммы микроорганизмов, а также продукты, так называемого, функционального питания, создающие в кишечнике человека благоприятную среду для роста флоры. Стоит, однако, отметить, что это лечение довольно длительное и дорогостоящее, а результат не всегда может удовлетворять пациента.

В отличие от европейской, в традиционной китайской медицине для лечения дисбактериоза применяется комплексный подход, основная цель которого — создание в организме пациента благоприятных условий для самовосстановления. То есть происходит нормализация энергетического баланса, восстановление работы кишечника и иммунитета. Врачи клиники китайской медицины «ТАО» практикуют эффективные и безопасные методики лечения дисбактериоза у женщин и мужчин, у взрослых и детей по индивидуальным программам.

симптомы, причины и лечение в Мытищах

Дисбактериоз – это кишечное расстройство, связанное с нарушением нормальной микрофлоры. В группе риска находятся маленькие дети до 2-3 лет, причем провоцирующие факторы могут отличаться в зависимости от возраста. Лечение дисбактериоза кишечника у детей сводится к нормализации баланса микроорганизмов.

При появлении первых признаков расстройства пищеварения покажите вашего малыша врачу. Записаться на прием к педиатру в медицинском центре «Апельсин» можно по телефону +7 (495) 646-80-03 или оставив заявку с помощью формы на сайте.

Причины

Детский дисбактериоз – это вторичное состояние. Изменения микрофлоры всегда связаны с другими неблагоприятными факторами. Например, у месячного ребенка таким фактором может стать искусственное вскармливание, у малышей до 1 года – неполноценное питание, отсутствие нормального прикорма.

Среди других причин, способных вызвать нарушение микрофлоры, можно отметить:

  • Расстройства стула, независимо от вызвавших их причин. Особенно часто к дисбактериозу приводит диарея.
  • Заболевания органов пищеварения.
  • Перенесенные инфекционные заболевания и лечение антибиотиками.

Диагностика

Диагностика и лечение дисбактериоза у детей всегда связаны с основным заболеванием. Основной диагностический метод – лабораторные исследования. Раньше широко использовался анализ кала, но этот метод имеет много недостатков, особенно, когда речь идет о маленьком ребенке. Дело в том, что при заборе материала для анализа необходимо соблюсти целый ряд правил, а это не всегда возможно.

По этой причине врачи нашей клиники используют другие диагностические методы:

  • Копрологическое исследование.
  • Бактериологическое исследование кала и желчи, соскобов со стенок разных отделов кишечника.
  • Биохимический анализ.

Эти методы позволяют получить точную информацию о микрофлоре кишечника. В тех случаях, когда врач подозревает, что дисбактериоз вызван заболеваниями органов ЖКТ, он назначит эндоскопическое обследование.

Лечение

Если ребенка ничего не беспокоит, лечение дисбактериоза у детей с использованием препаратов не всегда оправдано. Возможно, достаточно изменить схему питания. Например, у годовалого ребенка может оказаться пищевая аллергия, которая приводит к нарушению микрофлоры.

Когда дисбактериоз развивается на фоне другой болезни, в первую очередь врач лечит первичное заболевание, и по мере облегчения состояния восстанавливается и микрофлора. Дополнительно могут быть назначены:

  • Препараты, содержащие микроорганизмы.
  • Средства, формирующие благоприятную среду для размножения лакто- и бифидобактерий.

Иногда врач может назначить курс антибиотиков, а после этого – восстанавливающие микрофлору препараты. Программу лечения у детей может подобрать только профильный специалист. Ваша задача – строго следовать его рекомендациями и не пытаться лечить расстройство самостоятельно.

определение, клинические последствия и предлагаемый протокол лечения (протокол Перротта для клинического лечения дисбактериоза кишечника, PID) для лечения и устранения стойкого или хронического дисбактериоза

062

https://www. peertechzpublications.com/journals/archives клинической гастроэнтерологии

Образец цитирования: Perrotta G (2021) Дисбактериоз кишечника: определение, клинические последствия и предлагаемый протокол лечения (Протокол Perrotta для клинического ведения

Дисбиоз кишечника, PID) для лечения и разрешения персистирующих или хронических дисбактериоз.Arch Clin Gastroenterol 7(2): 056-063.

DOI: https://dx.doi.org/10.17352/2455-2283.000100

55. Perrotta G (2019)–Биполярное расстройство: определение, дифференциальный диагноз, клинические контексты и терапевтические подходы. J Neuroscience and Neurological

Surgery 5. Ссылка: https://bit.ly/3hKPdqM

56. Kim HN, Yun Y, Ryu S, Chang Y, Kwon MJ, et al (2018) Корреляция между микробиотой кишечника

и личность у взрослых: перекрестное исследование.Мозг Бех Имм

69: 374-485. Ссылка: https://bit.ly/2R7A3Dc

57. Bauer ME, Teixeira AL (2018) Воспаление при психических расстройствах: что

стоит на первом месте? Ann NY Acad Sci 1437: 57-67. Ссылка: https://bit.ly/34CUZVM

58. Kennedy PJ, Murphy AB, Cryan JF, Ross PR, Dinan TG, et al. (2016) Микробиом

в функции мозга и психическом здоровье. Trends Food Science & Technology 57:

289-301. Ссылка: https://bit.ly/3iLg1YX

59.Perrotta G (2020)Пограничное расстройство личности: определение, дифференциальный диагноз, клинический контекст и терапевтические подходы. Ann Psychiatry

Treatm 4: 043-056. Ссылка: https://bit.ly/3hx2B1N

60. Perrotta G (2020) Нарциссизм и психопатологические профили: определения,

клинический контекст, нейробиологические аспекты и клиническое лечение. J Clin Cases

Rep 4: 12-25. Ссылка: https://bit.ly/2X8wzzF

61. Perrotta G (2021) Истерическое расстройство личности: определение, клинические профили, дифференциальный диагноз

и терапевтические рамки.Arch Community Med

Общественное здравоохранение 7: 001-005. Ссылка: https://bit.ly/3cuga0H

62. Perrotta G (2021)Состояние сознания: от перцептивных изменений

к диссоциативным формам. Определяющий, нейробиологический и клинический профили. J Neuro

Neurol Sci Disord 7: 006-018. Ссылка: https://bit.ly/2P9JVvf

63. Perrotta G (2021) Избегающее расстройство личности: определение, клинические и

нейробиологические профили, дифференциальный диагноз и терапевтические рамки.J

Neuro Neurol Sci Disord 7: 001-005. Ссылка: https://bit.ly/3p5S9SP

64. Settani CR, Ianiro G, Bibbò S, Cammarota G, Gasbarrini A (2021) Кишечная микробиота

изменение и модуляция при психических расстройствах: современные данные о фекальной

микробиоте трансплантация. Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry 109:

110258. Ссылка: https://bit.ly/3fWwzfn

65. Perrotta G (2021) Психологические и иммунобиологические последствия

Covid-19: возможная корреляция с предыдущими пандемиями и наводит на мысль

терапевтическая гипотеза реконвалесцентной плазмы.Глоб Дж. Клин Вирол 6: 007-011.

Ссылка: https://bit.ly/3fWi8b7

66. Scaldaferri F, Ianiro G, Privitera G, Lopetuso LR, Vetrone LM, et al. (2020)

Захватывающее путешествие SARS-CoV-2 в кишечник: от патогенеза

до будущих клинических последствий. Воспаление кишечника Dis 26: 1306-1314. Ссылка:

https://bit.ly/3p5rQMy

67. Ferreira C, Viana SD, Reis F (2020) Является ли дисбиоз кишечной микробиоты предиктором

повышенной восприимчивости к неблагоприятному исходу у пациентов с Covid-19? Обновление.

Микроорганизмы 9: 53. Ссылка: https://bit.ly/3x5yPr1

68. Perrotta G (2021) Пандемия Covid-19: все возможные эффективные решения

искоренить проблему. Поперечный анализ клинического, социально-экономического,

политического и психологического профилей. Arch Community Med Public Health 7: 099-

110. Ссылка: https://bit.ly/3BxkNSI

69. Iebba V (2018) Il microbiota. Un nuovo mondo inesplorato. Кароччи Эд, Рома.

70. Оттман Н., Смидт Х., де Вос В.М., Белзер С. (2012) Функция нашей микробиоты:

кто там и что они делают?. Front Cell Infect Microbiol 2: 104. Ссылка:

https://bit.ly/2WjWojk

71. Meng X, Zhang G, Cao H, Yu D, Fang X и др. (2020)Дисбактериоз кишечника и

кишечных заболеваний: механизм и лечение. J Appl Microbiol 129: 787-805.

Ссылка: https://bit.ly/3y5pdOz

72. Saffouri GB, Shields-Cutler RR, Chen J, Yang Y, Lekatz HR, et al. (2019)

Микробный дисбактериоз тонкой кишки лежит в основе симптомов, связанных

с функциональными желудочно-кишечными расстройствами.Nat Commun 10: 2012. Ссылка:

https://go.nature.com/2VggRFi

73. Candido TLN, Bressan J, Alfenas RCG (2018)Дисбиоз и метаболический

эндотоксемия, вызванная диетой с высоким содержанием жиров. Нутр Хосп 35: 1432-1440. Ссылка:

https://bit.ly/3kTGRAO

74. Ghibbar R, Dieleman AL (2019) Микробиота кишечника при глютеновой болезни и пробиотики

. Питательные вещества 11: 2375. Ссылка: https://bit.ly/3kUXSKV

75. Seon-Kyun K, Guevarra RB, Kim YT, Kwon J, Kim H, et al. (2019) Роль пробиотиков

в заболеваниях, связанных с микробиомом кишечника человека. J Microbiol

Biotechnol 29: 1335-1340. Ссылка: https://bit.ly/2VdIlG

76. Тохо Р., Суарес А., Клементе М.Г., де лос Рейес-Гавилан К.Г., Марголлес

А и др. (2014) Кишечная микробиота в норме и при болезнях: роль

бифидобактерий в гомеостазе кишечника. World J Gastroenterol 20: 15163-76. Ссылка:

https://bit.ly/3zD8K4a

77. Tsai YL, Lin TL, Chang CJ, Wu TR, Lai WF, et al.(2019) Пробиотики, пребиотики

и облегчение заболеваний. J Biomed Sci 26: 3. Ссылка: https://bit.ly/3BF1qH8

78. Costantini L, Molinari R, Farinon B, Merendino N (2017) Влияние

омега-3 жирных кислот на микробиоту кишечника. Int J Mol Sci 18: 2645. Ссылка:

https://bit.ly/3i1A5Y4

79. Gagliardi A, Totino V, Cacciotti F, Iebba V, Neroni B, et al. (2018) Восстановление

экосистемы кишечной микробиоты. Int J Environ Res Public Health 15: 1679. Ссылка:

Ссылка: https://bit.ly/2V5yM1b

80. Liu J, Liu X, Xiong XQ, Yang T, Cui T et al. (2017) Влияние добавок витамина А

на микробиоту кишечника у детей с расстройствами аутистического спектра

— пилотное исследование. BMC Microbiol 17: 204. Ссылка: https://bit.ly/3y4UwZz

81. Cantorna MT, Snyder L, Arora J (2019) Витамин A и витамин D

регулируют микробную сложность, барьерную функцию и слизистую оболочку. иммунные реакции на

обеспечивают гомеостаз кишечника.Crit Rev Biochem Mol Biol 54: 184-192. Ссылка:

https://bit.ly/3iSR3aq

82. Sirisinha S (2015) Плейотропная роль витамина А в регуляции иммунитета

слизистых оболочек. Asian Pac J Allergy Immunol 33: 71-89. Ссылка: https://bit.ly/36ZK89B

83. Li Y, Luo ZY, Hu YY, Bi YW, Yang JM и др. (2020)Кишечная микробиота регулирует

поведение, подобное аутизму, опосредуя гомеостаз витамина B 6 у мышей

с дефицитом EphB6. Микробиом 8: 120. Ссылка: https://bit.ly/3i2RDTu

84. LeBlanc JG, Milani C, de Giori GS, Sesma F, van Sinderen D, et al. (2013)

Бактерии как поставщики витаминов своему хозяину: перспектива кишечной микробиоты. Curr

Опин Биотехнолог 24: 160-168. Ссылка: https://bit.ly/3eUt9tV

85. Jiang S, Zhu Q, Mai M, Yang W, Du G (2020) Витамин B и витамин D как

модуляторы микробиоты кишечника у людей с избыточным весом. Int J Food Sci Nutr 71:

1001-1009. Ссылка: https://bit.ly/3x9ubIt

86.Ратайчак А.Е., Шимчак-Томчак А., Скшипчак-Зелиньска М., Рихтер А.М.,

Завада А. и др. (2020) Дефицит витамина С и риск остеопороза

у пациентов с воспалительным заболеванием кишечника. Nutrients 12: 2263. Ссылка:

https://bit.ly/3rAdo0e

87. Ikeda S, Takahashi S, Suzuki N, Hanzawa F, Horio F, et al (2020) Gut

Микробиота не участвует в Индукция экспрессии белков острой фазы

, вызванная дефицитом витамина С.J Nutr Sci Vitaminol (Токио) 66: 19-23. Ссылка:

https://bit.ly/2WppZYN

88. Sassi F, Tamone C, D’Amelio P (2018) Витамин D: питательное вещество, гормон и иммуномодулятор

. Питательные вещества 10: 1656. Ссылка: https://bit.ly/2UPW63h

89. Риччио П., Россано Р. (2018) Диета, микробиота кишечника и витамины D + A при множественном склерозе

. Нейротерапия 15: 75-91. Ссылка: https://bit.ly/3y5pIIr

90. Choi Y, Lee S, Kim S, Lee J, Ha J и др. (2020) Потребление витамина Е (α-токоферол)

влияет на состав микробиоты кишечника.Int J Food Sci Nutr 71:

221-225. Ссылка: https://bit.ly/372SsFQ

91. Shabbir U, Rubab M, Daliri EB, Chelliah R, Javed A, et al (2021) Куркумин,

Кверцетин, катехины и метаболические заболевания: роль кишечника Микробиота.

Питательные вещества 13: 206. Ссылка: https://bit.ly/2VczWYC

Дисбиоз тонкой кишки: на пути к оптимальной терапии для нормализации микробиоты кишечника

Дисбактериоз в тонкой кишке: на пути к оптимальной терапии для нормализации микробиота кишечника

Microb Health Dis 2021; 3: e504

DOI: 10. 26355/mhd_20217_504

  Тема: Микробиота кишечника   Категория: Оригинальная статья

Гасбаррини Г. Università Cattolica del Sacro Cuore, Рим, Италия , Мосони С. Istituto di Medicina Interna, Università Cattolica del Sacro Cuore, Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli, Рим, Италия
[email protected]Это , Диониси Т. Istituto di Medicina Interna, Università Cattolica del Sacro Cuore, Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli, Рим, Италия , Гасбаррини А. Istituto di Medicina Interna, Università Cattolica del Sacro Cuore, Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli, Рим, Италия , Лопетузо Л. Р. Центр болезней пищеварительного тракта CEMAD, Отделение медицинских и хирургических наук, Fondazione Policlinico Universitario «A.Gemelli» IRCCS, Università Cattolica del Sacro Cuore, Рим, Италия

Abstract

Цели: Рифаксимин эффективен и безопасен при лечении избыточного бактериального роста в тонкой кишке (СИБР), однако на сегодняшний день нет единого мнения относительно правильного выбора времени терапии. Целью настоящего исследования является предоставление предварительных данных об эффектах рифаксимина (600 мг/сут в течение пяти дней) у пациентов с SIBO.

Пациенты и методы: Мы ретроспективно проанализировали клинические записи и исходные дыхательные тесты с лактулозой 15 в остальном здоровых пациентов с установленным диагнозом СИБР.7 человек получали рифаксимин в суточной дозе 600 мг/сут в течение 5 дней в месяц (1-я группа). Остальных 8 субъектов лечили той же суточной дозой рифаксимина, но в течение двух месячных циклов по 5 дней каждый (группа 2). Все пациенты повторили дыхательный тест через месяц. Результаты дыхательных тестов, проведенных на исходном уровне и через месяц, сравнивали, чтобы определить, имели ли разные дозы терапии разные эффекты.

Результаты: Сравнивая результаты дыхательных тестов, проведенных в начале исследования и через один месяц, мы обнаружили значительное снижение уровня h3 в выдыхаемом воздухе у пациентов, получавших рифаксимин в течение двух месячных циклов, в то время как уровни h3 в выдыхаемом воздухе оставались стабильными у пациентов, получавших только один месячный курс рифаксимина. У всех больных отмечалось клиническое улучшение.

Выводы: Настоящее исследование предполагает, что рифаксимин может улучшать дисбактериоз кишечника и симптомы желудочно-кишечного тракта, вызванные SIBO, с результатами, которые кажутся более очевидными, когда рифаксимин вводят в течение двух месячных циклов, а не одного.

Процитировать эту статью

Гасбаррини Г. Università Cattolica del Sacro Cuore, Рим, Италия , Мосони С.Istituto di Medicina Interna, Università Cattolica del Sacro Cuore, Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli, Рим, Италия
[email protected] , Диониси Т. Istituto di Medicina Interna, Università Cattolica del Sacro Cuore, Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli, Рим, Италия , Гасбаррини А. Istituto di Medicina Interna, Università Cattolica del Sacro Cuore, Fondazione Policlinico Universitario A.Джемелли, Рим, Италия , Лопетузо Л. Р. Центр болезней пищеварительного тракта CEMAD, Отделение медицинских и хирургических наук, Fondazione Policlinico Universitario «A. Gemelli» IRCCS, Università Cattolica del Sacro Cuore, Рим, Италия Дисбиоз тонкой кишки: на пути к оптимальной терапии для нормализации микробиоты кишечника

Microb Health Dis 2021; 3: e504
DOI: 10.26355/mhd_20217_504

История публикаций

Дата подачи: 26 мая 2021 г.

Отредактировано: 08 июня 2021 г.

Принято: 05 июля 2021 г.

Опубликовано онлайн: 23 июля 2021 г.

Симптомы и лечение дисбактериоза кишечника

Многие люди не осознают, насколько важен баланс микрофлоры кишечника для здоровья всего организма.Например, знаете ли вы, что около 70-80% иммунной системы организма находится в желудочно-кишечном тракте?

Если ваш кишечник разбалансирован, все ваше тело пойдет в одном направлении. Здоровье кишечника влияет на все в организме.

Давайте рассмотрим симптомы дисбактериоза кишечника, причины, диагностику и естественные варианты лечения.

Что такое дисбактериоз кишечника?

Дисбактериоз кишечника — это термин, обозначающий дисбаланс в желудочно-кишечной системе. Это противоположность ортобиозу, который означает, что в кишечнике существует здоровый баланс.Желудочно-кишечная система содержит более 500 видов бактерий, несколько различных видов дрожжей и, как упоминалось выше, составляет 70-80% иммунной системы организма. Целью желудочно-кишечной системы является расщепление и переваривание пищи для создания полезных для организма витаминов и минералов; поглощать эти витамины и питательные вещества; и предотвратить попадание в организм вредных для здоровья предметов, таких как токсины и патогены.

Несмотря на то, что в кишечнике много здоровых бактерий и тканей, в кишечник также могут попасть вредные бактерии, паразиты, вирусы, токсины и искусственные предметы из пищи и воды.Кроме того, когда кишечник нездоров, возникают проблемы с бактериальным балансом, что приводит к размножению дрожжей и грибков, в то время как здоровые бактерии уменьшаются. Этот дисбаланс приводит к повреждению кишечника и последующим проблемам в других частях тела, включая болезни, сыпь и другие проблемы, о которых мы поговорим далее.

Симптомы дисбактериоза кишечника

Симптомы дисбактериоза кишечника могут широко варьироваться в зависимости от организма каждого человека. Поскольку дисбактериоз может поражать любую часть тела, некоторые симптомы могут проявляться в желудочно-кишечном тракте, в то время как другие могут казаться не связанными с другими частями тела.Вот некоторые общие симптомы и связанные с ними заболеваниями:

Желудочно-кишечные симптомы:
  • Кислотный рефлюкс
  • Ощущение общего недомогания или усталости
  • .
  • Судороги

Цефтриаксон вызывает дисбактериоз и изменяет структуру кишечника при адъювантном лечении ожирения

  • Marchesi JR, Adams DH, Fava F, Hermes GDA, Hirschfield G, Hold G, et al.Микробиота кишечника и здоровье хозяина: новый клинический рубеж. Кишка. 2016;65:330–9.

    ПабМед Google ученый

  • Backhed F, Ding H, Wang T, Hooper LV, Koh GY, Nagy A, et al. Микробиота кишечника как фактор окружающей среды, регулирующий накопление жира.Proc Natl Acad Sci USA. 2004; 101:15718–23.

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Jumpertz R, Le DS, Turnbaugh PJ, Trinidad C, Bogardus C, Gordon JI, et al. Исследования энергетического баланса выявляют связь между кишечными микробами, калорийностью и усвоением питательных веществ у людей. Am J Clin Nutr. 2011;94:58–65.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Хупер Л.В., Вонг М.Х., Телин А., Ханссон Л., Фальк П.Г., Гордон Дж. И.Молекулярный анализ комменсальных отношений хозяин-микроб в кишечнике. Наука. 2001; 291:881–4.

    КАС пабмед Google ученый

  • Стаппенбек Т.С., Хупер Л.В., Гордон Дж.И. Регуляция развития кишечного ангиогенеза местными микробами через клетки Панета. Proc Natl Acad Sci USA. 2002; 99:15451–5.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Бакхед Ф., Манчестер Дж.К., Семенкович С.Ф., Гордон Дж.И.Механизмы, лежащие в основе устойчивости к диетическому ожирению у безмикробных мышей. Proc Natl Acad Sci USA. 2007; 104: 979–84.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Cani PD, Amar J, Iglesias MA, Poggi M, Knauf C, Bastelica D, et al. Метаболическая эндотоксемия инициирует ожирение и резистентность к инсулину. Диабет. 2007; 56: 1761–72.

    КАС пабмед Google ученый

  • Бакхед Ф.Программирование метаболизма хозяина кишечной микробиотой. Энн Нутр Метаб. 2011; 58:44–52.

    ПабМед Google ученый

  • Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ). Ожирение и избыточный вес, 2021 г. https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/obesity-and-overweight. По состоянию на 11 августа 2021 г.

  • Доре Дж., Блоттьер Х. Влияние диеты на микробиоту кишечника и ее последствия для здоровья. Курр Опин Биотехнолог. 2015;32:195–9.

    ПабМед Google ученый

  • Брусаферро А., Коццали Р., Орабона С., Бискарини А., Фаринелли Э., Кавалли Э. и др. Пришло ли время использовать пробиотики для профилактики или лечения ожирения? Питательные вещества. 2018;10:1613.

    Центральный пабмед Google ученый

  • Reis SA, Peluzio MCG, Bressan J. Использование противомикробных препаратов в качестве адъювантной терапии для лечения ожирения и резистентности к инсулину: эффекты и связанные механизмы.Diabetes Metab Res Rev. 2018;34:e3014.

    ПабМед Google ученый

  • Бороды Т.Дж., Хоруц А. Трансплантация фекальной микробиоты и новые приложения. Нат Рев Гастроэнтерол Гепатол. 2011;9:88–96.

    ПабМед Google ученый

  • Яниро Г., Тилг Х., Гасбаррини А. Антибиотики как глубинные модуляторы микробиоты кишечника: между добром и злом. Кишка. 2016; 65: 1906–15.

    КАС пабмед Google ученый

  • Willyard C. Лекарственно-устойчивые бактерии, представляющие наибольшую угрозу для здоровья. Природа. 2017;543:7643.

    Google ученый

  • Бекаттини С., Таур Ю., Памер Э.Г. Индуцированные антибиотиками изменения кишечной микробиоты и заболевания. Тренды Мол Мед. 2016; 22: 458–78.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Crovesy L, Ostrowski M, Ferreira DMTP, Rosado EL, Soares-Mota M.Влияние Lactobacillus на массу тела и жировые отложения у субъектов с избыточным весом: систематический обзор рандомизированных контролируемых клинических испытаний. Инт Дж. Обес. 2017;41:1607–14.

    КАС Google ученый

  • Дрисси Ф., Рауль Д., Мерхей В. Метаболическая роль лактобактерий в изменении веса у людей и животных. Микроб Патог. 2017;106:182–94.

    ПабМед Google ученый

  • Диас М.М., Рейс С.А., Консейсао Л.Л., Седияма CMNO, Перейра С.С., Оливейра Л.Л. и др. Ожирение, вызванное диетой, на животных моделях: моменты, которые следует учитывать, и влияние на метаболические маркеры. Диабетол Метаб Синдр. 2021;13:32.

    Google ученый

  • Dias MM, Louzano SAR, Conceição LL, Fernandes RC, Mendes TAO, Pereira SS, et al.Антибиотик, за которым следует потенциальный пробиотик, увеличивает количество бурой жировой ткани, снижает биометрические показатели и изменяет типы кишечной микробиоты при ожирении. Пробиотики Антимикроб Прот. 2021.

  • Hall KD, Ayuketah A, Brychta R, Cai H, Cassimatis T, Chen KY, et al. Ультраобработанные диеты вызывают избыточное потребление калорий и увеличение веса: стационарное рандомизированное контролируемое исследование потребления пищи вволю. Клеточный метаб. 2019;30:67–77.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Веттори А., Помпуччи Г., Паолини Б., Дель Чондоло И., Брессан С., Дундар М. и др.Генетический фон, питание и ожирение: обзор. Eur Rev Med Pharmacol Sci. 2019;23:1751–61.

    КАС пабмед Google ученый

  • Vedova MCD, Muñoz MD, Santillan LD, Plateo-Pignatari MG, Germanó MJ, Tosi MER, et al. Модель ожирения, вызванного диетой, на мышах, напоминающая большинство признаков метаболического синдрома человека. Nutr Metab Insights. 2016;9:93–102.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Мембрез М., Бланшер Ф., Жаке М., Бибилони Р., Кани П.Д., Бурселин Р.Г. и др. Модуляция кишечной микробиоты с помощью норфлоксацина и ампициллина повышает толерантность к глюкозе у мышей. FASEB J. 2008; 22:2416–26.

    КАС пабмед Google ученый

  • Раджпал Д.К., Кляйн Дж.Л., Мэйхью Д., Бушерон Дж., Спивак А.Т., Кумар В. и др.Модуляция микробиома кишечника антибиотиками селективного спектра в моделях ожирения и диабета у грызунов. PLoS 1. 2015; 10:1–19.

    Google ученый

  • Del Fiol FS, Ferreira ACMT, Marciano JJ, Marques MC, Sant’Ana LL. Ожирение и использование антибиотиков и пробиотиков у крыс. Химиотерапия. 2014;60:162–7.

    Google ученый

  • Роза Д.Д., Гжесковяк Л.М., Феррейра CLLF, Фонсека А.К.М., Рейс С.А., Диас М.М. и др.Кефир снижает резистентность к инсулину и экспрессию воспалительных цитокинов в модели метаболического синдрома на животных. Функция питания 2016;7:3390–401.

    КАС пабмед Google ученый

  • Jin W, Wang H, Ji Y, Hu Q, Yan W, Chen G и др. Повышенная воспалительная реакция кишечника и дисфункция кишечного барьера у мышей с дефицитом Nrf2 после черепно-мозговой травмы. Цитокин. 2008;44:135–40.

    КАС пабмед Google ученый

  • Роза Д.Д., Сейлз Р.Л., Мораес ЛФС, Лоренсу Ф.К., Невес К.А., Сабаренсе К.М. и др.Льняное семя, оливковое масло и рыбий жир влияют на плазматические липиды, миграцию лимфоцитов и морфометрию кишечника крыс Вистар. Бюстгальтеры Acta Cir. 2010;25:275–80.

    ПабМед Google ученый

  • Чжан Б.В., Ли М., Ма Л.К., Вэй Ф.В. Широко применимый протокол выделения ДНК из образцов фекалий. Биохим Генет. 2006; 44: 503–12.

    КАС пабмед Google ученый

  • Болгер А.М., Лозе М., Усадел Б.Trimmomatic: гибкий триммер для данных последовательностей Illumina. Биоинформатика. 2014;30:2114–20.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Каллахан Б.Дж., Макмерди П.Дж., Розен М.Дж., Хан А.В., Джонсон А.Дж.А., Холмс С.П. DADA2: Вывод образца с высоким разрешением из данных ампликона Illumina. Нат Методы. 2016;13:581–3.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Quast C, Pruesse E, Yilmaz P, Gerken J, Schweer T, Yarza P, et al. Проект базы данных генов рибосомной РНК SILVA: улучшенная обработка данных и веб-инструменты. Нуклеиновые Кислоты Res. 2013;41:D590–6.

    КАС Google ученый

  • McMurdie PJ, Homes S. Phyloseq: пакет биопроводников для обработки и анализа высокопроизводительных данных о филогенетических последовательностях. Pac Symp Biocomput 2012; 235–246.

  • Siegfried VR, Ruckermann H, Stumpf G, Siegfried VR, Ruckermann H, Siegfried VR, et al.Метод определения органических кислот в силосе методом высокоэффективной жидкостной хроматографии. Ландвирч. 1984.

  • Salles Teixeira TF, Moreira APB, Souza NCS, Frias R, Peluzio MCG. Измерение кишечной проницаемости: общие аспекты и возможные подводные камни. Нутр Хосп. 2014; 29: 269–81.

    ПабМед Google ученый

  • Arrieta MC, Bistritz L, Meddings JB. Изменения кишечной проницаемости. Кишка.2006; 55: 1512–20.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Линч С.В., Педерсен О. Микробиом кишечника человека в норме и при болезни. N Engl J Med. 2016; 375: 2369–79.

    КАС пабмед Google ученый

  • Guo Y, Yang X, Qi Y, Wen S, Liu Y, Tang S, et al. Длительное применение цефтриаксона натрия вызывало изменения микробиоты кишечника и иммунной системы.Научный доклад 2017; 7:43035.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Van Hal SJ, Ip CLC, Ansari MA, Wilson DJ, Espedido BA, Jensen SO, et al. Эволюционная динамика Enterococcus faecium выявляет сложные геномные отношения между изолятами с независимым появлением резистентности к ванкомицину. Микроб Геном. 2016;2:e000048.

    Центральный пабмед Google ученый

  • Джернберг С., Лофмарк С., Эдлунд С., Янссон Дж. К.Долгосрочные экологические последствия применения антибиотиков для микробиоты кишечника человека. ISME J. 2007; 1: 56–66.

    КАС пабмед Google ученый

  • Леви М., Колодзейчик А.А., Таисс К.А., Элинав Э. Дисбактериоз и иммунная система. Нат Рев Иммунол. 2017;17:219–32.

    КАС пабмед Google ученый

  • Колодзейчик А.А., Чжэн Д., Элинав Э. Взаимодействие диеты и микробиоты и индивидуальное питание.Nat Rev Microbiol. 2019;17(12):742–53. https://doi.org/10.1038/s41579-019-0256-8.

    КАС Статья пабмед Google ученый

  • Змора Н., Суэц Дж., Элинав Э. Вы то, что вы едите: диета, здоровье и микробиота кишечника. Нат Рев Гастроэнтерол Гепатол. 2019;16(1):35–56. https://doi.org/10.1038/s41575-018-0061-2.

    КАС Статья пабмед Google ученый

  • Саккас Х., Бозидис П., Тузиос С., Колиос Д., Афанасиу Г., Атанасопулу Э., Геру И., Гарцоника К.Пищевой статус и влияние веганской диеты на микробиоту кишечника и здоровье человека. Медицина. 2020;56(2):88. https://doi.org/10.3390/medicina56020088.

    Артикул ПабМед Центральный Google ученый

  • Белый PAS, Cercato LM, Araújo JMD, Souza LA, Soares AF, Barbosa APO и др. Modelo de obesidade induzida por диета hyperlipídica e associada à резистентность à ação да инсулина e непереносимость à глюкоза. Арк Брас Эндокринол Метабол.2013;57:339–45.

    ПабМед Google ученый

  • Cani PD, Bibiloni R, Knauf C, Waget A, Neyrinck AM, Delzenne NM, et al. Изменения в микробиоте кишечника контролируют воспаление, вызванное метаболической эндотоксемией, при ожирении и диабете, вызванных диетой с высоким содержанием жиров, у мышей. Диабет. 2008;57:1470–81.

    КАС пабмед Google ученый

  • Daniel H, Gholami AM, Berry D, Desmarchelier C, Hahne H, Loh G, et al.Диета с высоким содержанием жиров изменяет физиологию кишечной микробиоты у мышей. ISME J. 2014; 8: 295–308.

    КАС пабмед Google ученый

  • Ukibe K, Miyoshi M, Kadooka Y. Введение Lactobacillus gasseri SBT2055 подавляет инфильтрацию макрофагов в жировую ткань у мышей с ожирением, вызванным диетой. Бр Дж Нутр. 2015; 114:1180–7.

    КАС пабмед Google ученый

  • Hildebrandt MA, Hoffmann C, Sherrill-Mix SA, Keilbaugh SA, Hamady M, Chen Y-Y, et al. Диета с высоким содержанием жиров определяет состав микробиома кишечника мышей независимо от ожирения. Гастроэнтерология. 2009; 137:1716–24.

    КАС пабмед Google ученый

  • Jung SP, Lee KM, Kang JH, Yun S-I, Park H-O, Moon Y и др. Влияние Lactobacillus gasseri BNR17 на взрослых с избыточным весом и ожирением: рандомизированное двойное слепое клиническое исследование. Корейский J Fam Med. 2013;34:80–9.

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Кадоока Ю., Сато М., Имаидзуми К., Акаи Ю., Окано М., Кагосима М. и др.Регулирование абдоминального ожирения пробиотиками ( Lactobacillus gasseri SBT2055) у взрослых с тенденцией к ожирению в рандомизированном контролируемом исследовании. Eur J Clin Nutr. 2010;64:636–43.

    КАС пабмед Google ученый

  • Медицинская помощь, хирургическая помощь, консультации
  • Хао В.Л., Ли Ю.К. Микрофлора желудочно-кишечного тракта: обзор. Методы Мол Биол . 2004. 268:491-502. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Бурес Дж., Сирани Дж., Кохутова Д. и др. Синдром избыточного бактериального роста в тонкой кишке. Мир J Гастроэнтерол .2010 28 июня. 16(24):2978-90. [Ссылка QxMD MEDLINE]. [Полный текст].

  • Virally-Monod M, Tielmans D, Kevorkian JP, et al. Хроническая диарея и сахарный диабет: распространенность избыточного бактериального роста в тонкой кишке. Диабет Метаб . 1998 г., 24 декабря (6): 530-6. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Куигли Э.М., Абу-Шанаб А. Избыточный бактериальный рост в тонком кишечнике. Заразить Dis Clin North Am . 2010 Dec. 24(4):943-59, viii-ix. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Макэвой А., Даттон Дж., Джеймс О.Ф. Бактериальное заражение тонкого кишечника является важной причиной скрытой мальабсорбции у пожилых людей. Br Med J (Clin Res Ed) . 1983, 17 сентября. 287(6395):789-93. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Пароди А., Паолино С., Греко А., Драго Ф., Манси С., Ребора А. Избыточный бактериальный рост в тонком кишечнике при розацеа: клиническая эффективность его ликвидации. Клин Гастроэнтерол Гепатол . 2008 июль.6(7):759-64. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Рубио-Тапия А. , Бартон С.Х., Розенблатт Дж.Э., Мюррей Дж.А. Распространенность избыточного бактериального роста в тонкой кишке, диагностируемого с помощью количественного посева кишечного аспирата при целиакии. J Клин Гастроэнтерол . 2009 фев. 43(2):157-61. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Ghoshal UC, Ghoshal U, Misra A, Choudhuri G. Частично реагирующая глютеновая болезнь, возникающая в результате избыточного бактериального роста в тонком кишечнике и непереносимости лактозы. ВМС Гастроэнтерол . 2004 22 мая. 4:10. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Льюис С.Дж., Франко С., Янг Г., О’Киф С.Дж. Изменение функции кишечника и избыточный бактериальный рост в двенадцатиперстной кишке у пациентов, получавших омепразол. Алимент Фармакол Тер . 1996 авг. 10 (4): 557-61. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Элфик Д.А., Чу Т.С., Хайэм С. Е., Берд Н., Ахмад А., Сандерс Д.С. Избыточный бактериальный рост в тонком кишечнике у пожилых людей с симптомами: можно ли его диагностировать раньше? Геронтология . 2005 ноябрь-декабрь. 51(6):396-401. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Hoverstad T, Bjorneklett A, Fausa O, Midtvedt T. Короткоцепочечные жирные кислоты при синдроме избыточного бактериального роста в тонкой кишке. Scand J Гастроэнтерол . 1985 май. 20(4):492-9. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Кокошис С.А., Шлетевиц К., Лавлейс Г., Лайне Р.А. Желчные кислоты двенадцатиперстной кишки у детей: кетопроизводные и аэробный бактериальный рост в тонкой кишке [опубликованные опечатки появляются в J Pediatr Gastroenterol Nutr 1988 Jan-Feb; 7 (1): 155]. J Педиатр Гастроэнтерол Нутр . 1987 сентябрь-октябрь. 6(5):686-96. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Чалмерс Р. А., Валман Х.Б., Либерман М.М. Измерение 4-гидроксифенилуксусной ацидурии в качестве скринингового теста на заболевание тонкой кишки. Клин Хим . 1979 25 октября (10): 1791-4. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Шерр Х.П., Сасаки Ю., Ньюман А. и др. Обнаружение бактериальной деконъюгации солей желчных кислот с помощью удобного метода анализа дыхания. N Английский J Med .1971, 16 сентября. 285(12):656-61. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Саад Р.Дж., Чей В.Д. Дыхательный тест на избыточный бактериальный рост в тонком кишечнике: максимальная точность теста. Клин Гастроэнтерол Гепатол . 12 (12) декабря 2014 г.: 1964–72; викторина e119-20. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Гасбаррини А., Корацца Г.Р., Гасбаррини Г., Монтальто М., Ди Стефано М., Базилиско Г. Методология и показания h3-дыхательного теста при желудочно-кишечных заболеваниях: Конференция Римского консенсуса. Алимент Фармакол Тер . 2009 г., 30 марта. 29 Дополнение 1:1-49. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Хофманн АФ. оценка избыточного бактериального роста в тонкой кишке: как, когда и почему. В: Перри Ф., Андриулли А., редакторы. Клиническое применение дыхательных тестов в гастроэнтерологии и гепатологии. 1998.

  • Стоцер П.О., Киландер А.Ф. Сравнение 1-граммового (14)C-D-ксилозного дыхательного теста и 50-граммового водородно-глюкозного дыхательного теста для диагностики избыточного бактериального роста в тонком кишечнике. Переваривание . 2000. 61(3):165-71. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Peralta S, Cottone C, Doveri T, Almasio PL, Craxi A. Разрастание бактерий в тонком кишечнике и симптомы, связанные с синдромом раздраженного кишечника: опыт применения рифаксимина. Мир J Гастроэнтерол . 2009 7 июня. 15(21):2628-31. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Pimentel M. Обзор применения рифаксимина для лечения СИБР и СРК. Экспертное заключение по расследованию наркотиков . 2009 март.18(3):349-58. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Scarpellini E, Gabrielli M, Lauritano CE, Lupascu A, Merra G, Cammarota G. Рифаксимин в высоких дозах для лечения избыточного бактериального роста в тонкой кишке. Алимент Фармакол Тер . 2007 1 апреля. 25(7):781-6. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Frissora CL, Cash BD. Обзорная статья: роль антибиотиков по сравнению с традиционной фармакотерапией в лечении симптомов синдрома раздраженного кишечника. Алимент Фармакол Тер .2007 1 июня. 25(11):1271-81. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Тамер М.А., Сантора Т.Р., Сандберг Д.Х. Терапия холестирамином при трудноизлечимой диарее. Педиатрия . 1974 г., февраль 53(2):217-20. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Кастильоне Ф., Риспо А., Ди Джироламо Э., Коццолино А., Мангузо Ф., Грассия Р. и др. Антибиотикотерапия избыточного бактериального роста в тонкой кишке у пациентов с болезнью Крона. Алимент Фармакол Тер . 2003 г., 18 (11-12): 1107-12.[Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Вандерхоф Дж. А., Янг Р. Дж. Этиология и патогенез избыточного бактериального роста. Клинические проявления и диагностика избыточного бактериального роста. Лечение избыточного бактериального роста UpToDate онлайн, том 18.1; Уэлсли, 2010 г. http://www.uptodate.com. Доступно на http://www.uptodate.com.

  • Banwell JG, Sherr H. Влияние бактериальных энтеротоксинов на желудочно-кишечный тракт. Гастроэнтерология . 1973 г., сентябрь 65 (3): 467-97.[Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Quigley EM, Quera R. Избыточный бактериальный рост в тонком кишечнике: роль антибиотиков, пребиотиков и пробиотиков. Гастроэнтерология . 2006 г., февраль 130 (2 Дополнение 1): S78-90. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Онг Д.К., Митчелл С.Б., Барретт Дж.С., Шеперд С.Дж., Ирвинг П.М., Бесекьерски Дж.Р. и др. Манипуляции с короткоцепочечными углеводами в рационе изменяют характер газообразования и генез симптомов при синдроме раздраженного кишечника. J Гастроэнтерол Гепатол . 2010 авг. 25 (8): 1366-73. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Макинтош К., Рид Д.Е., Шнайдер Т., Данг Ф., Кештели А.Х., Де Пальма Г. и др. FODMAP изменяют симптомы и метаболизм пациентов с СРК: рандомизированное контролируемое исследование. Кишка . 2017 июль 66 (7): 1241-1251. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Zhong C, Qu C, Wang B, Liang S, Zeng B. Пробиотики для предотвращения и лечения избыточного бактериального роста в тонком кишечнике: метаанализ и систематический обзор текущих данных. J Клин Гастроэнтерол . 2017 51 апреля (4): 300-311. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • [Руководство] Пиментел М., Саад Р.Дж., Лонг М.Д., Рао ССК. Клинические рекомендации ACG: Избыточный бактериальный рост в тонком кишечнике. Am J Гастроэнтерол . 2020 фев. 115 (2): 165-178. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • [Руководство] Резаи А., Буреси М., Лембо А., Лин Х., МакКаллум Р., Рао С. и соавт. Дыхательные тесты на основе водорода и метана при желудочно-кишечных расстройствах: Североамериканский консенсус. Am J Гастроэнтерол . 2017 май. 112 (5): 775-784. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Hill ID, Mann MD, Househam KC, Bowie MD. Применение перорального гентамицина, метронидазола и холестирамина при лечении тяжелой персистирующей диареи у младенцев. Педиатрия . 1986 г., апрель 77(4):477-81. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Абрачинскас Д., Голдфингер Ю.В. Газы в кишечнике и вздутие живота. UpToDate онлайн, 18.1. Уэлсли, 2010 г. http://www.uptodate.com. Доступно на http://www.uptodate.com.

  • Бухник Ю., Ален С., Аттар А. и др. Бактериальные популяции, загрязняющие верхний отдел кишечника у пациентов с синдромом избыточного бактериального роста в тонкой кишке. Am J Гастроэнтерол . 1999 май.94(5):1327-31. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Дональд И. П., Китчингмэм Г., Дональд Ф., Купфер Р.М. Диагностика избыточного бактериального роста в тонкой кишке у пожилых пациентов. J Am Geriatr Soc . 1992 г., июль 40 (7): 692-6. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Элфик Д.А., Чу Т.С., Хайэм С.Е., Берд Н., Ахмад А., Сандерс Д.С. Избыточный бактериальный рост в тонком кишечнике у пожилых людей с симптомами: можно ли его диагностировать раньше? Геронтология . 2005 ноябрь-декабрь. 51(6):396-401.[Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Грейси М., Берк В., Ошин А. и др. Бактерии, соли желчных кислот и мальабсорбция моносахаридов в кишечнике. Кишка . 1971 Сентябрь 12 (9): 683-92. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Грегг CR. Кишечная бактериальная флора и синдром избыточного бактериального роста. Семин Гастроинтест Дис . 2002 13 октября (4): 200-9. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Haboubi NY, Lee GS, Montgomery RD. Морфометрия слизистой оболочки двенадцатиперстной кишки у пожилых пациентов с избыточным бактериальным ростом тонкой кишки: ответ на лечение антибиотиками. Возраст Старение . 1991 20 января (1): 29-32. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Килби А.М., Долби Дж.М., Хонор П., Уокер-Смит Дж.А. Бактериальная флора двенадцатиперстной кишки на ранних стадиях транзиторной непереносимости моносахаридов у детей раннего возраста. Arch Dis Child . 1977 март 52(3):228-34. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • King CE, Тоскес PP. Бактериальный рост в тонкой кишке. Гастроэнтерология . 1979 май. 76 (5 часть 1): 1035-55. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Клиш В.Дж., Удалл Дж.Н., Родригес Дж.Т. и др.Площадь поверхности кишечника у детей раннего возраста с приобретенной непереносимостью моносахаридов. J Педиатр . 1978 г., апрель 92(4):566-71. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Лин Х.К. Избыточный бактериальный рост в тонком кишечнике: основа для понимания синдрома раздраженного кишечника. ДЖАМА . 2004 г., 18 августа. 292(7):852-8. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Матиас Младший, Кленч М.Х. Обзор: патофизиология диареи, вызванной избыточным бактериальным ростом тонкой кишки. Am J Med Sci . 1985 июнь 289(6):243-8. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Мейерс Дж.С., Эренпрейс Э.Д., Крейг Р.М. Синдром избыточного бактериального роста в тонкой кишке. Curr Treat Options Гастроэнтерол . 2001 4 февраля (1): 7-14. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Nichols VN, Fraley JK, Evans KD, Nichols BL Jr. Приобретенная непереносимость моносахаридов у младенцев. J Педиатр Гастроэнтерол Нутр . 1989 8 января (1): 51-7. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Зальцман Дж. Р., Рассел Р. М. Пищевые последствия избыточного роста бактерий в кишечнике. Компрессор Ther . 1994. 20(9):523-30. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Tahan S, Melli LC, Mello CS, Rodrigues MS, Bezerra Filho H, de Morais MB. Эффективность триметоприм-сульфаметоксазола и метронидазола при лечении избыточного бактериального роста в тонкой кишке у детей, проживающих в трущобах. J Педиатр Гастроэнтерол Нутр . 2013 сен.57 (3): 316-8. [Ссылка QxMD MEDLINE].

  • Влияние антимикробной терапии на микробиом кишечника | Журнал антимикробной химиотерапии

    Аннотация

    Микробиом кишечника в настоящее время считается самостоятельным органом и играет важную роль в поддержании здоровья и восстановлении после критических заболеваний. Комменсальные организмы, ответственные за основу кишечного микробиома, ценны для защиты от болезней и решения различных физиологических задач.Критическое заболевание и связанные с ним вмешательства оказывают пагубное влияние на микробиом. Хотя противомикробные препараты являются одним из основных и часто спасающих жизнь пациентов с сепсисом средств, они также могут проложить путь к последующему вреду из-за повреждения микробиома кишечника. Баланс между чрезмерным использованием противомикробных препаратов и клинической потребностью в таких ситуациях часто бывает трудно определить, что способствует возникновению многих неспецифических признаков и симптомов сепсиса. Учитывая эффективность противомикробных препаратов, используемых для лечения пациентов с сепсисом, воздействие на микробиом кишечника часто бывает быстрым и длительным, и в этом случае полное выздоровление может никогда не наблюдаться.Чрезмерный рост оппортунистических патогенов вызывает серьезную озабоченность, поскольку они могут привести к инфекциям, которые становится все труднее лечить. Продолжение исследований для понимания нарушений микробиома кишечника у пациентов в критическом состоянии и их исходов имеет важное значение для разработки будущих методов лечения, позволяющих избежать повреждения или восстановить микробиом. В этом обзоре мы обсуждаем влияние противомикробных препаратов, часто используемых для лечения сепсиса, на микробиоту кишечника.

    Введение

    Кишечная микробиота — микробы, которые коллективно населяют кишечник человека, — играет ключевую роль в защите организма от потенциально вредных объектов, таких как бактерии, токсины и антигены. 1 Взаимодействие между сепсисом и микробиотой можно рассматривать как до сих пор не полностью изученную двунаправленную связь. Болезненное состояние сепсиса оказывает деструктивное влияние на микробиоту, но вмешательства при оказании помощи этим критически больным пациентам также являются внешними модуляторами микробиоты. 2

    Быстрое назначение адекватной противомикробной терапии пациентам с сепсисом имеет жизненно важное значение и связано с более низкой госпитальной и 30-дневной смертностью по сравнению с неадекватным эмпирическим введением антибиотиков. 3 , 4 Первоначальное лечение сепсиса критически влияет на клинический исход для пациента. Схемы эмпирической терапии при критических состояниях часто состоят из нескольких противомикробных препаратов широкого спектра действия для обеспечения надлежащего охвата потенциальных возбудителей, вызывающих озабоченность. Однако антибиотики больше не считаются только полезными; они также могут быть потенциально вредными агентами, поскольку многочисленные исследования показали, что их использование может иметь серьезные и долгосрочные последствия для состава микробиоты.При более раннем распознавании этиологии инфекции можно ограничить вред микробиоте за счет уменьшения неоправданного воздействия противомикробных препаратов. 5–7

    Продолжительность антимикробной терапии была независимо связана с развитием инфекции Clostridioides ( Clostridium ) difficile (ИКД). 8 , 9 Кроме того, многочисленные исследования продемонстрировали корреляцию воздействия противомикробных препаратов с влиянием на колонизацию и резистентность патогенов. 10–13 Например, распространение VRE после воздействия противомикробных препаратов также вызывает озабоченность, поскольку высокая бактериальная нагрузка увеличивает риск распространения через транслокацию и впоследствии может привести к инфекциям кровотока. Опосредованное антибиотиками истощение комменсальных бактерий снижает экспрессию RegIII-γ в кишечнике, которая обычно препятствует колонизации VRE. 14 Кроме того, эти нарушения в микробиоте могут предрасполагать пациента к рецидивирующей инфекции и сепсису. 15 , 16 Неудивительно, что для предотвращения или лечения сепсиса разрабатываются направленные на микробиоту методы лечения. 17 , 18 Остается выяснить, в какой степени эти изменения в микробиоте влияют на клинический исход у больных сепсисом. Одной из многих проблем в понимании связи между применением противомикробных препаратов и влиянием на микробиоту у пациентов с сепсисом является различный уровень воздействия противомикробных препаратов на госпитализированных пациентов, который трудно зафиксировать. 10–12 Спектр действия, полученная доза, способ введения, а также фармакокинетические и фармакодинамические свойства антибиотика определяют степень его воздействия на микробиоту. 5 , 6 Кроме того, многие другие виды лечения, назначаемые пациентам с сепсисом, такие как ингибиторы протонной помпы, энтеральное/парентеральное питание, противовоспалительные препараты, седативные средства, опиоиды и катехоламины, все описаны как оказывающие влияние на микробиота кишечника. 18 , 19 Влияние лекарств на микробиом остается в значительной степени недостаточно изученным, о чем свидетельствуют недавние скрининговые испытания in vitro 1200 имеющихся на рынке все лекарственные препараты, предназначенные для человека, ингибируют по крайней мере одного кишечного комменсала. 19

    Поскольку данные продолжают подтверждать основную роль микробиома при сепсисе, знания о взаимодействии хозяина и возбудителя, а также об экологическом воздействии противомикробных агентов имеют большое клиническое значение. В этом обзоре мы кратко обсудим влияние сепсиса и антибиотиков, используемых при сепсисе, на состав микробиоты кишечника.

    Влияние болезненного состояния при сепсисе на микробиом кишечника

    Сепсис определяется как угрожающая жизни органная дисфункция, вызванная нерегулируемой реакцией хозяина на инфекцию. 20 Несколько исследований показали потерю разнообразия микробиома — совокупности всех геномов микробов в экосистеме — у пациентов в критическом состоянии. 1 , 2 , 21–23 Было описано, что потеря разнообразия, называемая дисбиозом, потенциально связана с плохим исходом, хотя основной механизм все еще нуждается в выяснении. 21 , 24 Одзима и др. . 25 обнаружили, что крайние значения соотношения Bacteroidetes по отношению к Firmicutes в образцах стула предсказывали смерть по сравнению с выживанием. 2 Кроме того, относительное содержание Pseudomonas aeruginosa в микробиоте эндотрахеальных трубок предсказывало выживаемость пациентов, причем выжившие предпочитали тип Actinobacteria, который включает бифидобактерии, обычно обнаруживаемые при пробиотической терапии. 26 Микробиом пациентов в отделении интенсивной терапии характеризуется потерей разнообразия, локализации специфичности и микробного богатства, а также избыточным ростом условно-патогенных микроорганизмов, обычно стремящихся к одному таксону. 2 , 21 , 27 , 28 Истощение в Faecalibacterium , которые также продуцируют жизненно важные жирные кислоты для кишечника, короткоцепочечные. 29 Существуют большие межличностные различия в нарушении регуляции микробиома, чего можно ожидать, поскольку пациенты в критическом состоянии постоянно подвергаются широкому спектру эндогенных изменений, которые, как было показано, модулируют состав микробиоты кишечника (например,грамм. повышенная продукция катехоламинов, измененный метаболизм глюкозы и нарушение моторики желудочно-кишечного тракта). 18 , 21 , 30

    Трудно разделить влияние самого сепсиса на микробиоту и эффект лечения сепсиса. Исследование сепсиса, вызванного пневмонией, на мышах, при котором мышам интраназально вводили грамотрицательную палочку Burkholderia pseudomallei , показало заметное изменение бактериального состава фекалий у всех септических мышей с сильным увеличением протеобактерий и уменьшением актинобактерий. 31 Эти результаты согласуются с недавними сообщениями о дисбактериозе кишечника у мышей, которым через дыхательные пути были привиты грипп, а также Mycobacterium tuberculosis . 32 , 33 В этих исследованиях в фекалиях не было обнаружено B. pseudomallei , гриппа или M. tuberculosis . Эти исследования показывают, что системная воспалительная реакция сама по себе может приводить к заметным изменениям микробиоты кишечника во время сепсиса.

    Неонатальный сепсис и микробиом

    Недоношенные новорожденные и младенцы с низкой массой тела при рождении часто получают несколько курсов антибиотиков для лечения таких состояний, как сепсис с отрицательным посевом или профилактика, что вместе с их низким разнообразием микробиома может привести к серьезным долгосрочным последствиям для здоровья (например,грамм. астма, псориаз, другие аутоиммунные заболевания и ожирение/метаболический дисбаланс), а также предрасположенность к развитию инфекционных заболеваний. 34–38 Кроме того, под давлением антибиотиков предположительно полезные комменсальные бактерии могут быть заменены патогенами с МЛУ. Эти факторы представляют угрозу для квазистабильного микробиома, который развивается примерно к 3-летнему возрасту. 39

    Независимо от класса, общее повышение избирательного давления антибиотиков связано с уменьшением бактериального разнообразия и колонизацией микрорезистентными микроорганизмами.Исследования сообщают о 2–9-кратном повышении риска бактериального заражения МЛУ среди пациентов, получающих антибиотики, что также приводит к усилению выделения и, следовательно, к инфекционности. 40 Однако некоторые антибиотики влияют на видовое богатство больше, чем другие. 41 В дополнение к другим искажающим факторам (например, грудное вскармливание, общее состояние здоровья) лечение меропенемом, цефотаксимом или тикарциллином/клавуланатом связано со значительным сокращением видового богатства. 42 , 43 Эта взаимосвязь между антибиотиками и разнообразием видов в настоящее время является объектом целенаправленных исследований.Исследования у недоношенных детей также показали предполагаемую связь между конкретными потенциальными патогенами и повышенным риском некротизирующего энтероколита (НЭК). Повышенное обилие энтеробактерий (сдвиг в сторону протеобактерий) вместе с уменьшением эндогенных анаэробов и уменьшением микробного разнообразия, предшествующих началу НЭК, подтверждают эти результаты. 44 Антимикробная терапия в течение более 5 дней при подозрении на ранний сепсис связана с повышенным риском развития НЭК и общей смертности. 42

    Влияние вмешательств при сепсисе на микробиом

    Наиболее пагубное воздействие на микробиом потенциально оказывает широкое применение антибиотиков. 45 Проспективное многоцентровое исследование точечной распространенности (1 день), в ходе которого были собраны данные в 1265 отделениях интенсивной терапии по всему миру, показало, что 71% всех пациентов получали антибиотики. 46 Даже макролиды, которые иногда используются в качестве прокинетиков, несмотря на прямое противомикробное воздействие на микробиом, вызывают изменения времени прохождения через кишечник, которые, как было показано, имеют сравнительно большую величину эффекта, что составляет примерно 5% наблюдаемых изменений состава. 47 Как указано выше, помимо антимикробного лечения, существуют дополнительные эффекты неантибиотического лечения сепсиса (или критического заболевания) на микробиом, такие как влияние ингибиторов протонной помпы и нутритивной поддержки. 17

    Клиническая значимость дисбактериоза микробиома при сепсисе остается плохо изученной. Однако этот патобиом представляется крайне неблагоприятным, с потенциальной связью с иммуносупрессией, вызванной сепсисом. 17 Существует несколько стратегий модуляции микробиома во время критического состояния, например, использование селективной дезактивации пищеварительного тракта (СДД) для предотвращения патологического разрастания. 48 , 49 Несмотря на некоторые данные о SDD, демонстрирующие снижение инфекции нижних дыхательных путей в кровотоке, это не нашло широкого применения в клинической практике. 50 Частично это может быть связано с боязнью развития бактерий МЛУ; это необоснованно, исходя из большинства исследований, с оговоркой, что они в основном проводились в отделениях интенсивной терапии с низким исходным уровнем устойчивости к противомикробным препаратам. Бьюлоу и др. . 23 показали, что в небольшой когорте SDD привела к отбору только четырех генов устойчивости, и пришли к выводу, что риски, связанные с устойчивостью к антибиотикам, ограничены.Однако были данные, позволяющие предположить, что реколонизация бактериями MDR может произойти при выписке из отделения интенсивной терапии и прекращении SDD. Наконец, учитывая сложность данных, касающихся SDD, результаты часто трудно интерпретировать, и некоторые исследования предполагают, что SDD не связана с преимуществами, как недавно было продемонстрировано. 51 , 52

    Пробиотики уже используются в качестве терапии в некоторых отделениях интенсивной терапии, потенциально снижая заболеваемость вентилятор-ассоциированной пневмонией. 53 Недавнее рандомизированное исследование синбиотиков показало, что они могут предотвращать сепсис у новорожденных в Индии. 54 Приблизительно 4500 здоровых новорожденных были рандомизированы для получения 7-дневного курса либо плацебо, либо перорального синбиотического препарата ( Lactobacillus plantarum в фруктоолигосахаридах, выбранных на основании доклинических данных, свидетельствующих о колонизации верхних отделов кишечника). Исследование было прекращено досрочно после того, как в группе лечения было продемонстрировано снижение риска основного исхода (смерть или сепсис) на 40%.Что еще более интригует, так это сопутствующее снижение инфекций нижних дыхательных путей и кожи и мягких тканей, что свидетельствует о более системной пользе модуляции кишечного микробиома.

    Влияние противомикробной терапии на микробиом кишечника

    Здесь обсуждается влияние обычно используемых противомикробных препаратов на микробиоту кишечника, начиная с комбинации β-лактамов/ингибиторов β-лактамаз, цефалоспоринов, карбапенемов и фторхинолонов. В таблице 1 представлены сводные данные о фекалиях после введения противомикробных препаратов, обсуждаемых в этом обзоре. 55

    Таблица 1.

    Резюме противомикробных препаратов и их влияние на фекальную микробиоту a

    девяносто одна тысяча триста пятьдесят один 85 лактобацилл клостридии лактобациллы 94 1

    Класс противомикробных препаратов . Антимикробный . Воздействие на фекальную микробиоту
    .
    Артикул .
    уменьшение . увеличение . стабильный .
    Пенициллины пиперациллина / тазобактама Enterobacteriaceae Bacteroides 56
    бифидобактерии энтерококки
    эубактерий клостридии
    лактобациллы
    Цефалоспорины цефепим E. палочка Bacteroides 61
    бифидобактерии клостридии
    цефтазидим энтеробактерий энтерококки 62, 63
    лактобациллы Bacteroides
    Ceftriaxone Enterobacteriaceae Entercocci 72, 73
    E.палочка
    лактобациллы
    бифидобактерии
    Clostridia
    Карбапенемы меропенем Enterobacteriaceae энтерококки дрожжей 83
    клостридии лактобациллы
    Bacteroides бифидобактерии
    эубактерий
    имипенем энтеробактерий клостридии
    энтерококки
    бифидобактерии
    эубактерий
    лактобациллы
    Bacteroides
    эртапенем E. палочка 90 662 энтерококки лактобациллы 86
    бифидобактерии клостридии
    Bacteroides
    фторхинолоны ципрофлоксацин Enterobacteriaceae энтерококки анаэробная флора 90, 91
    бифидобактерии
    левофлоксацин E.палочка бифидобактерии 92
    энтерококки Bacteroides
    моксифлоксацина E.coli, 94
    Entercocccci
    Bifidobacteria
    ClostTridia
    девяносто одна тысяча триста пятьдесят один 85 лактобацилл клостридии лактобациллы 94

    Antimicrobial Class . Антимикробный . Воздействие на фекальную микробиоту
    .
    Артикул .
    уменьшение . увеличение . стабильный . 91 185
    Пенициллины пиперациллина / тазобактама Enterobacteriaceae Bacteroides 56
    бифидобактерии энтерококки
    эубактерий клостридии
    лактобациллы
    Цефалоспорины цефепим E.палочка Bacteroides 61
    бифидобактерии клостридии
    цефтазидим энтеробактерий энтерококки 62, 63
    лактобациллы Bacteroides
    Ceftriaxone Enterobacteriaceae Entercocci 72, 73
    E. палочка
    лактобациллы
    бифидобактерии
    Clostridia
    Карбапенемы меропенем Enterobacteriaceae энтерококки дрожжей 83
    клостридии лактобациллы
    Bacteroides бифидобактерии
    эубактерий
    имипенем энтеробактерий клостридии
    энтерококки
    бифидобактерии
    эубактерий
    лактобациллы
    Bacteroides
    эртапенем E.палочка энтерококки лактобациллы 86
    бифидобактерии клостридии
    Bacteroides
    фторхинолоны ципрофлоксацин Enterobacteriaceae энтерококки анаэробная флора 90, 91
    бифидобактерии
    левофлоксацин E. палочка 90 662 бифидобактерии 92
    энтерококки Bacteroides
    моксифлоксацина E.coli, 94
    Entercocccci бактерии
    Bifidobacteria
    Fusobacteria
    Closttridia
    Таблица 1.

    Краткое описание противомикробных препаратов и их воздействия на фекальную микробиоту a

    лактобацилл клостридии лактобациллы 94 1

    Класс противомикробных препаратов . Антимикробный . Воздействие на фекальную микробиоту
    .
    Артикул .
    уменьшение . увеличение . стабильный . 91 185
    Пенициллины пиперациллина / тазобактама Enterobacteriaceae Bacteroides 56
    бифидобактерии энтерококки
    эубактерий клостридии
    лактобациллы
    Цефалоспорины цефепим E.палочка Bacteroides 61
    бифидобактерии клостридии
    цефтазидим энтеробактерий энтерококки 62, 63
    лактобациллы Bacteroides
    Ceftriaxone Enterobacteriaceae Entercocci 72, 73
    E. палочка 90 662
    лактобациллы
    бифидобактерии
    Clostridia
    Карбапенемы меропенем Enterobacteriaceae энтерококки дрожжей 83
    клостридии лактобациллы
    Bacteroides бифидобактерии
    эубактерий
    имипенем энтеробактерий клостридии 85
    энтерококки
    бифидобактерии
    эубактерий
    лактобациллы
    Bacteroides
    эртапенем E.палочка 90 662 энтерококки лактобациллы 86
    бифидобактерии клостридии
    Bacteroides
    фторхинолоны ципрофлоксацин Enterobacteriaceae энтерококки анаэробная флора 90, 91
    бифидобактерии
    левофлоксацин E. палочка 90 662 бифидобактерии 92
    энтерококки Bacteroides
    моксифлоксацина E.coli, 94
    Entercocccci
    Bifidobacteria
    ClostTridia
    девяносто одна тысяча триста пятьдесят один 85 лактобацилл клостридии лактобациллы 94
    Antimicrobial Class . Антимикробный . Воздействие на фекальную микробиоту
    .
    Артикул .
    уменьшение . увеличение . стабильный .
    Пенициллины пиперациллина / тазобактама Enterobacteriaceae Bacteroides 56
    бифидобактерии энтерококки
    эубактерий клостридии
    лактобациллы
    Цефалоспорины цефепим E.палочка Bacteroides 61
    бифидобактерии клостридии
    цефтазидим энтеробактерий энтерококки 62, 63
    лактобациллы Bacteroides
    Ceftriaxone Enterobacteriaceae Entercocci 72, 73
    E. палочка
    лактобациллы
    бифидобактерии
    Clostridia
    Карбапенемы меропенем Enterobacteriaceae энтерококки дрожжей 83
    клостридии лактобациллы
    Bacteroides бифидобактерии
    эубактерий
    имипенем энтеробактерий клостридии
    энтерококки
    бифидобактерии
    эубактерий
    лактобациллы
    Bacteroides
    эртапенем E.палочка 90 662 энтерококки лактобациллы 86
    бифидобактерии клостридии
    Bacteroides
    фторхинолоны ципрофлоксацин Enterobacteriaceae энтерококки анаэробная флора 90, 91
    бифидобактерии
    левофлоксацин E. палочка + бифидобактерии 92
    энтерококки Bacteroides
    моксифлоксацина E.coli, 94
    Entercocccci Бактерии
    Bifidobacteria
    Fusobacteria
    Closttridia

    Piperacillin / Tazobactam

    Пиперациллин/тазобактам — это эмпирический противомикробный препарат, используемый у госпитализированных пациентов при подозрении на ряд инфекций, вызванных грамотрицательными микроорганизмами.Добавление ингибитора β-лактамазы тазобактама значительно расширяет спектр исходного соединения, позволяя охватить широкий спектр потенциальных патогенов, вызывающих озабоченность. Nord и коллеги 56 исследовали влияние пиперациллина/тазобактама на микробиоту человека у пациентов, получавших препарат в течение 4–8 дней для лечения внутрибрюшных инфекций. Хотя чрезмерного роста таких организмов, как C. difficile , не наблюдалось, предположительно из-за ингибирующей активности агента в отношении микроорганизмов, наблюдалось снижение количества анаэробных организмов, таких как бифидобактерии, эубактерии и лактобациллы. 56 , 57 Хотя во время лечения наблюдалось лишь незначительное снижение количества энтерококков, после прекращения лечения пиперациллином/тазобактамом фекальные концентрации энтерококков увеличивались до уровней, которые превышали фекальные концентрации до лечения. 56 Большую озабоченность вызвало выделение резистентных видов Enterobacter , которые были обнаружены у трех пациентов в результате лечения, возможно, в результате дерепрессированной продукции AmpC в присутствии лекарственного давления. Поскольку данные фекальной микробиоты предполагают развитие резистентности у Enterobacteriaceae после воздействия пиперациллина/тазобактама, это было подтверждено в рандомизированном клиническом исследовании у пациентов с интраабдоминальными инфекциями, получавших либо пиперациллин/тазобактам, либо эртапенем. 11 По сравнению с пациентами, получавшими эртапенем, у пациентов, получавших пиперациллин/тазобактам, была значительно более высокая частота резистентных энтеробактерий, идентифицированных с помощью ректальных мазков. В другом исследовании оценивали влияние одного пиперациллина на микрофлору толстой кишки у 20 пациентов, перенесших колоректальные операции, которые получали препарат в течение 2 дней с профилактической целью. 58 Наблюдалось снижение количества анаэробных кокков, как описано в приведенных выше исследованиях. У двух из 20 пациентов был выделен C. difficile с наличием токсинопродукции. Важно отметить, что оба пациента ранее получали антимикробную терапию. Несмотря на то, что терапия пиперациллином проводилась всего 2 дня, нарушения кишечной микрофлоры не возвращались к долечебным закономерностям до 4 недель. 58

    Хотя пиперациллин/тазобактам не был связан с колонизацией VRE в моделях на мышах, клинические данные у пациентов в отделении интенсивной терапии продемонстрировали обратное. 59 , 60 В исследовании 146 пациентов с задокументированным VRE-отрицательным ректальным мазком до терапии новые показатели колонизации VRE, наблюдаемые у пациентов, получавших цефепим, по сравнению с теми, кто лечился пиперациллином/тазобактамом, были одинаковыми, в пределах от от 25% до 30%. 60 Хотя обычно считается, что пиперациллин/тазобактам не имеет сильной связи с ВРЭ по сравнению с другими антибиотиками (например, цефалоспоринами расширенного спектра действия), исследования, оценивающие эту связь, часто объединяют класс пенициллинов в одну категорию.Проблема с этим обобщением заключается в различной степени экскреции желчи и анаэробной активности внутри класса, что в конечном итоге определяет разрушающее действие этих агентов на экологию микробиома.

    Цефепим и цефтазидим

    Цефепим представляет собой цефалоспорин четвертого поколения, применяемый в клинических условиях из-за его широкого спектра активности в отношении грамотрицательных патогенов, включая P. aeruginosa , а также из-за его стабильности в отношении микроорганизмов, продуцирующих AmpC.Влияние цефепима на кишечную флору изучали у 12 здоровых лиц в плацебо-контролируемом исследовании для оценки влияния препарата на микрофлору фекалий. Наблюдалось снижение количества Escherichia coli и бифидобактерий в фекалиях, а также минимальное увеличение Bacteroides spp. и C. difficile . 61 Кроме того, после 8 дней лечения цефепимом для нормализации фекальных бактерий потребовалось 20–48 дней.

    Цефтазидим — цефалоспорин третьего поколения, также обладающий широким спектром грамотрицательной активности, включая активность в отношении P.палочка . Влияние цефтазидима на фекальный микробиом изучали у восьми здоровых добровольцев. Как и ожидалось, к концу курса лечения содержание энтеробактерий в кишечнике было подавлено. 62 , 63 Кишечные анаэробные микроорганизмы, такие как Lactobacillus bifidus , имели небольшое снижение, а Bacteroides fragilis в целом имели минимальные колебания. Обнаружение устойчивых к ампициллину и цефазолину энтеробактерий через 2 недели после последней дозы было наиболее значительным влиянием цефтазидима на кишечную флору.Резистентности к цефтазидиму не наблюдалось. 62 Аналогичные результаты были получены в исследовании, проведенном Knothe и его коллегами. 63

    Цефалоспорины как класс ранее ассоциировались с колонизацией VRE. 64 , 65 Однако связь между отдельными антибиотиками класса цефалоспоринов и колонизацией VRE до недавнего времени не была хорошо описана. 66 Наблюдалась связь между количеством дней терапии цефепимом/цефтазидимом на 1000 пациенто-дней и возникновением колоний VRE. Однако это наблюдение не подтвердилось при многофакторном анализе с учетом демографических и клинических переменных. Сложно получить клинические данные о рисках и частоте колонизации резистентными микроорганизмами из-за множества факторов, влияющих на результаты. Наблюдательные изменения в показателях внутрибольничных инфекций также могут наблюдаться, когда нехватка лекарств приводит к более широкому использованию другого класса противомикробных препаратов в качестве замены. 67 Показатели VRE удвоились во время национальной нехватки пиперациллина/тазобактама, что привело к значительному увеличению использования цефепима в учреждении.

    Цефтриаксон

    Цефтриаксон является цефалоспорином третьего поколения с псевдомоналсберегающим грамотрицательным действием . Широкое проникновение этого агента в желчные пути делает его уникальным по сравнению с другими β-лактамами, а также делает его предпочтительным агентом для лечения некоторых инфекций, таких как холецистит. 68 Однако считается, что это фармакологическое свойство также приводит к более серьезным нарушениям микробиоты кишечника. Влияние цефтриаксона на кишечную микробиоту изучалось на различных популяциях пациентов, включая здоровых добровольцев, а также пациентов с острой инфекцией. 69–72 Эти исследования показали, что Enterobacteriaceae в кишечнике были либо в значительной степени подавлены, либо элиминированы. Хотя в большинстве этих исследований также было обнаружено снижение уровня анаэробных бактерий, они не были подавлены до такой степени, как Enterobacteriaceae. Кроме того, чрезмерный рост Enterococcus spp. наблюдалось. Интересно, что данные Nilsson-Ehle и коллег 73 предполагают корреляцию между билиарным клиренсом цефтриаксона и влиянием на микробиоту кишечника, учитывая, что у двух пациентов с минимальным воздействием на аэробные бактерии также был самый низкий билиарный клиренс.Кроме того, у одного пациента, у которого в фекалиях во время и после лечения присутствовал токсин-продуцирующий C. difficile с наличием диареи, был самый высокий билиарный клиренс.

    Влияние цефалоспоринов третьего поколения на фекальную флору также изучали у детей в возрасте от 2 до 18 месяцев, получавших противомикробную терапию по поводу серьезных бактериальных инфекций. 74 Образцы стула до лечения выявили однородную и нормальную кишечную флору с Pseudomonas spp.и Candida albicans присутствуют в небольших количествах. Первая доза цефтриаксона привела к элиминации чувствительных аэробных бактерий из фекалий всего за 48 часов. Кроме того, образцы показали увеличение присутствия C. albicans и энтерококков до тех пор, пока снова не появилась грамотрицательная флора. Во время лечения наиболее частым выделенным грамотрицательным микроорганизмом был P. aeruginosa.

    Чтобы лучше понять возникновение резистентности, de Lastours и коллеги 75 сравнили образцы стула пациентов, получавших цефтриаксон, с образцами пациентов, не получавших цефтриаксон, и обнаружили, что примерно у 27% пациентов, получавших цефтриаксон, были обнаружены новые штаммы Enterobacteriaceae, избыточно продуцирующие AmpC. Хотя наблюдалось небольшое увеличение колонизации организмов БЛРС, этот показатель не отличался от такового у госпитализированных пациентов, не получавших антибиотики, возможно, из-за риска передачи организмов БЛРС в условиях стационара независимо от воздействия антибиотиков. Персистенция колонизации AmpC-продуцирующими микроорганизмами была обнаружена у трех из четырех пациентов при длительном наблюдении, проведенном между 3 и 6 месяцами после лечения. Ранее также была описана корреляция между специфическими фармакокетическими концентрациями цефтриаксона и усилением генов резистентности к СТХ-М. fC max >30 мг/л или f AUC 0 24 >222 мг·ч/л были связаны с повышенным риском амплификации. 76 Кроме того, продолжительность лечения >14 дней, независимо от воздействия препарата, была связана с повышенным риском усиления.

    Длительный период полувыведения цефтриаксона позволяет вводить его один раз в день, что делает его привлекательным выбором для лечения широкого спектра стационарных и амбулаторных инфекций, но это также приводит к более широкому использованию по сравнению с другими цефалоспоринами. 77 Риск, связанный с колонизацией резистентными грамотрицательными бациллами в результате применения цефтриаксона, описан в литературе. 75 , 76 , 78 , 79 Исследование, проведенное в одном учреждении, анализирующем потребление антибиотиков и ИКД, выявило значительную клиническую корреляцию между цефтриаксоном и ИКД. 80 Аналогичные выводы были сделаны в результате метаанализа, проведенного с использованием 14 исследований, включавших преимущественно наблюдательные исследования случай-контроль.Этот метаанализ показал, что использование цефалоспоринов третьего поколения было связано с самым высоким риском внутрибольничной ИКД. 81 Как и другие цефалоспорины, использование цефтриаксона было связано с VRE. Одно исследование показало, что применение цефтриаксона было связано с заболеваемостью нозокомиальной ВРЭ в кровотоке, в то время как другие противомикробные препараты, такие как пиперациллин/тазобактам, цефтазидим и цефепим, не демонстрировали такой же корреляции. 82

    Несмотря на эти данные, цефтриаксон часто воспринимается как деэскалатор по сравнению со стандартными эмпирическими препаратами, такими как пиперациллин/тазобактам или цефепим.Хотя препарат имеет более узкий спектр действия по сравнению с цефалоспоринами нового поколения или пенициллинами расширенного спектра действия, известное влияние на микробиом кишечника, данные, свидетельствующие о риске колонизации резистентными патогенами, и обильное накопление в желудочно-кишечном тракте вызывают беспокойство.

    Карбапенемы

    Обладая надежной активностью в отношении патогенов, продуцирующих БЛРС, карбапенемы часто используются в качестве эмпирической терапии у пациентов с наличием в анамнезе лекарственно-устойчивых микроорганизмов или с высоким риском их возникновения.Хотя изменения кишечной микрофлоры наблюдались у пациентов, получавших меропенем и имипенем, они считались относительно незначительными по сравнению с изменениями, вызываемыми другими карбапенемами, предположительно из-за очень низких концентраций обоих агентов в фекалиях. 83–85 Однако было показано, что эртапенем оказывает большее влияние на кишечную микрофлору и обнаруживается в более значительных концентрациях с фекалиями. При исследовании на здоровых добровольцах было показано, что эртапенем снижает количество анаэробных организмов, таких как Bacteroides spp. 86 Также было отмечено снижение количества E. coli и увеличение количества энтерококков, подобное наблюдаемому при применении цефтриаксона. 86 Примечательно, что эти исследования проводились на здоровых добровольцах или пациентах, получавших короткие курсы терапии для хирургической профилактики, и, следовательно, продолжительность воздействия препарата и реакция организма, вероятно, были несопоставимы с продолжительностью, которую испытывали бы инфицированные пациенты.

    Воздействие эртапенема на приобретение резистентных энтеробактерий и VRE также сравнивали с воздействием пиперациллина/тазобактама у пациентов, получавших лечение по поводу интраабдоминальных инфекций. 11 Хотя это и не является статистически значимым, ректальные мазки выявили больше пациентов в группе эртапенема (6,4%), у которых развился ВРЭ, по сравнению с группой пиперациллин/тазобактам (1,6%). Однако у пациентов, получавших эртапенем, была более низкая частота резистентных энтеробактерий.

    Несмотря на менее значительные и более изменчивые изменения фекального микробиома при применении имипенема и меропенема, оба препарата связаны с клиническими последствиями, связанными с риском приобретения резистентных патогенов.Tacconelli и коллеги 10 оценили взаимосвязь между терапией антибиотиками и приобретением резистентных патогенов, особенно MRSA, VRE и резистентных к ципрофлоксацину P. aeruginosa . Эти данные показали, что карбапенемы, в частности имипенем и меропенем, были связаны с самым высоким риском развития устойчивых к антибиотикам бактерий: на 1000 дней приема антибиотиков было выявлено 14 новых случаев. Метаанализ рандомизированных исследований, изучающих риск ИКД, связанный с антибиотиками, показал, что карбапенемы связаны с более высоким риском, чем цефалоспорины и даже фторхинолоны, причем последние признаны предрасполагающими к ИКД пациентами. 87 Хотя это открытие является довольно уникальным для данного мета-анализа, следует отметить, что при проведении анализа подгрупп, оценивающего класс карбапенемов без эртапенема, наблюдалось аналогичное возникновение ИКД. Кроме того, этот метаанализ отличался тем, что оценивались только рандомизированные исследования, тогда как другие анализы включали наблюдательные исследования. 88

    Фторхинолоны

    Их превосходная пероральная биодоступность и мощная активность in vitro делают фторхинолоны широко применяемыми препаратами при различных состояниях, включая сепсис, вызванный мочевыводящими или дыхательными путями.Несмотря на серьезные проблемы с токсичностью (например, разрыв сухожилия, гипогликемия, невропатия), простота перехода на пероральный эквивалент способствовала чрезмерному использованию этих препаратов, так что с 2000 по 2010 год количество назначений увеличилось на 64%. 89 К сожалению, такое чрезмерное использование также привело к возникновению резистентности к фторхинолонам, что имеет негативные последствия для клинических исходов. Влияние на фекальную микробиоту широко используемых фторхинолонов, таких как ципрофлоксацин, левофлоксацин и моксифлоксацин, было изучено с относительно последовательными результатами. 90–94 Как и ожидалось, все эти исследования продемонстрировали значительное снижение фекальных концентраций Enterobacteriaceae, во многих из которых наблюдалась полная эрадикация при концентрациях ниже предела обнаружения. В меньшей степени и в большей степени в зависимости от индивидуального фторхинолона поражались анаэробные бактерии (например, клостридии, бифидобактерии и Bacteroides spp.). Появление резистентной к фторхинолонам E. coli , возможно, является одним из наиболее клинически значимых последствий применения фторхинолонов для микробиома.Несмотря на глубокую элиминацию Enterobacteriaceae, несколько исследований зафиксировали появление этих устойчивых штаммов E. coli в результате лечения фторхинолонами. 95 Уровень резистентной к фторхинолонам E. coli составил ∼15–20% в исследовании 451 госпитализированного пациента, получавшего курс фторхинолонов. 96 Ни продолжительность терапии, ни тип получаемого фторхинолона не имеют сильной связи с приобретением резистентности E.палочка . Возможно, наиболее тревожным и часто забываемым элементом в этом наборе данных является частота горизонтального переноса резистентных штаммов у пациентов, не получающих фторхинолоны, но находящихся в той же палате, в 5,6%. 96 Кроме того, мутации резистентности, затрагивающие биологические функции клетки, иногда могут привести к снижению приспособленности организма. Однако этого не наблюдалось ни у устойчивых к фторхинолонам штаммов E. coli , ни у появившихся в последнее время проблематичных штаммов фторхинолонов ST131, которые обнаруживаются не только у госпитализированных пациентов, но и колонизируют кишечник здоровых людей. 97

    Связь между применением фторхинолонов и ИКД была продемонстрирована в клинических исследованиях. 88 , 98 Однако эта связь не была столь глубокой в ​​ранее упомянутом метаанализе, в котором оценивались только рандомизированные исследования. 87 Связь между применением фторхинолонов и ИКД, по-видимому, тесно связана со штаммом BI/NAP1/027, который, хотя первоначально был выделен в Северной Америке, распространился в другие части мира. 99 Таким образом, возможно, что исследования, в которых упоминаются менее значимые ассоциации между фторхинолонами и ИКД, в целом показали более низкий уровень использования фторхинолонов и, следовательно, более низкие показатели резистентных к фторхинолонам штаммов C. difficile .

    Новые агенты

    Рашид и его коллеги недавно провели обзор исследований влияния новых противомикробных препаратов широкого спектра действия (например, цефтаролина, цефтобипрола, телаванцина и тигециклина) на человеческую микрофлору здоровых добровольцев. 100 Было обнаружено, что цефтаролин, цефтобипрол и телаванцин оказывают незначительное экологическое воздействие на кишечную микробиоту после 7-дневного приема антибиотиков. Кроме того, не наблюдалось новых колонизирующих аэробных или анаэробных бактерий, устойчивых к этим агентам. Влияние тигециклина на микрофлору кишечника было более обширным. 101 Уменьшение количества энтерококков, E. coli , лактобацилл и бифидобактерий (но не влияет на Bacteroides spp.) наблюдались в кишечной микрофлоре, в то время как численность других энтеробактерий и дрожжей увеличивалась. Кроме того, у некоторых пациентов были обнаружены устойчивые к тигециклину штаммы Enterobacter cloacae и Klebsiella pneumoniae . Большинство нарушений кишечной микробиоты нормализовалось к концу 31-дневного периода исследования.

    В последние годы на рынок поступили три комбинации β-лактамов/ингибиторов β-лактамаз: цефтазидим/авибактам, цефтолозан/тазобактам и меропенем/ваборбактам.Рашид и его коллеги 102 исследовали влияние цефтазидима/авибактама на микрофлору кишечника здоровых добровольцев и обнаружили, что он оказывает значительное экологическое воздействие на микробиоту кишечника. Количество E. coli и других энтеробактерий значительно уменьшалось при введении цефтазидима/авибактама, тогда как количество энтерококков увеличивалось. Лактобациллы, бифидобактерии, клостридии и Bacteroides spp. значительно снижалась при применении цефтазидима/авибактама.Токсигенные штаммы C. difficile были обнаружены у 5 из 12 добровольцев в ходе исследования. Влияние цефтолозана/тазобактама и меропенема/ваборбактама на кишечную флору в опубликованной литературе еще не описано.

    Время до разрушения

    Хотя обсуждаемые здесь данные о фекальной микробиоте подтверждают идею о том, что даже короткие курсы антибиотиков могут вызвать значительное нарушение микробиоты кишечника, гораздо сложнее точно определить, когда это нарушение происходит.Причины этой проблемы включают межпациентную изменчивость и наше понимание того, какие изменения являются клинически значимыми, в отличие от произвольных результатов. Исследования, в которых исследуется микробиом кишечника с использованием молекулярных методов, обеспечивают более полную оценку последовательных изменений в микробиоме кишечника.

    Исследовали фекальную микробиоту 39-летнего пациента, получавшего амоксициллин/клавулановую кислоту в дозе 875/125 мг два раза в сутки в течение 10 дней по поводу острого синусита. 103 У пациента развился жидкий стул в течение 24 часов терапии.Стул собирали при первой дефекации в течение дня во время антибактериальной терапии и еженедельно после этого. Образец дня 0 состоял в основном из Bacteroides spp., Clostridioides кластеров рРНК IV и XIVa и Bifidobacterium spp. Уже через 4 дня после начала терапии произошел сдвиг в составе микробиоты, включавший элиминацию кластера XIVa рРНК Clostridioides и Bifidobacterium spp.Кроме того, 34% последовательностей принадлежали Enterobacteriaceae, которые первоначально представляли только 2% последовательностей на 0-й день. За исключением бифидобактерий, нормализация микробиоты наблюдалась к 24-му дню. Несмотря на то, что диарея пациента не была связана с C. difficile , поскольку продукция токсина отсутствовала, было ясно, что микробиота кишечника сильно пострадала. В другом исследовании De La Cochetière и коллеги 104 использовали молекулярные методы для анализа фекальной микробиоты шести добровольцев, получавших 5-дневный курс амоксициллина.Профили сравнивали друг с другом на основе сходства, при этом день 0 использовался в качестве стандартного эталона. У четырех добровольцев, которые ежедневно предоставляли образцы стула, процент сходства снизился в среднем до 73% на 3-й день, в диапазоне от 62% до 82%. Более того, в то время как средний показатель на 4-й день оставался на уровне 74%, диапазон расширился до 46–94%, что указывает на величину межпациентной вариабельности.

    Описаны долгосрочные эффекты антибиотиков на микробиом, хотя они и изучаются реже. 105 , 106 В одном исследовании оценивалось влияние 10-дневного курса ципрофлоксацина на микробиом в течение года, при этом образцы фекалий собирались в общей сложности шесть раз. 106 При использовании культуральных методов наблюдалось снижение числа грамотрицательных аэробов, что согласуется с результатами исследований, описанных выше. Однако при использовании молекулярных методов влияние ципрофлоксацина на микробиоту проявлялось в течение всего периода исследования 12 мес. 106 В другом исследовании оценивали кишечный микробиом трех человек путем ежедневного отбора проб фекалий в течение 10-месячного периода у субъектов, получивших два 5-дневных курса ципрофлоксацина с интервалом в 6 месяцев. 105 Заметное изменение состава микробиоты наблюдалось уже через 3 дня после начала курса лечения. Из-за агрессивного отбора проб фекалий была зафиксирована и отмечена значительная межсубъектная изменчивость. Важно отметить, что до 50% микроорганизмов, которые составляли микробиоту кишечника до воздействия, были уничтожены воздействием ципрофлоксацина.Несмотря на стабильный состав микробиоты к восьмому месяцу исследования, состав микробиоты каждого субъекта был изменен по сравнению с составом, отмеченным до любого воздействия ципрофлоксацина. Авторы также отметили, что это стабильное изменение, вероятно, связано с множественными нарушениями, поскольку у одного субъекта действительно было полное выздоровление после первого курса лечения.

    Выводы

    Известно, что нарушения микробиома на раннем этапе развития имеют длительные последствия во взрослом возрасте и могут даже определять последующее течение болезни человека.Молекулярные данные, описывающие сдвиги фекальной микробиоты, позволяют предположить, что помимо изменений, происходящих после рождения и при воспалительных проявлениях желудочно-кишечных заболеваний, таких как болезнь Крона, значительное изменение, наблюдаемое при воздействии противомикробных препаратов, было единственной другой ситуацией, когда эти заметные изменения микробиоты очевидны. 107 , 108 Учитывая, что микробиом и сепсис тесно переплетены, будущие исследования должны расширить наши знания о важности гомеостатического микробиома и его терапевтическом потенциале.

    Несмотря на спасение жизни, антимикробные вмешательства оказывают значительное влияние на микробиоту кишечника, что приемлемо в контексте острой фазы лечения потенциально смертельной инфекции. Было проведено множество исследований, в основном с использованием культуральных методов, чтобы помочь лучше понять влияние конкретных противомикробных препаратов на фекальную микробиоту. Однако клинический перевод этих исследований является более сложной задачей. Пациенты часто получают несколько коктейлей терапии, находятся в состоянии воспаления и имеют смешанные проблемы, которые затрудняют установление прямой связи.Молекулярные методы могут обеспечить другой уровень детализации, которого не хватает культуральным методам. Как часть разумного управления, быстрые технологии, которые идентифицируют микроорганизмы и их предполагаемую реакцию на лечение антибиотиками (многие из которых делают это непосредственно из образца), могут облегчить усилия по управлению. Хотя нежелательно прекращать раннее вмешательство противомикробной терапии у пациентов с признаками и симптомами инфекции, следует приложить усилия для поддержки более ранней таргетной терапии, чтобы избежать ненужного воздействия этих агентов, поскольку многие из этих агентов разрушают микробиом всего за несколько секунд. разовая доза и может потребоваться до нескольких недель для восстановления.Подобно химиотерапии рака, таргетная антимикробная терапия должна быть оптимизирована для достижения баланса между эффективностью и токсичностью.

    Благодарности

    Авторы хотели бы выразить признательность Кристине Чантелл и Элизабет Вуд за их опыт и помощь в оценке этого обзора.

    Финансирование

    WJW получил грант Vidi (475) от Нидерландской организации научных исследований (NWO).H. S. V. и W. J. W получили Европейскую академию сепсиса Инновационной учебной сети Марии Кюри Скледовской (MC-ITN), финансируемой программой Европейского Союза Horizon 2020.

    Заявления о прозрачности

    А. А. Б. в настоящее время является сотрудником группы по научным вопросам компании Accelerate Diagnostics, Inc. и получает опционы на акции.

    Остальным авторам нечего объявлять.

    Эта статья является частью Дополнения, спонсируемого Accelerate Diagnostics Inc.

    Каталожные номера

    1

    Линч

    SV

    ,

    Педерсен

    О.

    Микробиом кишечника человека в норме и при патологии

    .

    N Engl J Med

    2016

    ;

    375

    :

    2369

    :

    2369

    79

    .2

    79

    .2

    McDonald

    D

    ,

    Ackermann

    ,

    G

    ,

    Khailova

    L

    et al.

    Экстремальный дисбактериоз микробиома при критических состояниях

    .

    mSphere

    2016

    ;

    4

    :

    E00199

    :

    E00199

    16

    .3

    маркет

    K

    ,

    Liesenborgs

    A

    ,

    Bergs

    J

    et al.

    Частота и исход неадекватного внутрибольничного эмпирического применения антибиотиков при тяжелой инфекции: систематический обзор и метаанализ

    .

    Crit Care

    2015

    ;

    19

    :

    63.

    4

    Родос

    А

    ,

    Эванс

    LE

    ,

    Альхаццани

    3 W

    2 и др.

    Кампания по выживанию при сепсисе: международные рекомендации по лечению сепсиса и септического шока: 2016

    .

    Медицинская интенсивная терапия

    2017

    ;

    43

    :

    304

    77

    .5

    Салливан

    Å

    ,

    Эдлунд

    С

    ,

    2 Норд

    ,

    Влияние противомикробных препаратов на экологический баланс микрофлоры человека

    .

    Ланцет Infect Dis

    2001

    ;

    1

    :

    101

    14

    .6

    Яниро

    G

    ,

    Тилг

    H

    ,

    Гасбаррини

    А.

    Антибиотики как глубинные модуляторы микробиоты кишечника: между добром и злом

    .

    Гут

    2016

    ;

    65

    :

    1906

    15

    .7

    Blaser

    MJ.

    Применение антибиотиков и его последствия для нормального микробиома

    .

    Наука

    2016

    ;

    352

    :

    544

    5

    .8

    Стивенс

    В

    ,

    Думяти

    Г

    ,

    Мелкий

    ЛС

    и др.

    Кумулятивное воздействие антибиотиков с течением времени и риск заражения Clostridium difficile

    .

    Clin Infect Dis

    2011

    ;

    53

    :

    42

    8

    .9

    Баффи

    CG

    ,

    Памер

    EG.

    Опосредованная микробиотой колонизационная резистентность к кишечным патогенам

    .

    Nat Rev Immunol

    2013

    ;

    13

    :

    790

    :

    790

    801

    .10

    Tacconelli

    E

    ,

    de Angelis

    G

    ,

    Cataldo

    MA

    et al.

    Использование антибиотиков и риск колонизации и инфицирования устойчивыми к антибиотикам бактериями: популяционное исследование больниц

    .

    Противомикробные агенты Chemother

    2009

    ;

    53

    :

    4264

    9

    .11

    DiNubile

    MJ

    ,

    Чау

    JW

    ,

    Satishchandran

    V

    и др.

    Приобретение резистентной кишечной флоры во время двойного слепого рандомизированного клинического исследования эртапенема по сравнению с терапией пиперациллином-тазобактамом при интраабдоминальных инфекциях

    .

    Противомикробные агенты Chemother

    2005

    ;

    49

    :

    3217

    :

    3217

    21

    .12

    Baden

    LR

    ,

    Thiemke

    W

    ,

    Skolnik

    A

    et al.

    Длительная колонизация устойчивыми к ванкомицину Enterococcus faecium у пациентов, находящихся на длительном лечении, и значение «клиренса»

    .

    Clin Infect Dis

    2001

    ;

    33

    :

    1654

    60

    .13

    Памер

    ЭГ.

    Восстановление микробиоты кишечника для борьбы с устойчивыми к антибиотикам патогенами

    .

    Наука

    2016

    ;

    352

    :

    535

    8

    .14

    Brandl

    K

    ,

    Plitas

    G

    ,

    Mihu

    CN

    и др.

    Устойчивые к ванкомицину энтерококки используют дефицит врожденного иммунитета, вызванный антибиотиками

    .

    Природа

    2008

    ;

    455

    :

    804

    704

    7

    .15

    Malik

    U

    ,

    Armstrong

    D

    ,

    Ashworth

    M

    et al.

    Связь между предшествующей терапией антибиотиками и последующим риском внебольничных инфекций: систематический обзор

    .

    J Antimicrob Chemother

    2018

    ;

    73

    :

    287

    96

    96

    .16

    Prescott

    HC

    ,

    Dickson

    RP

    ,

    Rogers

    MAM

    et al.

    Тип госпитализации и последующий тяжелый сепсис

    .

    Am J Respir Crit Care Med

    2015

    ;

    192

    :

    581

    8

    .17

    Хаак

    БВ

    ,

    Леви

    М

    ,

    Вирсинг

    Терапия, нацеленная на микробиоту, в отделении интенсивной терапии

    .

    Curr Opin Crit Care

    2017

    ;

    23

    :

    167

    74

    .18

    Haak

    BW

    ,

    Wiersinga

    WJ.

    Роль микробиоты кишечника при сепсисе

    .

    Ланцет Гастроэнтерол Гепатол

    2017

    ;

    2

    :

    135

    43

    43

    .19

    Maier

    L

    ,

    PRUTEANU

    M

    ,

    KUHN

    M

    et al.

    Обширное воздействие неантибиотических препаратов на кишечные бактерии человека

    .

    Природа

    2018

    ;

    555

    :

    623

    :

    623

    8

    .20

    Певица

    M

    ,

    Deutschman

    CS

    ,

    Seymour

    CW

    et al.

    Третий международный консенсус в отношении сепсиса и септического шока (Сепсис-3)

    .

    ДЖАМА

    2016

    ;

    315

    :

    801

    10

    .21

    Lankelma

    JM

    ,

    van Vught

    LA

    ,

    Belzer

    C

    и др.

    Критически больные пациенты демонстрируют большие межличностные различия в нарушении регуляции кишечной микробиоты: пилотное исследование

    .

    Медицинская интенсивная терапия

    2017

    ;

    43

    :

    59

    68

    .22

    Заборин

    А

    ,

    Смит

    Д

    ,

    Гарфилд 90et

    Состав и поведение сообществ патогенов со сверхнизким разнообразием, присутствующих в кишечнике человека во время длительной критической болезни

    .

    МБио

    2014

    ;

    5

    :

    E01361

    14

    .23 —

    14

    .23

    Buelow

    E

    ,

    Bello González

    TDJ

    ,

    Фуэнтес

    S

    et al.

    Сравнительный анализ кишечной микробиоты и профиля резистома пациентов интенсивной терапии, получающих селективную деконтаминацию желудочно-кишечного тракта, и здоровых добровольцев

    Микробиом

    2017

    ;

    5

    :

    88.

    24

    Крезалек

    МА

    ,

    ДеФацио

    Ж

    ,

    Заборина

    Оэт.

    Сдвиг кишечного «микробиома» в «патобиом» определяет течение и исход сепсиса после хирургической травмы

    .

    Амортизатор

    2016

    ;

    45

    :

    475

    475

    82

    .25

    Ojima

    M

    ,

    MOTOWA

    D

    ,

    Shimizu

    K

    et al.

    Метагеномный анализ выявляет динамические изменения микробиоты всего кишечника в острой фазе у пациентов отделения интенсивной терапии

    .

    Dig Dis Sci

    2016

    ;

    61

    :

    1628

    1628

    34

    .26

    Hotterbeekx,

    A

    ,

    Xavier

    BB

    ,

    Bielen

    K

    et al.

    Микробиом эндотрахеальной трубки, связанный с Pseudomonas aeruginosa или Staphylococcus epidermidis

    .

    Научный представитель

    2016

    ;

    6

    :

    36507.

    27

    Акрами

    К

    ,

    Суини

    Д.А.

    Микробиом тяжелобольного пациента

    .

    Curr Opin Crit Care

    2018

    ;

    24

    :

    49

    49

    54

    .28

    Yeh

    A

    ,

    Rogers

    MB

    ,

    Firek

    B

    et al.

    Дисбиоз во многих участках тела у взрослых хирургических пациентов в критическом состоянии

    .

    Амортизатор

    2016

    ;

    46

    :

    649

    54

    54

    .29

    Wischmeyer

    PE

    ,

    McDonald

    D

    ,

    Knight

    R

    Роль микробиома, пробиотиков и «терапии дисбактериоза» при критических состояниях

    .

    Curr Opin Crit Care

    2016

    ;

    22

    :

    347

    53

    .30

    Диксон

    RP.

    Микробиом и критические заболевания

    .

    Ланцет Респир Мед

    2016

    ;

    4

    :

    59

    59

    72

    .31

    Lankelma

    JM

    ,

    Birnie

    E

    ,

    Weehuizen

    TAF

    et al.

    Микробиота кишечника как модулятор врожденного иммунитета при мелиоидозе

    .

    PLoS Negl Trop Dis

    2017

    ;

    11

    :

    e0005548.

    32

    Deriu

    E

    ,

    Boxx

    GM

    ,

    He

    X

    и др.

    Вирус гриппа влияет на микробиоту кишечника и вторичную инфекцию Salmonella в кишечнике через интерфероны типа I

    .

    PLoS Pathog

    2016

    ;

    12

    :

    e1005572.

    33

    Winglee

    K

    ,

    Eloe-Fadrosh

    E

    ,

    Gupta

    S

    и др.

    Аэрозоль Инфекция Mycobacterium tuberculosis вызывает быструю потерю разнообразия микробиоты кишечника

    .

    PLoS One

    2014

    ;

    9

    :

    e97048.

    34

    Арболея

    С

    ,

    Бинетти

    А

    ,

    Салазар

    Н

    и др.

    Становление и развитие кишечной микробиоты у недоношенных новорожденных

    .

    FEMS Microbiol Ecol

    2012

    ;

    79

    :

    763

    763

    72

    .35

    72

    .35

    Holmes

    E

    ,

    LOO

    RL

    ,

    Stamler

    J

    et al.

    Разнообразие метаболических фенотипов человека и его связь с диетой и артериальным давлением

    .

    Природа

    2008

    ;

    453

    :

    396

    :

    396

    400

    .36

    Smith

    MI

    ,

    Yatsunenko

    T

    ,

    Манари

    MJ

    et al.

    Микробиомы кишечника малавийских пар близнецов, несовместимые с квашиоркором

    .

    Наука

    2013

    ;

    339

    :

    548

    54

    .37

    Стефка

    AT

    ,

    Фили

    T

    ,

    Трипати

    P

    и др.

    Комменсальные бактерии защищают от сенсибилизации пищевыми аллергенами

    .

    Proc Natl Acad Sci USA

    2014

    ;

    111

    :

    13145

    13145

    50

    .38

    HSIAO

    EY

    ,

    Mcbride

    SW

    ,

    HSIEN

    S

    et al.

    Микробиота модулирует поведенческие и физиологические отклонения, связанные с нарушениями развития нервной системы

    .

    Сотовый

    2013

    ;

    155

    :

    1451

    :

    1451

    63

    .39

    Langdon

    A

    ,

    Crook

    N

    ,

    Dantas

    G.

    Влияние антибиотиков на микробиом в процессе разработки и альтернативные подходы к терапевтическому модулированию

    .

    Геном Мед

    2016

    ;

    8

    :

    39

    .40

    Almagor

    J

    ,

    Temkin

    E

    ,

    Benenson

    I 900.0.

    Влияние использования антибиотиков на передачу резистентных бактерий в больницах: анализ агентной модели

    .

    PLoS One

    2018

    ;

    13

    :

    e0197111.

    41

    Graffunder

    EM

    ,

    Preston

    KE

    ,

    Evans

    AM

    и др.

    Факторы риска, связанные с микроорганизмами, продуцирующими бета-лактамазы расширенного спектра, в больнице третичного уровня

    .

    J Antimicrob Chemother

    2005

    ;

    56

    :

    139

    45

    .42

    Александр

    VN

    ,

    Northrup

    V

    ,

    Bizzarro

    Воздействие антибиотиков в отделении интенсивной терапии новорожденных и риск некротизирующего энтероколита

    .

    J Педиатр

    2011

    ;

    159

    :

    392

    7

    .43 —

    7

    .43

    Gibson

    Mk

    ,

    Wang

    B

    ,

    AHMADI

    S

    et al.

    Динамика развития микробиоты кишечника недоношенных детей и антибиотикорезистома

    .

    Nat Microbiol

    2016

    ;

    1

    :

    16024.

    44

    Seale

    JV

    ,

    Hutchinson

    RA

    ,

    Fleming

    и др.

    Определяет ли выбор антибиотика для лечения подозрения на поздний сепсис у недоношенных детей риск развития некротизирующего энтероколита? Систематический обзор

    .

    Early Hum Dev

    2018

    ;

    123

    :

    6

    10

    .45

    Blaser

    M.

    Злоупотребление антибиотиками: остановить уничтожение полезных бактерий

    .

    Природа

    2011

    ;

    476

    :

    396

    :

    493

    4

    .46

    Vincent

    J-L

    ,

    Rello

    J

    ,

    Marshall

    J

    et al.

    Международное исследование распространенности и исходов инфекции в отделениях интенсивной терапии

    .

    ДЖАМА

    2009

    ;

    302

    :

    2323

    2323

    9

    .47

    Roager

    HM

    ,

    Hansen

    LBS

    ,

    BAHL

    MI

    et al.

    Время транзита через толстую кишку зависит от бактериального метаболизма и оборота слизистой оболочки кишечника

    .

    Nat Microbiol

    2016

    ;

    1

    :

    16093.

    48

    Цена

    R

    ,

    MacLennan

    G

    ,

    Glen

    J

    J

    Селективная дезинфекция пищеварительного тракта или ротоглотки и местное введение хлоргексидина в ротоглотку для предотвращения смерти при общей интенсивной терапии: систематический обзор и сетевой метаанализ

    .

    БМЖ

    2014

    ;

    348

    :

    g2197.

    49

    Ван Нуд

    E

    ,

    Вриз

    A

    ,

    Ньюдорп

    M

    и др.

    Дуоденальное вливание донорских фекалий при рецидивах Clostridium difficile

    .

    N Engl J Med

    2013

    ;

    368

    :

    407

    407

    15

    .50

    De Smet

    AMGA

    ,

    Kluytmans

    Jajw

    ,

    BLOK

    HEM

    et al.

    Селективная деконтаминация пищеварительного тракта и селективная деконтаминация ротоглотки и резистентность к антибиотикам у пациентов в отделениях интенсивной терапии: открытое кластерное групповое рандомизированное перекрестное исследование

    .

    Ланцет Infect Dis

    2011

    ;

    11

    :

    372

    80

    .51

    Wittekamp

    BH

    ,

    Plantinga

    NL

    ,

    Cooper

    BS

    и др.

    Стратегии обеззараживания и инфекции кровотока устойчивыми к антибиотикам микроорганизмами у пациентов, находящихся на ИВЛ: рандомизированное клиническое исследование

    .

    ДЖАМА

    2018

    ;

    320

    :

    2087

    98

    .52

    Херли

    JC.

    Безопасна ли селективная дезинфекция пищеварительного тракта?

    Clin Infect Dis

    2015

    ;

    60

    :

    1729

    30

    .53

    Manzanares

    W

    ,

    Lemieux

    M

    ,

    Langlois

    PL

    и др.

    Пробиотическая и синбиотическая терапия при критических состояниях: систематический обзор и метаанализ

    .

    Crit Care

    2016

    ;

    19

    :

    262.

    54

    Паниграхи

    P

    ,

    Парида

    S

    ,

    Нанда

    3 NC и др.

    Рандомизированное исследование синбиотиков для предотвращения сепсиса среди младенцев в сельских районах Индии

    .

    Природа

    2017

    ;

    548

    :

    407

    12

    .55

    Мёллеринг

    RC.

    Фармакокинетика ванкомицина

    .

    J Antimicrob Chemother

    1984

    ;

    14

    PULT D:

    43

    52

    .56

    52

    .56

    NORD

    CE

    ,

    Brismar

    B

    ,

    Kasholm-Tengve

    B

    et al.

    Влияние лечения пиперациллином/тазобактамом на микрофлору кишечника человека

    .

    J Antimicrob Chemother

    1993

    ;

    31

    Supple A:

    61

    5

    .57 —

    5

    .57 —

    Kundrapu

    S

    ,

    Sunkesula

    ,

    VCK

    ,

    жюри

    La

    et al.

    Снижают ли пиперациллин/тазобактам и другие антибиотики с ингибирующей активностью в отношении Clostridium difficile риск приобретения C . сложная колонизация?

    BMC Infect Dis

    2016

    ;

    16

    :

    159

    . 58

    Kager

    L

    ,

    Malmborg

    AS

    ,

    Nord

    CE

    и др.

    Влияние профилактики пиперациллином на микрофлору толстой кишки у пациентов, перенесших колоректальные операции

    .

    Инфекция

    1983

    ;

    11

    :

    251

    4

    .59 —

    4

    .59

    STIETEL

    U

    ,

    PULTZ

    NJ

    ,

    HELFAND

    MS

    et al.

    Повышенная чувствительность к ванкомицин-резистентным Enterococcus кишечная колонизация сохраняется после завершения лечения мышей антианаэробными антибиотиками

    .

    Infect Control Hosp Epidemiol

    2004

    ;

    25

    :

    373

    :

    373

    9

    .60

    Paterson

    DL

    ,

    MUTO

    CA

    ,

    NDIRANGE

    M

    et al.

    Приобретение ректальной колонизации устойчивыми к ванкомицину Enterococcus среди пациентов отделения интенсивной терапии, получавших пиперациллин-тазобактам, по сравнению с теми, кто получал схемы антибиотикотерапии, содержащие цефепим

    .

    Противомикробные агенты Chemother

    2008

    ;

    52

    :

    465

    9

    .61

    Bächer

    K

    ,

    Schaeffer

    M

    ,

    Lode

    H

    и др.

    Фармакокинетика многократных доз, безопасность и влияние на фекальную микрофлору цефепима у здоровых добровольцев

    .

    J Antimicrob Chemother

    1992

    ;

    30

    :

    365

    365

    75

    .62

    95

    .62

    KEMMERICH

    B

    ,

    WARNS

    H

    ,

    Lode

    H

    et al.

    Фармакокинетика многократных доз цефтазидима и его влияние на фекальную флору

    .

    Противомикробные агенты Chemother

    1983

    ;

    24

    :

    333

    8

    .63

    Knothe

    H

    ,

    Детте

    GA

    ,

    Шах

    Влияние инъекционных цефалоспоринов на микрофлору желудочно-кишечного тракта: наблюдения у здоровых добровольцев и госпитализированных пациентов

    .

    Инфекция

    1985

    ;

    13

    SUL 1:

    S129

    33

    . 64

    33

    .64

    Flokas

    Me

    ,

    Karageorgos

    SA

    ,

    DETSIS

    M

    et al.

    Колонизация энтерококков, устойчивых к ванкомицину, факторы риска и риск инфицирования среди госпитализированных детей: систематический обзор и метаанализ

    .

    Int J Противомикробные агенты

    2017

    ;

    49

    :

    565

    72

    .65

    Рис

    LB

    ,

    Hutton-Thomas

    R

    ,

    Лактикова

    V

    и др. β

    — Лактамные антибиотики и колонизация желудочно-кишечного тракта энтерококками, устойчивыми к ванкомицину

    .

    J Infect Dis

    2004

    ;

    189

    :

    1113

    1113

    18

    .66

    McKinnell

    JA

    ,

    Kunz

    DF

    ,

    Moser

    SA

    et al.

    Анализ случаев колонизации ванкомицин-резистентными энтерококками на уровне пациента и дней лечения антибиотиками

    .

    Эпидемиол Инфекция

    2016

    ;

    144

    :

    1749

    :

    1748

    55

    . 67

    55

    .67

    King

    ST

    ,

    Парикмахерская

    Ke

    ,

    Parham

    JJ

    et al.

    Изменения в потреблении противомикробных препаратов и уровне инфицирования до и во время дефицита пиперациллина/тазобактама

    .

    J Glob Antimicrob Resist

    2017

    ;

    11

    :

    111

    111

    13

    .68

    Richards

    DM

    ,

    пятки

    RC

    ,

    BROGDEN

    RN

    et al.

    Цефтриаксон. Обзор его антибактериальной активности, фармакологических свойств и терапевтического применения

    .

    Наркотики

    1984

    ;

    27

    :

    469

    527

    527

    527

    .69

    Welling

    GW

    ,

    Meijer-Severers

    GJ

    ,

    Helmus

    G

    et al.

    Влияние цефтриаксона на анаэробную бактериальную флору и ферментативную активность бактерий в кишечном тракте

    .

    Инфекция

    1991

    ;

    19

    :

    313

    313

    16

    . 70

    de Vries-Signers

    HG

    ,

    TONK

    RH

    ,

    ван дер Вайдж

    D.

    Влияние внутримышечного цефтриаксона на аэробную оральную и фекальную флору 11 здоровых добровольцев

    .

    Scand J Infect Dis

    1991

    ;

    23

    :

    625

    33

    .71

    33

    .71

    Cavallaro

    V

    ,

    Catania

    V

    ,

    Bonaccoro

    R

    et al.

    Влияние цефалоспоринов широкого спектра действия на микрофлору полости рта и кишечника у пациентов, перенесших колоректальные операции

    .

    J Chemother

    1992

    ;

    4

    :

    82

    7 2002

    7

    .72

    Vogel

    F

    ,

    OCHS

    HR

    ,

    WETTICH

    K

    et al.

    Влияние ступенчатой ​​терапии цефтриаксоном плюс лоракарбеф по сравнению с парентеральной терапией цефтриаксоном на кишечную микрофлору у пациентов с внебольничной пневмонией

    .

    Clin Microbiol Infect

    2001

    ;

    7

    :

    376

    376

    9

    . 73

    Nilsson-Ehle

    I

    ,

    NORD

    CE

    ,

    Ursing

    B.

    Цефтриаксон: фармакокинетика и влияние на микрофлору кишечника у больных с острыми бактериальными инфекциями

    .

    Scand J Infect Dis

    1985

    ;

    17

    :

    77

    82

    .74

    Гуггенбихлер

    JP

    ,

    Кофлер

    Дж

    3 , 9000 2

    Влияние цефалоспоринов третьего поколения на аэробную кишечную флору

    .

    Инфекция

    1985

    ;

    13

    S 1:

    S137

    9

    .75 —

    9

    .75

    de Lastours

    V

    ,

    Goulenok

    T

    ,

    Guérin

    F

    et al.

    Цефтриаксон способствует появлению избыточной продукции AmpC Enterobacteriaceae в кишечной микробиоте госпитализированных пациентов

    .

    Eur J Clin Microbiol Infect Dis

    2018

    ;

    37

    :

    417

    417

    21

    .76

    Meletiadis

    J

    ,

    Turlej-Rogacka

    A

    ,

    Lerner

    A

    et al.

    Усиление устойчивости кишечной флоры к противомикробным препаратам у пациентов, получавших цефтриаксон

    .

    Противомикробные агенты Chemother

    2017

    ;

    61

    :

    E00473

    17

    .77

    17

    .77

    Baggs

    J

    ,

    Fridkin

    SK

    ,

    Pollack

    La

    et al.

    Оценка национальных тенденций в использовании антибиотиков для стационарного лечения в больницах США с 2006 по 2012 год

    .

    JAMA Intern Med

    2016

    ;

    176

    :

    1639

    :

    1639

    48

    .78

    WENDT

    C

    ,

    LIN

    D

    ,

    VON BAUM

    H.

    Факторы риска колонизации энтеробактериями, устойчивыми к цефалоспоринам третьего поколения

    .

    Инфекция

    2005

    ;

    33

    :

    327

    32

    .79

    Ламберт Зеховски

    N

    ,

    Бинген

    E

    ,

    Ожар

    Y

    и др.

    Влияние цефотаксима на фекальную флору у детей

    .

    Инфекция

    1985

    ;

    13

    S 1:

    S140

    4

    4

    .80

    Crew

    PE

    ,

    Rhodes

    NJ

    ,

    O’Donnell

    JN

    et al.

    Корреляция между потреблением антибиотиков на уровне больницы и заболеваемостью в медицинском учреждении Clostridium difficile инфекция

    .

    Am J Инфекционный контроль

    2018

    ;

    46

    :

    270

    5

    .81

    Слизни

    C

    ,

    Райли

    ТВ.

    Антибиотики и внутрибольничная инфекция Clostridium difficile : обновление систематического обзора и метаанализа

    .

    J Antimicrob Chemother

    2014

    ;

    69

    :

    891

    :

    881

    91

    .82

    91

    .82

    Mckinnell

    JA

    ,

    Kunz

    DF

    ,

    Chamot

    E

    et al.

    Связь между ванкомицин-резистентной энтерококковой бактериемией и применением цефтриаксона

    .

    Infect Control Hosp Epidemiol

    2012

    ;

    33

    :

    718

    24

    . 83

    Берган

    T

    ,

    Nord

    CE

    ,

    0 Thorsteinsson 300SB

    Влияние меропенема на микрофлору кишечника

    .

    Eur J Clin Microbiol Infect Dis

    1991

    ;

    10

    :

    524

    7

    .84

    Norrby

    SR

    ,

    Rogers

    JD

    ,

    Ferber

    F

    и др.

    Распределение радиоактивно меченых имипенема и циластатина у здоровых добровольцев

    .

    Противомикробные агенты Chemother

    1984

    ;

    26

    :

    707

    707

    14

    .85

    Kager

    L

    ,

    Brismar

    B

    ,

    Malmborg

    AS

    et al.

    Концентрации имипенема в колоректальной хирургии и влияние на микрофлору толстой кишки

    .

    Противомикробные агенты Chemother

    1989

    ;

    33

    :

    204

    8

    .86

    8

    .86

    Pletz

    MWR

    ,

    RAU

    M

    ,

    Bulitta

    J

    et al.

    Фармакокинетика эртапенема и влияние на микрофлору кишечника по сравнению с цефтриаксоном после многократного введения добровольцам мужского и женского пола

    .

    Противомикробные агенты Chemother

    2004

    ;

    48

    :

    3765

    72

    .87

    Вардакас

    KZ

    ,

    Тригкидис

    KK

    ,

    Букувала

    E

    и др.

    Инфекция Clostridium difficile после системного введения антибиотиков в рандомизированных контролируемых исследованиях: систематический обзор и метаанализ

    .

    Int J Антимикробные агенты

    2016

    ;

    48

    :

    1

    10

    .88

    10

    .88

    Браун

    KA

    ,

    Khanafer

    N

    ,

    Daneman

    N

    et al.

    Мета-анализ антибиотиков и риска внебольничной инфекции Clostridium difficile

    .

    Противомикробные агенты Chemother

    2013

    ;

    57

    :

    2326

    :

    2326

    32

    .89

    Van Boeckel

    TP

    ,

    Gandra

    S

    ,

    Ashok

    A

    et al.

    Мировое потребление антибиотиков с 2000 по 2010 год: анализ национальных данных о продажах фармацевтических препаратов

    .

    Ланцет Infect Dis

    2014

    ;

    14

    :

    742

    742

    50

    .90

    Wiström

    J

    ,

    GENTRY

    LO

    ,

    Palmgren

    AC

    et al.

    Экологические последствия краткосрочного лечения ципрофлоксацином диареи путешественников

    .

    J Antimicrob Chemother

    1992

    ;

    30

    :

    693

    693

    706

    .91

    Borzio

    M

    ,

    Salerno

    F

    ,

    Saudelli

    M

    et al.

    Эффективность перорального ципрофлоксацина в качестве селективного дезинфицирующего средства для кишечника при циррозе печени

    .

    Ital J Гастроэнтерол Гепатол

    1997

    ;

    29

    :

    262

    6

    .92

    Edlund

    C

    ,

    Sjöstedt

    S

    3 ,0 Nord

    ,

    Сравнительное влияние левофлоксацина и офлоксацина на нормальную микрофлору полости рта и кишечника

    .

    Scand J Infect Dis

    1997

    ;

    29

    :

    383

    6

    . 93

    Инагаки

    Y

    ,

    Накая

    R

    ,

    Чида

    T

    и др.

    Влияние левофлоксацина, оптически активного изомера офлоксацина, на фекальную микрофлору у добровольцев

    .

    Jpn J Антибиот

    1992

    ;

    45

    :

    241

    52

    52

    .94

    Edlund

    C

    ,

    Beyer

    G

    ,

    Heemer-Bau

    M

    et al.

    Сравнительное влияние моксифлоксацина и кларитромицина на нормальную микрофлору кишечника

    .

    Scand J Infect Dis

    2000

    ;

    32

    :

    81

    5

    .95

    де Ластур

    В

    ,

    Фантин

    Б.

    Влияние фторхинолонов на микробиоту человека. Сосредоточьтесь на появлении устойчивости к антибиотикам

    .

    Future Microbiol

    2015

    ;

    10

    :

    1241

    :

    1241

    55

    .96

    de Fastours

    V

    ,

    Chau

    F

    ,

    ROY

    C

    et al.

    Возникновение резистентности к хинолонам в микробиоте госпитализированных пациентов, получавших или не получавших фторхинолоны

    .

    J Antimicrob Chemother

    2014

    ;

    69

    :

    3393

    3393

    400

    .97

    Nicolas-Chanoine

    M-H

    ,

    BERTRAND

    x

    ,

    MADEC

    J-Y.

    Escherichia coli ST131, интригующая клональная группа

    .

    Clin Microbiol Rev

    2014

    ;

    27

    :

    543

    74

    .98

    Дешпанде

    А

    ,

    Пасупулети

    В

    ,

    Тхота

    Р

    и др.

    Внебольничная инфекция Clostridium difficile и антибиотики: метаанализ

    .

    J Antimicrob Chemother

    2013

    ;

    68

    :

    1951

    1951

    61

    .99

    Worny

    M

    ,

    Pepin

    J

    ,

    Fank

    A

    et al.

    Выработка токсина новым штаммом Clostridium difficile , связанная со вспышками тяжелых заболеваний в Северной Америке и Европе

    .

    Ланцет

    2005

    ;

    366

    :

    1079

    84

    . 100

    Рашид

    M-U

    ,

    Weintraub

    A 3

    Nord 9

    ,

    Влияние новых противомикробных препаратов на экологический баланс микрофлоры человека

    .

    Анаэроб

    2012

    ;

    18

    :

    249

    53

    .101

    Nord

    CE

    ,

    Sillerström

    E 00 20090 2 Wahl und

    Влияние тигециклина на нормальную микрофлору ротоглотки и кишечника

    .

    Противомикробные агенты Chemother

    2006

    ;

    50

    :

    3375

    3375

    80

    .102

    RASHID

    M-U

    ,

    Rosenborg

    S

    ,

    Panagiotidis

    G

    et al.

    Экологический эффект цефтазидима/авибактама на нормальную микробиоту кишечника человека

    .

    Int J Антимикробные агенты

    2015

    ;

    46

    :

    60

    5

    .103

    Янг

    ВБ

    ,

    Шмидт

    ТМ.

    Антибиотикоассоциированная диарея, сопровождающаяся масштабными изменениями состава фекальной микробиоты

    .

    J Clin Microbiol

    2004

    ;

    42

    :

    1203

    1203

    6

    .104

    De La Cochetière

    MF

    ,

    Durand

    T

    ,

    Lepage

    P

    et al.

    Устойчивость доминирующей фекальной микробиоты человека к короткому курсу антибиотиков

    .

    J Clin Microbiol

    2005

    ;

    43

    :

    5588

    92

    .105

    Dethlefsen

    L

    ,

    Relman

    DA.

    Неполное восстановление и индивидуальная реакция микробиоты дистального отдела кишечника человека на повторное воздействие антибиотиков

    .

    Proc Natl Acad Sci USA

    2011

    ;

    108

    Sust 1:

    4554

    61

    .106

    RASHID

    RASHID

    M-U

    ,

    ZAURA

    E

    ,

    BUIJS

    MJ

    et al.

    Определение долгосрочного эффекта применения антибиотиков на нормальную микробиоту кишечника человека с использованием методов посева и пиросеквенирования

    .

    Clin Infect Dis

    2015

    ;

    60

    S 1:

    S77

    84

    .107

    Favier

    CF

    ,

    VAUANHAN

    EE

    ,

    de VOS

    WM

    et al.

    Молекулярный мониторинг сукцессии бактериальных сообществ у новорожденных

    .

    Appl Environ Microbiol

    2002

    ;

    68

    :

    219

    219

    219

    26

    .108

    Seksik

    P

    ,

    Rigottier-Gois

    L

    ,

    Gramet

    G

    et al.

    Изменения доминирующих групп фекальных бактерий у пациентов с болезнью Крона толстой кишки

    .

    Гут

    2003

    ;

    52

    :

    237

    42

    .

    Примечания автора

    © Автор(ы) 2019.Опубликовано Oxford University Press от имени Британского общества противомикробной химиотерапии.

    Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями некоммерческой лицензии Creative Commons Attribution (http://creativecommons. org/licenses/by-nc/4.0/), которая разрешает некоммерческое повторное использование, распространение, и воспроизведение на любом носителе при условии надлежащего цитирования оригинальной работы. Для коммерческого повторного использования, пожалуйста, свяжитесь с [email protected]

    Желудочно-кишечный микробиом — что нам нужно знать в клинической практике — Полный текст — GE — Португальский журнал гастроэнтерологии 2020, Vol.27, № 5

    Микробиота кишечника человека играет важную роль в здоровье человека. Когда баланс между микробиотой хозяина и кишечника нарушается, происходят изменения в составе и функции микробиоты, что называется дисбиозом. Факторы окружающей среды, такие как диета, ингибиторы протонной помпы и антибиотики, могут привести к необратимому дисбиотическому нарушению. Выяснение этих дисбалансов стало возможным благодаря недавним достижениям в методах секвенирования генома, которые подтвердили признание взаимодействия между микробиомом и кишечными и внекишечными расстройствами. Этот обзор посвящен влиянию микробиоты на воспалительные заболевания кишечника, рак желудка, колоректальный рак, неалкогольную жировую болезнь печени (НАЖБП), синдром раздраженного кишечника (СРК) и инфекцию Clostridium difficile (CDI). Кроме того, обобщаются новые методы лечения. Трансплантация фекальной микробиоты (ТФМ) является успешной и признанной терапией рецидивирующей ИКД, и ее применение при других заболеваниях, связанных с дисбиозом, вызывает огромный интерес. Пре- и пробиотики нацелены на восстановление микробного баланса и оказывают положительный эффект в основном у пациентов с НАЖБП, язвенным колитом, СРК и ИКД.Многообещающие антиканцерогенные эффекты также были продемонстрированы на животных моделях. В литературе все чаще описываются микробные изменения при многих дисбиотических расстройствах и указывается, что необходимо лечить. Тем не менее, применение пробиотиков и ТФМ в клинической практике страдает от нехватки рандомизированных контролируемых исследований со стандартными схемами терапии для поддержки их рекомендаций.

    © 2020 Sociedade Portuguesa de Gastroenterologia Опубликовано S. Karger AG, Basel

    Микробиота · Disbiose · Doenças associadas a disbiose · Probióticos · Трансплантат микробиоты фекальный ·

    A микробиота желудочно-кишечного тракта desempenhaum papelesQuando всплеск um desequilíbrio Entre Эста e о hospedeiro, ocorrem alterações на composição электронной função да микробиота дие себе Designa де disbiose. Fatores ambientais como диета, inibidores да бомба де protões e antibióticos podem induzir ум estado disbiótico Permanente. O esclarecimento destas desregulações foi possível graças a avanços freshes nos métodos de sequenciação genómica que, por sua vez, nos ajudaram a perceber interação entre a microbiota e distúrbios intestinais e extra-intestinais. Esta revisão foca-se не влияет на микробиоту, вызывающую воспаление кишечника, Cancros gástrico e colorretal, Fígado Gordo Não-Alcoólico (FGNA), Síndroma do Intestino Irritável (SII) и Infeção por Clostridium difficile (ICD). Além disso, резюме-se no final as estratégias terapêuticas que têm surgido. О трансплантате фекальных é ум tratamento com eficácia estabelecida на infeção recorrente por C. difficile , reunindo um crescente interesse na sua aplicação em outras doenças relacionadas com disbiose. Os pre- e probióticos promovem or reequilíbrio microbiano e têm Evidência de efeitos positivos sobretudo no FGNA, Colite Ulcerosa, SII и ICD . Em modelos animais, estes tambem demostraram efeitos anti-carcinogenicos promissores.Э очевидно на literatura uma descrição cada vez mais pormenorizada das alterações microbianas em vários distúrbios disbióticos, oferecendo ferramentas que allowem saber o que pode ser tratado. No entanto, a aplicção de probióticos e трансплантат фекальных na prática clinica sofre ainda de carência de ensaios clinicos randomizados, com режимы terapêuticos стандарт, em número que разрешение в sua recomendação формальный.

    Введение

    Желудочно-кишечный тракт является нашим наиболее колонизированным органом, в котором насчитывается сто триллионов организмов, симбиотически связанных с человеком [1]. Под микробиотой человека понимается вся популяция микроорганизмов (бактерий, грибов, архей, вирусов и простейших), обитающих в организме человека, коллективные геномы которых образуют метагеном человека [2].

    У здорового человека микробиота выполняет важные метаболические [3] и иммунные функции [4]. В толстой кишке он обеспечивает ферменты, необходимые для ферментации углеводов, образуя жирные кислоты с короткой цепью (SCFA) в виде бутирата. SCFA обеспечивают около 70% энергии колоноцитам, сохраняя кишечный барьер и усиливая противовоспалительные и противораковые свойства [5].Взаимодействие хозяин-микробиом имеет важное значение для поддержания сильной иммунной системы, позволяя желудочно-кишечному тракту оставаться здоровым и свободным от патогенных бактерий [6].

    Микробный состав кишечника сильно различается у разных людей и в разных отделах желудочно-кишечного тракта. Однако среди здоровых взрослых стабильно преобладают бактерии двух филумов, Bacteroidetes и Firmicutes, реже встречаются Actinobacteria и Proteobacteria [7]. Примечательно, что разнообразие и плотность видов бактерий увеличивается от проксимального к дистальному отделу кишечника.

    Сложным аспектом изучения микробиоты является сложность определения идеального состояния эубиоза из-за высокой вариабельности между здоровыми людьми. Однако в большинстве исследований некоторые комменсальные бактерии, такие как Roseburia , Akkermansia , Bifidobacterium и Faecalibacterium prausnitzii , по-видимому, связаны со здоровым кишечником. Несмотря на это, иногда нарушается баланс между микробиотой хозяина и кишечника, происходят изменения в ее составе и функциях, что часто называют дисбиозом [8].Колонии микробов живут в высококонкурентной среде, борясь за одни и те же ниши и ресурсы. Дисбиоз обычно характеризуется одной или несколькими из следующих характеристик: потеря комменсалов, чрезмерный рост потенциально вредных организмов и снижение общего разнообразия [9].

    Изменения численности и состава микробиоты связаны с рядом кишечных и внекишечных расстройств у человека. Однако существует разрыв между фундаментальными научными данными и клинической практикой.В этом обзоре мы описываем факторы, влияющие на микробиоту, а затем обобщаем дисбаланс микробиоты, связанный с распространенными желудочно-кишечными заболеваниями и потенциальными методами лечения, а именно воспалительным заболеванием кишечника (ВЗК), раком желудка (РЖ), колоректальным раком (КРР), неалкогольной жировой болезнью печени (НАЖБП). ), инфекция Clostridium difficile (CDI) и синдром раздраженного кишечника (IBS).

    Методы анализа микробиома

    Как правило, желудочно-кишечные микроорганизмы трудно выделить в культуре, что затрудняет понимание истинной микробной сложности.Это ограничение было частично преодолено за последние несколько десятилетий благодаря использованию секвенирования ДНК для определения генетического содержания микробиома.

    Большинство методов нацелены на ген 16S рибосомной РНК (16SrRNA), поскольку он высоко консервативен у разных видов бактерий. Секвенируя этот ген, мы отвечаем на вопрос «кто там»? выявление относительной численности данного бактериального таксона.

    Анализ маркерных генов отличается от метагеномного дробового секвенирования (так называемого полногеномного дробового секвенирования — WGS), поскольку он основан на нацеливании на ампликон (целевую последовательность или ген, который амплифицируется), а не на попытках секвенировать все гены в образце [10 ].

    Метод секвенирования 16SrРНК с трудом приближается к самым глубоким таксономическим уровням и не позволяет установить связь между видом бактерий и их функциональной способностью. Однако этот метод остается более дешевым, легкодоступным и по-прежнему учитывает микробное разнообразие и состав [11].

    Секвенирование WGS с последующим метагеномным анализом также определяет количество и разнообразие микробного сообщества, но добавляет более подробную информацию к таксономической характеристике образца.При таком подходе мы отвечаем на вопрос «что они могут сделать», определяя содержание генов и предполагаемые потенциальные функции микробной ДНК [12]. Геномную ДНК выделяют из исследуемой среды, но не различают, исходит она от жизнеспособных клеток или нет, экспрессируются ли предполагаемые гены и при каких обстоятельствах [13].

    Внедрение метатранскриптомного анализа превзошло ограничения всех других методов микробиома кишечника. Метатранскриптомика выявляет суммарное содержание генных транскриптов (тРНК) в микробиоте, отвечая на вопрос «что они делают»? [11].Поскольку метатранскриптомный анализ дополняет метагеномику, мы можем узнать, какие из генов, которые были отмечены в метагеномном анализе, транскрибируются и в какой степени, демонстрируя функциональные изменения, которые способствуют здоровью и заболеванию, даже до того, как произойдет композиционная модификация [14]. Тем не менее метатранскриптомика еще более дорога и сложна, чем метагеномика.

    Комбинация всех подходов может открыть окно для более глубокого понимания потенциальных генов и путей, которые могут способствовать гомеостазу и восприимчивости к заболеваниям, что позволит исследовать новые фармакологические мишени [15].

    Факторы, влияющие на микробиоту

    Было проведено множество исследований факторов, способных влиять на микробиом желудочно-кишечного тракта человека, включая генетику хозяина и факторы окружающей среды [7]. Здесь мы сосредоточимся на последних, а именно на диете, ингибиторах протонной помпы (ИПП) и антибиотиках.

    Диета

    Среди факторов окружающей среды диета, пожалуй, наиболее легко поддается изменению. Многие исследования пытались выяснить связь между западной диетой и дисбактериозом кишечника как триггером нарушения проницаемости кишечника и барьерной функции [16].Западная диета в основном состоит из белков животного происхождения, полных и насыщенных жиров и простых сахаров, а не из фруктов и овощей, и была связана с уменьшением бактериальной колонизации и увеличением количества Bacteroides (в основном бактерий, разлагающих муцин), Firmicutes и Proteobacteria phyla [17]. ]. В недавнем исследовании сообщалось, что диета с низким содержанием клетчатки приводит к тому, что микробиота поглощает слой слизи, что приводит к истончению эпителия, повышая вероятность инвазивной патогенной атаки [18].

    Средиземноморская диета основана на высоком потреблении фруктов, овощей, неочищенных злаков и рыбы и низком потреблении красного мяса и была связана с пользой для микробиоты кишечника, снижением нагрузки Escherichia coli и повышением уровня SCFA [19].

    Микробиота кишечника претерпевает относительно быстрые изменения при воздействии различных диет. Дэвид и др. [20] показали, что диеты с высоким содержанием жиров, состоящие исключительно из продуктов животного происхождения, всего за 2 дня изменили микробиом как по структуре, так и по функциям. Тем не менее, масштабы этого эффекта кажутся скромными, поскольку изменение рациона питания не обязательно приводит к постоянной модификации состава, по крайней мере, на уровне типа, поскольку ежедневные изменения в основном происходят на уровне рода и вида. В том же исследовании анализ секвенирования РНК выявил повышенную экспрессию генов, связанных с катаболизмом аминокислот и производством канцерогенных полициклических ароматических углеводородов, в рационе животного происхождения по сравнению с рационом растительного происхождения.

    Зная тот факт, что диета может способствовать дисбактериозу кишечника и, как следствие, связанным с ним заболеваниям, становится ясно, что модификацию диеты следует рассматривать в качестве вспомогательной терапии.

    Ингибиторы протонной помпы

    В норме рН просвета желудка составляет 1,5–3,5, а ИПП повышают рН до значений выше 3,5–5,0, что может влиять на состав микробиоты из-за повышения рН, а также путем прямого воздействия на протонную помпу микроорганизмов.

    Использование ИПП может привести к развитию кишечных инфекций, таких как ИКД [21].Цуда и др. [22] проанализировали 18 человек, принимавших ИПП более 2 лет, и 27 здоровых добровольцев, никогда не принимавших ИПП, и обнаружили значительную корреляцию между значением рН и количеством бактерий во всех образцах желудочного сока. Их данные свидетельствуют о том, что чрезмерный рост бактерий в желудке при использовании ИПП может быть вызван отсутствием уничтожения, а не размножением бактерий из-за низкой кислотности желудка.

    В недавнем исследовании, проведенном в Японии, также изучались образцы фекалий пациентов в трех точках (до и через 4 и 8 недель после начала лечения ИПП) [23].Различия в общем количестве бактерий в этих 3 точках были незначительными, хотя общее количество факультативных анаэробов, таких как Lactobacillus, Streptococcus, Staphylococcus и Enterobacteriaceae , значительно увеличилось после лечения [23]. Стрептококки являются комменсалами ротовой полости, горла и носовой полости человека и инактивируются кислотой желудочного сока, что создает барьер против бактериальной инвазии нижних отделов желудочно-кишечного тракта. Увеличение рН желудка после применения ИПП может быть одной из причин, по которой во многих исследованиях методом случай-контроль в образцах фекалий обнаруживают Streptococcus , что позволяет предположить наличие бактериальной транслокации [22, 24].

    ИПП широко назначают как при амбулаторном, так и при стационарном лечении, во многих случаях без формальных показаний. Побочными эффектами ИПП нельзя пренебречь, поэтому решение об их использовании следует принимать более осторожно.

    Антибиотики

    Антибиотики являются мощным оружием против патогенных бактерий, но могут также воздействовать на комменсальные организмы, что приводит к потере микробного разнообразия, сдвигам в метаболической способности и снижению устойчивости к колонизации инвазивными патогенами [25].

    В течение нескольких дней после лечения антибиотиками были описаны глубокие и быстрые изменения микробиоты кишечника.Исследование случай-контроль показало, что пероральные антибиотики широкого спектра действия (ципрофлоксацин, ванкомицин и метронидазол) в течение 7 дней были связаны с потерей разнообразия и резкими сдвигами в составе сообщества на 9-й день [26]. Несмотря на значительный краткосрочный эффект, через 8–31 месяц лечения наблюдалось заметное возвращение к исходному уровню. Тем не менее, все больше данных свидетельствует о том, что микробиом может быть, по крайней мере, слегка нарушен в течение длительных периодов времени, некоторые штаммы могут быть потеряны на неопределенный срок [27], а последствия, такие как устойчивость к антибиотикам, могут сохраняться в течение более длительных периодов времени [28].

    Также была предложена связь между использованием антибиотиков в раннем возрасте и развитием заболеваний в более позднем детстве, таких как ожирение и болезнь Крона (БК) [29, 30]. Количество курсов лечения антибиотиками и то, чем раньше их начинают дети, по-видимому, являются важными факторами.

    Другая проблема, связанная с антибактериальной терапией, связана с колонизацией C. difficile и инфекцией, поскольку использование антибиотиков является их основной причиной. Метаанализ 2016 года показал, что клиндамицин был антибиотиком, наиболее часто связанным с ИКД у госпитализированных пациентов, за которым следуют карбапенемы [31].Позже мы сосредоточимся на влиянии самой ИКД на микробиоту кишечника.

    Потенциальная роль дисбактериоза в желудочно-кишечных заболеваниях

    Несколько широко распространенных заболеваний связаны с дисбалансом состава и функции микробиоты, включая ВЗК, ожирение, диабет, аллергию, СРК, РЖ, колоректальные полипы и КРР, цирроз печени, НАЖБП, нарушения развития нервной системы расстройства, сердечно-сосудистые заболевания, холестериновые камни в желчном пузыре, диарея, недоедание и заболевание почек [32]. Однако еще предстоит изучить, является ли это изменение микробного состава причиной или следствием самого заболевания. Теперь мы уделим особое внимание ассоциациям микробиома и желудочно-кишечных заболеваний, недавно описанным в литературе.

    Колоректальный рак

    CRC является третьим наиболее распространенным и четвертым наиболее смертоносным видом рака в мире [33]. Хотя в развитии колоректальных аденом и рака также присутствуют генетические компоненты, это многофакторное заболевание, поскольку оно включает различные элементы, такие как иммунитет хозяина, факторы окружающей среды и микробиота кишечника [34].

    Количество бактерий в толстой кишке в миллион раз выше, чем в тонкой кишке, и там в 12 раз больше раковых заболеваний, что отчасти может быть связано с ролью микробиоты толстой кишки в канцерогенезе [35]. Ранее CRC был связан с определенными бактериями, такими как Streptococcus gallolyticus (ранее S. bovis ) [36], E. coli [37], Bacteroides fragilis [38], Clostridium septicum [39] , и другие. Совсем недавно случаи рака были связаны не только с конкретной бактерией, но и с дисбиозом, с уменьшением разнообразия и стабильности сообщества кишечной микробиоты [40].

    Изменения микробиоты у пациентов с КРР показаны в таблице 1. В различных исследованиях было показано увеличение распространенности Fusobacterium у пациентов с КРР [41-43] и в аденоматозных тканях по сравнению с окружающими тканями [44], что свидетельствует о возможном роль в каскаде аденома-рак. Согласно Буллману и др. [45], лечение метронидазолом значительно снижает нагрузку Fusobacterium в опухолевой ткани и уменьшает рост опухоли толстой кишки в моделях на мышах. Следовательно, Fusobacterium может быть маркером стула для повышенного риска CRC.

    Таблица 1.

    Изменения микробиоты при раке желудочно-кишечного тракта

    Секвенирование бактериальной РНК также выявило снижение уровня Firmicutes у пациентов с колоректальным раком как в образцах кала, так и в образцах биопсии опухоли по сравнению со здоровыми людьми [41]. С другой стороны, данные о Bacteroidetes противоречивы [41, 46].

    В недавнем исследовании Rezasoltani et al. [47] обнаружили значительную взаимосвязь между размером полипа и количеством Fusobacterium nucleatum , Streptococcus bovis , Lactobacillus spp., Roseburia spp. и Porphyromonas spp. Это исследование методом «случай-контроль» выявило роль некоторых специфических бактерий в развитии аденомы.

    Исследования на мышах также показывают, что дисбактериоз может быть триггером воспалительного колоректального рака. Один из предполагаемых механизмов включает отсутствие SCFAs, поскольку бактерии, ответственные за их производство, такие как Faecalibacterium и Roseburia , уменьшаются в фекальной микробиоте во время развития CRC [48].Известно, что бутират обладает антиканцерогенным действием, поскольку подавляет пролиферацию клеток, индуцирует апоптоз опухолевых клеток и опосредует Т-клетки [49].

    Рак желудка

    РЖ является пятым наиболее распространенным злокачественным новообразованием и третьей ведущей причиной смерти от рака [33]. Около 81% заболеваемости РЖ связано с Helicobacter pylori , что делает этот микроорганизм наиболее распространенным патогеном, связанным с этим злокачественным новообразованием [50].

    Эффективная эрадикация H. pylori не полностью предотвращает канцерогенез желудка [51, 52], и только 1-2% H.pylori -позитивных людей развивается РЖ [53]. Кроме того, у мышей, трансгенных по инсулину и гастрину, одновременная колонизация H. pylori и сложной желудочной микробиотой увеличивала заболеваемость РЖ [54], ускоряя начало злокачественного новообразования, по сравнению с мышами, инфицированными только H. pylori [54]. 55]. Эти данные свидетельствуют о том, что другие комменсалы желудочной микробиоты могут способствовать развитию рака.

    Инфекция H. pylori снижает кислотность желудка, позволяя создать новую микробиоту, которая может усилить канцерогенез.Эти бактерии разрастаются в гипокислой среде и способны преобразовывать соединения азота в потенциально канцерогенные N-нитрозосоединения [56]. Многочисленные бактерии, такие как E.coli , Neisseria , Neisseria , Staphylococcus , Lactobacilus , Lactobacillus , Nitrospirae , и Veilenenella могут производить эти соединения [57, 58], а некоторые авторы уже продемонстрировали увеличение некоторых из этих бактерий в GC [59-62]. Микробная среда

    GC представлена ​​в таблице 1.Данные о бактериальном разнообразии в РЖ противоречивы. Авилес-Хименес и др. [61] сообщили о снижении микробного разнообразия от неатрофического гастрита до кишечной метаплазии и РЖ. Фактически, в большинстве исследований сообщалось о снижении микробного разнообразия [61, 62], хотя некоторые авторы описывали обратное [59, 63].

    Любопытно, что в многочисленных исследованиях наблюдалась такая же картина увеличения при изучении видов Lactobacillus в GC [61-63]. Эти виды используются в пробиотиках, которые полезны для хозяина.Однако в желудке Lactobacillus увеличивают количество молочной кислоты, которая может служить источником энергии для опухолевых клеток, а также способствовать воспалению и опухолевому ангиогенезу [64].

    Пероральные бактериальные комменсалы также могут играть важную роль в патогенезе и прогрессировании злокачественных новообразований желудка, поскольку многие исследования показывают повышение уровня этих микроорганизмов в образцах GC [60, 65].

    Воспалительное заболевание кишечника

    ВЗК представляет собой хроническое рецидивирующее и ремиттирующее воспалительное заболевание желудочно-кишечного тракта, которое состоит из двух основных форм: БК и язвенного колита (ЯК).Несмотря на многочисленные усилия, точная этиология не описана, но считается, что она связана с взаимодействием между генетическими факторами и факторами окружающей среды, которые могут нарушить регуляцию иммунного ответа хозяина на кишечную микробиоту.

    В настоящее время считается, что дисбактериоз кишечника является потенциально важным механизмом, лежащим в основе патогенеза ВЗК [66]. Следует отметить, что регионы с высоким содержанием бактерий коррелируют с большей частотой БК и ЯК, особенно в терминальном отделе подвздошной кишки и толстой кишке.

    Изменения микробиоты, связанные с пациентами с ВЗК, обобщены в таблице 2.Характерные признаки ВЗК включают снижение бактериального разнообразия и стабильности, в основном из-за истощения членов Firmicutes и обогащения типов Proteobacteria и Actinobacteria [67, 68]. Дисбактериоз может возникать до начала воспаления кишечника у генетически предрасположенных мышей, что доказано Glymenaki et al. [69, 70] в двух разных исследованиях.

    Таблица 2.

    Изменения микробиоты у пациентов с воспалительным синдромом кишечника

    Истощение некоторых бактерий с последующей потерей их защитных функций оказывает важное влияние на заболевание.В нескольких недавних исследованиях сообщалось о меньшей доле F. prausnitzii у пациентов с ВЗК [71, 72]. Этот комменсал относится к типу Firmicutes и является основным продуцентом SCFA с важными противовоспалительными и клеточными защитными функциями [73, 74]. Кроме того, исследовательская группа из Франции [71] обнаружила связь между рецидивом целиакии и низким уровнем F. prausnitzii , высоким уровнем С-реактивного белка и низким уровнем Bacteroides .

    Статус дисбактериоза ЯК был связан с увеличением количества Bacteroidetes phylum [75] и рода Bacteroides [76], точнее с B.fragilis и vulgatus [75].

    Благодаря достижениям в секвенировании ДНК Morgan et al. [74] указали, что микробная функция была постоянно более нарушена (12%), чем состав (2%), что привело к выводу, что исследования состава микробиоты могут недооценивать ее влияние на патогенез ВЗК.

    Неалкогольная жировая болезнь печени

    НАЖБП охватывает спектр заболеваний печени от стеатоза до неалкогольного стеатогепатита, фиброза, цирроза и, в конечном итоге, гепатоцеллюлярной карциномы, при которой происходит отложение жира в печени.НАЖБП требует исключения ежедневного потребления алкоголя более 30 г для мужчин и 20 г для женщин. В последние годы НАЖБП стала одной из наиболее частых причин заболеваний печени во всем мире [77].

    Эффективность изменений образа жизни, таких как диета и физическая активность, оказывает большое влияние на метаболический контроль и гистологию печени [78], что делает очевидным важность факторов окружающей среды при этом заболевании. Однако существует большая вариабельность прогрессирования НАЖБП, которая не объясняется генетикой или окружающей средой.

    Печень является первым органом, который через портальный тракт подвергается воздействию метаболитов кишечного происхождения, таких как пищевые питательные вещества и продукты, связанные с микробиотой. Из-за этого прямого взаимодействия между кишечником и печенью дисбактериоз микробиоты был определен как основной фактор патологии на всех стадиях НАЖБП [79]. Дисбактериоз может приводить к повышению проницаемости кишечника, способствуя транслокации комменсальных метаболитов по сосудистой системе в печень (эндотоксемия), что непосредственно способствует нарушению печеночного липидного обмена и воспалительным процессам в печени [80].

    Многие исследователи изучали состав микробиоты у пациентов с НАЖБП. В исследовании, сравнивающем кишечный микробиом между пациентами с НАЖБП без ожирения и здоровым контролем, в первой группе было больше Bacteroidetes и меньше Firmicutes [81]. Внутри Firmicutes количество бактерий, продуцирующих SCFA, и 7α-дегидроксилирующих бактерий было снижено [81].

    Некоторые авторы пытались связать конкретную бактерию с фиброзом печени при НАЖБП. Дуарте и др. [82] обнаружили связь с повышенным содержанием Lactobacillus , а Boursier et al.[79] описали корреляцию с Ruminococcus . В недавнем исследовании [83] описано, что в микробиоте кишечника при НАЖБП преобладают Firmicutes и Bacteroidetes, за которыми следуют Proteobacteria и Actinobacteria в меньшем количестве. Однако по мере прогрессирования фиброза наблюдается значительное увеличение численности Proteobacteria phylum и уменьшение численности Firmicutes. Дисбактериоз начинается на ранних стадиях заболевания печени и во многом зависит от этиологических факторов [84].

    Ясно, что микробиота меняется в течение НАЖБП, и это может объяснить различия, обнаруженные в составе микробиоты.Однако эти исследования различаются используемыми определениями, дизайном исследования и клиническими конечными точками, что делает неуместными общие выводы.

    C. difficile Инфекция

    C. difficile является анаэробным, грамположительным, спорообразующим бактериальным патогеном и признан основной причиной внутрибольничной диареи, ассоциированной с приемом антибиотиков [85]. В нормальных условиях кишечные комменсалы предотвращают колонизацию C. difficile , подавляя его патогенную активность в толстой кишке за счет прорастания спор и продукции токсина.

    Микробиота кишечника человека претерпевает огромные изменения на протяжении всей жизни; следовательно, неудивительно, что ИКД чаще встречается у пожилых людей [86]. Помимо возраста, многие факторы риска способствуют нарушению микробиоты кишечника и восприимчивости к ИКД, но наибольшее влияние оказывает антимикробная терапия [87].

    Обычно у пациентов с ИКД наблюдается снижение общего бактериального разнообразия [88]. Увеличение числа протеобактерий и снижение числа типов Firmicutes и Bacteroidetes являются наиболее частыми находками у этих пациентов [89, 90].

    В настоящее время стандартным лечением начального нетяжелого эпизода ИКД является пероральный прием ванкомицина или фидаксомицина [91]. Около четверти всех пациентов с ИКД будут иметь рецидивы с возрастающей частотой в каждом последующем эпизоде ​​[92]. Исследование Seekatz et al. [93] выяснили, что микробиота кишечника у пациентов с рецидивирующей ИКД и тяжелой ИКД имела тенденцию к более низкому разнообразию сообщества, но различия между этими двумя группами были менее выражены при сравнении ИКД со здоровыми пациентами.Авторы также пришли к выводу, что восстановление кишечной микробиоты во время лечения было более динамичным у пациентов без рецидива. Более глубокие изменения в составе кишечной микробиоты и низкая динамика выздоровления пациентов с рецидивирующей ИКД по сравнению с лицами с однократной инфекцией подтверждает тот факт, что рецидивирующая инфекция сложнее поддается лечению и имеет более высокую частоту повторного заражения с каждым новым эпизодом. Таким образом, лечение рецидивирующей ИКД представляет собой серьезную клиническую проблему.

    Синдром раздраженного кишечника

    СРК является одним из наиболее распространенных заболеваний желудочно-кишечного тракта в клинической практике с высокой заболеваемостью и общей распространенностью около 11% [94].

    СРК классически связывают с функциональными изменениями на оси мозг-кишка, которые включают нарушение моторики кишечника, сенсомоторную дисфункцию и психологический стресс. Недавние данные также подтверждают, что дисбактериоз кишечника является потенциальным фактором риска СРК, непосредственно вызывая аномальную иммунную активацию кишечника и хроническое воспаление кишечника [95]. Убеждение, что дисбактериоз может играть роль в патогенезе СРК, основано на том факте, что событие бактериального гастроэнтерита является наиболее приемлемым предиктором развития СРК [96].

    FODMAP (ферментируемые олиго-, ди- и моносахариды и полиолы) тесно связаны с СРК, поскольку они способствуют висцеральной гиперчувствительности, усиливают перистальтику кишечника и способствуют дисбиотическому дисбалансу путем подавления бактерий, участвующих в потреблении газа. Несмотря на положительное влияние диеты с низким содержанием FODMAP на симптомы СРК, она снижает концентрацию в просвете Bifidobacterium и F. prausnitzii [97]. Долгосрочные последствия диеты с низким содержанием FODMAP остаются неясными.

    Многочисленные исследования показали различную кишечную микробиоту у пациентов с СРК, и было обнаружено, что даже кишечные симптомы положительно связаны с определенными микроорганизмами. Изменения микробиоты кишечника у пациентов с СРК представлены в таблице 3. В целом у пациентов с СРК наблюдается снижение микробного разнообразия [98]. Данные свидетельствуют о повышенном уровне Firmicutes и снижении Bacteroidetes [99, 100]. В систематическом обзоре 2019 года с участием 777 пациентов авторы подтверждают эти изменения микробиоты [101].Напротив, Wang et al. [102] представили противоречивые результаты.

    Таблица 3.

    Изменения микробиоты у пациентов с синдромом раздраженного кишечника

    Потенциально патогенные бактерии, такие как Ruminococcus , Clostridium и E. coli , как сообщается, увеличиваются при СРК,10 [98]. Несмотря на то, что Lactobacillus и Bifidobacterium использовались в качестве пробиотиков, в многочисленных исследованиях у пациентов с СРК увеличивается количество обоих [103], что поднимает вопрос о роли этих бактерий в СРК.

    В нескольких исследованиях дисбактериоза при СРК, БК и ЯК было подтверждено, что Faecalibacterium , более конкретно F. prausnitzii , снижается, что делает этот микроорганизм «маркером здорового кишечника». F. prausnitzii оказывает сильное противовоспалительное действие как in vitro, так и in vivo, поддерживая здоровье кишечника [100, 102].

    Тем не менее, полученные на сегодняшний день результаты противоречивы, вероятно, из-за влияния таких факторов, как диета, фенотипическая характеристика пациентов и географические условия.

    Терапевтическая модуляция желудочно-кишечной микробиоты

    Появились новые терапевтические возможности, а именно пробиотики, пребиотики, синбиотики и трансплантация фекальной микробиоты (ТФМ) (рис.  1). Все они направлены на восстановление состава микробиоты, гомеостаза кишечника и защиты физического барьера.

    Рис. 1.

    Обзор модуляторной терапии, нацеленной на дисбиотические состояния, и их актуальность в настоящее время. НАЖБП, неалкогольная жировая болезнь печени; CDI, инфекция Clostridium difficile ; ВЗК, воспалительное заболевание кишечника; СРК, синдром раздраженного кишечника; ЯК, язвенный колит; CD, болезнь Крона; ТФМ, трансплантация фекальной микробиоты.

    Пробиотики, пребиотики и синбиотики

    Пробиотики — это живые микроорганизмы, которые приносят пользу здоровью хозяина при введении в адекватных количествах [104]. Наиболее часто используемыми пробиотиками являются Bifidobacterium spp., Lactobacillus spp., Lactococcus spp. и Saccharomyces boulardii . Преимущества пробиотиков достигаются за счет увеличения разнообразия микробиоты желудочно-кишечного тракта и снижения количества патогенных микроорганизмов ( Clostridium кластер XI, C. difficile , Clostridium perfringens , Enterococcus faecium и Campylobacter ) [105], в условиях конкуренции бактерий за питание и прилипание к слизистой оболочке [106]. Bifidobacteria , в частности, способны ингибировать потенциальные патогены, снижать уровень аммиака в крови, вырабатывать витамины и пищеварительные ферменты [107].

    В течение многих лет пробиотикам приходилось преодолевать недоверие из-за отсутствия доказательств их использования из-за трудностей с воспроизводимостью и стандартизацией доз и методов доставки.Однако недавние данные свидетельствуют о том, что пробиотики могут играть определенную роль в контексте конкретного заболевания, о чем будет сказано ниже.

    Пребиотики представляют собой неперевариваемые полисахариды и олигосахариды, такие как лактулоза, фруктоолигосахариды, галактоолигосахариды и инулин, которые ферментируются в толстой кишке, что приводит к специфическим изменениям в составе и/или функциях микробиоты желудочно-кишечного тракта. Пребиотические волокна естественным образом встречаются в обычном рационе, в основном в овощах, таких как спаржа, чеснок, лук-порей и лук [108].Пребиотики избирательно поддерживают рост в кишечнике защитных организмов, особенно Bifidobacterium и Lactobacilli , а также снижают проницаемость кишечника и метаболическую эндотоксемию [109]. Резистентный крахмал представляет собой особую форму пребиотиков, вызывающую растущий интерес в связи с его влиянием на перистальтику кишечника и воспаление при ВЗК и КРР [110].

    Наконец, синбиотики представляют собой комбинацию пребиотиков и пробиотиков с потенциальной пользой для хозяина.

    Эффективность пробиотиков, пребиотиков или синбиотиков в клинической практике зависит от штамма, дозировки и контекста применения.Именно об этих исследуемых аспектах и ​​пойдет речь.

    Колоректальный рак и рак желудка

    В дополнение к иммунологическим и метаболическим преимуществам пре- и пробиотиков для здоровья кишечника исследуются антиканцерогенные эффекты.

    Экспериментальные исследования пробиотиков in vitro показали многообещающие антиканцерогенные результаты, поскольку они обладают способностью разлагать канцерогенные метаболиты, увеличивать количество антиканцерогенных соединений (SCFAs и конъюгированная линолевая кислота) и ингибировать пролиферацию раковых клеток [111].Симбиотический препарат с обогащенным олигофруктозой инулином, Lactobacillus rhamnosus GC и Bifidobacterium lactis Bb12 снижал колоректальную пролиферацию и улучшал барьерную функцию эпителия у пациентов с полипэктомией [112]. Тем не менее, данные о клинически важных преимуществах все еще ограничены, и нет исследований на людях, которые показали бы снижение риска аденомы/КРР.

    Исследования про- и пребиотиков при РЖ были сосредоточены на эрадикации H. pylori .Пробиотики, используемые в качестве адъюванта при лечении H. pylori , по-видимому, увеличивают скорость эрадикации путем прямого ингибирования H. pylori и уменьшения побочных эффектов терапии первой линии [113]. Тем не менее, Маастрихтский V / Флорентийский консенсус 2016 г. предполагает очень мало доказательств положительного влияния пробиотиков на эрадикацию H. pylori [114], хотя они значительно уменьшают связанную с лечением диарею, связанную с приемом антибиотиков, и могут повысить соблюдение режима лечения.

    Несмотря на общее влияние микробиома на рак желудочно-кишечного тракта, мало внимания уделяется пробиотикам как средствам контроля желудочного и колоректального канцерогенеза у людей.

    Воспалительные заболевания кишечника

    При ВЗК наблюдались расхождения между эффективностью пробиотиков и пребиотиков при БК и ЯК. Многочисленные исследования, сравнивающие пробиотики и плацебо у пациентов с болезнью Крона, не показали четких доказательств полезности пробиотиков при этом заболевании [115]. Однако другие результаты наблюдались при язвенном колите, где добавление пробиотика к обычному лечению улучшало индукцию и поддерживающую ремиссию при активном язвенном колите легкой и средней степени тяжести [115]. Э.coli Nissle 1917 эквивалентен месалазину в поддержании ремиссии у пациентов с ЯК [116]. Высокоэффективный пробиотический лечебный продукт питания, содержащий 8 различных штаммов, называемый VSL#3®, вызывает ремиссию и облегчает рецидивы при ЯК легкой и средней степени тяжести [117].

    Другие пробиотики, такие как Bifidobacterium [118] и Lactobacillus [119], по-видимому, оказывают благотворное влияние на лечение активного ЯК. Кроме того, добавление пребиотиков, таких как инулин, обогащенный олигофруктозой, при активном ЯК было связано с ранним снижением фекального кальпротектина [120].Таким образом, нельзя дать четких рекомендаций по дозе или штамму для активного ЯК, и необходимы дополнительные исследования.

    Поухит является наиболее частым осложнением после наложения подвздошно-анального анастомоза при ЯК. По данным Европейской организации Крона и колита, имеются убедительные доказательства полезности VSL#3® для предотвращения начального эпизода резервуарного илеита и для поддержания ремиссии хронического резервуарного илеита после лечения антибиотиками [121].

    Неалкогольная жировая болезнь печени

    Было высказано предположение, что некоторые пробиотики могут быть полезны при НАЖБП, даже изменяя биопсийные характеристики печени, но долгосрочные преимущества пока неизвестны [122].Исследование, проведенное на детях с ожирением и подтвержденной УЗИ НАЖБП, показало, что у тех, кто получал пробиотики в капсулах ( Lactobacillus acidophilus и rhamnosis , Bifidobacterium lactis и bifidum ) в течение 12 недель, были снижены уровни ферментов печени, триглицеридов и холестерина, а также с улучшением степени стеатоза на УЗИ по сравнению с группой плацебо [123].

    Использование синбиотиков, таких как Bifidobacterium longum с фруктоолигосахаридами, по сравнению с модификацией образа жизни, значительно снижало фактор некроза опухоли-α, С-реактивный белок, уровни аспартатаминотрансферазы в сыворотке, инсулинорезистентность, сывороточный эндотоксин и биопсию. стеатоз [124].

    В недавнем систематическом обзоре и метаанализе были проанализированы 25 клинических испытаний, в которых изучалось влияние пре-, про- и синбиотиков на пациентов с НАЖБП и подтверждалось потенциальное использование микробной терапии при лечении НАЖБП, поскольку были обнаружены положительные результаты в отношении массы тела. индекс, печеночные ферменты, холестерин сыворотки, холестерин липопротеинов низкой плотности и триглицериды [122].

    C. difficile Инфекция

    По мере роста показателей ИКД и снижения эффективности традиционных методов лечения появляются новые подходы.Недавний Кокрановский обзор показал, что совместное назначение пробиотиков с антибиотиками было связано с более низким риском развития ИКД, но текущие рекомендации еще не рекомендуют рутинное профилактическое использование пробиотиков [125].

    Препараты пребиотиков как средства лечения и профилактики рецидивирующей ИКД до сих пор не имеют доказанного клинического применения [126].

    Синдром раздраженного кишечника

    По данным Всемирной гастроэнтерологической организации, некоторые пробиотические штаммы могут уменьшить боль и обеспечить общее облегчение при СРК с последовательным уменьшением вздутия живота и метеоризма в опубликованных исследованиях [127].Значительное уменьшение боли после введения пробиотиков, содержащих Bifidobacterium breve , Bifidobacterium longum или Lactobacillus acidophilus , также было продемонстрировано Ortiz-Lucas et al. [128]. Интересно, что у пациентов с аномальным соотношением интерлейкина 10 (ИЛ-10)/ИЛ-12, указывающим на провоспалительное состояние, уровни нормализовались после введения Bifidobacterium infantis 36624 [129].

    В ходе недавнего метаанализа, проведенного Американским колледжем гастроэнтерологии, были изучены 53 РКИ с участием 5545 пациентов с СРК.В совокупности пробиотики статистически превосходили плацебо с количеством, необходимым для лечения, равным 7, но с низким качеством доказательств в поддержку их использования [130]. Основываясь на обновлении Британской диетической ассоциации за 2016 год, нет убедительных доказательств, чтобы рекомендовать конкретный пробиотик, и все они должны использоваться по одному в течение как минимум 4 недель [131]. Систематический обзор 2019 г. у пациентов с СРК не выявил различий между пребиотиками и плацебо в отношении симптомов и качества жизни [132].

    Трансплантация фекальной микробиоты

    ТФМ заключается во введении фекалий здорового донора в желудочно-кишечный тракт пациента-реципиента [133]. Следовательно, есть возможность восстановить сложность и разнообразие микробиоты кишечника, превзойдя преимущества пробиотиков [134].

    Согласно нескольким недавно опубликованным систематическим обзорам и мета-анализам [135-137], FMT успешно применялась при лечении рецидивирующей ИКД с показателем излечения примерно 90%. Согласно рекомендациям США, опубликованным в 2018 г., ТФМ предлагается пациентам с не менее чем двумя рецидивами [138]. В рекомендациях European Consensus [133] рекомендуется ТФМ при легкой и тяжелой рецидивирующей ИКД и предлагается рассматривать ИКД, рефрактерную к первоначальной антибиотикотерапии.До сих пор нет доказательств использования ТФМ в качестве лечения первого эпизода ИКД. В исследовании, проведенном в Португалии, общая частота излечения рецидивирующей или рефрактерной ИКД с помощью ТФМ составила 96% (87,5% при использовании верхней эндоскопии и 100% при колоноскопии) [139].

    При краткосрочном наблюдении ТФМ кажется безопасной, при этом наиболее частыми побочными эффектами являются дискомфорт в животе, диарея, запор и субфебрильная температура. Тяжелые побочные эффекты встречаются редко и включают рецидив ВЗК, передачу кишечных патогенов, пневмонию, инфекцию/сепсис и постинфекционный СРК.Потенциальные долгосрочные последствия связаны с возможностью передачи невыявленных инфекций, которые могут вызвать заболевание спустя годы и вызвать хронические заболевания, как сообщалось в отчетах о случаях, таких как ожирение, диабет, НАЖБП, астма, аутизм и другие [140, 141]. ]. Для обеспечения условий безопасности проводится отбор доноров, который включает в себя медицинское собеседование, а также анализы крови и кала. Европейский консенсус предложил клиническое и аналитическое наблюдение в течение как минимум 8 недель после ТФМ [133].

    В настоящее время, в связи с показателями успешности ТФМ при рецидивирующей ИКД, существует большой интерес к оценке ТФМ при заболеваниях, связанных с измененной микробиотой кишечника, в частности ВЗК, СРК и идиопатических запорах. Интересным открытием было то, что FMT был менее эффективен у пациентов с рецидивирующей ИКД с ВЗК по сравнению с пациентами без ВЗК. Фактически, у 25% пациентов с ВЗК после ТФМ наблюдалось обострение [142].

    Подобно пре- и пробиотикам при ВЗК, БК с меньшей вероятностью будет реагировать на ТФМ, чем ЯК. Однако пилотное исследование [143] продемонстрировало высокие показатели клинического улучшения и ремиссии у пациентов с рефрактерной БК после ТФМ.До сих пор нет рандомизированных контролируемых исследований ТФМ при БК. Пациенты с активным ЯК, получавшие ТФМ, достигли ремиссии в значительно большей пропорции по сравнению с группой плацебо. Те, кто находился на ранней стадии ЯК, достигли более высоких показателей успеха, чем те, кто находился на поздней стадии ЯК. Любопытно, что большинство пациентов, достигших ремиссии, получали фекалии от одного здорового донора [144]. Следовательно, ТФМ является многообещающей альтернативой ВЗК, требующей дальнейшего изучения для поддержки рекомендации.

    Ожидается, что IBS выиграет от потенциала FMT.В рандомизированном контролируемом исследовании 2018 года было проанализировано 83 пациента с СРК, 55 из которых получали ТФМ. Через 3 месяца после лечения у 65% пациентов в группе ТФМ и у 43% в группе плацебо наблюдалось снижение показателей тяжести СРК [145]. Тем не менее, противоречивые результаты в настоящее время не поддерживают широкое использование этого метода лечения [146].

    ТФМ теоретически может быть полезна при НАЖБП и раке желудочно-кишечного тракта, поскольку микробиота играет роль в их патогенезе. Тем не менее, его потенциальные преимущества в этих условиях еще не изучены.

    Описание дисбактериоза при многих нежелудочно-кишечных заболеваниях вызвало исследование потенциальных показаний к ТФМ для них. В настоящее время исследования FMT распространяются на аутизм, рассеянный склероз, метаболические заболевания, идиопатическую тромбоцитопеническую пурпуру, аутоиммунные заболевания, аллергические расстройства и другие психические расстройства [141]. Дальнейшее исследование FMT должно быть сосредоточено на описании дозировки и времени FMT, помимо демографических и клинических данных пациента.

    Заключение

    Недавний результат секвенирования генома микробиома выявил многочисленные корреляции между дисбиотическим дисбалансом и желудочно-кишечными заболеваниями.Тем не менее, они представляют собой ранние этапы исследований, когда было установлено мало причинно-следственных связей. Исследования на моделях мышей показали, что дисбактериоз играет роль в патогенезе канцерогенеза, вызванного воспалением, и может возникать до начала заболевания.

    Большинство протеобактерий считаются неблагоприятными, о чем свидетельствует их увеличение при ВЗК и ИКД, в отличие от фирмикутов, количество которых снижено у пациентов с ВЗК, КРР, НАЖБП и ИКД. Даже у здоровых пациентов такие факторы, как диета, ИПП или антибиотики, модулируют микробиоту кишечника.Длительная терапия антибиотиками широкого спектра действия, западная диета и снижение кислотности желудка с помощью ИПП являются общепризнанными факторами риска заболеваний, связанных с дисбиозом. Однако до сих пор нет единого мнения о том, что представляет собой нормальная микробиота, и в клинической практике сложно интегрировать результаты анализа микробиоты отдельных пациентов, а именно для выбора оптимального пути восстановления нормальной микробиоты.

    Все больше доказательств поддерживает пробиотики в качестве адъювантной терапии, главным образом, при НАЖБП, ИКД, ЯК и СРК.Авторы считают, что дальнейшие клинические испытания пре- и пробиотиков с использованием стандартизированных штаммов, доз и продолжительности лечения необходимы для включения этих препаратов в международные рекомендации. С другой стороны, FMT является установленным вариантом для повторяющихся CDI. Тем не менее, применение FMT при других заболеваниях, связанных с дисбиозом, не имеет рандомизированных контролируемых исследований, чтобы поддержать рекомендацию.

    Заявление о раскрытии информации

    У авторов нет конфликта интересов, о котором следует заявить.

    Эта статья находится под лицензией Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License (CC BY-NC-ND). Использование и распространение в коммерческих целях, а также любое распространение измененного материала требует письменного разрешения. Дозировка препарата: авторы и издатель приложили все усилия, чтобы гарантировать, что выбор препарата и дозировка, указанные в этом тексте, соответствуют текущим рекомендациям и практике на момент публикации. Тем не менее, в связи с продолжающимися исследованиями, изменениями в правительственных постановлениях и постоянным потоком информации, касающейся лекарственной терапии и реакций на лекарства, читателю настоятельно рекомендуется проверять вкладыш в упаковке для каждого лекарства на предмет любых изменений в показаниях и дозировке, а также для дополнительных предупреждений. и меры предосторожности.Это особенно важно, когда рекомендуемый агент является новым и/или редко используемым лекарственным средством. Отказ от ответственности: заявления, мнения и данные, содержащиеся в этой публикации, принадлежат исключительно отдельным авторам и участникам, а не издателям и редакторам. Появление рекламы и/или ссылок на продукты в публикации не является гарантией, одобрением или одобрением рекламируемых продуктов или услуг или их эффективности, качества или безопасности. Издатель и редактор(ы) отказываются от ответственности за любой ущерб людям или имуществу в результате любых идей, методов, инструкций или продуктов, упомянутых в содержании или рекламе.

    Дисбактериоз кишечника лечение: Лечение дисбактериоза у взрослых | Клиника Семейный доктор

    Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован.